MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_015966	GTCCA	2	10	2490830	2490839	20 %	20 %	20 %	40 %	345304025
54002	NC_015966	CGAA	2	8	2490857	2490864	50 %	0 %	25 %	25 %	345304025
54003	NC_015966	CGC	2	6	2490919	2490924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304025
54004	NC_015966	ATGCCC	2	12	2490954	2490965	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345304025
54005	NC_015966	GGC	2	6	2490998	2491003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304025
54006	NC_015966	CCA	2	6	2491027	2491032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304025
54007	NC_015966	ACG	2	6	2491092	2491097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304025
54008	NC_015966	GGC	2	6	2491128	2491133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304025
54009	NC_015966	CCT	2	6	2491150	2491155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304025
54010	NC_015966	CCT	2	6	2491183	2491188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304025
54011	NC_015966	CAC	2	6	2491325	2491330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304025
54012	NC_015966	GCG	2	6	2491354	2491359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304025
54013	NC_015966	GTA	2	6	2491382	2491387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304025
54014	NC_015966	ACG	2	6	2491519	2491524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304025
54015	NC_015966	TCCG	2	8	2491696	2491703	0 %	25 %	25 %	50 %	345304025
54016	NC_015966	GTC	3	9	2491790	2491798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304025
54017	NC_015966	TGA	2	6	2491807	2491812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304025
54018	NC_015966	TCG	2	6	2491923	2491928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304025
54019	NC_015966	GCG	2	6	2492035	2492040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304025
54020	NC_015966	GC	3	6	2492053	2492058	0 %	0 %	50 %	50 %	345304025
54021	NC_015966	CGGC	2	8	2492110	2492117	0 %	0 %	50 %	50 %	345304025
54022	NC_015966	CTG	2	6	2492174	2492179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304025
54023	NC_015966	TTC	2	6	2492196	2492201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304025
54024	NC_015966	GGA	2	6	2492291	2492296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304025
54025	NC_015966	CCG	2	6	2492307	2492312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304025
54026	NC_015966	CAG	2	6	2492339	2492344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304025
54027	NC_015966	GAACGT	2	12	2492417	2492428	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345304025
54028	NC_015966	ATCT	2	8	2492442	2492449	25 %	50 %	0 %	25 %	345304026
54029	NC_015966	TGA	2	6	2492478	2492483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304026
54030	NC_015966	CAG	2	6	2492496	2492501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304026
54031	NC_015966	ACG	2	6	2492517	2492522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304026
54032	NC_015966	CCA	2	6	2492611	2492616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304026
54033	NC_015966	AGC	2	6	2492652	2492657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304026
54034	NC_015966	GCC	3	9	2492669	2492677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304026
54035	NC_015966	GAG	2	6	2492708	2492713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304026
54036	NC_015966	CCG	2	6	2492735	2492740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304026
54037	NC_015966	TGC	2	6	2492811	2492816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304026
54038	NC_015966	GAA	2	6	2492858	2492863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304026
54039	NC_015966	CGG	2	6	2492896	2492901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304026
54040	NC_015966	GCTTCG	2	12	2492913	2492924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304026
54041	NC_015966	TCCT	2	8	2492945	2492952	0 %	50 %	0 %	50 %	345304026
54042	NC_015966	GCA	2	6	2492977	2492982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304026
54043	NC_015966	CGTG	2	8	2493037	2493044	0 %	25 %	50 %	25 %	345304026
54044	NC_015966	GCG	2	6	2493060	2493065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304026
54045	NC_015966	GTG	2	6	2493081	2493086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304026
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54047	NC_015966	CGGG	2	8	2493147	2493154	0 %	0 %	75 %	25 %	345304026
54048	NC_015966	GCC	2	6	2493159	2493164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304026
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54050	NC_015966	GC	3	6	2493288	2493293	0 %	0 %	50 %	50 %	345304026
54051	NC_015966	AGC	2	6	2493294	2493299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304026
54052	NC_015966	GTG	2	6	2493339	2493344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304026
54053	NC_015966	CCCA	2	8	2493374	2493381	25 %	0 %	0 %	75 %	345304026
54054	NC_015966	GGT	2	6	2493385	2493390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304026
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54056	NC_015966	CAG	3	9	2493407	2493415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304026
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54059	NC_015966	CGGC	2	8	2493520	2493527	0 %	0 %	50 %	50 %	345304026
54060	NC_015966	CAT	2	6	2493551	2493556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304026
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54066	NC_015966	CCAG	2	8	2493808	2493815	25 %	0 %	25 %	50 %	345304026
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54086	NC_015966	AGCCC	2	10	2494805	2494814	20 %	0 %	20 %	60 %	345304027
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54100	NC_015966	CG	3	6	2495401	2495406	0 %	0 %	50 %	50 %	345304029
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54115	NC_015966	GGT	2	6	2495719	2495724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304029
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54231	NC_015966	GGCT	2	8	2507564	2507571	0 %	25 %	50 %	25 %	345304032
54232	NC_015966	ACG	2	6	2507635	2507640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304032
54233	NC_015966	GCC	2	6	2507670	2507675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304032
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54235	NC_015966	GCGAG	2	10	2507777	2507786	20 %	0 %	60 %	20 %	345304032
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54267	NC_015966	CG	3	6	2509714	2509719	0 %	0 %	50 %	50 %	345304034
54268	NC_015966	CGG	2	6	2509736	2509741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304034
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54303	NC_015966	AGC	4	12	2511101	2511112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304035
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54322	NC_015966	CGG	2	6	2511704	2511709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304035
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54324	NC_015966	TCCA	2	8	2511734	2511741	25 %	25 %	0 %	50 %	345304035
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54328	NC_015966	GCGCA	2	10	2511817	2511826	20 %	0 %	40 %	40 %	345304035
54329	NC_015966	CAG	2	6	2511838	2511843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304035
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54331	NC_015966	CAG	2	6	2511874	2511879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304035
54332	NC_015966	GCC	3	9	2511884	2511892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304035
54333	NC_015966	GCC	2	6	2511905	2511910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304035
54334	NC_015966	GCC	2	6	2511935	2511940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304035
54335	NC_015966	TCC	2	6	2512185	2512190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304036
54336	NC_015966	CGC	2	6	2512292	2512297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304036
54337	NC_015966	CGAT	2	8	2512309	2512316	25 %	25 %	25 %	25 %	345304036
54338	NC_015966	GCA	2	6	2512340	2512345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304036
54339	NC_015966	TGA	2	6	2512550	2512555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304037
54340	NC_015966	CGG	2	6	2512615	2512620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304037
54341	NC_015966	CAG	2	6	2512641	2512646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304037
54342	NC_015966	CGA	2	6	2512655	2512660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304037
54343	NC_015966	GTA	2	6	2512663	2512668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304037
54344	NC_015966	CGA	2	6	2512742	2512747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304037
54345	NC_015966	GC	3	6	2512759	2512764	0 %	0 %	50 %	50 %	345304037
54346	NC_015966	ATCAGC	2	12	2512801	2512812	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345304037
54347	NC_015966	TGC	2	6	2512825	2512830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304037
54348	NC_015966	CG	3	6	2512839	2512844	0 %	0 %	50 %	50 %	345304037
54349	NC_015966	A	6	6	2512902	2512907	100 %	0 %	0 %	0 %	345304037
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