MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_015966	CAG	2	6	2445998	2446003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303988
53002	NC_015966	GCC	2	6	2446031	2446036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303988
53003	NC_015966	TGA	2	6	2446051	2446056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303988
53004	NC_015966	CAC	2	6	2446097	2446102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303988
53005	NC_015966	GTC	2	6	2446119	2446124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303988
53006	NC_015966	GCA	2	6	2446144	2446149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303988
53007	NC_015966	GC	3	6	2446167	2446172	0 %	0 %	50 %	50 %	345303988
53008	NC_015966	CGG	2	6	2446192	2446197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303988
53009	NC_015966	GCA	2	6	2446249	2446254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303988
53010	NC_015966	CGAG	2	8	2446276	2446283	25 %	0 %	50 %	25 %	345303988
53011	NC_015966	AGCC	2	8	2446311	2446318	25 %	0 %	25 %	50 %	345303988
53012	NC_015966	GTT	2	6	2446382	2446387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303988
53013	NC_015966	TGG	2	6	2446513	2446518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303988
53014	NC_015966	AGC	2	6	2446569	2446574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303988
53015	NC_015966	GCC	2	6	2446618	2446623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303988
53016	NC_015966	CGT	2	6	2446639	2446644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303988
53017	NC_015966	CGG	2	6	2446672	2446677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303988
53018	NC_015966	GCT	2	6	2446684	2446689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303988
53019	NC_015966	GCG	2	6	2446702	2446707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303988
53020	NC_015966	CCG	2	6	2446748	2446753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303988
53021	NC_015966	CAG	2	6	2446772	2446777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303988
53022	NC_015966	TCA	2	6	2446786	2446791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303988
53023	NC_015966	CCAG	2	8	2446855	2446862	25 %	0 %	25 %	50 %	345303988
53024	NC_015966	GATC	2	8	2446870	2446877	25 %	25 %	25 %	25 %	345303988
53025	NC_015966	TCG	2	6	2446899	2446904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303988
53026	NC_015966	CTG	2	6	2446916	2446921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303988
53027	NC_015966	CTC	2	6	2446925	2446930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303988
53028	NC_015966	CAC	2	6	2447039	2447044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303988
53029	NC_015966	CCA	2	6	2447175	2447180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303989
53030	NC_015966	CG	3	6	2447208	2447213	0 %	0 %	50 %	50 %	345303989
53031	NC_015966	ACC	2	6	2447240	2447245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303989
53032	NC_015966	TCGA	2	8	2447270	2447277	25 %	25 %	25 %	25 %	345303989
53033	NC_015966	CGA	2	6	2447289	2447294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303989
53034	NC_015966	CGT	2	6	2447404	2447409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303989
53035	NC_015966	CGTC	2	8	2447502	2447509	0 %	25 %	25 %	50 %	345303989
53036	NC_015966	GCT	2	6	2447553	2447558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303989
53037	NC_015966	GCG	2	6	2447566	2447571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303989
53038	NC_015966	GTA	2	6	2447593	2447598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303989
53039	NC_015966	CGA	2	6	2447643	2447648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303989
53040	NC_015966	CCA	2	6	2447652	2447657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303989
53041	NC_015966	CTCC	2	8	2447733	2447740	0 %	25 %	0 %	75 %	345303989
53042	NC_015966	GCCCTC	2	12	2447791	2447802	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	345303989
53043	NC_015966	GC	3	6	2447907	2447912	0 %	0 %	50 %	50 %	345303989
53044	NC_015966	GTCCG	2	10	2447929	2447938	0 %	20 %	40 %	40 %	345303989
53045	NC_015966	CCA	2	6	2448003	2448008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303989
53046	NC_015966	GCT	3	9	2448337	2448345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303990
53047	NC_015966	GCC	2	6	2448383	2448388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303990
53048	NC_015966	CGG	2	6	2448415	2448420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303990
53049	NC_015966	CGG	2	6	2448486	2448491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303990
53050	NC_015966	CAT	2	6	2448496	2448501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303990
53051	NC_015966	GCC	2	6	2448524	2448529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303990
53052	NC_015966	TTCGAC	2	12	2448611	2448622	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345303990
53053	NC_015966	GAA	2	6	2448679	2448684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303990
53054	NC_015966	GGC	2	6	2448775	2448780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303990
53055	NC_015966	CGC	2	6	2448781	2448786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303990
53056	NC_015966	GCA	2	6	2448796	2448801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303990
53057	NC_015966	GAA	2	6	2448872	2448877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303990
53058	NC_015966	CCG	2	6	2448892	2448897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303990
53059	NC_015966	GGAA	2	8	2448933	2448940	50 %	0 %	50 %	0 %	345303990
53060	NC_015966	CTGGC	2	10	2449043	2449052	0 %	20 %	40 %	40 %	345303991
53061	NC_015966	AAC	2	6	2449053	2449058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345303991
53062	NC_015966	TCG	2	6	2449104	2449109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303991
53063	NC_015966	CGTG	2	8	2449140	2449147	0 %	25 %	50 %	25 %	345303991
53064	NC_015966	TCGGC	2	10	2449155	2449164	0 %	20 %	40 %	40 %	345303991
53065	NC_015966	GC	3	6	2449163	2449168	0 %	0 %	50 %	50 %	345303991
53066	NC_015966	CTA	2	6	2449186	2449191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303991
53067	NC_015966	TCA	2	6	2449242	2449247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303991
53068	NC_015966	CGG	2	6	2449249	2449254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303991
53069	NC_015966	CAT	2	6	2449264	2449269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303991
53070	NC_015966	GCC	2	6	2449274	2449279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303991
53071	NC_015966	AGG	2	6	2449293	2449298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303991
53072	NC_015966	CGG	2	6	2449300	2449305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303991
53073	NC_015966	TTC	2	6	2449394	2449399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303991
53074	NC_015966	TGC	2	6	2449443	2449448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303991
53075	NC_015966	CGG	2	6	2449450	2449455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303991
53076	NC_015966	ACT	2	6	2449545	2449550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303991
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53078	NC_015966	GCC	2	6	2449589	2449594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303991
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53082	NC_015966	GC	3	6	2449858	2449863	0 %	0 %	50 %	50 %	345303992
53083	NC_015966	CTG	2	6	2449871	2449876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303992
53084	NC_015966	CTG	2	6	2449886	2449891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303992
53085	NC_015966	CGT	2	6	2449894	2449899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303992
53086	NC_015966	C	6	6	2449904	2449909	0 %	0 %	0 %	100 %	345303992
53087	NC_015966	ACC	2	6	2449913	2449918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303992
53088	NC_015966	CAG	2	6	2449925	2449930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303992
53089	NC_015966	AAG	2	6	2449943	2449948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303992
53090	NC_015966	GGC	2	6	2450017	2450022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303992
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53092	NC_015966	GCT	2	6	2450212	2450217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303992
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53098	NC_015966	GCCG	2	8	2450668	2450675	0 %	0 %	50 %	50 %	345303992
53099	NC_015966	CTC	2	6	2450695	2450700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303992
53100	NC_015966	CGG	2	6	2450776	2450781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303993
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53103	NC_015966	TGG	2	6	2451036	2451041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303994
53104	NC_015966	GAA	2	6	2451062	2451067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303994
53105	NC_015966	GAA	2	6	2451083	2451088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303994
53106	NC_015966	CGA	2	6	2451241	2451246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303994
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53109	NC_015966	CCGG	2	8	2451307	2451314	0 %	0 %	50 %	50 %	345303994
53110	NC_015966	GGC	2	6	2451421	2451426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303994
53111	NC_015966	GCT	2	6	2451439	2451444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303994
53112	NC_015966	ACGGCG	2	12	2451585	2451596	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345303994
53113	NC_015966	CGA	2	6	2451610	2451615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303994
53114	NC_015966	CCTGC	2	10	2451617	2451626	0 %	20 %	20 %	60 %	345303994
53115	NC_015966	GGC	2	6	2451718	2451723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303994
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53218	NC_015966	GAAC	2	8	2456571	2456578	50 %	0 %	25 %	25 %	345303997
53219	NC_015966	TGG	2	6	2456687	2456692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303997
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53343	NC_015966	GGC	2	6	2462192	2462197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304002
53344	NC_015966	CTG	2	6	2462199	2462204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304002
53345	NC_015966	GCG	2	6	2462236	2462241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304002
53346	NC_015966	GCA	2	6	2462300	2462305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304002
53347	NC_015966	GCG	2	6	2462433	2462438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304002
53348	NC_015966	CGC	2	6	2462443	2462448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304002
53349	NC_015966	GGC	2	6	2462459	2462464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304002
53350	NC_015966	CAA	2	6	2462477	2462482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345304002
53351	NC_015966	TGC	2	6	2462494	2462499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304002
53352	NC_015966	GAG	2	6	2462508	2462513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304002
53353	NC_015966	TCGG	2	8	2462589	2462596	0 %	25 %	50 %	25 %	345304002
53354	NC_015966	CTG	2	6	2462607	2462612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304002
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53356	NC_015966	CGC	2	6	2462677	2462682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304002
53357	NC_015966	CTG	2	6	2462697	2462702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304002
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53359	NC_015966	GCC	2	6	2462775	2462780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304002
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53361	NC_015966	GCC	3	9	2462812	2462820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304002
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53364	NC_015966	CTG	2	6	2462952	2462957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304002
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53372	NC_015966	ACC	2	6	2463180	2463185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304002
53373	NC_015966	GTC	2	6	2463241	2463246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304003
53374	NC_015966	TCG	2	6	2463281	2463286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304003
53375	NC_015966	GCA	2	6	2463345	2463350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304003
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53380	NC_015966	TGG	2	6	2463569	2463574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304003
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53382	NC_015966	GCCG	2	8	2463695	2463702	0 %	0 %	50 %	50 %	345304003
53383	NC_015966	GC	3	6	2463706	2463711	0 %	0 %	50 %	50 %	345304003
53384	NC_015966	CGCAGG	2	12	2463719	2463730	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345304003
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53413	NC_015966	CTCCAC	2	12	2464853	2464864	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	345304004
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53425	NC_015966	CG	3	6	2465666	2465671	0 %	0 %	50 %	50 %	345304005
53426	NC_015966	CACCAG	2	12	2465700	2465711	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	345304005
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53429	NC_015966	TTG	2	6	2465915	2465920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345304006
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53431	NC_015966	AGCC	2	8	2466035	2466042	25 %	0 %	25 %	50 %	345304006
53432	NC_015966	GGT	2	6	2466084	2466089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304006
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53441	NC_015966	TCG	2	6	2466425	2466430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304006
53442	NC_015966	CCT	2	6	2466498	2466503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304007
53443	NC_015966	GCA	2	6	2466531	2466536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304007
53444	NC_015966	CAGC	2	8	2466619	2466626	25 %	0 %	25 %	50 %	345304007
53445	NC_015966	AGC	2	6	2466686	2466691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304007
53446	NC_015966	CCA	2	6	2466741	2466746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304007
53447	NC_015966	CGA	2	6	2466760	2466765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304007
53448	NC_015966	GCC	2	6	2466772	2466777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304007
53449	NC_015966	CAC	2	6	2466778	2466783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304007
53450	NC_015966	CGC	2	6	2466795	2466800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304007
53451	NC_015966	CTG	2	6	2466826	2466831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304007
53452	NC_015966	CGTG	2	8	2466837	2466844	0 %	25 %	50 %	25 %	345304007
53453	NC_015966	GCA	2	6	2466924	2466929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304007
53454	NC_015966	TGG	2	6	2466963	2466968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304007
53455	NC_015966	CAC	2	6	2466976	2466981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304007
53456	NC_015966	AGA	2	6	2467047	2467052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304007
53457	NC_015966	CGC	2	6	2467068	2467073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304007
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