MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52001	NC_015966	CAT	3	9	2401339	2401347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303954
52002	NC_015966	ACC	2	6	2401352	2401357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303954
52003	NC_015966	TGG	2	6	2401371	2401376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303954
52004	NC_015966	CAA	2	6	2401412	2401417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345303954
52005	NC_015966	TCA	2	6	2401467	2401472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303954
52006	NC_015966	ACG	2	6	2401497	2401502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303954
52007	NC_015966	CAG	2	6	2401538	2401543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303954
52008	NC_015966	GCC	3	9	2401559	2401567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303954
52009	NC_015966	TGC	2	6	2401584	2401589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303954
52010	NC_015966	CTG	2	6	2401751	2401756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303954
52011	NC_015966	TCG	2	6	2401767	2401772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303954
52012	NC_015966	TGA	2	6	2401782	2401787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303954
52013	NC_015966	ATG	3	9	2401796	2401804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303954
52014	NC_015966	GCC	2	6	2401807	2401812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303954
52015	NC_015966	GCT	3	9	2401837	2401845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303954
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52017	NC_015966	TCGT	2	8	2401887	2401894	0 %	50 %	25 %	25 %	345303954
52018	NC_015966	CGG	2	6	2401903	2401908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303954
52019	NC_015966	CTG	3	9	2401977	2401985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303955
52020	NC_015966	GCT	2	6	2401994	2401999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303955
52021	NC_015966	CTG	2	6	2402034	2402039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303955
52022	NC_015966	TGC	2	6	2402107	2402112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303955
52023	NC_015966	TGC	2	6	2402131	2402136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303955
52024	NC_015966	TGC	2	6	2402164	2402169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303955
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52026	NC_015966	CTG	2	6	2402224	2402229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303956
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52042	NC_015966	CGT	2	6	2402658	2402663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303956
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52050	NC_015966	CGA	3	9	2402931	2402939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303956
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52060	NC_015966	TGA	2	6	2403268	2403273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303957
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52072	NC_015966	CG	3	6	2403937	2403942	0 %	0 %	50 %	50 %	345303957
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52081	NC_015966	TGCCGC	2	12	2404300	2404311	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345303958
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52087	NC_015966	TCG	2	6	2404525	2404530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303958
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52102	NC_015966	GAA	2	6	2405010	2405015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303958
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52111	NC_015966	GCCG	2	8	2405186	2405193	0 %	0 %	50 %	50 %	345303958
52112	NC_015966	C	6	6	2405215	2405220	0 %	0 %	0 %	100 %	345303958
52113	NC_015966	ACCG	2	8	2405222	2405229	25 %	0 %	25 %	50 %	345303958
52114	NC_015966	CAGC	2	8	2405237	2405244	25 %	0 %	25 %	50 %	345303958
52115	NC_015966	GCTGGA	2	12	2405261	2405272	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345303958
52116	NC_015966	CTG	2	6	2405322	2405327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303958
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52225	NC_015966	CTA	2	6	2410264	2410269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303963
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52227	NC_015966	AGCGCA	2	12	2410293	2410304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303963
52228	NC_015966	CCG	2	6	2410344	2410349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303963
52229	NC_015966	ACTC	2	8	2410416	2410423	25 %	25 %	0 %	50 %	345303963
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52232	NC_015966	GTC	2	6	2410505	2410510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303963
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52328	NC_015966	TC	3	6	2415444	2415449	0 %	50 %	0 %	50 %	345303967
52329	NC_015966	TAA	2	6	2415459	2415464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345303967
52330	NC_015966	TCT	2	6	2415498	2415503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303967
52331	NC_015966	AGCC	2	8	2415520	2415527	25 %	0 %	25 %	50 %	345303967
52332	NC_015966	GCG	2	6	2415660	2415665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303967
52333	NC_015966	GGC	2	6	2415718	2415723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303967
52334	NC_015966	CTTC	2	8	2415728	2415735	0 %	50 %	0 %	50 %	345303967
52335	NC_015966	G	6	6	2415762	2415767	0 %	0 %	100 %	0 %	345303967
52336	NC_015966	TGG	2	6	2415813	2415818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303967
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52340	NC_015966	CCT	2	6	2415935	2415940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303968
52341	NC_015966	TCG	2	6	2415979	2415984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303968
52342	NC_015966	CAC	2	6	2415990	2415995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303968
52343	NC_015966	GC	3	6	2415996	2416001	0 %	0 %	50 %	50 %	345303968
52344	NC_015966	CGC	2	6	2416061	2416066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303968
52345	NC_015966	GC	3	6	2416065	2416070	0 %	0 %	50 %	50 %	345303968
52346	NC_015966	GCGG	2	8	2416077	2416084	0 %	0 %	75 %	25 %	345303968
52347	NC_015966	GTT	2	6	2416155	2416160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303968
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52454	NC_015966	TGG	2	6	2421095	2421100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303972
52455	NC_015966	GCC	2	6	2421126	2421131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303972
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52457	NC_015966	TGC	2	6	2421191	2421196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303972
52458	NC_015966	ATG	2	6	2421202	2421207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303972
52459	NC_015966	AGAAA	2	10	2421496	2421505	80 %	0 %	20 %	0 %	345303973
52460	NC_015966	CGT	2	6	2421516	2421521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303973
52461	NC_015966	CGC	2	6	2421584	2421589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303973
52462	NC_015966	GTC	2	6	2421659	2421664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303973
52463	NC_015966	GAA	2	6	2421674	2421679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303973
52464	NC_015966	CTG	2	6	2421716	2421721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303973
52465	NC_015966	CGT	2	6	2421727	2421732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303973
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52480	NC_015966	C	6	6	2422498	2422503	0 %	0 %	0 %	100 %	345303974
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52491	NC_015966	TCG	2	6	2423023	2423028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303974
52492	NC_015966	ACG	2	6	2423029	2423034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303974
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