MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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51502	NC_015966	GCT	2	6	2379102	2379107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303931
51503	NC_015966	TCG	2	6	2379161	2379166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303931
51504	NC_015966	CGA	2	6	2379171	2379176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303931
51505	NC_015966	TGC	2	6	2379278	2379283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303931
51506	NC_015966	ACG	2	6	2379313	2379318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303931
51507	NC_015966	CG	3	6	2379328	2379333	0 %	0 %	50 %	50 %	345303931
51508	NC_015966	GAA	2	6	2379340	2379345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303931
51509	NC_015966	CGC	2	6	2379349	2379354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303931
51510	NC_015966	CTG	2	6	2379355	2379360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303931
51511	NC_015966	CGA	2	6	2379495	2379500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303931
51512	NC_015966	TGC	2	6	2379524	2379529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303931
51513	NC_015966	GCCC	2	8	2379537	2379544	0 %	0 %	25 %	75 %	345303931
51514	NC_015966	GCAAG	2	10	2379625	2379634	40 %	0 %	40 %	20 %	345303932
51515	NC_015966	TGC	2	6	2379660	2379665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303932
51516	NC_015966	GCA	2	6	2379673	2379678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303932
51517	NC_015966	GCT	2	6	2379703	2379708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303932
51518	NC_015966	CAG	2	6	2379716	2379721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303932
51519	NC_015966	GAA	2	6	2379737	2379742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303932
51520	NC_015966	CG	3	6	2379793	2379798	0 %	0 %	50 %	50 %	345303932
51521	NC_015966	AGC	2	6	2379879	2379884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303932
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51525	NC_015966	GAAGCC	2	12	2379998	2380009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303932
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51527	NC_015966	GC	3	6	2380018	2380023	0 %	0 %	50 %	50 %	345303932
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51530	NC_015966	GCGT	2	8	2380072	2380079	0 %	25 %	50 %	25 %	345303932
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51533	NC_015966	GC	3	6	2380223	2380228	0 %	0 %	50 %	50 %	345303933
51534	NC_015966	CTG	2	6	2380276	2380281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303933
51535	NC_015966	CG	3	6	2380301	2380306	0 %	0 %	50 %	50 %	345303933
51536	NC_015966	GCA	2	6	2380314	2380319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303933
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51541	NC_015966	ACA	2	6	2380407	2380412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345303933
51542	NC_015966	CCA	3	9	2380460	2380468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303933
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51602	NC_015966	GCCGC	2	10	2385046	2385055	0 %	0 %	40 %	60 %	345303938
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51609	NC_015966	TGCAGG	2	12	2385328	2385339	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345303938
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51731	NC_015966	CTG	2	6	2390478	2390483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303942
51732	NC_015966	CGC	2	6	2390499	2390504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303942
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51959	NC_015966	GCC	2	6	2400025	2400030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303952
51960	NC_015966	GCA	2	6	2400096	2400101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303952
51961	NC_015966	CTG	2	6	2400115	2400120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303952
51962	NC_015966	CAA	2	6	2400136	2400141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345303952
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51964	NC_015966	CCT	2	6	2400212	2400217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303952
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51966	NC_015966	CTG	2	6	2400274	2400279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303952
51967	NC_015966	TCG	3	9	2400299	2400307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303952
51968	NC_015966	GCC	2	6	2400320	2400325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303952
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51970	NC_015966	ACC	2	6	2400352	2400357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303952
51971	NC_015966	GCA	2	6	2400359	2400364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303952
51972	NC_015966	CGGC	2	8	2400414	2400421	0 %	0 %	50 %	50 %	345303952
51973	NC_015966	CGT	2	6	2400441	2400446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303952
51974	NC_015966	CGA	2	6	2400450	2400455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303952
51975	NC_015966	CAG	2	6	2400609	2400614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303953
51976	NC_015966	CCG	2	6	2400624	2400629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303953
51977	NC_015966	GCG	2	6	2400644	2400649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303953
51978	NC_015966	CTGG	2	8	2400663	2400670	0 %	25 %	50 %	25 %	345303953
51979	NC_015966	CTG	2	6	2400692	2400697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303953
51980	NC_015966	TGC	2	6	2400698	2400703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303953
51981	NC_015966	CTT	2	6	2400707	2400712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303953
51982	NC_015966	CCA	2	6	2400715	2400720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303953
51983	NC_015966	GTGCTG	2	12	2400793	2400804	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345303953
51984	NC_015966	CCG	2	6	2400846	2400851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303953
51985	NC_015966	CTG	2	6	2400877	2400882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303953
51986	NC_015966	TCG	2	6	2400929	2400934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303953
51987	NC_015966	CAG	2	6	2400973	2400978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303953
51988	NC_015966	GCT	2	6	2400984	2400989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303953
51989	NC_015966	CCTGCC	2	12	2400996	2401007	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	345303953
51990	NC_015966	CAC	2	6	2401068	2401073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303953
51991	NC_015966	GACC	2	8	2401095	2401102	25 %	0 %	25 %	50 %	345303953
51992	NC_015966	CGT	2	6	2401106	2401111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303953
51993	NC_015966	CCTGC	2	10	2401157	2401166	0 %	20 %	20 %	60 %	345303954
51994	NC_015966	CAG	2	6	2401178	2401183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303954
51995	NC_015966	CAG	2	6	2401193	2401198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303954
51996	NC_015966	ACC	2	6	2401199	2401204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303954
51997	NC_015966	CGC	2	6	2401212	2401217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303954
51998	NC_015966	CGG	2	6	2401225	2401230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303954
51999	NC_015966	GCT	2	6	2401237	2401242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303954
52000	NC_015966	GCT	5	15	2401300	2401314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303954

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