MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_015966	CGGTGC	2	12	2352165	2352176	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345303900
51002	NC_015966	GAC	2	6	2352182	2352187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303900
51003	NC_015966	TGC	2	6	2352194	2352199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303900
51004	NC_015966	TCGGCC	2	12	2352212	2352223	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345303900
51005	NC_015966	CAG	2	6	2352229	2352234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303900
51006	NC_015966	GCCGT	2	10	2352260	2352269	0 %	20 %	40 %	40 %	345303900
51007	NC_015966	GCGT	2	8	2352341	2352348	0 %	25 %	50 %	25 %	345303900
51008	NC_015966	CCA	2	6	2352390	2352395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303900
51009	NC_015966	GC	4	8	2352397	2352404	0 %	0 %	50 %	50 %	345303900
51010	NC_015966	GCC	2	6	2352409	2352414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303900
51011	NC_015966	TCC	2	6	2352419	2352424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303900
51012	NC_015966	GCC	2	6	2352502	2352507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303900
51013	NC_015966	GCC	2	6	2352537	2352542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303900
51014	NC_015966	CAC	2	6	2352574	2352579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303900
51015	NC_015966	GCC	2	6	2352605	2352610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303900
51016	NC_015966	TCC	2	6	2352614	2352619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303900
51017	NC_015966	CG	4	8	2352755	2352762	0 %	0 %	50 %	50 %	345303900
51018	NC_015966	CCG	2	6	2352782	2352787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303900
51019	NC_015966	TGC	2	6	2352824	2352829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303900
51020	NC_015966	TCG	2	6	2352845	2352850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303900
51021	NC_015966	ACCGT	2	10	2352908	2352917	20 %	20 %	20 %	40 %	345303900
51022	NC_015966	TGC	2	6	2352956	2352961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303900
51023	NC_015966	CAG	2	6	2353021	2353026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303900
51024	NC_015966	TTCG	2	8	2353033	2353040	0 %	50 %	25 %	25 %	345303900
51025	NC_015966	TCG	2	6	2353178	2353183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303901
51026	NC_015966	GAC	2	6	2353186	2353191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303901
51027	NC_015966	TTC	2	6	2353219	2353224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303901
51028	NC_015966	CGA	2	6	2353452	2353457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303901
51029	NC_015966	GCC	2	6	2353492	2353497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303901
51030	NC_015966	AACG	2	8	2353517	2353524	50 %	0 %	25 %	25 %	345303901
51031	NC_015966	GCAC	2	8	2353586	2353593	25 %	0 %	25 %	50 %	345303901
51032	NC_015966	CCA	2	6	2353662	2353667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303901
51033	NC_015966	CG	3	6	2353685	2353690	0 %	0 %	50 %	50 %	345303901
51034	NC_015966	AAC	2	6	2353691	2353696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345303901
51035	NC_015966	TCG	2	6	2353718	2353723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303901
51036	NC_015966	A	7	7	2353771	2353777	100 %	0 %	0 %	0 %	345303901
51037	NC_015966	CGA	2	6	2353856	2353861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303901
51038	NC_015966	CCA	2	6	2353871	2353876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303901
51039	NC_015966	GCTT	2	8	2353914	2353921	0 %	50 %	25 %	25 %	345303902
51040	NC_015966	CGAT	2	8	2353963	2353970	25 %	25 %	25 %	25 %	345303902
51041	NC_015966	GTG	2	6	2354043	2354048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303902
51042	NC_015966	CCGTC	2	10	2354117	2354126	0 %	20 %	20 %	60 %	345303902
51043	NC_015966	GCC	2	6	2354145	2354150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303902
51044	NC_015966	GCG	2	6	2354160	2354165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303902
51045	NC_015966	GCC	2	6	2354180	2354185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303902
51046	NC_015966	GCG	2	6	2354193	2354198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303902
51047	NC_015966	CAG	2	6	2354220	2354225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303902
51048	NC_015966	CTC	2	6	2354226	2354231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303902
51049	NC_015966	TCG	2	6	2354257	2354262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303902
51050	NC_015966	TCC	2	6	2354341	2354346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303902
51051	NC_015966	GAT	2	6	2354403	2354408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303902
51052	NC_015966	CCG	2	6	2354483	2354488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303902
51053	NC_015966	CAGCGC	2	12	2354499	2354510	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345303902
51054	NC_015966	CGT	2	6	2354525	2354530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303902
51055	NC_015966	CAG	2	6	2354541	2354546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303902
51056	NC_015966	TTC	2	6	2354611	2354616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303903
51057	NC_015966	GCC	2	6	2354667	2354672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303903
51058	NC_015966	CGT	2	6	2354681	2354686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303903
51059	NC_015966	ACG	2	6	2354701	2354706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303903
51060	NC_015966	CCAGA	2	10	2354772	2354781	40 %	0 %	20 %	40 %	345303903
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51064	NC_015966	CCA	2	6	2355026	2355031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303903
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51066	NC_015966	CG	3	6	2355302	2355307	0 %	0 %	50 %	50 %	345303903
51067	NC_015966	TCG	2	6	2355331	2355336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303903
51068	NC_015966	AGCCG	2	10	2355377	2355386	20 %	0 %	40 %	40 %	345303903
51069	NC_015966	GCA	2	6	2355398	2355403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303903
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51072	NC_015966	CTC	2	6	2355468	2355473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303903
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51075	NC_015966	CTT	2	6	2355596	2355601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303903
51076	NC_015966	CAC	2	6	2355654	2355659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303903
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51082	NC_015966	CCGT	2	8	2355732	2355739	0 %	25 %	25 %	50 %	345303903
51083	NC_015966	TCT	2	6	2355749	2355754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303903
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51087	NC_015966	TTC	2	6	2356092	2356097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303904
51088	NC_015966	CGCC	2	8	2356124	2356131	0 %	0 %	25 %	75 %	345303904
51089	NC_015966	CG	3	6	2356132	2356137	0 %	0 %	50 %	50 %	345303904
51090	NC_015966	GCT	2	6	2356166	2356171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303904
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51100	NC_015966	GCG	2	6	2356488	2356493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303904
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51103	NC_015966	GCC	3	9	2356567	2356575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303904
51104	NC_015966	CAGCC	2	10	2356576	2356585	20 %	0 %	20 %	60 %	345303904
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51114	NC_015966	GCC	2	6	2357066	2357071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303905
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51228	NC_015966	CGA	2	6	2363494	2363499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303914
51229	NC_015966	GTT	2	6	2363551	2363556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303914
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51231	NC_015966	GCT	2	6	2363662	2363667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303914
51232	NC_015966	TCA	2	6	2363670	2363675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303914
51233	NC_015966	TCG	2	6	2363699	2363704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303914
51234	NC_015966	ACG	2	6	2363712	2363717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303914
51235	NC_015966	ACG	2	6	2363745	2363750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303914
51236	NC_015966	CGT	2	6	2363779	2363784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303914
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51238	NC_015966	ATG	2	6	2363825	2363830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303914
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51251	NC_015966	GCCG	2	8	2364603	2364610	0 %	0 %	50 %	50 %	345303915
51252	NC_015966	CGCC	2	8	2364654	2364661	0 %	0 %	25 %	75 %	345303915
51253	NC_015966	ACG	2	6	2364677	2364682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303915
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51303	NC_015966	T	6	6	2368765	2368770	0 %	100 %	0 %	0 %	345303918
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51308	NC_015966	GCT	2	6	2368982	2368987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303918
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51312	NC_015966	ACG	2	6	2369388	2369393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303919
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51314	NC_015966	AGC	2	6	2369519	2369524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303919
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51316	NC_015966	GAA	2	6	2369584	2369589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303919
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51318	NC_015966	GGA	2	6	2369837	2369842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303920
51319	NC_015966	CAG	2	6	2369880	2369885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303920
51320	NC_015966	GCC	2	6	2369961	2369966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303920
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51322	NC_015966	CAG	2	6	2369997	2370002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303920
51323	NC_015966	AATC	2	8	2370099	2370106	50 %	25 %	0 %	25 %	345303921
51324	NC_015966	GCT	2	6	2370176	2370181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303921
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51327	NC_015966	ATC	2	6	2370214	2370219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303921
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51330	NC_015966	TCGGCA	2	12	2370298	2370309	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345303921
51331	NC_015966	AAG	2	6	2370310	2370315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303921
51332	NC_015966	CCTCGA	2	12	2370329	2370340	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345303921
51333	NC_015966	CTT	2	6	2370453	2370458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303921
51334	NC_015966	GGC	2	6	2370460	2370465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303921
51335	NC_015966	TGA	2	6	2370491	2370496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303921
51336	NC_015966	CCA	2	6	2370503	2370508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303921
51337	NC_015966	GCG	2	6	2370539	2370544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303921
51338	NC_015966	TGG	2	6	2370632	2370637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303921
51339	NC_015966	TCCTGC	2	12	2370691	2370702	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	345303921
51340	NC_015966	GCA	2	6	2370710	2370715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303921
51341	NC_015966	CAG	3	9	2370756	2370764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303921
51342	NC_015966	GCC	2	6	2370768	2370773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303921
51343	NC_015966	CGA	2	6	2370854	2370859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303921
51344	NC_015966	CG	3	6	2370863	2370868	0 %	0 %	50 %	50 %	345303921
51345	NC_015966	TGG	2	6	2370922	2370927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303921
51346	NC_015966	TTG	2	6	2370988	2370993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303921
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