MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50002	NC_015966	TGT	2	6	2309356	2309361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303849
50003	NC_015966	CG	3	6	2309452	2309457	0 %	0 %	50 %	50 %	345303849
50004	NC_015966	GAT	3	9	2309492	2309500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303849
50005	NC_015966	CGT	2	6	2309563	2309568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303849
50006	NC_015966	GCA	2	6	2309569	2309574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303849
50007	NC_015966	GCC	2	6	2309580	2309585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303849
50008	NC_015966	CGT	2	6	2309593	2309598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303849
50009	NC_015966	GGT	2	6	2309674	2309679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303849
50010	NC_015966	TCG	2	6	2309727	2309732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303849
50011	NC_015966	CG	3	6	2309734	2309739	0 %	0 %	50 %	50 %	345303849
50012	NC_015966	GCT	2	6	2309779	2309784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303849
50013	NC_015966	TTC	2	6	2309789	2309794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303849
50014	NC_015966	CTT	2	6	2309812	2309817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303849
50015	NC_015966	AGG	2	6	2309820	2309825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303849
50016	NC_015966	TCC	2	6	2310027	2310032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303850
50017	NC_015966	GAA	2	6	2310033	2310038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303850
50018	NC_015966	AGC	2	6	2310047	2310052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303850
50019	NC_015966	CCGCTT	2	12	2310067	2310078	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	345303850
50020	NC_015966	GTC	2	6	2310084	2310089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303850
50021	NC_015966	GCC	2	6	2310153	2310158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303850
50022	NC_015966	GCC	2	6	2310174	2310179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303850
50023	NC_015966	ACG	2	6	2310194	2310199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303850
50024	NC_015966	CGCGGC	2	12	2310208	2310219	0 %	0 %	50 %	50 %	345303850
50025	NC_015966	CGC	2	6	2310228	2310233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303850
50026	NC_015966	CGGC	2	8	2310247	2310254	0 %	0 %	50 %	50 %	345303850
50027	NC_015966	CGT	2	6	2310259	2310264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303850
50028	NC_015966	CGA	2	6	2310312	2310317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303850
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50031	NC_015966	GAC	2	6	2310349	2310354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303850
50032	NC_015966	CCT	2	6	2310397	2310402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303850
50033	NC_015966	CGG	2	6	2310429	2310434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303850
50034	NC_015966	GTG	2	6	2310441	2310446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303850
50035	NC_015966	TGA	2	6	2310463	2310468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303850
50036	NC_015966	GCCTTG	2	12	2310492	2310503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303850
50037	NC_015966	CGT	2	6	2310509	2310514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303850
50038	NC_015966	GC	3	6	2310538	2310543	0 %	0 %	50 %	50 %	345303850
50039	NC_015966	GCC	2	6	2310552	2310557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303850
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50041	NC_015966	T	7	7	2310602	2310608	0 %	100 %	0 %	0 %	345303850
50042	NC_015966	CTC	2	6	2310709	2310714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303851
50043	NC_015966	GCC	2	6	2310783	2310788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303851
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50047	NC_015966	GCTC	2	8	2310939	2310946	0 %	25 %	25 %	50 %	345303851
50048	NC_015966	TGA	2	6	2310954	2310959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303851
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50050	NC_015966	CTT	2	6	2311005	2311010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303851
50051	NC_015966	CCGT	2	8	2311025	2311032	0 %	25 %	25 %	50 %	345303851
50052	NC_015966	TTCCAG	2	12	2311039	2311050	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345303851
50053	NC_015966	TCT	2	6	2311065	2311070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303851
50054	NC_015966	CG	3	6	2311077	2311082	0 %	0 %	50 %	50 %	345303851
50055	NC_015966	CGGC	2	8	2311176	2311183	0 %	0 %	50 %	50 %	345303851
50056	NC_015966	CCGCGC	2	12	2311190	2311201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303851
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50065	NC_015966	CCAG	2	8	2311822	2311829	25 %	0 %	25 %	50 %	345303852
50066	NC_015966	GGC	2	6	2311879	2311884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303852
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50102	NC_015966	CGT	2	6	2313709	2313714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303857
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50232	NC_015966	GCCC	2	8	2319667	2319674	0 %	0 %	25 %	75 %	345303867
50233	NC_015966	GCT	2	6	2319739	2319744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303867
50234	NC_015966	CCTT	2	8	2319771	2319778	0 %	50 %	0 %	50 %	345303867
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50240	NC_015966	GCG	2	6	2320051	2320056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303868
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50462	NC_015966	GTC	2	6	2329051	2329056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303881
50463	NC_015966	ATG	2	6	2329084	2329089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303881
50464	NC_015966	GTC	2	6	2329231	2329236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303882
50465	NC_015966	CTT	3	9	2329237	2329245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303882
50466	NC_015966	GCC	2	6	2329271	2329276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303882
50467	NC_015966	GC	3	6	2329318	2329323	0 %	0 %	50 %	50 %	345303882
50468	NC_015966	GAT	2	6	2329336	2329341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303882
50469	NC_015966	CCAC	2	8	2329406	2329413	25 %	0 %	0 %	75 %	345303882
50470	NC_015966	GCG	2	6	2329414	2329419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303882
50471	NC_015966	CAG	2	6	2329432	2329437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303882
50472	NC_015966	CGGCG	2	10	2329438	2329447	0 %	0 %	60 %	40 %	345303882
50473	NC_015966	CCGC	2	8	2329455	2329462	0 %	0 %	25 %	75 %	345303882
50474	NC_015966	CTC	2	6	2329495	2329500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303882
50475	NC_015966	TCT	2	6	2329527	2329532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303882
50476	NC_015966	CTT	2	6	2329543	2329548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303882
50477	NC_015966	GC	3	6	2329576	2329581	0 %	0 %	50 %	50 %	345303882
50478	NC_015966	TCG	2	6	2329589	2329594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303882
50479	NC_015966	GTC	2	6	2329620	2329625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303882
50480	NC_015966	CGTAC	2	10	2329725	2329734	20 %	20 %	20 %	40 %	345303883
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50482	NC_015966	CTT	2	6	2329950	2329955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303883
50483	NC_015966	GTG	3	9	2329960	2329968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303883
50484	NC_015966	CG	3	6	2329973	2329978	0 %	0 %	50 %	50 %	345303883
50485	NC_015966	ACG	2	6	2329989	2329994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303883
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50489	NC_015966	TCC	2	6	2330401	2330406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303884
50490	NC_015966	CCA	2	6	2330462	2330467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303884
50491	NC_015966	AGC	2	6	2330497	2330502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303884
50492	NC_015966	CGG	2	6	2330503	2330508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303884
50493	NC_015966	TTC	2	6	2330535	2330540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303884
50494	NC_015966	CGG	2	6	2330548	2330553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303884
50495	NC_015966	TGA	2	6	2330573	2330578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303884
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50497	NC_015966	GCCGT	2	10	2330603	2330612	0 %	20 %	40 %	40 %	345303884
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50499	NC_015966	GAA	2	6	2330634	2330639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303884
50500	NC_015966	CGCT	2	8	2330689	2330696	0 %	25 %	25 %	50 %	345303884

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