MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia heilongjiangensis 054 chromosome

Total Repeats: 24673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015866	ATT	2	6	408	413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583223
2	NC_015866	TTC	2	6	428	433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583223
3	NC_015866	GCA	2	6	453	458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583223
4	NC_015866	TAT	2	6	577	582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583223
5	NC_015866	ATT	2	6	669	674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583223
6	NC_015866	T	6	6	688	693	0 %	100 %	0 %	0 %	341583223
7	NC_015866	ATG	2	6	787	792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583223
8	NC_015866	ATA	2	6	828	833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583223
9	NC_015866	GCT	2	6	900	905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583223
10	NC_015866	GTA	2	6	969	974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583223
11	NC_015866	TTA	2	6	982	987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583223
12	NC_015866	CAG	2	6	1162	1167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583223
13	NC_015866	TAA	2	6	1171	1176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583223
14	NC_015866	AT	3	6	1182	1187	50 %	50 %	0 %	0 %	341583223
15	NC_015866	A	6	6	1196	1201	100 %	0 %	0 %	0 %	341583223
16	NC_015866	ATA	2	6	1207	1212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583223
17	NC_015866	ATA	2	6	1438	1443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583224
18	NC_015866	AAAGTA	2	12	1471	1482	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	341583224
19	NC_015866	TGA	2	6	1497	1502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583224
20	NC_015866	GTA	2	6	1535	1540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583224
21	NC_015866	CAA	2	6	1597	1602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583224
22	NC_015866	A	8	8	1601	1608	100 %	0 %	0 %	0 %	341583224
23	NC_015866	TAA	2	6	1626	1631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583224
24	NC_015866	TCT	2	6	1746	1751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583225
25	NC_015866	A	6	6	1754	1759	100 %	0 %	0 %	0 %	341583225
26	NC_015866	TC	3	6	1764	1769	0 %	50 %	0 %	50 %	341583225
27	NC_015866	A	6	6	1824	1829	100 %	0 %	0 %	0 %	341583225
28	NC_015866	AT	3	6	1889	1894	50 %	50 %	0 %	0 %	341583225
29	NC_015866	TA	3	6	2007	2012	50 %	50 %	0 %	0 %	341583225
30	NC_015866	ATA	3	9	2010	2018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583225
31	NC_015866	A	7	7	2036	2042	100 %	0 %	0 %	0 %	341583225
32	NC_015866	TGG	2	6	2074	2079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341583225
33	NC_015866	TGA	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583225
34	NC_015866	GAA	2	6	2233	2238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583225
35	NC_015866	AAT	2	6	2263	2268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583225
36	NC_015866	AAG	2	6	2280	2285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583225
37	NC_015866	TTA	2	6	2318	2323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583225
38	NC_015866	CAA	3	9	2381	2389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583225
39	NC_015866	T	8	8	2413	2420	0 %	100 %	0 %	0 %	341583226
40	NC_015866	A	6	6	2423	2428	100 %	0 %	0 %	0 %	341583226
41	NC_015866	T	6	6	2488	2493	0 %	100 %	0 %	0 %	341583226
42	NC_015866	T	7	7	2548	2554	0 %	100 %	0 %	0 %	341583226
43	NC_015866	T	6	6	2557	2562	0 %	100 %	0 %	0 %	341583226
44	NC_015866	GA	3	6	2575	2580	50 %	0 %	50 %	0 %	341583226
45	NC_015866	CGG	2	6	2602	2607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583226
46	NC_015866	AGC	2	6	2633	2638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583226
47	NC_015866	ATA	2	6	2678	2683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583226
48	NC_015866	A	7	7	2683	2689	100 %	0 %	0 %	0 %	341583226
49	NC_015866	T	7	7	2707	2713	0 %	100 %	0 %	0 %	341583226
50	NC_015866	TA	3	6	2739	2744	50 %	50 %	0 %	0 %	341583226
51	NC_015866	TTTTA	2	10	2779	2788	20 %	80 %	0 %	0 %	341583226
52	NC_015866	ATA	2	6	2816	2821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583226
53	NC_015866	TAA	2	6	2847	2852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583226
54	NC_015866	TTAT	2	8	2940	2947	25 %	75 %	0 %	0 %	341583226
55	NC_015866	AT	3	6	2999	3004	50 %	50 %	0 %	0 %	341583226
56	NC_015866	ATG	2	6	3077	3082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583226
57	NC_015866	TAT	2	6	3097	3102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583226
58	NC_015866	TTA	2	6	3111	3116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583226
59	NC_015866	ATTTA	2	10	3132	3141	40 %	60 %	0 %	0 %	341583226
60	NC_015866	TTAT	2	8	3162	3169	25 %	75 %	0 %	0 %	341583226
61	NC_015866	A	6	6	3226	3231	100 %	0 %	0 %	0 %	341583227
62	NC_015866	CTC	2	6	3308	3313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583227
63	NC_015866	TC	3	6	3312	3317	0 %	50 %	0 %	50 %	341583227
64	NC_015866	ATT	2	6	3332	3337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583227
65	NC_015866	T	6	6	3375	3380	0 %	100 %	0 %	0 %	341583227
66	NC_015866	ATT	2	6	3445	3450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583227
67	NC_015866	A	7	7	3489	3495	100 %	0 %	0 %	0 %	341583227
68	NC_015866	A	6	6	3506	3511	100 %	0 %	0 %	0 %	341583227
69	NC_015866	CAAA	2	8	3591	3598	75 %	0 %	0 %	25 %	341583227
70	NC_015866	AGA	2	6	3618	3623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583227
71	NC_015866	AGA	2	6	3633	3638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583227
72	NC_015866	AGC	2	6	3648	3653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583227
73	NC_015866	TGC	2	6	3660	3665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583227
74	NC_015866	TG	3	6	3680	3685	0 %	50 %	50 %	0 %	341583227
75	NC_015866	A	7	7	3760	3766	100 %	0 %	0 %	0 %	341583227
76	NC_015866	A	7	7	3779	3785	100 %	0 %	0 %	0 %	341583227
77	NC_015866	GA	3	6	3787	3792	50 %	0 %	50 %	0 %	341583227
78	NC_015866	T	6	6	3816	3821	0 %	100 %	0 %	0 %	341583227
79	NC_015866	ATT	2	6	3851	3856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583227
80	NC_015866	TATT	2	8	3858	3865	25 %	75 %	0 %	0 %	341583227
81	NC_015866	GAG	2	6	3925	3930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583227
82	NC_015866	TCGC	2	8	3985	3992	0 %	25 %	25 %	50 %	341583227
83	NC_015866	A	6	6	4028	4033	100 %	0 %	0 %	0 %	341583227
84	NC_015866	TAT	2	6	4086	4091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583227
85	NC_015866	GCA	2	6	4114	4119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583227
86	NC_015866	AGA	2	6	4212	4217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583227
87	NC_015866	AT	3	6	4246	4251	50 %	50 %	0 %	0 %	341583227
88	NC_015866	CTA	2	6	4307	4312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583227
89	NC_015866	TAT	2	6	4363	4368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583227
90	NC_015866	TTA	2	6	4369	4374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583227
91	NC_015866	GGTCA	2	10	4376	4385	20 %	20 %	40 %	20 %	341583227
92	NC_015866	TGT	2	6	4389	4394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583227
93	NC_015866	AT	3	6	4556	4561	50 %	50 %	0 %	0 %	341583227
94	NC_015866	AG	3	6	4575	4580	50 %	0 %	50 %	0 %	341583227
95	NC_015866	ATA	2	6	4583	4588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583227
96	NC_015866	TA	3	6	4663	4668	50 %	50 %	0 %	0 %	341583227
97	NC_015866	GGC	2	6	4834	4839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583227
98	NC_015866	GCA	2	6	4858	4863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583227
99	NC_015866	A	6	6	4885	4890	100 %	0 %	0 %	0 %	341583227
100	NC_015866	TA	3	6	4915	4920	50 %	50 %	0 %	0 %	341583227
101	NC_015866	GGA	2	6	4935	4940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583227
102	NC_015866	GAA	2	6	4957	4962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583227
103	NC_015866	AAG	2	6	4988	4993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583227
104	NC_015866	AAT	2	6	4999	5004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583227
105	NC_015866	GAA	2	6	5005	5010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583227
106	NC_015866	TAA	2	6	5025	5030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583227
107	NC_015866	CTA	2	6	5049	5054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583227
108	NC_015866	TAAAT	2	10	5085	5094	60 %	40 %	0 %	0 %	341583227
109	NC_015866	AT	3	6	5107	5112	50 %	50 %	0 %	0 %	341583227
110	NC_015866	AAAACC	2	12	5311	5322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583227
111	NC_015866	AGT	2	6	5410	5415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583227
112	NC_015866	AAG	2	6	5441	5446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583227
113	NC_015866	ACG	2	6	5450	5455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583227
114	NC_015866	ATA	2	6	5477	5482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583227
115	NC_015866	ATT	2	6	5528	5533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583227
116	NC_015866	TAA	2	6	5550	5555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583227
117	NC_015866	AATA	2	8	5556	5563	75 %	25 %	0 %	0 %	341583227
118	NC_015866	GAT	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583227
119	NC_015866	ATTC	2	8	5593	5600	25 %	50 %	0 %	25 %	341583227
120	NC_015866	TGC	2	6	5607	5612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583227
121	NC_015866	T	6	6	5635	5640	0 %	100 %	0 %	0 %	341583227
122	NC_015866	ATT	2	6	5651	5656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583227
123	NC_015866	TGC	2	6	5664	5669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583227
124	NC_015866	CTA	2	6	5759	5764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583227
125	NC_015866	AGT	2	6	5796	5801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583227
126	NC_015866	CGC	2	6	5822	5827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583227
127	NC_015866	A	7	7	5845	5851	100 %	0 %	0 %	0 %	341583227
128	NC_015866	TTG	2	6	5858	5863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583227
129	NC_015866	TTA	2	6	5887	5892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583227
130	NC_015866	ATA	2	6	5909	5914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583227
131	NC_015866	TAA	2	6	5978	5983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583227
132	NC_015866	ATA	2	6	6001	6006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583227
133	NC_015866	GAA	2	6	6007	6012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583227
134	NC_015866	A	6	6	6024	6029	100 %	0 %	0 %	0 %	341583227
135	NC_015866	ATA	2	6	6055	6060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583227
136	NC_015866	ATG	2	6	6088	6093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583227
137	NC_015866	AT	3	6	6141	6146	50 %	50 %	0 %	0 %	341583227
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269	NC_015866	TTA	2	6	15364	15369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583238
270	NC_015866	TAC	2	6	15370	15375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583238
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273	NC_015866	TAA	2	6	15442	15447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583238
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388	NC_015866	AGCA	2	8	21514	21521	50 %	0 %	25 %	25 %	341583243
389	NC_015866	TAA	2	6	21551	21556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583243
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393	NC_015866	A	6	6	21615	21620	100 %	0 %	0 %	0 %	341583243
394	NC_015866	AAG	2	6	21622	21627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583243
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