MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia heilongjiangensis 054 chromosome

Total Repeats: 24673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015866	TTGA	2	8	200986	200993	25 %	50 %	25 %	0 %	341583416
4002	NC_015866	A	6	6	201024	201029	100 %	0 %	0 %	0 %	341583416
4003	NC_015866	AGC	2	6	201119	201124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583416
4004	NC_015866	T	6	6	201150	201155	0 %	100 %	0 %	0 %	341583416
4005	NC_015866	A	6	6	201230	201235	100 %	0 %	0 %	0 %	341583416
4006	NC_015866	CTT	2	6	201289	201294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583416
4007	NC_015866	TAA	2	6	201311	201316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583416
4008	NC_015866	T	6	6	201403	201408	0 %	100 %	0 %	0 %	341583416
4009	NC_015866	GCA	2	6	201414	201419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583416
4010	NC_015866	TAAAA	2	10	201440	201449	80 %	20 %	0 %	0 %	341583416
4011	NC_015866	CTG	2	6	201493	201498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583416
4012	NC_015866	T	6	6	201501	201506	0 %	100 %	0 %	0 %	341583416
4013	NC_015866	TAGCA	2	10	201551	201560	40 %	20 %	20 %	20 %	341583416
4014	NC_015866	T	6	6	201569	201574	0 %	100 %	0 %	0 %	341583416
4015	NC_015866	TTC	2	6	201596	201601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583416
4016	NC_015866	ATC	2	6	201632	201637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583416
4017	NC_015866	ATT	2	6	201699	201704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583416
4018	NC_015866	T	6	6	201741	201746	0 %	100 %	0 %	0 %	341583416
4019	NC_015866	ATT	2	6	201747	201752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583416
4020	NC_015866	AT	3	6	201807	201812	50 %	50 %	0 %	0 %	341583416
4021	NC_015866	AGT	2	6	201821	201826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583416
4022	NC_015866	GTT	2	6	201934	201939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583416
4023	NC_015866	TAA	3	9	201944	201952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583416
4024	NC_015866	TTG	2	6	201956	201961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583416
4025	NC_015866	TCT	2	6	202369	202374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583417
4026	NC_015866	TAAAG	2	10	202426	202435	60 %	20 %	20 %	0 %	341583417
4027	NC_015866	ATA	2	6	202442	202447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583417
4028	NC_015866	AAAG	2	8	202562	202569	75 %	0 %	25 %	0 %	341583417
4029	NC_015866	A	6	6	202633	202638	100 %	0 %	0 %	0 %	341583417
4030	NC_015866	AAAG	2	8	202714	202721	75 %	0 %	25 %	0 %	341583417
4031	NC_015866	ATA	2	6	202800	202805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583417
4032	NC_015866	GCT	2	6	202946	202951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583417
4033	NC_015866	TA	3	6	202986	202991	50 %	50 %	0 %	0 %	341583417
4034	NC_015866	TCA	2	6	203018	203023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583417
4035	NC_015866	T	6	6	203033	203038	0 %	100 %	0 %	0 %	341583417
4036	NC_015866	GGC	2	6	203041	203046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583417
4037	NC_015866	ATTA	2	8	203142	203149	50 %	50 %	0 %	0 %	341583418
4038	NC_015866	ATT	2	6	203268	203273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583418
4039	NC_015866	CCA	2	6	203319	203324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341583418
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4041	NC_015866	T	6	6	203396	203401	0 %	100 %	0 %	0 %	341583418
4042	NC_015866	AGCA	2	8	203417	203424	50 %	0 %	25 %	25 %	341583418
4043	NC_015866	CAG	2	6	203428	203433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583418
4044	NC_015866	T	6	6	203450	203455	0 %	100 %	0 %	0 %	341583418
4045	NC_015866	ATC	2	6	203492	203497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583418
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4047	NC_015866	GCT	2	6	203586	203591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583418
4048	NC_015866	TAT	2	6	203650	203655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583418
4049	NC_015866	ATTA	2	8	203669	203676	50 %	50 %	0 %	0 %	341583418
4050	NC_015866	GAT	2	6	203708	203713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583418
4051	NC_015866	ATC	2	6	203744	203749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583418
4052	NC_015866	ATT	2	6	203753	203758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583418
4053	NC_015866	TGC	2	6	203774	203779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583418
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4056	NC_015866	TATT	2	8	204212	204219	25 %	75 %	0 %	0 %	341583419
4057	NC_015866	AAG	2	6	204257	204262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583419
4058	NC_015866	TTA	2	6	204268	204273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583419
4059	NC_015866	TTA	2	6	204299	204304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583419
4060	NC_015866	TTG	2	6	204319	204324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583419
4061	NC_015866	TTA	2	6	204352	204357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583419
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4064	NC_015866	ATA	2	6	204476	204481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583419
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4068	NC_015866	T	7	7	204659	204665	0 %	100 %	0 %	0 %	341583420
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4071	NC_015866	ATT	2	6	204773	204778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583420
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4073	NC_015866	ATA	2	6	204813	204818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583420
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4079	NC_015866	AT	3	6	205044	205049	50 %	50 %	0 %	0 %	341583420
4080	NC_015866	T	6	6	205140	205145	0 %	100 %	0 %	0 %	341583420
4081	NC_015866	T	6	6	205154	205159	0 %	100 %	0 %	0 %	341583420
4082	NC_015866	ATA	2	6	205185	205190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583420
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4084	NC_015866	TC	3	6	205210	205215	0 %	50 %	0 %	50 %	341583420
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4088	NC_015866	T	7	7	205658	205664	0 %	100 %	0 %	0 %	341583421
4089	NC_015866	AAT	2	6	205690	205695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583421
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4091	NC_015866	TTC	2	6	205803	205808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583421
4092	NC_015866	CATT	2	8	205936	205943	25 %	50 %	0 %	25 %	341583421
4093	NC_015866	TTTA	2	8	205959	205966	25 %	75 %	0 %	0 %	341583421
4094	NC_015866	AAT	2	6	205975	205980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583421
4095	NC_015866	CATT	2	8	206017	206024	25 %	50 %	0 %	25 %	341583421
4096	NC_015866	TGC	2	6	206025	206030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583421
4097	NC_015866	CTA	2	6	206063	206068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583421
4098	NC_015866	CAT	2	6	206078	206083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583421
4099	NC_015866	TCA	2	6	206170	206175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583421
4100	NC_015866	TAA	2	6	206190	206195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583421
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4104	NC_015866	CAAG	2	8	206312	206319	50 %	0 %	25 %	25 %	341583421
4105	NC_015866	ATG	2	6	206356	206361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583421
4106	NC_015866	GAATT	2	10	206366	206375	40 %	40 %	20 %	0 %	341583421
4107	NC_015866	CGC	2	6	206411	206416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583421
4108	NC_015866	T	6	6	206509	206514	0 %	100 %	0 %	0 %	341583421
4109	NC_015866	GCT	2	6	206524	206529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583421
4110	NC_015866	TGA	2	6	206538	206543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583421
4111	NC_015866	TGAT	2	8	206616	206623	25 %	50 %	25 %	0 %	341583421
4112	NC_015866	TAG	2	6	206696	206701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583421
4113	NC_015866	AAT	2	6	206780	206785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583421
4114	NC_015866	ATTT	3	12	206807	206818	25 %	75 %	0 %	0 %	341583421
4115	NC_015866	AAGCCC	2	12	206826	206837	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	341583421
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4117	NC_015866	TGC	2	6	206931	206936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583421
4118	NC_015866	TAC	2	6	206945	206950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583421
4119	NC_015866	A	6	6	206957	206962	100 %	0 %	0 %	0 %	341583421
4120	NC_015866	AT	3	6	207037	207042	50 %	50 %	0 %	0 %	341583421
4121	NC_015866	CAG	2	6	207184	207189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583422
4122	NC_015866	TAAA	2	8	207232	207239	75 %	25 %	0 %	0 %	341583422
4123	NC_015866	ATA	2	6	207252	207257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583422
4124	NC_015866	TAA	2	6	207311	207316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583422
4125	NC_015866	ATT	2	6	207341	207346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583422
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4128	NC_015866	GAT	2	6	207411	207416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583422
4129	NC_015866	ATA	2	6	207435	207440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583422
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4235	NC_015866	ATA	2	6	212927	212932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583428
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4243	NC_015866	TTAAA	2	10	215077	215086	60 %	40 %	0 %	0 %	341583430
4244	NC_015866	ACC	2	6	215186	215191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341583430
4245	NC_015866	TAAAT	2	10	215222	215231	60 %	40 %	0 %	0 %	341583430
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4252	NC_015866	TAT	2	6	215431	215436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583430
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4359	NC_015866	ATT	2	6	220234	220239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583434
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4365	NC_015866	TA	3	6	220431	220436	50 %	50 %	0 %	0 %	341583434
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