MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL02

Total Repeats: 1714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015704	TCC	2	6	113	118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338215080
2	NC_015704	T	6	6	127	132	0 %	100 %	0 %	0 %	338215080
3	NC_015704	GT	3	6	170	175	0 %	50 %	50 %	0 %	338215080
4	NC_015704	GTA	2	6	178	183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215080
5	NC_015704	GTA	2	6	250	255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215080
6	NC_015704	ATG	2	6	269	274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215080
7	NC_015704	GCA	2	6	341	346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215080
8	NC_015704	GAA	2	6	349	354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215080
9	NC_015704	AAT	2	6	471	476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215080
10	NC_015704	ATCA	2	8	520	527	50 %	25 %	0 %	25 %	338215081
11	NC_015704	CCA	2	6	537	542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215081
12	NC_015704	TGATGT	2	12	549	560	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338215081
13	NC_015704	T	7	7	585	591	0 %	100 %	0 %	0 %	338215081
14	NC_015704	TTC	2	6	631	636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215081
15	NC_015704	CTTTT	2	10	653	662	0 %	80 %	0 %	20 %	338215081
16	NC_015704	CTG	2	6	667	672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215081
17	NC_015704	TTC	2	6	709	714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215081
18	NC_015704	GTTT	2	8	780	787	0 %	75 %	25 %	0 %	338215082
19	NC_015704	TTC	2	6	804	809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215082
20	NC_015704	CAT	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215082
21	NC_015704	TTC	2	6	825	830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215082
22	NC_015704	CCA	2	6	869	874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215082
23	NC_015704	TTTTG	2	10	906	915	0 %	80 %	20 %	0 %	338215082
24	NC_015704	GTTTT	2	10	1017	1026	0 %	80 %	20 %	0 %	338215082
25	NC_015704	GGTA	2	8	1089	1096	25 %	25 %	50 %	0 %	338215082
26	NC_015704	AAT	2	6	1161	1166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215082
27	NC_015704	CAAG	2	8	1232	1239	50 %	0 %	25 %	25 %	338215082
28	NC_015704	CTA	2	6	1250	1255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215082
29	NC_015704	AGAAA	2	10	1309	1318	80 %	0 %	20 %	0 %	338215082
30	NC_015704	AGT	2	6	1332	1337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215082
31	NC_015704	C	6	6	1348	1353	0 %	0 %	0 %	100 %	338215082
32	NC_015704	TTA	2	6	1370	1375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215082
33	NC_015704	CA	3	6	1506	1511	50 %	0 %	0 %	50 %	338215083
34	NC_015704	TAAA	2	8	1552	1559	75 %	25 %	0 %	0 %	338215083
35	NC_015704	TGA	2	6	1649	1654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215084
36	NC_015704	AAGG	2	8	1656	1663	50 %	0 %	50 %	0 %	338215084
37	NC_015704	CAA	2	6	1759	1764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215084
38	NC_015704	TAT	2	6	1803	1808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215084
39	NC_015704	GCC	2	6	1819	1824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215084
40	NC_015704	GCC	2	6	1894	1899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215084
41	NC_015704	TGC	2	6	1938	1943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215084
42	NC_015704	TCT	2	6	1958	1963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215084
43	NC_015704	AT	3	6	1987	1992	50 %	50 %	0 %	0 %	338215085
44	NC_015704	T	6	6	1995	2000	0 %	100 %	0 %	0 %	338215085
45	NC_015704	AATG	2	8	2020	2027	50 %	25 %	25 %	0 %	338215085
46	NC_015704	GAA	2	6	2059	2064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215085
47	NC_015704	GGTG	2	8	2244	2251	0 %	25 %	75 %	0 %	338215085
48	NC_015704	CAC	2	6	2278	2283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215085
49	NC_015704	CAA	2	6	2336	2341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215085
50	NC_015704	ATTC	2	8	2369	2376	25 %	50 %	0 %	25 %	338215086
51	NC_015704	GCA	2	6	2410	2415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215086
52	NC_015704	GAA	2	6	2467	2472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215086
53	NC_015704	TTTG	2	8	2508	2515	0 %	75 %	25 %	0 %	338215086
54	NC_015704	TGGG	2	8	2552	2559	0 %	25 %	75 %	0 %	338215086
55	NC_015704	TCT	2	6	2567	2572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215086
56	NC_015704	TCA	2	6	2663	2668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215086
57	NC_015704	GAA	2	6	2695	2700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215086
58	NC_015704	TTG	2	6	2737	2742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215086
59	NC_015704	CTA	2	6	2852	2857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215087
60	NC_015704	CGC	2	6	2858	2863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215087
61	NC_015704	CAT	2	6	2906	2911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215087
62	NC_015704	GCAG	2	8	2955	2962	25 %	0 %	50 %	25 %	338215087
63	NC_015704	T	6	6	2968	2973	0 %	100 %	0 %	0 %	338215087
64	NC_015704	ATG	2	6	2980	2985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215087
65	NC_015704	T	6	6	3045	3050	0 %	100 %	0 %	0 %	338215087
66	NC_015704	A	6	6	3136	3141	100 %	0 %	0 %	0 %	338215088
67	NC_015704	TGAAA	2	10	3226	3235	60 %	20 %	20 %	0 %	338215088
68	NC_015704	ATACG	2	10	3268	3277	40 %	20 %	20 %	20 %	338215088
69	NC_015704	GAT	2	6	3356	3361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215088
70	NC_015704	CAA	2	6	3397	3402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215088
71	NC_015704	ACGA	2	8	3420	3427	50 %	0 %	25 %	25 %	338215088
72	NC_015704	CTT	2	6	3486	3491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215088
73	NC_015704	CAG	2	6	3512	3517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215088
74	NC_015704	ACT	2	6	3523	3528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215088
75	NC_015704	TTCG	2	8	3712	3719	0 %	50 %	25 %	25 %	338215088
76	NC_015704	AAT	2	6	3818	3823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215088
77	NC_015704	CAG	2	6	3862	3867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215088
78	NC_015704	ATG	2	6	3902	3907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215088
79	NC_015704	CT	3	6	3908	3913	0 %	50 %	0 %	50 %	338215088
80	NC_015704	TA	3	6	3924	3929	50 %	50 %	0 %	0 %	338215088
81	NC_015704	TAG	2	6	3939	3944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215088
82	NC_015704	GAA	2	6	4061	4066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215088
83	NC_015704	CAA	2	6	4075	4080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215088
84	NC_015704	GCG	3	9	4163	4171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215088
85	NC_015704	ATT	2	6	4222	4227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215088
86	NC_015704	T	6	6	4339	4344	0 %	100 %	0 %	0 %	338215088
87	NC_015704	TGG	2	6	4392	4397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215088
88	NC_015704	T	6	6	4403	4408	0 %	100 %	0 %	0 %	338215088
89	NC_015704	TCGAA	2	10	4433	4442	40 %	20 %	20 %	20 %	338215088
90	NC_015704	AAC	2	6	4490	4495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215088
91	NC_015704	TAC	2	6	4502	4507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215088
92	NC_015704	TGG	2	6	4536	4541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215088
93	NC_015704	CGA	2	6	4654	4659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215088
94	NC_015704	TTG	2	6	4685	4690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215088
95	NC_015704	GAA	2	6	4702	4707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215088
96	NC_015704	GTC	2	6	4720	4725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215088
97	NC_015704	AAAT	2	8	4846	4853	75 %	25 %	0 %	0 %	338215088
98	NC_015704	TTA	2	6	4933	4938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215088
99	NC_015704	ACT	2	6	4956	4961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215088
100	NC_015704	ATA	2	6	5022	5027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215088
101	NC_015704	ACC	2	6	5034	5039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215088
102	NC_015704	ATTATG	2	12	5063	5074	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	338215088
103	NC_015704	CTT	2	6	5173	5178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215088
104	NC_015704	AGT	2	6	5224	5229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215088
105	NC_015704	GAT	2	6	5243	5248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215088
106	NC_015704	TAT	2	6	5278	5283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215088
107	NC_015704	CAA	2	6	5284	5289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215088
108	NC_015704	CAT	2	6	5383	5388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215088
109	NC_015704	TGC	2	6	5445	5450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215088
110	NC_015704	GCG	2	6	5518	5523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215088
111	NC_015704	GGA	2	6	5530	5535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338215088
112	NC_015704	GAAC	2	8	5606	5613	50 %	0 %	25 %	25 %	338215088
113	NC_015704	T	6	6	5695	5700	0 %	100 %	0 %	0 %	338215089
114	NC_015704	TGT	2	6	5724	5729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215089
115	NC_015704	CTT	2	6	5783	5788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215089
116	NC_015704	A	7	7	5820	5826	100 %	0 %	0 %	0 %	338215089
117	NC_015704	GCG	2	6	5834	5839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215089
118	NC_015704	ATT	2	6	5962	5967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215089
119	NC_015704	ATGA	2	8	6049	6056	50 %	25 %	25 %	0 %	338215089
120	NC_015704	GA	3	6	6091	6096	50 %	0 %	50 %	0 %	338215089
121	NC_015704	TAC	2	6	6127	6132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215089
122	NC_015704	GGCA	2	8	6162	6169	25 %	0 %	50 %	25 %	338215089
123	NC_015704	TTTAAC	2	12	6250	6261	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338215089
124	NC_015704	ATG	2	6	6281	6286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215089
125	NC_015704	AAG	2	6	6362	6367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215089
126	NC_015704	TGAAA	2	10	6414	6423	60 %	20 %	20 %	0 %	338215089
127	NC_015704	ACCG	2	8	6464	6471	25 %	0 %	25 %	50 %	338215089
128	NC_015704	AGA	2	6	6537	6542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215089
129	NC_015704	GAA	2	6	6595	6600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215089
130	NC_015704	A	6	6	6607	6612	100 %	0 %	0 %	0 %	338215089
131	NC_015704	TGA	2	6	6621	6626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215089
132	NC_015704	GATT	2	8	6814	6821	25 %	50 %	25 %	0 %	338215090
133	NC_015704	T	7	7	6820	6826	0 %	100 %	0 %	0 %	338215090
134	NC_015704	AAG	2	6	6959	6964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215090
135	NC_015704	GGT	2	6	7046	7051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215090
136	NC_015704	TTGGT	2	10	7309	7318	0 %	60 %	40 %	0 %	338215090
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253	NC_015704	TCA	2	6	15251	15256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215098
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256	NC_015704	ATT	2	6	15333	15338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215098
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259	NC_015704	A	6	6	15457	15462	100 %	0 %	0 %	0 %	338215098
260	NC_015704	TTA	2	6	15493	15498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215098
261	NC_015704	CAAA	2	8	15535	15542	75 %	0 %	0 %	25 %	338215098
262	NC_015704	CT	3	6	15590	15595	0 %	50 %	0 %	50 %	338215098
263	NC_015704	GAT	2	6	15647	15652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215098
264	NC_015704	TCA	2	6	15655	15660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215098
265	NC_015704	ATC	2	6	15726	15731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215098
266	NC_015704	GTC	2	6	15905	15910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215098
267	NC_015704	TTA	2	6	15943	15948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215098
268	NC_015704	TTA	2	6	15997	16002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215098
269	NC_015704	CAA	2	6	16049	16054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215098
270	NC_015704	AAC	2	6	16077	16082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215098
271	NC_015704	CAT	2	6	16227	16232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215098
272	NC_015704	ATC	2	6	16269	16274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215098
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275	NC_015704	ATT	2	6	16413	16418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215098
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280	NC_015704	AAAT	2	8	16557	16564	75 %	25 %	0 %	0 %	338215098
281	NC_015704	ATT	2	6	16608	16613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215098
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288	NC_015704	AAGG	2	8	16890	16897	50 %	0 %	50 %	0 %	338215098
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292	NC_015704	T	7	7	17041	17047	0 %	100 %	0 %	0 %	338215098
293	NC_015704	ATA	2	6	17049	17054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215098
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301	NC_015704	T	6	6	17309	17314	0 %	100 %	0 %	0 %	338215099
302	NC_015704	GCA	2	6	17365	17370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215099
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345	NC_015704	CTCA	2	8	18934	18941	25 %	25 %	0 %	50 %	338215100
346	NC_015704	TTC	2	6	18994	18999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215101
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354	NC_015704	CAAA	2	8	19338	19345	75 %	0 %	0 %	25 %	338215102
355	NC_015704	CAA	2	6	19664	19669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215103
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358	NC_015704	TCA	2	6	19760	19765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215103
359	NC_015704	TGT	2	6	19829	19834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215103
360	NC_015704	TCG	2	6	19867	19872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215103
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362	NC_015704	GTT	3	9	19898	19906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215103
363	NC_015704	TTC	2	6	20659	20664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215104
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366	NC_015704	GGC	2	6	20994	20999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215104
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368	NC_015704	T	7	7	21063	21069	0 %	100 %	0 %	0 %	338215104
369	NC_015704	ATC	2	6	21253	21258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215105
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372	NC_015704	CTTA	2	8	21317	21324	25 %	50 %	0 %	25 %	338215105
373	NC_015704	TGAT	2	8	21353	21360	25 %	50 %	25 %	0 %	338215105
374	NC_015704	CAC	2	6	21368	21373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215105
375	NC_015704	TGA	2	6	21447	21452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215105
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377	NC_015704	CAA	2	6	21526	21531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215105
378	NC_015704	CGC	2	6	21532	21537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215105
379	NC_015704	GGT	2	6	21640	21645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215105
380	NC_015704	TGA	2	6	21651	21656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215105
381	NC_015704	AATA	2	8	21814	21821	75 %	25 %	0 %	0 %	338215105
382	NC_015704	A	6	6	21838	21843	100 %	0 %	0 %	0 %	338215105
383	NC_015704	TGC	2	6	21879	21884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215105
384	NC_015704	CATTT	2	10	21891	21900	20 %	60 %	0 %	20 %	338215105
385	NC_015704	ATG	2	6	21923	21928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215105
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387	NC_015704	TCCTA	2	10	21975	21984	20 %	40 %	0 %	40 %	338215105
388	NC_015704	GGT	2	6	21991	21996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215105
389	NC_015704	GAA	2	6	22027	22032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215105
390	NC_015704	TTA	2	6	22034	22039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215105
391	NC_015704	ACA	2	6	22099	22104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215106
392	NC_015704	CAAA	2	8	22110	22117	75 %	0 %	0 %	25 %	338215106
393	NC_015704	TGA	2	6	22164	22169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215106
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395	NC_015704	A	6	6	22391	22396	100 %	0 %	0 %	0 %	338215106
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