MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL05

Total Repeats: 656

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015695	AATG	2	8	151	158	50 %	25 %	25 %	0 %	338215005
2	NC_015695	TCA	2	6	196	201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215005
3	NC_015695	GCA	2	6	208	213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215005
4	NC_015695	AAT	2	6	233	238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215005
5	NC_015695	T	8	8	246	253	0 %	100 %	0 %	0 %	338215005
6	NC_015695	GAA	2	6	257	262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215005
7	NC_015695	ATT	2	6	266	271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215005
8	NC_015695	GTT	2	6	326	331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215005
9	NC_015695	TCT	2	6	344	349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215005
10	NC_015695	AGA	2	6	375	380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215005
11	NC_015695	CAG	2	6	404	409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215005
12	NC_015695	TAT	2	6	434	439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215005
13	NC_015695	CTC	2	6	441	446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338215005
14	NC_015695	AT	3	6	465	470	50 %	50 %	0 %	0 %	338215005
15	NC_015695	T	6	6	561	566	0 %	100 %	0 %	0 %	338215005
16	NC_015695	ATT	2	6	578	583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215005
17	NC_015695	A	8	8	614	621	100 %	0 %	0 %	0 %	338215005
18	NC_015695	ATG	2	6	627	632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215005
19	NC_015695	ATC	2	6	821	826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215005
20	NC_015695	GATC	2	8	841	848	25 %	25 %	25 %	25 %	338215005
21	NC_015695	CGA	2	6	849	854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215005
22	NC_015695	ATA	2	6	870	875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215005
23	NC_015695	ATT	2	6	879	884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215005
24	NC_015695	GCA	2	6	888	893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215005
25	NC_015695	CCA	2	6	984	989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215005
26	NC_015695	TCG	2	6	1083	1088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215005
27	NC_015695	A	6	6	1133	1138	100 %	0 %	0 %	0 %	338215005
28	NC_015695	TTGG	2	8	1150	1157	0 %	50 %	50 %	0 %	338215005
29	NC_015695	TGA	2	6	1176	1181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215005
30	NC_015695	ATG	2	6	1211	1216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215005
31	NC_015695	GAA	2	6	1320	1325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215005
32	NC_015695	A	7	7	1381	1387	100 %	0 %	0 %	0 %	338215006
33	NC_015695	GATTG	2	10	1595	1604	20 %	40 %	40 %	0 %	338215006
34	NC_015695	CCATT	2	10	1630	1639	20 %	40 %	0 %	40 %	338215006
35	NC_015695	ATT	2	6	1646	1651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215006
36	NC_015695	TCA	2	6	1660	1665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215006
37	NC_015695	A	6	6	1733	1738	100 %	0 %	0 %	0 %	338215006
38	NC_015695	GAA	2	6	1904	1909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215006
39	NC_015695	AGA	2	6	1948	1953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215006
40	NC_015695	CTG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215006
41	NC_015695	ACC	2	6	2007	2012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215006
42	NC_015695	TACG	2	8	2023	2030	25 %	25 %	25 %	25 %	338215006
43	NC_015695	T	6	6	2114	2119	0 %	100 %	0 %	0 %	338215006
44	NC_015695	GAT	2	6	2189	2194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215006
45	NC_015695	CGG	2	6	2221	2226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215006
46	NC_015695	ATGTGG	2	12	2244	2255	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	338215006
47	NC_015695	ATC	2	6	2271	2276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215006
48	NC_015695	GAA	2	6	2375	2380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215006
49	NC_015695	TG	3	6	2414	2419	0 %	50 %	50 %	0 %	338215006
50	NC_015695	CTG	2	6	2495	2500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215006
51	NC_015695	CGG	2	6	2509	2514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215006
52	NC_015695	TGG	2	6	2639	2644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215006
53	NC_015695	AG	3	6	2650	2655	50 %	0 %	50 %	0 %	338215006
54	NC_015695	CATC	2	8	2662	2669	25 %	25 %	0 %	50 %	338215006
55	NC_015695	AG	3	6	2681	2686	50 %	0 %	50 %	0 %	338215006
56	NC_015695	T	6	6	2698	2703	0 %	100 %	0 %	0 %	338215006
57	NC_015695	TGT	2	6	2766	2771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215006
58	NC_015695	CAG	2	6	2774	2779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215006
59	NC_015695	G	6	6	2988	2993	0 %	0 %	100 %	0 %	338215006
60	NC_015695	TACG	2	8	3082	3089	25 %	25 %	25 %	25 %	338215006
61	NC_015695	CG	3	6	3137	3142	0 %	0 %	50 %	50 %	338215006
62	NC_015695	CGA	2	6	3223	3228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215006
63	NC_015695	TTGA	2	8	3305	3312	25 %	50 %	25 %	0 %	338215006
64	NC_015695	TGA	3	9	3310	3318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215006
65	NC_015695	ACG	2	6	3404	3409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215006
66	NC_015695	CTA	2	6	3460	3465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215006
67	NC_015695	GT	3	6	3468	3473	0 %	50 %	50 %	0 %	338215006
68	NC_015695	TCTT	2	8	3492	3499	0 %	75 %	0 %	25 %	338215006
69	NC_015695	CCT	2	6	3500	3505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338215006
70	NC_015695	ACGC	2	8	3509	3516	25 %	0 %	25 %	50 %	338215006
71	NC_015695	TTC	2	6	3668	3673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215007
72	NC_015695	CTT	2	6	3679	3684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215007
73	NC_015695	CTT	2	6	3727	3732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215007
74	NC_015695	TCT	2	6	3735	3740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215007
75	NC_015695	AAT	2	6	3854	3859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215007
76	NC_015695	CTT	2	6	3880	3885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215007
77	NC_015695	CTT	2	6	3910	3915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215007
78	NC_015695	T	6	6	3941	3946	0 %	100 %	0 %	0 %	338215007
79	NC_015695	GTA	2	6	4103	4108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215007
80	NC_015695	AAT	2	6	4131	4136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215007
81	NC_015695	TTTTA	2	10	4193	4202	20 %	80 %	0 %	0 %	338215007
82	NC_015695	ACA	2	6	4231	4236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215007
83	NC_015695	CAA	2	6	4241	4246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215007
84	NC_015695	AAT	2	6	4450	4455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215008
85	NC_015695	A	7	7	4566	4572	100 %	0 %	0 %	0 %	338215008
86	NC_015695	GAA	2	6	4582	4587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215008
87	NC_015695	T	6	6	4665	4670	0 %	100 %	0 %	0 %	338215008
88	NC_015695	CGG	2	6	4724	4729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215008
89	NC_015695	GGCA	2	8	4730	4737	25 %	0 %	50 %	25 %	338215008
90	NC_015695	GGAA	2	8	4758	4765	50 %	0 %	50 %	0 %	338215008
91	NC_015695	A	6	6	4789	4794	100 %	0 %	0 %	0 %	338215008
92	NC_015695	GCT	2	6	4798	4803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215008
93	NC_015695	AT	3	6	4866	4871	50 %	50 %	0 %	0 %	338215008
94	NC_015695	ACCC	2	8	4883	4890	25 %	0 %	0 %	75 %	338215008
95	NC_015695	TGG	2	6	4964	4969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215008
96	NC_015695	GAA	2	6	4999	5004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215008
97	NC_015695	ATT	2	6	5111	5116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215008
98	NC_015695	AAAAG	2	10	5118	5127	80 %	0 %	20 %	0 %	338215008
99	NC_015695	GAA	2	6	5152	5157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215008
100	NC_015695	TAA	2	6	5163	5168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215008
101	NC_015695	GAA	2	6	5173	5178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215008
102	NC_015695	A	7	7	5419	5425	100 %	0 %	0 %	0 %	338215009
103	NC_015695	A	7	7	5473	5479	100 %	0 %	0 %	0 %	338215009
104	NC_015695	A	6	6	5556	5561	100 %	0 %	0 %	0 %	338215009
105	NC_015695	GAA	2	6	5571	5576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215009
106	NC_015695	T	7	7	5633	5639	0 %	100 %	0 %	0 %	338215009
107	NC_015695	ATA	2	6	5710	5715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215009
108	NC_015695	CAGAA	2	10	5804	5813	60 %	0 %	20 %	20 %	338215009
109	NC_015695	TCT	2	6	5989	5994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215010
110	NC_015695	TAT	2	6	6016	6021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215010
111	NC_015695	CTT	2	6	6022	6027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215010
112	NC_015695	TAA	2	6	6033	6038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215010
113	NC_015695	AAG	2	6	6083	6088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215010
114	NC_015695	ATC	2	6	6165	6170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215010
115	NC_015695	TTA	2	6	6216	6221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215010
116	NC_015695	CAATAC	2	12	6272	6283	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	338215010
117	NC_015695	CG	3	6	6287	6292	0 %	0 %	50 %	50 %	338215010
118	NC_015695	TAC	2	6	6365	6370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215010
119	NC_015695	T	7	7	6408	6414	0 %	100 %	0 %	0 %	338215010
120	NC_015695	AAT	2	6	6426	6431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215010
121	NC_015695	ATA	2	6	6578	6583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215010
122	NC_015695	ATC	2	6	6629	6634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215010
123	NC_015695	ACC	2	6	6651	6656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215010
124	NC_015695	GTT	2	6	6757	6762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215010
125	NC_015695	T	8	8	6782	6789	0 %	100 %	0 %	0 %	338215010
126	NC_015695	TGT	2	6	6936	6941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215011
127	NC_015695	GAAA	2	8	6942	6949	75 %	0 %	25 %	0 %	338215011
128	NC_015695	CTC	2	6	6968	6973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338215011
129	NC_015695	CAT	2	6	7004	7009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215011
130	NC_015695	ACT	2	6	7086	7091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215011
131	NC_015695	TTC	2	6	7103	7108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215011
132	NC_015695	GAA	2	6	7158	7163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215011
133	NC_015695	GCA	2	6	7329	7334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215011
134	NC_015695	T	6	6	7397	7402	0 %	100 %	0 %	0 %	338215011
135	NC_015695	T	6	6	7411	7416	0 %	100 %	0 %	0 %	338215011
136	NC_015695	TCT	2	6	7434	7439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215011
137	NC_015695	CGA	2	6	7568	7573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215011
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139	NC_015695	CCA	3	9	7625	7633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215011
140	NC_015695	T	6	6	7655	7660	0 %	100 %	0 %	0 %	338215011
141	NC_015695	ATG	2	6	7680	7685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215011
142	NC_015695	CTT	2	6	7691	7696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215011
143	NC_015695	CATG	2	8	7756	7763	25 %	25 %	25 %	25 %	338215011
144	NC_015695	ATG	2	6	7872	7877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215011
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172	NC_015695	ATCC	2	8	9134	9141	25 %	25 %	0 %	50 %	338215011
173	NC_015695	TACA	2	8	9182	9189	50 %	25 %	0 %	25 %	338215011
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264	NC_015695	CAA	2	6	14886	14891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215015
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267	NC_015695	CAA	2	6	14967	14972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215015
268	NC_015695	GTT	2	6	14977	14982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215015
269	NC_015695	TGT	2	6	15063	15068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215015
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275	NC_015695	GTG	2	6	15385	15390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215016
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397	NC_015695	TGT	2	6	23272	23277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215023
398	NC_015695	ATAAA	2	10	23280	23289	80 %	20 %	0 %	0 %	338215023
399	NC_015695	TTG	2	6	23398	23403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215023
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