MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL03

Total Repeats: 1128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015694	CAA	2	6	31691	31696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209500
502	NC_015694	CAA	2	6	31718	31723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209500
503	NC_015694	ATT	2	6	31743	31748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209500
504	NC_015694	CTT	2	6	31873	31878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209500
505	NC_015694	AGC	2	6	31884	31889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209500
506	NC_015694	T	6	6	31898	31903	0 %	100 %	0 %	0 %	338209500
507	NC_015694	TCT	2	6	31906	31911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209500
508	NC_015694	ATC	2	6	31931	31936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209500
509	NC_015694	AAG	3	9	31970	31978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209500
510	NC_015694	AGGC	2	8	31992	31999	25 %	0 %	50 %	25 %	338209500
511	NC_015694	ATG	2	6	32028	32033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209500
512	NC_015694	TA	3	6	32034	32039	50 %	50 %	0 %	0 %	338209500
513	NC_015694	GAACGG	2	12	32108	32119	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	338209500
514	NC_015694	TAA	2	6	32122	32127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209500
515	NC_015694	AAGC	2	8	32315	32322	50 %	0 %	25 %	25 %	338209501
516	NC_015694	GTT	2	6	32360	32365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209501
517	NC_015694	CAT	2	6	32378	32383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209501
518	NC_015694	TA	4	8	32384	32391	50 %	50 %	0 %	0 %	338209501
519	NC_015694	TGA	2	6	32424	32429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209501
520	NC_015694	ATTA	2	8	33693	33700	50 %	50 %	0 %	0 %	338209502
521	NC_015694	TTA	2	6	33725	33730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209502
522	NC_015694	AT	3	6	33834	33839	50 %	50 %	0 %	0 %	338209502
523	NC_015694	GAA	2	6	33865	33870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209502
524	NC_015694	TTAAT	2	10	33878	33887	40 %	60 %	0 %	0 %	338209502
525	NC_015694	TGA	2	6	33912	33917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209502
526	NC_015694	ACCC	2	8	33940	33947	25 %	0 %	0 %	75 %	338209502
527	NC_015694	GGT	2	6	33964	33969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209502
528	NC_015694	ATG	2	6	33983	33988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209502
529	NC_015694	AGGT	2	8	33989	33996	25 %	25 %	50 %	0 %	338209502
530	NC_015694	GAA	2	6	34054	34059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209502
531	NC_015694	TAAA	2	8	34124	34131	75 %	25 %	0 %	0 %	338209502
532	NC_015694	ATG	2	6	34142	34147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209502
533	NC_015694	AGAAA	2	10	34158	34167	80 %	0 %	20 %	0 %	338209502
534	NC_015694	CGG	2	6	34199	34204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209502
535	NC_015694	GAA	2	6	34228	34233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209502
536	NC_015694	GAA	2	6	34237	34242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209502
537	NC_015694	GGA	2	6	34294	34299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209502
538	NC_015694	TAT	2	6	34360	34365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209502
539	NC_015694	TCA	2	6	34401	34406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209502
540	NC_015694	GAT	2	6	34438	34443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209502
541	NC_015694	ATG	3	9	34538	34546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209502
542	NC_015694	AT	3	6	34555	34560	50 %	50 %	0 %	0 %	338209502
543	NC_015694	GAA	2	6	34576	34581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209502
544	NC_015694	TATC	2	8	34584	34591	25 %	50 %	0 %	25 %	338209502
545	NC_015694	TGT	2	6	34609	34614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209502
546	NC_015694	AATT	2	8	34667	34674	50 %	50 %	0 %	0 %	338209502
547	NC_015694	GCT	2	6	34675	34680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209502
548	NC_015694	GAAA	2	8	34685	34692	75 %	0 %	25 %	0 %	338209502
549	NC_015694	GAA	2	6	34705	34710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209502
550	NC_015694	AAT	2	6	34720	34725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209502
551	NC_015694	AACTGG	2	12	34842	34853	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338209503
552	NC_015694	A	6	6	35114	35119	100 %	0 %	0 %	0 %	338209503
553	NC_015694	AGA	2	6	35158	35163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209503
554	NC_015694	TAT	2	6	35206	35211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209503
555	NC_015694	GCA	2	6	35276	35281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209503
556	NC_015694	AT	3	6	35307	35312	50 %	50 %	0 %	0 %	338209503
557	NC_015694	A	6	6	35330	35335	100 %	0 %	0 %	0 %	338209503
558	NC_015694	AATC	2	8	35364	35371	50 %	25 %	0 %	25 %	338209503
559	NC_015694	AAT	2	6	35433	35438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209503
560	NC_015694	AT	3	6	35437	35442	50 %	50 %	0 %	0 %	338209503
561	NC_015694	TATT	2	8	35514	35521	25 %	75 %	0 %	0 %	338209504
562	NC_015694	A	7	7	35549	35555	100 %	0 %	0 %	0 %	338209504
563	NC_015694	ATT	2	6	35661	35666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209504
564	NC_015694	ACG	2	6	35690	35695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209504
565	NC_015694	AGG	2	6	35838	35843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209504
566	NC_015694	TTA	2	6	35864	35869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209504
567	NC_015694	CTG	2	6	36005	36010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209504
568	NC_015694	TTA	2	6	36050	36055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209504
569	NC_015694	AAT	2	6	36086	36091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209504
570	NC_015694	CAA	2	6	36110	36115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209504
571	NC_015694	GAA	2	6	36281	36286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209505
572	NC_015694	CAG	2	6	36305	36310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209505
573	NC_015694	CGAA	2	8	36329	36336	50 %	0 %	25 %	25 %	338209505
574	NC_015694	ACAG	2	8	36360	36367	50 %	0 %	25 %	25 %	338209505
575	NC_015694	AT	3	6	36423	36428	50 %	50 %	0 %	0 %	338209505
576	NC_015694	TGATAA	2	12	36520	36531	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	338209505
577	NC_015694	AT	3	6	36532	36537	50 %	50 %	0 %	0 %	338209505
578	NC_015694	AAT	2	6	36545	36550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209505
579	NC_015694	ATA	2	6	36564	36569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209505
580	NC_015694	ATG	2	6	36738	36743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209505
581	NC_015694	CTT	2	6	36744	36749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209505
582	NC_015694	G	6	6	36778	36783	0 %	0 %	100 %	0 %	338209505
583	NC_015694	ATG	2	6	36819	36824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209505
584	NC_015694	CTC	2	6	36888	36893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209505
585	NC_015694	ATT	2	6	36918	36923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209505
586	NC_015694	T	6	6	36925	36930	0 %	100 %	0 %	0 %	338209505
587	NC_015694	GAATTA	2	12	37017	37028	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	338209505
588	NC_015694	AAT	2	6	37031	37036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209505
589	NC_015694	TCAAT	2	10	37180	37189	40 %	40 %	0 %	20 %	338209505
590	NC_015694	CTG	2	6	37264	37269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209506
591	NC_015694	TGA	2	6	37343	37348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209506
592	NC_015694	TGGA	2	8	37363	37370	25 %	25 %	50 %	0 %	338209506
593	NC_015694	GGA	2	6	37393	37398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209506
594	NC_015694	CAT	2	6	37453	37458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209506
595	NC_015694	ATT	2	6	37476	37481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209506
596	NC_015694	TGA	3	9	37509	37517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209506
597	NC_015694	A	7	7	37551	37557	100 %	0 %	0 %	0 %	338209506
598	NC_015694	AGA	2	6	37569	37574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209506
599	NC_015694	TAA	2	6	37577	37582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209506
600	NC_015694	GCG	2	6	37960	37965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209507
601	NC_015694	TA	3	6	37972	37977	50 %	50 %	0 %	0 %	338209507
602	NC_015694	T	6	6	37982	37987	0 %	100 %	0 %	0 %	338209507
603	NC_015694	ATA	2	6	37990	37995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209507
604	NC_015694	ATA	2	6	38016	38021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209507
605	NC_015694	CAT	2	6	38066	38071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209507
606	NC_015694	AAG	2	6	38086	38091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209507
607	NC_015694	ATA	2	6	38160	38165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209507
608	NC_015694	GA	3	6	38273	38278	50 %	0 %	50 %	0 %	338209507
609	NC_015694	TCT	2	6	38282	38287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209507
610	NC_015694	A	6	6	38335	38340	100 %	0 %	0 %	0 %	338209507
611	NC_015694	TTG	2	6	38395	38400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209507
612	NC_015694	TAC	2	6	38447	38452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209507
613	NC_015694	AAC	2	6	38453	38458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209507
614	NC_015694	AGC	2	6	38532	38537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209507
615	NC_015694	A	6	6	38564	38569	100 %	0 %	0 %	0 %	338209507
616	NC_015694	TCA	2	6	38675	38680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209507
617	NC_015694	TAA	2	6	38710	38715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209507
618	NC_015694	T	6	6	38735	38740	0 %	100 %	0 %	0 %	338209507
619	NC_015694	AAG	2	6	38782	38787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209507
620	NC_015694	ATA	2	6	38857	38862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209507
621	NC_015694	GTA	2	6	38863	38868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209507
622	NC_015694	GAA	2	6	38892	38897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209507
623	NC_015694	AAT	2	6	38974	38979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209507
624	NC_015694	A	6	6	39028	39033	100 %	0 %	0 %	0 %	338209508
625	NC_015694	TA	3	6	39082	39087	50 %	50 %	0 %	0 %	338209508
626	NC_015694	TATTT	2	10	39234	39243	20 %	80 %	0 %	0 %	338209508
627	NC_015694	T	7	7	39318	39324	0 %	100 %	0 %	0 %	338209508
628	NC_015694	CA	3	6	39375	39380	50 %	0 %	0 %	50 %	338209508
629	NC_015694	GAA	2	6	39433	39438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209508
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