MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL01

Total Repeats: 1762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015693	TTTC	2	8	212	219	0 %	75 %	0 %	25 %	338209373
2	NC_015693	TTC	2	6	270	275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209373
3	NC_015693	T	6	6	312	317	0 %	100 %	0 %	0 %	338209373
4	NC_015693	CCG	2	6	325	330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209373
5	NC_015693	GC	3	6	355	360	0 %	0 %	50 %	50 %	338209373
6	NC_015693	ACC	2	6	444	449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209373
7	NC_015693	AAAT	2	8	603	610	75 %	25 %	0 %	0 %	338209373
8	NC_015693	TAT	2	6	611	616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209373
9	NC_015693	CCG	2	6	622	627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209373
10	NC_015693	CCA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209373
11	NC_015693	GTG	2	6	766	771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209373
12	NC_015693	TGA	2	6	856	861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209373
13	NC_015693	TCG	2	6	862	867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209373
14	NC_015693	TGC	2	6	907	912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209373
15	NC_015693	T	6	6	975	980	0 %	100 %	0 %	0 %	338209373
16	NC_015693	GTA	2	6	1042	1047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209373
17	NC_015693	CGA	2	6	1059	1064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209373
18	NC_015693	TGA	2	6	1109	1114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209373
19	NC_015693	CCA	2	6	1139	1144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209373
20	NC_015693	A	6	6	1144	1149	100 %	0 %	0 %	0 %	338209373
21	NC_015693	GCC	4	12	1254	1265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209373
22	NC_015693	TAT	2	6	1322	1327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209373
23	NC_015693	T	6	6	1439	1444	0 %	100 %	0 %	0 %	338209373
24	NC_015693	CGGC	2	8	1445	1452	0 %	0 %	50 %	50 %	338209373
25	NC_015693	GTTGAT	2	12	1470	1481	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338209373
26	NC_015693	CGG	2	6	1500	1505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209373
27	NC_015693	ATTC	2	8	1506	1513	25 %	50 %	0 %	25 %	338209373
28	NC_015693	GAA	2	6	1564	1569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209373
29	NC_015693	ATA	2	6	1593	1598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209373
30	NC_015693	CGC	2	6	1665	1670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209373
31	NC_015693	GGT	2	6	1674	1679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209373
32	NC_015693	GCC	2	6	1720	1725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209373
33	NC_015693	TGC	2	6	1743	1748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209373
34	NC_015693	TGG	2	6	1832	1837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209373
35	NC_015693	T	7	7	2027	2033	0 %	100 %	0 %	0 %	338209373
36	NC_015693	TGC	2	6	2035	2040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209373
37	NC_015693	CGG	2	6	2081	2086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209373
38	NC_015693	AAG	2	6	2117	2122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209373
39	NC_015693	TAA	2	6	2203	2208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209373
40	NC_015693	AAGGT	2	10	2233	2242	40 %	20 %	40 %	0 %	338209373
41	NC_015693	T	6	6	2280	2285	0 %	100 %	0 %	0 %	338209373
42	NC_015693	TTG	2	6	2299	2304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209373
43	NC_015693	CGC	2	6	2364	2369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209373
44	NC_015693	GGGCA	2	10	2490	2499	20 %	0 %	60 %	20 %	338209373
45	NC_015693	CCT	2	6	2552	2557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209373
46	NC_015693	ACT	2	6	2562	2567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209373
47	NC_015693	TAGG	2	8	2568	2575	25 %	25 %	50 %	0 %	338209373
48	NC_015693	CAAT	2	8	2579	2586	50 %	25 %	0 %	25 %	338209373
49	NC_015693	A	6	6	2598	2603	100 %	0 %	0 %	0 %	338209373
50	NC_015693	TCA	2	6	2609	2614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209373
51	NC_015693	AT	3	6	2630	2635	50 %	50 %	0 %	0 %	338209373
52	NC_015693	A	6	6	2674	2679	100 %	0 %	0 %	0 %	338209373
53	NC_015693	GGC	2	6	3773	3778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209374
54	NC_015693	AGC	2	6	3833	3838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209374
55	NC_015693	CCA	2	6	3877	3882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209374
56	NC_015693	GGAA	2	8	3908	3915	50 %	0 %	50 %	0 %	338209374
57	NC_015693	TTG	2	6	3984	3989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209374
58	NC_015693	ACC	2	6	4002	4007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209374
59	NC_015693	TCT	2	6	4031	4036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209374
60	NC_015693	CGG	2	6	4062	4067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209374
61	NC_015693	ACG	3	9	4108	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209374
62	NC_015693	CAAT	2	8	4148	4155	50 %	25 %	0 %	25 %	338209374
63	NC_015693	T	7	7	4179	4185	0 %	100 %	0 %	0 %	338209374
64	NC_015693	GACC	2	8	4249	4256	25 %	0 %	25 %	50 %	338209374
65	NC_015693	GGA	2	6	4298	4303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209374
66	NC_015693	A	7	7	4337	4343	100 %	0 %	0 %	0 %	338209374
67	NC_015693	GAT	2	6	4416	4421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209374
68	NC_015693	GCA	2	6	4506	4511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209374
69	NC_015693	CAC	2	6	6183	6188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209375
70	NC_015693	TGAA	2	8	6254	6261	50 %	25 %	25 %	0 %	338209375
71	NC_015693	CGA	2	6	6282	6287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209375
72	NC_015693	TAT	2	6	6298	6303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209375
73	NC_015693	CCG	2	6	6386	6391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209375
74	NC_015693	CTG	2	6	6400	6405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209375
75	NC_015693	TAC	2	6	6454	6459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209375
76	NC_015693	ATG	2	6	6479	6484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209375
77	NC_015693	TGC	2	6	6548	6553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209375
78	NC_015693	GCT	2	6	6561	6566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209375
79	NC_015693	CGG	2	6	6587	6592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209375
80	NC_015693	ACA	2	6	6641	6646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209375
81	NC_015693	ACGC	2	8	6696	6703	25 %	0 %	25 %	50 %	338209375
82	NC_015693	TCC	2	6	6721	6726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209375
83	NC_015693	ATCA	2	8	6976	6983	50 %	25 %	0 %	25 %	338209375
84	NC_015693	CAA	3	9	7026	7034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209375
85	NC_015693	CAA	2	6	7113	7118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209375
86	NC_015693	CGG	2	6	7206	7211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209375
87	NC_015693	TAC	2	6	7240	7245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209375
88	NC_015693	GAT	2	6	7246	7251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209375
89	NC_015693	A	6	6	7291	7296	100 %	0 %	0 %	0 %	338209375
90	NC_015693	GGGT	2	8	7321	7328	0 %	25 %	75 %	0 %	338209375
91	NC_015693	GAAA	2	8	7344	7351	75 %	0 %	25 %	0 %	338209375
92	NC_015693	A	6	6	7425	7430	100 %	0 %	0 %	0 %	338209375
93	NC_015693	T	6	6	7642	7647	0 %	100 %	0 %	0 %	338209375
94	NC_015693	ACGTTT	2	12	7684	7695	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338209375
95	NC_015693	AGGTAA	2	12	7859	7870	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	338209375
96	NC_015693	TCT	2	6	7888	7893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209375
97	NC_015693	ATT	2	6	7922	7927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209375
98	NC_015693	CGG	2	6	7946	7951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209375
99	NC_015693	ATG	2	6	7954	7959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209375
100	NC_015693	CAA	2	6	8031	8036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209375
101	NC_015693	ATC	2	6	8113	8118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209375
102	NC_015693	CGG	2	6	8121	8126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209375
103	NC_015693	AGG	2	6	8127	8132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209375
104	NC_015693	CTG	2	6	8173	8178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209375
105	NC_015693	TA	3	6	8206	8211	50 %	50 %	0 %	0 %	338209375
106	NC_015693	CAA	2	6	8220	8225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209375
107	NC_015693	ATT	2	6	8282	8287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209375
108	NC_015693	GCG	2	6	8312	8317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209375
109	NC_015693	ATTT	2	8	8378	8385	25 %	75 %	0 %	0 %	338209375
110	NC_015693	GGGT	2	8	8408	8415	0 %	25 %	75 %	0 %	338209375
111	NC_015693	CCA	2	6	8420	8425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209375
112	NC_015693	AGA	2	6	8598	8603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209375
113	NC_015693	ACC	2	6	8605	8610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209375
114	NC_015693	AGG	2	6	8627	8632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209375
115	NC_015693	CGGG	2	8	8669	8676	0 %	0 %	75 %	25 %	338209375
116	NC_015693	CG	3	6	9020	9025	0 %	0 %	50 %	50 %	338209376
117	NC_015693	ACA	2	6	9080	9085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209376
118	NC_015693	ACTA	2	8	9091	9098	50 %	25 %	0 %	25 %	338209376
119	NC_015693	T	6	6	9099	9104	0 %	100 %	0 %	0 %	338209376
120	NC_015693	A	6	6	9107	9112	100 %	0 %	0 %	0 %	338209376
121	NC_015693	AAATT	2	10	9139	9148	60 %	40 %	0 %	0 %	338209376
122	NC_015693	TTC	2	6	9265	9270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209377
123	NC_015693	GTT	3	9	9276	9284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209377
124	NC_015693	A	6	6	9326	9331	100 %	0 %	0 %	0 %	338209377
125	NC_015693	TCG	2	6	9365	9370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209377
126	NC_015693	CTGT	2	8	9391	9398	0 %	50 %	25 %	25 %	338209377
127	NC_015693	CTT	2	6	9528	9533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209377
128	NC_015693	GCC	2	6	9554	9559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209377
129	NC_015693	ATG	2	6	9613	9618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209377
130	NC_015693	CTG	2	6	9673	9678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209377
131	NC_015693	CCA	2	6	9768	9773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209377
132	NC_015693	TA	3	6	9817	9822	50 %	50 %	0 %	0 %	338209377
133	NC_015693	ATCA	2	8	9871	9878	50 %	25 %	0 %	25 %	338209377
134	NC_015693	TACTTG	2	12	9889	9900	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338209377
135	NC_015693	T	6	6	9951	9956	0 %	100 %	0 %	0 %	338209377
136	NC_015693	CAA	2	6	10069	10074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209377
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265	NC_015693	TTGG	2	8	16581	16588	0 %	50 %	50 %	0 %	338209385
266	NC_015693	TTGA	2	8	16592	16599	25 %	50 %	25 %	0 %	338209385
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394	NC_015693	AGC	2	6	23192	23197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209391
395	NC_015693	GCA	2	6	23263	23268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209391
396	NC_015693	ATA	2	6	23301	23306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209391
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398	NC_015693	C	7	7	23410	23416	0 %	0 %	0 %	100 %	338209391
399	NC_015693	TGA	2	6	23479	23484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209391
400	NC_015693	T	6	6	23540	23545	0 %	100 %	0 %	0 %	338209391
401	NC_015693	CAA	2	6	23554	23559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209391
402	NC_015693	GCATCG	2	12	23560	23571	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338209391
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408	NC_015693	TGA	2	6	23896	23901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209391
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497	NC_015693	AG	3	6	28588	28593	50 %	0 %	50 %	0 %	338209395
498	NC_015693	T	7	7	28599	28605	0 %	100 %	0 %	0 %	338209395
499	NC_015693	T	6	6	28667	28672	0 %	100 %	0 %	0 %	338209395
500	NC_015693	CGTTAC	2	12	28710	28721	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338209395

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