MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 11016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015062	AGA	2	6	172064	172069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835283
3002	NC_015062	GC	3	6	172108	172113	0 %	0 %	50 %	50 %	322835283
3003	NC_015062	CCATCG	2	12	172188	172199	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322835283
3004	NC_015062	GAT	2	6	172237	172242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835283
3005	NC_015062	CAC	2	6	172276	172281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835283
3006	NC_015062	GCC	2	6	172315	172320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835283
3007	NC_015062	CAGA	2	8	172381	172388	50 %	0 %	25 %	25 %	322835283
3008	NC_015062	C	6	6	172407	172412	0 %	0 %	0 %	100 %	322835283
3009	NC_015062	AGC	2	6	172538	172543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835283
3010	NC_015062	TCAGCA	2	12	172563	172574	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322835283
3011	NC_015062	CTG	2	6	172591	172596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835283
3012	NC_015062	CAGT	2	8	172688	172695	25 %	25 %	25 %	25 %	322835284
3013	NC_015062	CAC	2	6	172743	172748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835284
3014	NC_015062	CAC	2	6	172755	172760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835284
3015	NC_015062	ACC	2	6	172834	172839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835284
3016	NC_015062	TGC	2	6	172841	172846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835284
3017	NC_015062	CAGC	2	8	172851	172858	25 %	0 %	25 %	50 %	322835284
3018	NC_015062	CAG	2	6	172872	172877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835284
3019	NC_015062	GCG	2	6	172954	172959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835284
3020	NC_015062	CAG	2	6	172986	172991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835284
3021	NC_015062	GC	3	6	172996	173001	0 %	0 %	50 %	50 %	322835284
3022	NC_015062	CAGCGC	2	12	173025	173036	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322835284
3023	NC_015062	TGA	2	6	173062	173067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835284
3024	NC_015062	ATC	2	6	173137	173142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835284
3025	NC_015062	GCCA	2	8	173149	173156	25 %	0 %	25 %	50 %	322835284
3026	NC_015062	TAG	2	6	173180	173185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835284
3027	NC_015062	GCC	2	6	173239	173244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835284
3028	NC_015062	CAG	2	6	173268	173273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835284
3029	NC_015062	TGC	2	6	173401	173406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835284
3030	NC_015062	TGC	2	6	173462	173467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835284
3031	NC_015062	GC	3	6	173506	173511	0 %	0 %	50 %	50 %	322835284
3032	NC_015062	GCA	2	6	173552	173557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835284
3033	NC_015062	AG	3	6	173842	173847	50 %	0 %	50 %	0 %	322835285
3034	NC_015062	TAT	2	6	174047	174052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835285
3035	NC_015062	GCA	2	6	174067	174072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835285
3036	NC_015062	CAA	2	6	174157	174162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835285
3037	NC_015062	AAC	2	6	174188	174193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835285
3038	NC_015062	GCG	2	6	174201	174206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835285
3039	NC_015062	TGG	2	6	174232	174237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835285
3040	NC_015062	ATG	2	6	174291	174296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835285
3041	NC_015062	CTG	2	6	174314	174319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835285
3042	NC_015062	CAG	2	6	174358	174363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835285
3043	NC_015062	AAGC	2	8	174391	174398	50 %	0 %	25 %	25 %	322835285
3044	NC_015062	GGC	2	6	174421	174426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835285
3045	NC_015062	CCG	2	6	174501	174506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835285
3046	NC_015062	CG	3	6	174548	174553	0 %	0 %	50 %	50 %	322835285
3047	NC_015062	ACA	2	6	174674	174679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835286
3048	NC_015062	CGG	2	6	174774	174779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835286
3049	NC_015062	CG	3	6	174835	174840	0 %	0 %	50 %	50 %	322835286
3050	NC_015062	CCG	2	6	174896	174901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835286
3051	NC_015062	TTCT	2	8	174919	174926	0 %	75 %	0 %	25 %	322835286
3052	NC_015062	TGC	2	6	174944	174949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835286
3053	NC_015062	GCT	2	6	174978	174983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835286
3054	NC_015062	GGC	2	6	174997	175002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835286
3055	NC_015062	CCT	2	6	175033	175038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322835286
3056	NC_015062	GCC	3	9	175096	175104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835286
3057	NC_015062	GCC	2	6	175122	175127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835286
3058	NC_015062	GCC	2	6	175159	175164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835286
3059	NC_015062	GCG	2	6	175192	175197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835286
3060	NC_015062	GGA	2	6	175245	175250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322835286
3061	NC_015062	GCG	2	6	175267	175272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835286
3062	NC_015062	GCA	2	6	175334	175339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835286
3063	NC_015062	GTG	2	6	175429	175434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835286
3064	NC_015062	TGA	2	6	175567	175572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835286
3065	NC_015062	ATTG	2	8	175829	175836	25 %	50 %	25 %	0 %	322835287
3066	NC_015062	CG	3	6	175841	175846	0 %	0 %	50 %	50 %	322835287
3067	NC_015062	GCC	2	6	175877	175882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835287
3068	NC_015062	CCAC	2	8	175998	176005	25 %	0 %	0 %	75 %	322835287
3069	NC_015062	CCA	2	6	176145	176150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835287
3070	NC_015062	A	6	6	176214	176219	100 %	0 %	0 %	0 %	322835287
3071	NC_015062	GTATC	2	10	176232	176241	20 %	40 %	20 %	20 %	322835287
3072	NC_015062	CAC	2	6	176262	176267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835287
3073	NC_015062	GTC	2	6	176299	176304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835287
3074	NC_015062	AGAA	2	8	176332	176339	75 %	0 %	25 %	0 %	322835287
3075	NC_015062	ATGG	2	8	176388	176395	25 %	25 %	50 %	0 %	322835287
3076	NC_015062	GCG	2	6	176506	176511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835287
3077	NC_015062	CAC	2	6	176520	176525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835287
3078	NC_015062	AGA	2	6	176563	176568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835287
3079	NC_015062	A	6	6	176612	176617	100 %	0 %	0 %	0 %	322835287
3080	NC_015062	CAA	2	6	176731	176736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835288
3081	NC_015062	ACA	2	6	176742	176747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835288
3082	NC_015062	ATGG	2	8	176760	176767	25 %	25 %	50 %	0 %	322835288
3083	NC_015062	TCT	2	6	176771	176776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835288
3084	NC_015062	CAG	2	6	176807	176812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835288
3085	NC_015062	GCCA	2	8	176820	176827	25 %	0 %	25 %	50 %	322835288
3086	NC_015062	CTG	2	6	176923	176928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835288
3087	NC_015062	TGA	2	6	176987	176992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835288
3088	NC_015062	CTG	2	6	177004	177009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835288
3089	NC_015062	TCC	2	6	177019	177024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322835288
3090	NC_015062	CGT	2	6	177177	177182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835288
3091	NC_015062	TGGC	2	8	177219	177226	0 %	25 %	50 %	25 %	322835288
3092	NC_015062	TGG	2	6	177251	177256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835288
3093	NC_015062	GAG	2	6	177257	177262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322835288
3094	NC_015062	TGC	2	6	177341	177346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835288
3095	NC_015062	GCGG	2	8	177457	177464	0 %	0 %	75 %	25 %	322835288
3096	NC_015062	GGAT	2	8	177523	177530	25 %	25 %	50 %	0 %	322835288
3097	NC_015062	GAT	2	6	177597	177602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835288
3098	NC_015062	GCT	2	6	177633	177638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835288
3099	NC_015062	CGG	2	6	177663	177668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835288
3100	NC_015062	AGG	2	6	177729	177734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322835288
3101	NC_015062	TGG	3	9	177737	177745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835288
3102	NC_015062	TCT	2	6	177757	177762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835288
3103	NC_015062	G	7	7	177804	177810	0 %	0 %	100 %	0 %	322835288
3104	NC_015062	TGC	2	6	177852	177857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835288
3105	NC_015062	CAT	2	6	178529	178534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835289
3106	NC_015062	TGT	2	6	178813	178818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835289
3107	NC_015062	GCCTG	2	10	178838	178847	0 %	20 %	40 %	40 %	322835289
3108	NC_015062	TGG	2	6	178867	178872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835289
3109	NC_015062	CGT	2	6	178958	178963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835289
3110	NC_015062	TCG	2	6	179152	179157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835289
3111	NC_015062	AGA	2	6	179405	179410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835289
3112	NC_015062	CAT	2	6	179447	179452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835289
3113	NC_015062	CTG	2	6	179466	179471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835289
3114	NC_015062	GT	3	6	179494	179499	0 %	50 %	50 %	0 %	322835289
3115	NC_015062	CCCG	2	8	179530	179537	0 %	0 %	25 %	75 %	322835289
3116	NC_015062	GCT	2	6	179552	179557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835289
3117	NC_015062	GTGG	2	8	179624	179631	0 %	25 %	75 %	0 %	322835289
3118	NC_015062	CTG	2	6	179709	179714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835289
3119	NC_015062	ATG	2	6	179751	179756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835289
3120	NC_015062	A	6	6	179766	179771	100 %	0 %	0 %	0 %	322835289
3121	NC_015062	TGA	2	6	179792	179797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835289
3122	NC_015062	AC	3	6	179827	179832	50 %	0 %	0 %	50 %	322835289
3123	NC_015062	GCG	2	6	179850	179855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835289
3124	NC_015062	A	6	6	179886	179891	100 %	0 %	0 %	0 %	322835289
3125	NC_015062	TGAT	2	8	179894	179901	25 %	50 %	25 %	0 %	322835289
3126	NC_015062	TAT	2	6	179907	179912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835290
3127	NC_015062	ATGG	2	8	179956	179963	25 %	25 %	50 %	0 %	322835290
3128	NC_015062	ATG	2	6	180022	180027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835290
3129	NC_015062	CTGG	2	8	180066	180073	0 %	25 %	50 %	25 %	322835290
3130	NC_015062	GCG	2	6	180080	180085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835290
3131	NC_015062	GGCGT	2	10	180181	180190	0 %	20 %	60 %	20 %	322835290
3132	NC_015062	CCGT	2	8	180222	180229	0 %	25 %	25 %	50 %	322835290
3133	NC_015062	TCAG	2	8	180272	180279	25 %	25 %	25 %	25 %	322835290
3134	NC_015062	GCTG	2	8	180350	180357	0 %	25 %	50 %	25 %	322835290
3135	NC_015062	T	6	6	180371	180376	0 %	100 %	0 %	0 %	322835290
3136	NC_015062	TGG	2	6	180389	180394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835290
3137	NC_015062	GCT	2	6	180405	180410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835290
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3142	NC_015062	CTG	2	6	180670	180675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835290
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3151	NC_015062	GCG	2	6	181269	181274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835292
3152	NC_015062	GAT	2	6	181333	181338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835292
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3155	NC_015062	CGC	2	6	181459	181464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835292
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3157	NC_015062	GCG	2	6	181499	181504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835292
3158	NC_015062	GAC	2	6	181521	181526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835292
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3163	NC_015062	A	6	6	182134	182139	100 %	0 %	0 %	0 %	322835293
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3226	NC_015062	GAT	2	6	185103	185108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835296
3227	NC_015062	CCA	2	6	185121	185126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835296
3228	NC_015062	GCTG	2	8	185288	185295	0 %	25 %	50 %	25 %	322835296
3229	NC_015062	TCA	2	6	185353	185358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835296
3230	NC_015062	GCT	2	6	185397	185402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835296
3231	NC_015062	TCA	2	6	185415	185420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835296
3232	NC_015062	AC	3	6	185524	185529	50 %	0 %	0 %	50 %	322835296
3233	NC_015062	AGC	2	6	185636	185641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835296
3234	NC_015062	GT	3	6	185806	185811	0 %	50 %	50 %	0 %	322835296
3235	NC_015062	GCAG	2	8	185883	185890	25 %	0 %	50 %	25 %	322835296
3236	NC_015062	GGC	2	6	185899	185904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835296
3237	NC_015062	TGA	2	6	185956	185961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835296
3238	NC_015062	ATCTGC	2	12	185962	185973	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322835297
3239	NC_015062	GTG	2	6	185982	185987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835297
3240	NC_015062	CGGCG	2	10	186014	186023	0 %	0 %	60 %	40 %	322835297
3241	NC_015062	GAA	2	6	186042	186047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835297
3242	NC_015062	ATC	2	6	186063	186068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835297
3243	NC_015062	ACTG	2	8	186137	186144	25 %	25 %	25 %	25 %	322835297
3244	NC_015062	CGA	2	6	186152	186157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835297
3245	NC_015062	GCA	2	6	186202	186207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835297
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3247	NC_015062	GGC	2	6	186429	186434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835297
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3346	NC_015062	T	6	6	189972	189977	0 %	100 %	0 %	0 %	322835301
3347	NC_015062	TGCC	2	8	189997	190004	0 %	25 %	25 %	50 %	322835301
3348	NC_015062	CAAGG	2	10	190044	190053	40 %	0 %	40 %	20 %	322835301
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3350	NC_015062	GCG	2	6	190066	190071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835301
3351	NC_015062	CCGG	2	8	190118	190125	0 %	0 %	50 %	50 %	322835301
3352	NC_015062	GCA	2	6	190164	190169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835301
3353	NC_015062	TGG	2	6	190316	190321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835301
3354	NC_015062	AGC	2	6	190382	190387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835301
3355	NC_015062	GGC	2	6	190414	190419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835301
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3357	NC_015062	CA	3	6	190476	190481	50 %	0 %	0 %	50 %	322835301
3358	NC_015062	CCA	2	6	190518	190523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835301
3359	NC_015062	GAA	2	6	190575	190580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835301
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3361	NC_015062	GCC	2	6	190621	190626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835302
3362	NC_015062	CAG	2	6	190644	190649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835302
3363	NC_015062	CTGTA	2	10	190672	190681	20 %	40 %	20 %	20 %	322835302
3364	NC_015062	TCAG	2	8	190801	190808	25 %	25 %	25 %	25 %	322835302
3365	NC_015062	TCT	2	6	190831	190836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835302
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3372	NC_015062	GCC	2	6	191237	191242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835303
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3475	NC_015062	CA	3	6	196451	196456	50 %	0 %	0 %	50 %	322835308
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3481	NC_015062	GCA	2	6	196684	196689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835309
3482	NC_015062	TTTA	2	8	196697	196704	25 %	75 %	0 %	0 %	322835309
3483	NC_015062	T	6	6	196784	196789	0 %	100 %	0 %	0 %	322835309
3484	NC_015062	TTG	2	6	196793	196798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835309
3485	NC_015062	TAT	2	6	196830	196835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835309
3486	NC_015062	ATA	2	6	196919	196924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835309
3487	NC_015062	CTCA	2	8	197028	197035	25 %	25 %	0 %	50 %	322835309
3488	NC_015062	AAG	2	6	197047	197052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835309
3489	NC_015062	GTA	2	6	197071	197076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835309
3490	NC_015062	TTTG	2	8	197098	197105	0 %	75 %	25 %	0 %	322835309
3491	NC_015062	ACTG	2	8	197338	197345	25 %	25 %	25 %	25 %	322835310
3492	NC_015062	ACTGA	2	10	197432	197441	40 %	20 %	20 %	20 %	322835310
3493	NC_015062	GAA	2	6	197494	197499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835310
3494	NC_015062	GCC	2	6	197511	197516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835310
3495	NC_015062	TGG	2	6	197521	197526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835310
3496	NC_015062	CGG	3	9	197638	197646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835310
3497	NC_015062	GCA	2	6	197696	197701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835310
3498	NC_015062	TAAAAG	2	12	197778	197789	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	322835310
3499	NC_015062	ATT	2	6	197843	197848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835310
3500	NC_015062	CCG	2	6	198012	198017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835311

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