MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 11016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015062	AAT	2	6	144494	144499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835260
2502	NC_015062	CCG	2	6	144546	144551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835260
2503	NC_015062	GGC	2	6	144601	144606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835260
2504	NC_015062	CAA	2	6	144628	144633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835260
2505	NC_015062	TGA	2	6	144765	144770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835260
2506	NC_015062	TGA	2	6	144816	144821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835260
2507	NC_015062	AAAG	2	8	145027	145034	75 %	0 %	25 %	0 %	322835260
2508	NC_015062	GACA	2	8	145063	145070	50 %	0 %	25 %	25 %	322835260
2509	NC_015062	TGG	2	6	145071	145076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835260
2510	NC_015062	CTT	2	6	145089	145094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835260
2511	NC_015062	GGT	2	6	145177	145182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835260
2512	NC_015062	TAC	2	6	145183	145188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835260
2513	NC_015062	TGG	2	6	145410	145415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835260
2514	NC_015062	TGA	2	6	145419	145424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835260
2515	NC_015062	CTGGC	2	10	145430	145439	0 %	20 %	40 %	40 %	322835260
2516	NC_015062	TGG	2	6	145503	145508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835260
2517	NC_015062	A	6	6	145511	145516	100 %	0 %	0 %	0 %	322835260
2518	NC_015062	TTA	2	6	145527	145532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835260
2519	NC_015062	AACA	2	8	145533	145540	75 %	0 %	0 %	25 %	322835260
2520	NC_015062	GGC	2	6	145541	145546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835260
2521	NC_015062	CGC	2	6	145564	145569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835260
2522	NC_015062	TTG	2	6	145580	145585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835260
2523	NC_015062	CAT	2	6	145588	145593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835260
2524	NC_015062	AAT	2	6	145616	145621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835260
2525	NC_015062	CAG	2	6	145679	145684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835260
2526	NC_015062	GTC	2	6	145994	145999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835260
2527	NC_015062	AACTC	2	10	146047	146056	40 %	20 %	0 %	40 %	322835260
2528	NC_015062	GCCC	2	8	146219	146226	0 %	0 %	25 %	75 %	322835260
2529	NC_015062	A	6	6	146230	146235	100 %	0 %	0 %	0 %	322835260
2530	NC_015062	GTC	2	6	146237	146242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835260
2531	NC_015062	CTA	2	6	146329	146334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835260
2532	NC_015062	CAGCT	2	10	146345	146354	20 %	20 %	20 %	40 %	322835260
2533	NC_015062	CAG	2	6	146452	146457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835260
2534	NC_015062	ATAC	2	8	146503	146510	50 %	25 %	0 %	25 %	322835260
2535	NC_015062	A	6	6	146573	146578	100 %	0 %	0 %	0 %	322835260
2536	NC_015062	GAT	2	6	146588	146593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835260
2537	NC_015062	TCT	2	6	146603	146608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835260
2538	NC_015062	GCC	2	6	146615	146620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835260
2539	NC_015062	GAT	2	6	146792	146797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835261
2540	NC_015062	TGCCCA	2	12	146857	146868	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322835261
2541	NC_015062	GC	3	6	146909	146914	0 %	0 %	50 %	50 %	322835261
2542	NC_015062	TTG	2	6	147063	147068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835261
2543	NC_015062	CTGTC	2	10	147126	147135	0 %	40 %	20 %	40 %	322835261
2544	NC_015062	AC	3	6	147154	147159	50 %	0 %	0 %	50 %	322835261
2545	NC_015062	CTG	2	6	147160	147165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835261
2546	NC_015062	AGAT	2	8	147297	147304	50 %	25 %	25 %	0 %	322835261
2547	NC_015062	ATCT	2	8	147320	147327	25 %	50 %	0 %	25 %	322835261
2548	NC_015062	CAG	2	6	147346	147351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835261
2549	NC_015062	ATGT	2	8	147389	147396	25 %	50 %	25 %	0 %	322835261
2550	NC_015062	GAA	2	6	147461	147466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835261
2551	NC_015062	GTT	2	6	147514	147519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835261
2552	NC_015062	GAC	2	6	147598	147603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835261
2553	NC_015062	TGAG	2	8	147627	147634	25 %	25 %	50 %	0 %	322835261
2554	NC_015062	GATACC	2	12	147659	147670	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322835261
2555	NC_015062	GAAT	2	8	147745	147752	50 %	25 %	25 %	0 %	322835261
2556	NC_015062	ATG	2	6	147881	147886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835261
2557	NC_015062	ATG	2	6	147891	147896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835261
2558	NC_015062	CA	3	6	147914	147919	50 %	0 %	0 %	50 %	322835261
2559	NC_015062	CGG	2	6	147967	147972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835261
2560	NC_015062	CAC	2	6	148129	148134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835261
2561	NC_015062	TGA	2	6	148185	148190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835261
2562	NC_015062	ATG	2	6	148217	148222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835261
2563	NC_015062	TGC	2	6	148236	148241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835261
2564	NC_015062	GAT	2	6	148271	148276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835261
2565	NC_015062	TTG	2	6	148305	148310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835261
2566	NC_015062	ACC	2	6	148320	148325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835261
2567	NC_015062	TGC	2	6	148353	148358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835261
2568	NC_015062	TGC	2	6	148434	148439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835261
2569	NC_015062	CTT	2	6	148444	148449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835261
2570	NC_015062	GCT	2	6	148641	148646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835262
2571	NC_015062	CAC	2	6	148776	148781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835262
2572	NC_015062	CGA	2	6	148830	148835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835262
2573	NC_015062	CGG	2	6	148846	148851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835262
2574	NC_015062	TGA	2	6	148901	148906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835262
2575	NC_015062	CTG	2	6	149122	149127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835262
2576	NC_015062	CAGCG	2	10	149227	149236	20 %	0 %	40 %	40 %	322835262
2577	NC_015062	TGA	2	6	149285	149290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835262
2578	NC_015062	GAA	2	6	149302	149307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835262
2579	NC_015062	CGG	2	6	149325	149330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835262
2580	NC_015062	TGA	2	6	149354	149359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835262
2581	NC_015062	TGC	2	6	149420	149425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835262
2582	NC_015062	GAA	2	6	149557	149562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835262
2583	NC_015062	AAT	2	6	149676	149681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835263
2584	NC_015062	TCA	2	6	149872	149877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835263
2585	NC_015062	CCA	2	6	149882	149887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835263
2586	NC_015062	GCT	3	9	149946	149954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835263
2587	NC_015062	GTG	2	6	150070	150075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835263
2588	NC_015062	GTT	2	6	150078	150083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835263
2589	NC_015062	GACA	2	8	150094	150101	50 %	0 %	25 %	25 %	322835263
2590	NC_015062	GGT	2	6	150117	150122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835263
2591	NC_015062	GTT	2	6	150189	150194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835263
2592	NC_015062	TCT	2	6	150243	150248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835264
2593	NC_015062	TGC	2	6	150407	150412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835264
2594	NC_015062	CCG	2	6	150503	150508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835264
2595	NC_015062	GCT	2	6	150549	150554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835264
2596	NC_015062	TCA	2	6	150689	150694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835264
2597	NC_015062	GACC	2	8	150708	150715	25 %	0 %	25 %	50 %	322835264
2598	NC_015062	TTA	2	6	150722	150727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835264
2599	NC_015062	CGC	2	6	150968	150973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835264
2600	NC_015062	GC	3	6	150983	150988	0 %	0 %	50 %	50 %	322835264
2601	NC_015062	GCGCC	2	10	150998	151007	0 %	0 %	40 %	60 %	322835264
2602	NC_015062	CGC	3	9	151068	151076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835264
2603	NC_015062	ATC	2	6	151124	151129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835264
2604	NC_015062	CAC	2	6	151149	151154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835264
2605	NC_015062	TCG	2	6	151241	151246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835264
2606	NC_015062	ACC	2	6	151326	151331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835264
2607	NC_015062	CCCGA	2	10	151377	151386	20 %	0 %	20 %	60 %	322835264
2608	NC_015062	CGG	2	6	151454	151459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835264
2609	NC_015062	CGG	2	6	151503	151508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835264
2610	NC_015062	ACGGCT	2	12	151511	151522	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322835264
2611	NC_015062	CGG	2	6	151569	151574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835264
2612	NC_015062	CGC	3	9	151596	151604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835264
2613	NC_015062	GGA	2	6	151695	151700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322835264
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2615	NC_015062	TCG	2	6	151769	151774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835264
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2618	NC_015062	GCG	2	6	151903	151908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835264
2619	NC_015062	GCC	3	9	151957	151965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835264
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2621	NC_015062	GGT	2	6	152040	152045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835264
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2744	NC_015062	TGC	2	6	158591	158596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835269
2745	NC_015062	TTC	2	6	158750	158755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835269
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2747	NC_015062	GCT	2	6	158868	158873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835269
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2749	NC_015062	ACTT	2	8	158921	158928	25 %	50 %	0 %	25 %	322835269
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2765	NC_015062	T	7	7	159764	159770	0 %	100 %	0 %	0 %	322835272
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2848	NC_015062	CTG	2	6	164212	164217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835275
2849	NC_015062	CAC	2	6	164238	164243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835275
2850	NC_015062	CTG	2	6	164278	164283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835275
2851	NC_015062	ATG	2	6	164389	164394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835275
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2853	NC_015062	ACTG	2	8	164502	164509	25 %	25 %	25 %	25 %	322835275
2854	NC_015062	ATC	3	9	164565	164573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835276
2855	NC_015062	TGA	2	6	164581	164586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835276
2856	NC_015062	A	6	6	164643	164648	100 %	0 %	0 %	0 %	322835276
2857	NC_015062	GTGAT	2	10	164659	164668	20 %	40 %	40 %	0 %	322835276
2858	NC_015062	CTGG	2	8	164708	164715	0 %	25 %	50 %	25 %	322835276
2859	NC_015062	CGG	2	6	164720	164725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835276
2860	NC_015062	GTG	2	6	164925	164930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835276
2861	NC_015062	GGT	2	6	164957	164962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835276
2862	NC_015062	ACTGG	2	10	164987	164996	20 %	20 %	40 %	20 %	322835276
2863	NC_015062	TGG	3	9	165031	165039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835276
2864	NC_015062	CTG	2	6	165138	165143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835276
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2866	NC_015062	CTG	2	6	165312	165317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835276
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2986	NC_015062	CGG	2	6	171462	171467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835282
2987	NC_015062	CTG	2	6	171479	171484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835282
2988	NC_015062	TCA	2	6	171493	171498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835282
2989	NC_015062	TGGC	2	8	171510	171517	0 %	25 %	50 %	25 %	322835282
2990	NC_015062	CCCG	2	8	171544	171551	0 %	0 %	25 %	75 %	322835282
2991	NC_015062	GCA	2	6	171643	171648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835282
2992	NC_015062	CAT	2	6	171653	171658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835282
2993	NC_015062	CCA	2	6	171745	171750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835282
2994	NC_015062	GTCC	2	8	171831	171838	0 %	25 %	25 %	50 %	322835283
2995	NC_015062	CAG	2	6	171841	171846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835283
2996	NC_015062	CAC	2	6	171865	171870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835283
2997	NC_015062	GGT	2	6	171889	171894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835283
2998	NC_015062	CCA	2	6	171898	171903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835283
2999	NC_015062	GTA	2	6	171908	171913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835283
3000	NC_015062	CGG	2	6	171958	171963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835283

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