MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 11016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015062	TTC	2	6	558377	558382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835660
10002	NC_015062	GCG	2	6	558445	558450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835660
10003	NC_015062	GACT	2	8	558458	558465	25 %	25 %	25 %	25 %	322835660
10004	NC_015062	AAAAC	2	10	558478	558487	80 %	0 %	0 %	20 %	322835661
10005	NC_015062	ATG	2	6	558538	558543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835661
10006	NC_015062	AGAA	2	8	558554	558561	75 %	0 %	25 %	0 %	322835661
10007	NC_015062	GCG	2	6	558617	558622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835661
10008	NC_015062	CTTCA	2	10	558816	558825	20 %	40 %	0 %	40 %	322835661
10009	NC_015062	ACG	2	6	558893	558898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835661
10010	NC_015062	CCG	2	6	558948	558953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835661
10011	NC_015062	ATT	2	6	558996	559001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835661
10012	NC_015062	TCGCG	2	10	559003	559012	0 %	20 %	40 %	40 %	322835662
10013	NC_015062	CATTT	2	10	559059	559068	20 %	60 %	0 %	20 %	322835662
10014	NC_015062	TCAG	2	8	559129	559136	25 %	25 %	25 %	25 %	322835662
10015	NC_015062	GCT	2	6	559190	559195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835662
10016	NC_015062	GA	4	8	559232	559239	50 %	0 %	50 %	0 %	322835662
10017	NC_015062	GT	3	6	559285	559290	0 %	50 %	50 %	0 %	322835662
10018	NC_015062	CTG	2	6	559296	559301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835662
10019	NC_015062	GCT	2	6	559312	559317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835662
10020	NC_015062	CCAG	2	8	559362	559369	25 %	0 %	25 %	50 %	322835662
10021	NC_015062	CTG	2	6	559371	559376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835662
10022	NC_015062	ACG	2	6	559454	559459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835662
10023	NC_015062	AAC	2	6	559472	559477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835662
10024	NC_015062	GAG	2	6	559502	559507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322835662
10025	NC_015062	TGAT	2	8	559520	559527	25 %	50 %	25 %	0 %	322835662
10026	NC_015062	TGCAGG	2	12	559610	559621	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322835663
10027	NC_015062	GGC	2	6	559637	559642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835663
10028	NC_015062	GAG	2	6	559741	559746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322835663
10029	NC_015062	AC	3	6	559798	559803	50 %	0 %	0 %	50 %	322835664
10030	NC_015062	CTG	2	6	559905	559910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835664
10031	NC_015062	CCG	2	6	559915	559920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835664
10032	NC_015062	GAT	2	6	559923	559928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835664
10033	NC_015062	CTG	2	6	560077	560082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835664
10034	NC_015062	GTCA	2	8	560093	560100	25 %	25 %	25 %	25 %	322835664
10035	NC_015062	CTG	2	6	560128	560133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835664
10036	NC_015062	GGT	2	6	560144	560149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835664
10037	NC_015062	CAG	2	6	560161	560166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835664
10038	NC_015062	ACC	2	6	560181	560186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835664
10039	NC_015062	AAAT	2	8	560297	560304	75 %	25 %	0 %	0 %	322835664
10040	NC_015062	AGC	2	6	560315	560320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835664
10041	NC_015062	CGTT	2	8	560553	560560	0 %	50 %	25 %	25 %	322835665
10042	NC_015062	GCT	2	6	560650	560655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835666
10043	NC_015062	GC	3	6	560688	560693	0 %	0 %	50 %	50 %	322835666
10044	NC_015062	A	6	6	560695	560700	100 %	0 %	0 %	0 %	322835666
10045	NC_015062	A	8	8	560720	560727	100 %	0 %	0 %	0 %	322835666
10046	NC_015062	A	8	8	560768	560775	100 %	0 %	0 %	0 %	322835666
10047	NC_015062	GA	4	8	560832	560839	50 %	0 %	50 %	0 %	322835666
10048	NC_015062	GCA	2	6	560920	560925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835666
10049	NC_015062	TGG	2	6	560934	560939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835666
10050	NC_015062	CGC	2	6	560947	560952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835666
10051	NC_015062	CTG	3	9	560953	560961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835666
10052	NC_015062	ATT	2	6	561009	561014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835666
10053	NC_015062	TGC	2	6	561024	561029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835666
10054	NC_015062	TGG	2	6	561035	561040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835666
10055	NC_015062	TCC	2	6	561104	561109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322835666
10056	NC_015062	A	6	6	561113	561118	100 %	0 %	0 %	0 %	322835666
10057	NC_015062	CGC	2	6	561123	561128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835666
10058	NC_015062	GAT	2	6	561138	561143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835666
10059	NC_015062	GGGC	2	8	561199	561206	0 %	0 %	75 %	25 %	322835666
10060	NC_015062	ACT	2	6	561229	561234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835666
10061	NC_015062	TGA	2	6	561291	561296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835666
10062	NC_015062	GCA	2	6	561334	561339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835666
10063	NC_015062	TCCCGT	2	12	561580	561591	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	322835667
10064	NC_015062	A	6	6	561600	561605	100 %	0 %	0 %	0 %	322835667
10065	NC_015062	CAG	2	6	561660	561665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835667
10066	NC_015062	TGC	2	6	561673	561678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835667
10067	NC_015062	CTG	2	6	561789	561794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835667
10068	NC_015062	AGG	2	6	561805	561810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322835667
10069	NC_015062	CAGC	2	8	561839	561846	25 %	0 %	25 %	50 %	322835667
10070	NC_015062	GC	3	6	562014	562019	0 %	0 %	50 %	50 %	322835667
10071	NC_015062	GAA	2	6	562067	562072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835667
10072	NC_015062	AGGC	2	8	562129	562136	25 %	0 %	50 %	25 %	322835667
10073	NC_015062	GCA	2	6	562185	562190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835667
10074	NC_015062	TTC	2	6	562192	562197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835667
10075	NC_015062	ACT	2	6	562205	562210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835667
10076	NC_015062	ACC	2	6	562233	562238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835667
10077	NC_015062	CGG	2	6	562301	562306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835667
10078	NC_015062	GTC	2	6	562401	562406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835667
10079	NC_015062	GCT	2	6	562476	562481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835667
10080	NC_015062	CGA	2	6	562547	562552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835667
10081	NC_015062	TG	3	6	562666	562671	0 %	50 %	50 %	0 %	322835667
10082	NC_015062	GTTTC	2	10	562691	562700	0 %	60 %	20 %	20 %	322835667
10083	NC_015062	CGCA	2	8	562862	562869	25 %	0 %	25 %	50 %	322835667
10084	NC_015062	CAA	2	6	562871	562876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835667
10085	NC_015062	TTC	2	6	562881	562886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835667
10086	NC_015062	TGG	2	6	562908	562913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835667
10087	NC_015062	ATT	2	6	562983	562988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835667
10088	NC_015062	ATC	2	6	563025	563030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835667
10089	NC_015062	TCAA	2	8	563052	563059	50 %	25 %	0 %	25 %	322835667
10090	NC_015062	AGC	2	6	563086	563091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835667
10091	NC_015062	TGA	2	6	563128	563133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835667
10092	NC_015062	ACG	2	6	563154	563159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835667
10093	NC_015062	AGG	2	6	563180	563185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322835667
10094	NC_015062	CG	3	6	563199	563204	0 %	0 %	50 %	50 %	322835668
10095	NC_015062	A	7	7	563207	563213	100 %	0 %	0 %	0 %	322835668
10096	NC_015062	CTG	2	6	563220	563225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835668
10097	NC_015062	GCA	3	9	563260	563268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835668
10098	NC_015062	TCA	2	6	563345	563350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835668
10099	NC_015062	ATC	2	6	563354	563359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835668
10100	NC_015062	CGA	2	6	563383	563388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835668
10101	NC_015062	A	6	6	563396	563401	100 %	0 %	0 %	0 %	322835668
10102	NC_015062	TGG	2	6	563518	563523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835668
10103	NC_015062	GAA	2	6	563578	563583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835668
10104	NC_015062	CTT	2	6	563609	563614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835668
10105	NC_015062	GTC	2	6	563649	563654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835668
10106	NC_015062	ACA	2	6	563708	563713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835668
10107	NC_015062	CAC	2	6	563741	563746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835668
10108	NC_015062	CAG	2	6	563786	563791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835668
10109	NC_015062	CCT	2	6	563850	563855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322835668
10110	NC_015062	ATT	2	6	563936	563941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835668
10111	NC_015062	GGC	2	6	563948	563953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835668
10112	NC_015062	TGAT	2	8	564024	564031	25 %	50 %	25 %	0 %	322835668
10113	NC_015062	CTG	2	6	564083	564088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835668
10114	NC_015062	AGA	2	6	564100	564105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835668
10115	NC_015062	TCA	2	6	564179	564184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835668
10116	NC_015062	ATT	2	6	564192	564197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835668
10117	NC_015062	TCGG	2	8	564203	564210	0 %	25 %	50 %	25 %	322835668
10118	NC_015062	GCA	2	6	564214	564219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835668
10119	NC_015062	CGC	2	6	564224	564229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835668
10120	NC_015062	CAT	2	6	564259	564264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835668
10121	NC_015062	GCCA	2	8	564282	564289	25 %	0 %	25 %	50 %	322835668
10122	NC_015062	GAC	2	6	564296	564301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835668
10123	NC_015062	TGAG	2	8	564333	564340	25 %	25 %	50 %	0 %	322835668
10124	NC_015062	CCA	2	6	564360	564365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835668
10125	NC_015062	GCG	2	6	564419	564424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835668
10126	NC_015062	TAA	2	6	564490	564495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835668
10127	NC_015062	CGC	2	6	564510	564515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835668
10128	NC_015062	CAG	2	6	564516	564521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835668
10129	NC_015062	GGC	2	6	564539	564544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835668
10130	NC_015062	GC	3	6	564594	564599	0 %	0 %	50 %	50 %	322835668
10131	NC_015062	ATC	2	6	564612	564617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835668
10132	NC_015062	ATC	2	6	564687	564692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835669
10133	NC_015062	CCA	2	6	564715	564720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835669
10134	NC_015062	CGG	2	6	564730	564735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835669
10135	NC_015062	CAGC	2	8	564770	564777	25 %	0 %	25 %	50 %	322835669
10136	NC_015062	TCA	2	6	564778	564783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835669
10137	NC_015062	TCA	2	6	564802	564807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835669
10138	NC_015062	TGA	2	6	565103	565108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835669
10139	NC_015062	GAT	2	6	565133	565138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835669
10140	NC_015062	TTC	2	6	565312	565317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835670
10141	NC_015062	GCT	2	6	565362	565367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835670
10142	NC_015062	GGA	2	6	565476	565481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322835670
10143	NC_015062	A	6	6	565493	565498	100 %	0 %	0 %	0 %	322835670
10144	NC_015062	CGGCG	2	10	565621	565630	0 %	0 %	60 %	40 %	322835670
10145	NC_015062	ACA	2	6	565637	565642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835670
10146	NC_015062	TGA	2	6	565710	565715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835670
10147	NC_015062	CGGG	2	8	565812	565819	0 %	0 %	75 %	25 %	322835670
10148	NC_015062	TGA	2	6	565959	565964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835670
10149	NC_015062	CGGG	2	8	565988	565995	0 %	0 %	75 %	25 %	322835670
10150	NC_015062	CAA	2	6	566020	566025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835670
10151	NC_015062	TGA	2	6	566061	566066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835670
10152	NC_015062	GGAA	2	8	566121	566128	50 %	0 %	50 %	0 %	322835670
10153	NC_015062	GAA	2	6	566137	566142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835670
10154	NC_015062	A	6	6	566141	566146	100 %	0 %	0 %	0 %	322835670
10155	NC_015062	GAA	2	6	566164	566169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835670
10156	NC_015062	AGA	2	6	566172	566177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835670
10157	NC_015062	GAAG	2	8	566178	566185	50 %	0 %	50 %	0 %	322835670
10158	NC_015062	A	6	6	566186	566191	100 %	0 %	0 %	0 %	322835670
10159	NC_015062	ACC	2	6	566413	566418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835670
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10162	NC_015062	CGG	2	6	566684	566689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835671
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10164	NC_015062	GCA	2	6	566748	566753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835671
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10166	NC_015062	CGG	2	6	566817	566822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835671
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10171	NC_015062	CGA	2	6	567417	567422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835672
10172	NC_015062	GCT	2	6	567462	567467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835672
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10175	NC_015062	CTG	2	6	567673	567678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835672
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10178	NC_015062	TTCG	2	8	567811	567818	0 %	50 %	25 %	25 %	322835672
10179	NC_015062	TGA	2	6	567836	567841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835672
10180	NC_015062	CTA	2	6	567882	567887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835672
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10182	NC_015062	GGCT	2	8	568083	568090	0 %	25 %	50 %	25 %	322835673
10183	NC_015062	ATG	2	6	568094	568099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835673
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10189	NC_015062	ATT	2	6	568524	568529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835674
10190	NC_015062	TGG	2	6	568576	568581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835674
10191	NC_015062	GCG	2	6	568590	568595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835674
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10193	NC_015062	TGA	2	6	568754	568759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835674
10194	NC_015062	ATC	2	6	568771	568776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835675
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10198	NC_015062	TGG	2	6	568838	568843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835675
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10200	NC_015062	CAA	2	6	568887	568892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835675
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10210	NC_015062	GCTCC	2	10	569337	569346	0 %	20 %	20 %	60 %	322835675
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10214	NC_015062	CT	3	6	569527	569532	0 %	50 %	0 %	50 %	322835676
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10217	NC_015062	GTTC	2	8	569701	569708	0 %	50 %	25 %	25 %	322835676
10218	NC_015062	GGAC	2	8	569890	569897	25 %	0 %	50 %	25 %	322835677
10219	NC_015062	GAA	2	6	569915	569920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835677
10220	NC_015062	TGA	3	9	569960	569968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835677
10221	NC_015062	ACG	2	6	570109	570114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835677
10222	NC_015062	CGGG	2	8	570123	570130	0 %	0 %	75 %	25 %	322835677
10223	NC_015062	TAA	2	6	570179	570184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835677
10224	NC_015062	CAC	2	6	570281	570286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835677
10225	NC_015062	GCG	2	6	570359	570364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835678
10226	NC_015062	CTG	2	6	570450	570455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835678
10227	NC_015062	TGC	2	6	570600	570605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835678
10228	NC_015062	AGCGT	2	10	570692	570701	20 %	20 %	40 %	20 %	322835678
10229	NC_015062	GCC	2	6	570713	570718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835678
10230	NC_015062	ACG	2	6	570779	570784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835678
10231	NC_015062	CTG	2	6	570797	570802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835678
10232	NC_015062	AGG	2	6	570808	570813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322835678
10233	NC_015062	TCA	3	9	570839	570847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835678
10234	NC_015062	CTT	2	6	571069	571074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835678
10235	NC_015062	CGA	2	6	571075	571080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835678
10236	NC_015062	CGG	2	6	571119	571124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835678
10237	NC_015062	ACA	2	6	571128	571133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835678
10238	NC_015062	TAC	2	6	571177	571182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835678
10239	NC_015062	GGC	2	6	571259	571264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835678
10240	NC_015062	TCAGC	2	10	571273	571282	20 %	20 %	20 %	40 %	322835678
10241	NC_015062	GGCA	2	8	571384	571391	25 %	0 %	50 %	25 %	322835678
10242	NC_015062	ATT	2	6	571410	571415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835678
10243	NC_015062	GAC	2	6	571585	571590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835679
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10301	NC_015062	CTG	2	6	575215	575220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835683
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10345	NC_015062	CAGT	2	8	578118	578125	25 %	25 %	25 %	25 %	322835688
10346	NC_015062	AAAGC	2	10	578132	578141	60 %	0 %	20 %	20 %	322835688
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10348	NC_015062	GC	3	6	578364	578369	0 %	0 %	50 %	50 %	322835689
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10350	NC_015062	ACG	2	6	578493	578498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835689
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10353	NC_015062	CTG	2	6	578624	578629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835689
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10355	NC_015062	CGC	2	6	578773	578778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835689
10356	NC_015062	CTGG	2	8	578780	578787	0 %	25 %	50 %	25 %	322835689
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