MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 11016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_015062	CCG	2	6	446761	446766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835544
8002	NC_015062	AGA	2	6	446833	446838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835544
8003	NC_015062	GTC	2	6	446849	446854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835544
8004	NC_015062	CCG	2	6	446875	446880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835544
8005	NC_015062	GCT	2	6	446885	446890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835544
8006	NC_015062	CCAG	2	8	446905	446912	25 %	0 %	25 %	50 %	322835544
8007	NC_015062	CGATG	2	10	446951	446960	20 %	20 %	40 %	20 %	322835544
8008	NC_015062	CG	4	8	446969	446976	0 %	0 %	50 %	50 %	322835544
8009	NC_015062	GC	3	6	446991	446996	0 %	0 %	50 %	50 %	322835544
8010	NC_015062	GTT	2	6	447082	447087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835544
8011	NC_015062	TGG	2	6	447299	447304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835545
8012	NC_015062	CTG	2	6	447343	447348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835545
8013	NC_015062	TGC	2	6	447357	447362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835545
8014	NC_015062	GAACT	2	10	447406	447415	40 %	20 %	20 %	20 %	322835545
8015	NC_015062	GT	3	6	447470	447475	0 %	50 %	50 %	0 %	322835545
8016	NC_015062	GTT	2	6	447552	447557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835545
8017	NC_015062	CCG	2	6	447572	447577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835545
8018	NC_015062	GCT	2	6	447597	447602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835545
8019	NC_015062	ATTT	2	8	447609	447616	25 %	75 %	0 %	0 %	322835545
8020	NC_015062	CGTT	2	8	447618	447625	0 %	50 %	25 %	25 %	322835545
8021	NC_015062	GCT	2	6	447648	447653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835545
8022	NC_015062	CTG	2	6	447706	447711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835545
8023	NC_015062	CAG	2	6	447753	447758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835545
8024	NC_015062	CGG	2	6	447764	447769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835545
8025	NC_015062	CGCGC	2	10	447859	447868	0 %	0 %	40 %	60 %	322835545
8026	NC_015062	ATC	2	6	447973	447978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835545
8027	NC_015062	CGT	2	6	447981	447986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835545
8028	NC_015062	GTG	2	6	448018	448023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835545
8029	NC_015062	TTG	2	6	448025	448030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835545
8030	NC_015062	GC	3	6	448112	448117	0 %	0 %	50 %	50 %	322835545
8031	NC_015062	TGC	2	6	448118	448123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835545
8032	NC_015062	TGGC	2	8	448124	448131	0 %	25 %	50 %	25 %	322835545
8033	NC_015062	CTG	2	6	448141	448146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835545
8034	NC_015062	CTG	2	6	448258	448263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835546
8035	NC_015062	TGGC	2	8	448303	448310	0 %	25 %	50 %	25 %	322835546
8036	NC_015062	GGC	2	6	448452	448457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835546
8037	NC_015062	TGG	2	6	448460	448465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835546
8038	NC_015062	TCG	2	6	448472	448477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835546
8039	NC_015062	GGC	2	6	448510	448515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835546
8040	NC_015062	TGC	2	6	448658	448663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835546
8041	NC_015062	TTG	2	6	448706	448711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835546
8042	NC_015062	GCG	2	6	448727	448732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835546
8043	NC_015062	TTTTAT	2	12	448809	448820	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	322835546
8044	NC_015062	CTG	2	6	448822	448827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835546
8045	NC_015062	TTTC	2	8	448828	448835	0 %	75 %	0 %	25 %	322835546
8046	NC_015062	CCAC	2	8	448867	448874	25 %	0 %	0 %	75 %	322835546
8047	NC_015062	GC	3	6	448894	448899	0 %	0 %	50 %	50 %	322835546
8048	NC_015062	TTTG	2	8	448917	448924	0 %	75 %	25 %	0 %	322835546
8049	NC_015062	GCG	2	6	448933	448938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835546
8050	NC_015062	CTGGCG	2	12	448966	448977	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322835546
8051	NC_015062	TGA	2	6	449000	449005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835546
8052	NC_015062	CGT	2	6	449014	449019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835546
8053	NC_015062	GT	3	6	449018	449023	0 %	50 %	50 %	0 %	322835546
8054	NC_015062	A	6	6	449029	449034	100 %	0 %	0 %	0 %	322835546
8055	NC_015062	ATGA	2	8	449037	449044	50 %	25 %	25 %	0 %	322835546
8056	NC_015062	GTG	2	6	449073	449078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835547
8057	NC_015062	TGG	2	6	449104	449109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835547
8058	NC_015062	CCA	2	6	449179	449184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835547
8059	NC_015062	GTC	2	6	449209	449214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835547
8060	NC_015062	GGCA	2	8	449301	449308	25 %	0 %	50 %	25 %	322835547
8061	NC_015062	AGC	2	6	449336	449341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835547
8062	NC_015062	GGC	2	6	449381	449386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835547
8063	NC_015062	AAC	2	6	449446	449451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835547
8064	NC_015062	CGG	2	6	449504	449509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835547
8065	NC_015062	GC	3	6	449519	449524	0 %	0 %	50 %	50 %	322835547
8066	NC_015062	GAT	2	6	449525	449530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835547
8067	NC_015062	GTT	2	6	449558	449563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835547
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8069	NC_015062	CA	3	6	449600	449605	50 %	0 %	0 %	50 %	322835547
8070	NC_015062	CAT	2	6	449708	449713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835547
8071	NC_015062	GCA	2	6	449720	449725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835547
8072	NC_015062	CTG	2	6	449760	449765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835547
8073	NC_015062	AGCC	2	8	449766	449773	25 %	0 %	25 %	50 %	322835547
8074	NC_015062	TGC	2	6	449797	449802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835547
8075	NC_015062	CGC	2	6	449824	449829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835547
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8077	NC_015062	TGC	2	6	449896	449901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835547
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8079	NC_015062	CGC	2	6	450004	450009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835547
8080	NC_015062	TCAT	2	8	450094	450101	25 %	50 %	0 %	25 %	322835547
8081	NC_015062	CAGC	2	8	450188	450195	25 %	0 %	25 %	50 %	322835547
8082	NC_015062	CGG	2	6	450275	450280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835547
8083	NC_015062	GT	4	8	450292	450299	0 %	50 %	50 %	0 %	322835547
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8087	NC_015062	GCTG	2	8	450598	450605	0 %	25 %	50 %	25 %	322835547
8088	NC_015062	TAAT	2	8	450620	450627	50 %	50 %	0 %	0 %	322835547
8089	NC_015062	CAA	2	6	450877	450882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835548
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8091	NC_015062	AAT	2	6	450997	451002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835548
8092	NC_015062	A	7	7	451148	451154	100 %	0 %	0 %	0 %	322835548
8093	NC_015062	CGC	2	6	451177	451182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835548
8094	NC_015062	ATCCA	2	10	451184	451193	40 %	20 %	0 %	40 %	322835548
8095	NC_015062	CAC	2	6	451327	451332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835548
8096	NC_015062	ATCTGG	2	12	451347	451358	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322835548
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8100	NC_015062	CA	3	6	451573	451578	50 %	0 %	0 %	50 %	322835548
8101	NC_015062	ATGA	2	8	451634	451641	50 %	25 %	25 %	0 %	322835548
8102	NC_015062	CTG	2	6	451646	451651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835548
8103	NC_015062	GTGC	2	8	451667	451674	0 %	25 %	50 %	25 %	322835548
8104	NC_015062	CAG	2	6	451748	451753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835548
8105	NC_015062	GAA	2	6	451766	451771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835548
8106	NC_015062	CG	3	6	451825	451830	0 %	0 %	50 %	50 %	322835548
8107	NC_015062	CTG	2	6	451841	451846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835548
8108	NC_015062	GTG	2	6	451886	451891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835548
8109	NC_015062	GTG	2	6	451898	451903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835548
8110	NC_015062	TCG	2	6	451941	451946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835548
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8115	NC_015062	A	6	6	452206	452211	100 %	0 %	0 %	0 %	322835548
8116	NC_015062	TGAC	2	8	452214	452221	25 %	25 %	25 %	25 %	322835548
8117	NC_015062	CAA	2	6	452278	452283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835548
8118	NC_015062	GATG	2	8	452296	452303	25 %	25 %	50 %	0 %	322835548
8119	NC_015062	CAG	2	6	452312	452317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835548
8120	NC_015062	CGC	2	6	452320	452325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835548
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8122	NC_015062	CGG	3	9	452427	452435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835548
8123	NC_015062	TGA	3	9	452651	452659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835549
8124	NC_015062	GGC	3	9	452688	452696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835549
8125	NC_015062	GCA	3	9	452763	452771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835549
8126	NC_015062	GCG	2	6	452776	452781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835549
8127	NC_015062	GCG	2	6	452795	452800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835549
8128	NC_015062	GTC	2	6	452801	452806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835549
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8141	NC_015062	GGT	2	6	453360	453365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835549
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8186	NC_015062	TG	3	6	456267	456272	0 %	50 %	50 %	0 %	322835552
8187	NC_015062	TGG	2	6	456295	456300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835552
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8193	NC_015062	CATTC	2	10	456522	456531	20 %	40 %	0 %	40 %	322835552
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8200	NC_015062	TTC	2	6	456939	456944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835552
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8202	NC_015062	AGA	2	6	456977	456982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835552
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8218	NC_015062	GCCA	2	8	458307	458314	25 %	0 %	25 %	50 %	322835553
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8223	NC_015062	TGGGCG	2	12	458656	458667	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	322835553
8224	NC_015062	TATCGC	2	12	458669	458680	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322835553
8225	NC_015062	TATC	2	8	458722	458729	25 %	50 %	0 %	25 %	322835553
8226	NC_015062	TCG	2	6	458761	458766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835553
8227	NC_015062	ATG	2	6	458773	458778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835553
8228	NC_015062	GAC	2	6	458810	458815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835553
8229	NC_015062	CGC	2	6	458907	458912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835553
8230	NC_015062	CGC	2	6	458944	458949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835553
8231	NC_015062	ATT	3	9	458988	458996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835553
8232	NC_015062	CGAAA	2	10	459005	459014	60 %	0 %	20 %	20 %	322835553
8233	NC_015062	AATA	2	8	459096	459103	75 %	25 %	0 %	0 %	322835553
8234	NC_015062	CAG	2	6	459114	459119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835553
8235	NC_015062	TAT	2	6	459134	459139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835553
8236	NC_015062	GGC	2	6	459342	459347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835554
8237	NC_015062	CAA	2	6	459409	459414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835554
8238	NC_015062	GAT	2	6	459449	459454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835554
8239	NC_015062	CTG	2	6	459500	459505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835554
8240	NC_015062	CTTT	2	8	459578	459585	0 %	75 %	0 %	25 %	322835554
8241	NC_015062	ATC	2	6	459608	459613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835554
8242	NC_015062	AAC	2	6	459621	459626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835554
8243	NC_015062	GAC	2	6	459652	459657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835554
8244	NC_015062	CAA	2	6	459670	459675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835554
8245	NC_015062	GATA	2	8	459703	459710	50 %	25 %	25 %	0 %	322835554
8246	NC_015062	GAT	2	6	459838	459843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835554
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8256	NC_015062	CGGTC	2	10	460358	460367	0 %	20 %	40 %	40 %	322835554
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8264	NC_015062	TCG	2	6	460725	460730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835554
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8276	NC_015062	TCG	2	6	461536	461541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835554
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8324	NC_015062	GTC	2	6	464186	464191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835557
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8354	NC_015062	CCA	2	6	466208	466213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835559
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8357	NC_015062	CAGG	2	8	466592	466599	25 %	0 %	50 %	25 %	322835559
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8362	NC_015062	GT	3	6	467204	467209	0 %	50 %	50 %	0 %	322835560
8363	NC_015062	TCAC	2	8	467226	467233	25 %	25 %	0 %	50 %	322835560
8364	NC_015062	CAT	2	6	467234	467239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835560
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8487	NC_015062	AAT	2	6	473828	473833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835565
8488	NC_015062	T	6	6	473836	473841	0 %	100 %	0 %	0 %	322835565
8489	NC_015062	ATAA	2	8	473846	473853	75 %	25 %	0 %	0 %	322835565
8490	NC_015062	GGGGC	2	10	474247	474256	0 %	0 %	80 %	20 %	322835566
8491	NC_015062	CGG	2	6	474259	474264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835566
8492	NC_015062	ATC	2	6	474430	474435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835566
8493	NC_015062	TGAT	2	8	474571	474578	25 %	50 %	25 %	0 %	322835566
8494	NC_015062	GGC	2	6	474657	474662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835566
8495	NC_015062	GCG	2	6	474771	474776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835566
8496	NC_015062	CAG	2	6	474869	474874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835566
8497	NC_015062	CAGATT	2	12	474909	474920	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	322835566
8498	NC_015062	CCA	2	6	474940	474945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835566
8499	NC_015062	TCAA	2	8	474970	474977	50 %	25 %	0 %	25 %	322835566
8500	NC_015062	GGT	2	6	475035	475040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835566

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