MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 11016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015062	TCA	2	6	368528	368533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835478
6502	NC_015062	GGT	2	6	368537	368542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835478
6503	NC_015062	CGC	2	6	368584	368589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835478
6504	NC_015062	GCG	2	6	368621	368626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835478
6505	NC_015062	GGT	2	6	368652	368657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835478
6506	NC_015062	CGG	2	6	368667	368672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835478
6507	NC_015062	TTC	2	6	368685	368690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835478
6508	NC_015062	TGC	2	6	368780	368785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835478
6509	NC_015062	TAT	2	6	368795	368800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835478
6510	NC_015062	CAG	2	6	368817	368822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835478
6511	NC_015062	TCTT	2	8	368902	368909	0 %	75 %	0 %	25 %	322835478
6512	NC_015062	T	6	6	368908	368913	0 %	100 %	0 %	0 %	322835478
6513	NC_015062	TCA	2	6	368920	368925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835478
6514	NC_015062	ATC	2	6	368928	368933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835478
6515	NC_015062	CAT	2	6	368937	368942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835478
6516	NC_015062	AAC	2	6	368946	368951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835478
6517	NC_015062	GGC	2	6	368962	368967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835478
6518	NC_015062	GACT	2	8	368994	369001	25 %	25 %	25 %	25 %	322835479
6519	NC_015062	TG	3	6	369018	369023	0 %	50 %	50 %	0 %	322835479
6520	NC_015062	CGG	2	6	369027	369032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835479
6521	NC_015062	ATG	2	6	369104	369109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835479
6522	NC_015062	GT	3	6	369169	369174	0 %	50 %	50 %	0 %	322835479
6523	NC_015062	GC	3	6	369203	369208	0 %	0 %	50 %	50 %	322835479
6524	NC_015062	GTCCA	2	10	369225	369234	20 %	20 %	20 %	40 %	322835479
6525	NC_015062	GCA	2	6	369295	369300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835479
6526	NC_015062	CGG	2	6	369335	369340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835479
6527	NC_015062	TAA	2	6	369570	369575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835479
6528	NC_015062	GCC	2	6	369608	369613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835479
6529	NC_015062	GGT	2	6	369752	369757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835479
6530	NC_015062	CAG	2	6	369776	369781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835479
6531	NC_015062	CGG	2	6	369827	369832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835479
6532	NC_015062	GGT	2	6	369887	369892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835479
6533	NC_015062	GTGAA	2	10	369952	369961	40 %	20 %	40 %	0 %	322835479
6534	NC_015062	CGC	2	6	369985	369990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835479
6535	NC_015062	CGT	2	6	370027	370032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835479
6536	NC_015062	CTGC	2	8	370036	370043	0 %	25 %	25 %	50 %	322835479
6537	NC_015062	GCA	2	6	370153	370158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835479
6538	NC_015062	CGGCG	2	10	370198	370207	0 %	0 %	60 %	40 %	322835479
6539	NC_015062	GGGC	2	8	370219	370226	0 %	0 %	75 %	25 %	322835479
6540	NC_015062	CTG	2	6	370250	370255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835479
6541	NC_015062	GTG	2	6	370320	370325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835479
6542	NC_015062	GCA	2	6	370474	370479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835479
6543	NC_015062	TCAG	2	8	370497	370504	25 %	25 %	25 %	25 %	322835479
6544	NC_015062	ATCT	2	8	370520	370527	25 %	50 %	0 %	25 %	322835479
6545	NC_015062	CAT	2	6	370544	370549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835479
6546	NC_015062	CG	3	6	370588	370593	0 %	0 %	50 %	50 %	322835479
6547	NC_015062	CG	3	6	370619	370624	0 %	0 %	50 %	50 %	322835479
6548	NC_015062	CTTC	2	8	370663	370670	0 %	50 %	0 %	50 %	322835479
6549	NC_015062	GCC	2	6	370806	370811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835480
6550	NC_015062	GTT	2	6	370816	370821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835480
6551	NC_015062	CCA	2	6	370848	370853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835480
6552	NC_015062	CCTG	2	8	370965	370972	0 %	25 %	25 %	50 %	322835480
6553	NC_015062	GCG	2	6	370979	370984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835480
6554	NC_015062	ACC	2	6	371033	371038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835480
6555	NC_015062	CGC	2	6	371052	371057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835480
6556	NC_015062	GCGCG	2	10	371073	371082	0 %	0 %	60 %	40 %	322835480
6557	NC_015062	GCT	2	6	371179	371184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835480
6558	NC_015062	TAA	2	6	371200	371205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835480
6559	NC_015062	TCC	2	6	371262	371267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322835481
6560	NC_015062	GCC	3	9	371348	371356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835481
6561	NC_015062	TGG	2	6	371392	371397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835481
6562	NC_015062	GCT	2	6	371423	371428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835481
6563	NC_015062	GCC	2	6	371477	371482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835481
6564	NC_015062	GCG	2	6	371574	371579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835481
6565	NC_015062	CGG	2	6	371727	371732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835481
6566	NC_015062	TAA	2	6	371857	371862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835481
6567	NC_015062	CTG	2	6	372011	372016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835481
6568	NC_015062	TCA	2	6	372025	372030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835481
6569	NC_015062	GCT	2	6	372080	372085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835481
6570	NC_015062	GGCT	2	8	372100	372107	0 %	25 %	50 %	25 %	322835481
6571	NC_015062	GTG	2	6	372144	372149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835481
6572	NC_015062	GCA	2	6	372250	372255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835481
6573	NC_015062	GCA	2	6	372291	372296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835481
6574	NC_015062	GCC	2	6	372309	372314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835481
6575	NC_015062	CGG	2	6	372323	372328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835481
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6579	NC_015062	CGG	2	6	372400	372405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835481
6580	NC_015062	GCG	2	6	372406	372411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835481
6581	NC_015062	CAG	2	6	372443	372448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835481
6582	NC_015062	CAG	2	6	372515	372520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835481
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6584	NC_015062	CAG	2	6	372680	372685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835481
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6588	NC_015062	GCG	2	6	372880	372885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835481
6589	NC_015062	CTG	2	6	372902	372907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835481
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6591	NC_015062	CGG	2	6	372985	372990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835481
6592	NC_015062	TGC	2	6	373020	373025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835481
6593	NC_015062	GCCA	2	8	373056	373063	25 %	0 %	25 %	50 %	322835481
6594	NC_015062	GAG	2	6	373099	373104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322835481
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6602	NC_015062	TGT	2	6	373402	373407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835481
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6604	NC_015062	GCA	2	6	373468	373473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835481
6605	NC_015062	CAGCGT	2	12	373547	373558	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322835481
6606	NC_015062	GGT	2	6	373588	373593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835481
6607	NC_015062	CTG	2	6	373604	373609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835481
6608	NC_015062	GCA	2	6	373695	373700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835481
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6612	NC_015062	GCA	2	6	373810	373815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835481
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6618	NC_015062	CTCA	2	8	373973	373980	25 %	25 %	0 %	50 %	322835481
6619	NC_015062	CGG	2	6	373997	374002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835481
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