MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 86290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015061	ATT	2	6	132375	132380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830850
2502	NC_015061	AT	3	6	132418	132423	50 %	50 %	0 %	0 %	322830850
2503	NC_015061	GGC	2	6	132497	132502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830850
2504	NC_015061	CGG	2	6	132524	132529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830850
2505	NC_015061	ACAA	2	8	132567	132574	75 %	0 %	0 %	25 %	322830850
2506	NC_015061	GGCG	2	8	132580	132587	0 %	0 %	75 %	25 %	322830850
2507	NC_015061	AGA	2	6	132595	132600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830850
2508	NC_015061	TCA	2	6	132673	132678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830850
2509	NC_015061	CGC	2	6	132704	132709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830850
2510	NC_015061	GCA	2	6	132724	132729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830850
2511	NC_015061	T	6	6	132734	132739	0 %	100 %	0 %	0 %	322830850
2512	NC_015061	TCA	2	6	132826	132831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830850
2513	NC_015061	ACCCAG	2	12	132854	132865	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	322830850
2514	NC_015061	T	6	6	132880	132885	0 %	100 %	0 %	0 %	322830850
2515	NC_015061	GCG	2	6	132971	132976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830850
2516	NC_015061	CG	3	6	133018	133023	0 %	0 %	50 %	50 %	322830850
2517	NC_015061	GCT	2	6	133114	133119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830850
2518	NC_015061	ACCG	2	8	133235	133242	25 %	0 %	25 %	50 %	322830850
2519	NC_015061	GCA	2	6	133348	133353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830850
2520	NC_015061	TG	3	6	133470	133475	0 %	50 %	50 %	0 %	322830850
2521	NC_015061	ATG	2	6	133494	133499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830850
2522	NC_015061	ACC	2	6	133730	133735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830851
2523	NC_015061	ATG	2	6	133773	133778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830851
2524	NC_015061	CGC	3	9	133834	133842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830851
2525	NC_015061	GCG	2	6	133967	133972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830851
2526	NC_015061	CA	3	6	134063	134068	50 %	0 %	0 %	50 %	322830851
2527	NC_015061	CAC	2	6	134084	134089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830851
2528	NC_015061	GGT	2	6	134189	134194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830851
2529	NC_015061	GTCC	2	8	134302	134309	0 %	25 %	25 %	50 %	322830851
2530	NC_015061	GCA	2	6	134341	134346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830851
2531	NC_015061	TGC	2	6	134373	134378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830851
2532	NC_015061	AC	3	6	134389	134394	50 %	0 %	0 %	50 %	322830851
2533	NC_015061	CG	3	6	134423	134428	0 %	0 %	50 %	50 %	322830851
2534	NC_015061	ATTG	2	8	134469	134476	25 %	50 %	25 %	0 %	322830851
2535	NC_015061	TTG	3	9	134500	134508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830851
2536	NC_015061	CGG	2	6	134641	134646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830852
2537	NC_015061	A	6	6	134686	134691	100 %	0 %	0 %	0 %	322830852
2538	NC_015061	GTG	2	6	134744	134749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830852
2539	NC_015061	CGTTG	2	10	134779	134788	0 %	40 %	40 %	20 %	322830852
2540	NC_015061	TGT	2	6	134827	134832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830852
2541	NC_015061	CAA	2	6	134890	134895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830852
2542	NC_015061	TAC	2	6	134929	134934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830852
2543	NC_015061	GAA	2	6	134936	134941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830852
2544	NC_015061	TGA	3	9	134952	134960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830852
2545	NC_015061	TTC	2	6	134981	134986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830852
2546	NC_015061	ATG	2	6	135089	135094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830852
2547	NC_015061	GAT	2	6	135278	135283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830852
2548	NC_015061	TGG	2	6	135294	135299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830852
2549	NC_015061	TGA	2	6	135313	135318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830852
2550	NC_015061	CGCTT	2	10	135393	135402	0 %	40 %	20 %	40 %	322830853
2551	NC_015061	TGC	2	6	135408	135413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830853
2552	NC_015061	CGG	2	6	135632	135637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830853
2553	NC_015061	CCAGCC	2	12	135655	135666	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	322830853
2554	NC_015061	CACG	2	8	135682	135689	25 %	0 %	25 %	50 %	322830853
2555	NC_015061	TGAA	2	8	135780	135787	50 %	25 %	25 %	0 %	322830853
2556	NC_015061	ACA	2	6	135790	135795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830853
2557	NC_015061	CTG	2	6	135852	135857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830853
2558	NC_015061	CCGG	2	8	135879	135886	0 %	0 %	50 %	50 %	322830853
2559	NC_015061	CAA	2	6	135892	135897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830853
2560	NC_015061	TGACCA	2	12	136024	136035	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322830853
2561	NC_015061	TTC	2	6	136044	136049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830853
2562	NC_015061	TCT	2	6	136467	136472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830854
2563	NC_015061	TTC	2	6	136474	136479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830854
2564	NC_015061	ACG	2	6	136489	136494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830854
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2567	NC_015061	CGC	2	6	136585	136590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830854
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2569	NC_015061	GCG	2	6	136638	136643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830854
2570	NC_015061	ATT	2	6	136644	136649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830854
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2572	NC_015061	TGA	2	6	136726	136731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830854
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2574	NC_015061	CTAT	2	8	136763	136770	25 %	50 %	0 %	25 %	322830854
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2581	NC_015061	GCA	2	6	137014	137019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830854
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2583	NC_015061	TG	3	6	137100	137105	0 %	50 %	50 %	0 %	322830855
2584	NC_015061	CTG	2	6	137119	137124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830855
2585	NC_015061	GCC	2	6	137134	137139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830855
2586	NC_015061	TGA	2	6	137154	137159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830855
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2591	NC_015061	AAG	2	6	137351	137356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830855
2592	NC_015061	CGA	2	6	137400	137405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830855
2593	NC_015061	TAT	2	6	137416	137421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830855
2594	NC_015061	CGATTG	2	12	137429	137440	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322830855
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2599	NC_015061	GC	3	6	137761	137766	0 %	0 %	50 %	50 %	322830856
2600	NC_015061	CGTC	2	8	137849	137856	0 %	25 %	25 %	50 %	322830856
2601	NC_015061	TGA	2	6	137879	137884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830856
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2604	NC_015061	CAT	2	6	138056	138061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830856
2605	NC_015061	GCA	2	6	138122	138127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830856
2606	NC_015061	GA	3	6	138130	138135	50 %	0 %	50 %	0 %	322830856
2607	NC_015061	A	6	6	138135	138140	100 %	0 %	0 %	0 %	322830856
2608	NC_015061	TGG	2	6	138183	138188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830857
2609	NC_015061	GAC	2	6	138251	138256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830857
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2611	NC_015061	ACG	2	6	138306	138311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830857
2612	NC_015061	GC	3	6	138318	138323	0 %	0 %	50 %	50 %	322830857
2613	NC_015061	CGC	2	6	138424	138429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830857
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2619	NC_015061	CGG	2	6	138630	138635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830857
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2621	NC_015061	CCG	2	6	138796	138801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830857
2622	NC_015061	TGC	2	6	138886	138891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830857
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2743	NC_015061	GAT	2	6	146351	146356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830862
2744	NC_015061	TGC	2	6	146365	146370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830862
2745	NC_015061	CCG	2	6	146416	146421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830862
2746	NC_015061	GCT	2	6	146489	146494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830862
2747	NC_015061	GCC	2	6	146506	146511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830862
2748	NC_015061	AT	3	6	146543	146548	50 %	50 %	0 %	0 %	322830862
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2759	NC_015061	GCGG	2	8	147817	147824	0 %	0 %	75 %	25 %	322830863
2760	NC_015061	GCT	2	6	147837	147842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830863
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2762	NC_015061	CGG	2	6	147891	147896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830863
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2844	NC_015061	CTG	2	6	151439	151444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830866
2845	NC_015061	GC	3	6	151445	151450	0 %	0 %	50 %	50 %	322830866
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2850	NC_015061	CGGG	2	8	151727	151734	0 %	0 %	75 %	25 %	322830866
2851	NC_015061	CTGC	2	8	151735	151742	0 %	25 %	25 %	50 %	322830866
2852	NC_015061	TTCGCC	2	12	151868	151879	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	322830866
2853	NC_015061	GC	3	6	151999	152004	0 %	0 %	50 %	50 %	322830866
2854	NC_015061	CGC	3	9	152002	152010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830866
2855	NC_015061	GGCCGG	2	12	152056	152067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830866
2856	NC_015061	AGTTGT	2	12	152104	152115	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	322830866
2857	NC_015061	CGC	2	6	152134	152139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830866
2858	NC_015061	CCG	2	6	152262	152267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830866
2859	NC_015061	GAT	2	6	152300	152305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830866
2860	NC_015061	TCA	2	6	152341	152346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830866
2861	NC_015061	TGA	2	6	152371	152376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830866
2862	NC_015061	TCT	2	6	152400	152405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830866
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2864	NC_015061	TGACG	2	10	152533	152542	20 %	20 %	40 %	20 %	322830866
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2986	NC_015061	CAT	2	6	159648	159653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830870
2987	NC_015061	GCG	2	6	159900	159905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830870
2988	NC_015061	GCC	2	6	159940	159945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830870
2989	NC_015061	ACG	2	6	159958	159963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830870
2990	NC_015061	CAG	2	6	160029	160034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830870
2991	NC_015061	CAC	2	6	160053	160058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830870
2992	NC_015061	CGC	2	6	160118	160123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830870
2993	NC_015061	CGA	2	6	160155	160160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830870
2994	NC_015061	CCG	2	6	160174	160179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830870
2995	NC_015061	CAG	2	6	160197	160202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830870
2996	NC_015061	CGAG	2	8	160307	160314	25 %	0 %	50 %	25 %	322830870
2997	NC_015061	CCAGC	2	10	160338	160347	20 %	0 %	20 %	60 %	322830870
2998	NC_015061	AATA	2	8	160382	160389	75 %	25 %	0 %	0 %	322830870
2999	NC_015061	TAT	2	6	160391	160396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830870
3000	NC_015061	ATC	2	6	160579	160584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830871

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