MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 86290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_015061	TGA	2	6	1026204	1026209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831683
18502	NC_015061	CAT	2	6	1026480	1026485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831684
18503	NC_015061	CCTT	2	8	1026520	1026527	0 %	50 %	0 %	50 %	322831684
18504	NC_015061	TCA	2	6	1026564	1026569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831684
18505	NC_015061	ATA	2	6	1026572	1026577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831684
18506	NC_015061	CCG	2	6	1026583	1026588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831684
18507	NC_015061	GATGTG	2	12	1026648	1026659	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	322831684
18508	NC_015061	TGGAAG	2	12	1026677	1026688	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	322831684
18509	NC_015061	TGC	2	6	1026737	1026742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831684
18510	NC_015061	GCA	2	6	1026810	1026815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831684
18511	NC_015061	GCGA	2	8	1026847	1026854	25 %	0 %	50 %	25 %	322831684
18512	NC_015061	GCC	2	6	1026868	1026873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831684
18513	NC_015061	CGG	2	6	1027014	1027019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831684
18514	NC_015061	GT	3	6	1027084	1027089	0 %	50 %	50 %	0 %	322831684
18515	NC_015061	CAG	2	6	1027237	1027242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831684
18516	NC_015061	CCGCG	2	10	1027348	1027357	0 %	0 %	40 %	60 %	322831684
18517	NC_015061	GCT	2	6	1027395	1027400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831684
18518	NC_015061	TA	3	6	1027438	1027443	50 %	50 %	0 %	0 %	322831684
18519	NC_015061	AT	3	6	1027586	1027591	50 %	50 %	0 %	0 %	322831684
18520	NC_015061	AAGCT	2	10	1027607	1027616	40 %	20 %	20 %	20 %	322831684
18521	NC_015061	TTC	2	6	1027626	1027631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831684
18522	NC_015061	GGT	2	6	1027709	1027714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831684
18523	NC_015061	CTGT	2	8	1027913	1027920	0 %	50 %	25 %	25 %	322831685
18524	NC_015061	TGG	2	6	1027963	1027968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831685
18525	NC_015061	GA	3	6	1028075	1028080	50 %	0 %	50 %	0 %	322831685
18526	NC_015061	GAC	2	6	1028088	1028093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831685
18527	NC_015061	CTG	2	6	1028156	1028161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831685
18528	NC_015061	GAA	2	6	1028173	1028178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831685
18529	NC_015061	GGC	2	6	1028373	1028378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831686
18530	NC_015061	CGC	2	6	1028382	1028387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831686
18531	NC_015061	TTG	2	6	1028404	1028409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831686
18532	NC_015061	GC	3	6	1028425	1028430	0 %	0 %	50 %	50 %	322831686
18533	NC_015061	GATTGT	2	12	1028453	1028464	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	322831686
18534	NC_015061	TGC	2	6	1028480	1028485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831686
18535	NC_015061	CCA	2	6	1028521	1028526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831686
18536	NC_015061	CTG	2	6	1028541	1028546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831686
18537	NC_015061	TGC	2	6	1028623	1028628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831686
18538	NC_015061	GCT	2	6	1028690	1028695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831686
18539	NC_015061	TTGCTG	2	12	1028814	1028825	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	322831686
18540	NC_015061	TGA	3	9	1028903	1028911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831686
18541	NC_015061	GGCG	2	8	1028924	1028931	0 %	0 %	75 %	25 %	322831686
18542	NC_015061	CGG	2	6	1028954	1028959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831686
18543	NC_015061	CCA	2	6	1028965	1028970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831686
18544	NC_015061	GGC	2	6	1028978	1028983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831686
18545	NC_015061	CGGG	2	8	1028997	1029004	0 %	0 %	75 %	25 %	322831686
18546	NC_015061	ATT	2	6	1029015	1029020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831686
18547	NC_015061	CGC	2	6	1029100	1029105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831686
18548	NC_015061	CGA	2	6	1029161	1029166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831686
18549	NC_015061	ATG	2	6	1029183	1029188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831686
18550	NC_015061	GCT	2	6	1029203	1029208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831686
18551	NC_015061	ATCCGC	2	12	1029258	1029269	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322831686
18552	NC_015061	GCGAT	2	10	1029316	1029325	20 %	20 %	40 %	20 %	322831686
18553	NC_015061	TCA	2	6	1029341	1029346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831686
18554	NC_015061	CAG	2	6	1029351	1029356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831686
18555	NC_015061	GAC	2	6	1029405	1029410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831686
18556	NC_015061	GCTGAT	2	12	1029516	1029527	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322831687
18557	NC_015061	ATT	2	6	1029559	1029564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831687
18558	NC_015061	GCT	2	6	1029586	1029591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831687
18559	NC_015061	CTG	3	9	1029631	1029639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831687
18560	NC_015061	CG	3	6	1029645	1029650	0 %	0 %	50 %	50 %	322831687
18561	NC_015061	CGTG	2	8	1029672	1029679	0 %	25 %	50 %	25 %	322831687
18562	NC_015061	TGAT	2	8	1029713	1029720	25 %	50 %	25 %	0 %	322831687
18563	NC_015061	CAG	2	6	1029727	1029732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831687
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18566	NC_015061	GCG	2	6	1029863	1029868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831687
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18598	NC_015061	GCC	2	6	1031392	1031397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831688
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18602	NC_015061	CCA	2	6	1031606	1031611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831688
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18964	NC_015061	CG	3	6	1053789	1053794	0 %	0 %	50 %	50 %	322831713
18965	NC_015061	GGC	2	6	1053815	1053820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831713
18966	NC_015061	GC	3	6	1053819	1053824	0 %	0 %	50 %	50 %	322831713
18967	NC_015061	GC	3	6	1053873	1053878	0 %	0 %	50 %	50 %	322831713
18968	NC_015061	TGC	2	6	1053935	1053940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831713
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18972	NC_015061	CAT	2	6	1054123	1054128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831714
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18979	NC_015061	GCA	2	6	1054452	1054457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831714
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18981	NC_015061	GGC	2	6	1054506	1054511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831714
18982	NC_015061	CTG	2	6	1054592	1054597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831714
18983	NC_015061	TGG	2	6	1054607	1054612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831714
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18985	NC_015061	CGG	2	6	1054755	1054760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831714
18986	NC_015061	A	6	6	1054784	1054789	100 %	0 %	0 %	0 %	322831714
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18992	NC_015061	GCA	2	6	1055252	1055257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831715
18993	NC_015061	GGTGAT	2	12	1055280	1055291	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	322831715
18994	NC_015061	A	6	6	1055574	1055579	100 %	0 %	0 %	0 %	322831716
18995	NC_015061	CCG	2	6	1055593	1055598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831716
18996	NC_015061	CCA	2	6	1055612	1055617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831716
18997	NC_015061	CGG	2	6	1055670	1055675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831716
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18999	NC_015061	GAAA	2	8	1055964	1055971	75 %	0 %	25 %	0 %	322831716
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