MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 86290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_015061	GTCA	2	8	998559	998566	25 %	25 %	25 %	25 %	322831656
18002	NC_015061	GCG	2	6	998674	998679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831656
18003	NC_015061	CGG	2	6	998720	998725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831656
18004	NC_015061	CGC	2	6	998907	998912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831656
18005	NC_015061	GCA	2	6	998966	998971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831656
18006	NC_015061	CGC	2	6	998993	998998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831656
18007	NC_015061	GCC	2	6	999033	999038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831656
18008	NC_015061	GA	3	6	999111	999116	50 %	0 %	50 %	0 %	322831656
18009	NC_015061	GCG	2	6	999167	999172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831656
18010	NC_015061	C	6	6	999196	999201	0 %	0 %	0 %	100 %	322831656
18011	NC_015061	TCG	2	6	999233	999238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831656
18012	NC_015061	CCA	2	6	999248	999253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831656
18013	NC_015061	GAT	2	6	999311	999316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831656
18014	NC_015061	CTGTTA	2	12	999346	999357	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	322831656
18015	NC_015061	TGA	2	6	999572	999577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831657
18016	NC_015061	CGC	2	6	999607	999612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831657
18017	NC_015061	GAC	2	6	999651	999656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831657
18018	NC_015061	TGA	2	6	999658	999663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831657
18019	NC_015061	GCG	2	6	999694	999699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831657
18020	NC_015061	GCC	2	6	999718	999723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831657
18021	NC_015061	CGC	2	6	999923	999928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831657
18022	NC_015061	GC	3	6	1000016	1000021	0 %	0 %	50 %	50 %	322831657
18023	NC_015061	GAA	2	6	1000062	1000067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831657
18024	NC_015061	TGG	2	6	1000069	1000074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831657
18025	NC_015061	GTG	2	6	1000092	1000097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831657
18026	NC_015061	TCG	2	6	1000102	1000107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831657
18027	NC_015061	CCG	2	6	1000112	1000117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831657
18028	NC_015061	GCT	2	6	1000233	1000238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831657
18029	NC_015061	TTC	2	6	1000271	1000276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831657
18030	NC_015061	TGC	2	6	1000312	1000317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831657
18031	NC_015061	GCC	2	6	1000336	1000341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831657
18032	NC_015061	TCA	2	6	1000349	1000354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831657
18033	NC_015061	AGC	2	6	1000390	1000395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831657
18034	NC_015061	ATGAAC	2	12	1000659	1000670	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	322831658
18035	NC_015061	GCA	2	6	1000695	1000700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831658
18036	NC_015061	TGC	2	6	1000765	1000770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831658
18037	NC_015061	CCG	2	6	1000794	1000799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831658
18038	NC_015061	TTC	2	6	1001019	1001024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831658
18039	NC_015061	ACA	3	9	1001170	1001178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831658
18040	NC_015061	TGG	2	6	1001233	1001238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831658
18041	NC_015061	CGC	2	6	1001240	1001245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831658
18042	NC_015061	TGAA	2	8	1001353	1001360	50 %	25 %	25 %	0 %	322831658
18043	NC_015061	AAGAC	2	10	1001380	1001389	60 %	0 %	20 %	20 %	322831658
18044	NC_015061	GC	3	6	1001497	1001502	0 %	0 %	50 %	50 %	322831659
18045	NC_015061	CTG	2	6	1001523	1001528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831659
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18047	NC_015061	GCG	2	6	1001596	1001601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831659
18048	NC_015061	TGCG	2	8	1001632	1001639	0 %	25 %	50 %	25 %	322831659
18049	NC_015061	GCCA	2	8	1001714	1001721	25 %	0 %	25 %	50 %	322831659
18050	NC_015061	GCG	2	6	1001748	1001753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831659
18051	NC_015061	CTG	2	6	1001754	1001759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831659
18052	NC_015061	TGC	2	6	1001890	1001895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831659
18053	NC_015061	GAA	2	6	1001985	1001990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831659
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18057	NC_015061	TGC	3	9	1002097	1002105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831659
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18059	NC_015061	CTG	2	6	1002179	1002184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831660
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18061	NC_015061	TTG	2	6	1002203	1002208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831660
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18083	NC_015061	TG	3	6	1003274	1003279	0 %	50 %	50 %	0 %	322831661
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18089	NC_015061	CTG	2	6	1003609	1003614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831662
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18229	NC_015061	GTGATG	2	12	1010589	1010600	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	322831669
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18347	NC_015061	CATGAC	2	12	1017219	1017230	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322831676
18348	NC_015061	GTG	2	6	1017265	1017270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831676
18349	NC_015061	CAA	2	6	1017375	1017380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831676
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18351	NC_015061	TGA	2	6	1017438	1017443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831676
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18353	NC_015061	ATG	2	6	1017575	1017580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831676
18354	NC_015061	TAC	2	6	1017619	1017624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831676
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18364	NC_015061	TCG	2	6	1018295	1018300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831677
18365	NC_015061	CTT	2	6	1018374	1018379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831677
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18374	NC_015061	TGC	2	6	1018752	1018757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831677
18375	NC_015061	TGC	3	9	1018827	1018835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831677
18376	NC_015061	ACC	2	6	1018852	1018857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831677
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18380	NC_015061	CATC	2	8	1018983	1018990	25 %	25 %	0 %	50 %	322831677
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18460	NC_015061	CAG	2	6	1024109	1024114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831682
18461	NC_015061	CAG	2	6	1024121	1024126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831682
18462	NC_015061	CCATGT	2	12	1024207	1024218	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322831682
18463	NC_015061	T	6	6	1024229	1024234	0 %	100 %	0 %	0 %	322831682
18464	NC_015061	ATG	2	6	1024269	1024274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831682
18465	NC_015061	TCA	2	6	1024321	1024326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831682
18466	NC_015061	CCAG	2	8	1024349	1024356	25 %	0 %	25 %	50 %	322831682
18467	NC_015061	GCCA	2	8	1024385	1024392	25 %	0 %	25 %	50 %	322831682
18468	NC_015061	AGCG	2	8	1024446	1024453	25 %	0 %	50 %	25 %	322831682
18469	NC_015061	ACA	2	6	1024494	1024499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831682
18470	NC_015061	TCA	2	6	1024536	1024541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831682
18471	NC_015061	CAG	2	6	1024574	1024579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831682
18472	NC_015061	CCA	2	6	1024639	1024644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831682
18473	NC_015061	TCT	2	6	1024657	1024662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831682
18474	NC_015061	TGC	2	6	1024706	1024711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831682
18475	NC_015061	CAG	2	6	1024735	1024740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831682
18476	NC_015061	GCC	2	6	1024790	1024795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831682
18477	NC_015061	CAG	2	6	1024853	1024858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831682
18478	NC_015061	CCGG	2	8	1024947	1024954	0 %	0 %	50 %	50 %	322831682
18479	NC_015061	AATC	2	8	1024990	1024997	50 %	25 %	0 %	25 %	322831682
18480	NC_015061	TTC	2	6	1025108	1025113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831682
18481	NC_015061	CAG	2	6	1025123	1025128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831682
18482	NC_015061	TCA	2	6	1025157	1025162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831682
18483	NC_015061	ATACCG	2	12	1025187	1025198	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322831682
18484	NC_015061	GTG	2	6	1025214	1025219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831682
18485	NC_015061	GGATC	2	10	1025257	1025266	20 %	20 %	40 %	20 %	322831682
18486	NC_015061	GTT	2	6	1025291	1025296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831682
18487	NC_015061	TGG	2	6	1025359	1025364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831682
18488	NC_015061	GCA	2	6	1025374	1025379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831682
18489	NC_015061	TCA	2	6	1025394	1025399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831682
18490	NC_015061	CTT	2	6	1025455	1025460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831682
18491	NC_015061	TGC	2	6	1025870	1025875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831683
18492	NC_015061	CG	3	6	1025883	1025888	0 %	0 %	50 %	50 %	322831683
18493	NC_015061	CTG	2	6	1025905	1025910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831683
18494	NC_015061	ATT	2	6	1025932	1025937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831683
18495	NC_015061	GTG	2	6	1025948	1025953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831683
18496	NC_015061	GTAT	2	8	1026010	1026017	25 %	50 %	25 %	0 %	322831683
18497	NC_015061	CGA	2	6	1026099	1026104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831683
18498	NC_015061	TGG	2	6	1026107	1026112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831683
18499	NC_015061	CGG	2	6	1026117	1026122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831683
18500	NC_015061	TCA	2	6	1026164	1026169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831683

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