MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 86290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_015061	GCTGAC	2	12	824647	824658	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322831498
15002	NC_015061	GTGAAA	2	12	824683	824694	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	322831498
15003	NC_015061	TA	3	6	824758	824763	50 %	50 %	0 %	0 %	322831498
15004	NC_015061	CTG	2	6	824773	824778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831498
15005	NC_015061	GCT	2	6	825058	825063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831499
15006	NC_015061	GGC	2	6	825071	825076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831499
15007	NC_015061	GC	4	8	825081	825088	0 %	0 %	50 %	50 %	322831499
15008	NC_015061	TAA	2	6	825135	825140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831499
15009	NC_015061	ATAA	2	8	825148	825155	75 %	25 %	0 %	0 %	322831499
15010	NC_015061	ACA	2	6	825158	825163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831499
15011	NC_015061	AGC	2	6	825166	825171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831499
15012	NC_015061	TTC	2	6	825181	825186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831499
15013	NC_015061	GA	3	6	825292	825297	50 %	0 %	50 %	0 %	322831499
15014	NC_015061	CTG	2	6	825318	825323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831499
15015	NC_015061	CAA	2	6	825354	825359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831499
15016	NC_015061	GCA	2	6	825362	825367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831499
15017	NC_015061	CGG	2	6	825642	825647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831500
15018	NC_015061	T	7	7	825744	825750	0 %	100 %	0 %	0 %	322831500
15019	NC_015061	CGG	2	6	825754	825759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831500
15020	NC_015061	CAC	2	6	825837	825842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831500
15021	NC_015061	CCG	2	6	825950	825955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831500
15022	NC_015061	TGA	2	6	826080	826085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831500
15023	NC_015061	TCG	2	6	826262	826267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831500
15024	NC_015061	GCA	2	6	826269	826274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831500
15025	NC_015061	AAT	2	6	826313	826318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831500
15026	NC_015061	GCC	2	6	826330	826335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831500
15027	NC_015061	CCG	3	9	826370	826378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831500
15028	NC_015061	AGTGTG	2	12	826463	826474	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	322831500
15029	NC_015061	GAT	2	6	826705	826710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831501
15030	NC_015061	A	6	6	826727	826732	100 %	0 %	0 %	0 %	322831501
15031	NC_015061	GCT	2	6	826737	826742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831501
15032	NC_015061	CAT	2	6	826761	826766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831501
15033	NC_015061	GAC	2	6	826774	826779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831501
15034	NC_015061	T	6	6	826782	826787	0 %	100 %	0 %	0 %	322831501
15035	NC_015061	GT	3	6	826789	826794	0 %	50 %	50 %	0 %	322831501
15036	NC_015061	TCA	2	6	826967	826972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831501
15037	NC_015061	GAT	2	6	827068	827073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831501
15038	NC_015061	AGA	2	6	827103	827108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831501
15039	NC_015061	TGG	2	6	827144	827149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831501
15040	NC_015061	TTC	2	6	827260	827265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831502
15041	NC_015061	CTGG	2	8	827296	827303	0 %	25 %	50 %	25 %	322831502
15042	NC_015061	GCTGA	2	10	827383	827392	20 %	20 %	40 %	20 %	322831502
15043	NC_015061	CCG	2	6	827454	827459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831502
15044	NC_015061	GGCA	2	8	827461	827468	25 %	0 %	50 %	25 %	322831502
15045	NC_015061	TGCC	2	8	827481	827488	0 %	25 %	25 %	50 %	322831502
15046	NC_015061	CCA	2	6	827535	827540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831502
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15048	NC_015061	TGG	2	6	827598	827603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831502
15049	NC_015061	ATCA	2	8	827635	827642	50 %	25 %	0 %	25 %	322831502
15050	NC_015061	GCCA	2	8	827669	827676	25 %	0 %	25 %	50 %	322831502
15051	NC_015061	GCTG	2	8	827679	827686	0 %	25 %	50 %	25 %	322831502
15052	NC_015061	CGTTG	2	10	827688	827697	0 %	40 %	40 %	20 %	322831502
15053	NC_015061	TTC	2	6	827713	827718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831502
15054	NC_015061	CAC	2	6	827719	827724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831502
15055	NC_015061	GCA	2	6	827784	827789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831502
15056	NC_015061	TTG	2	6	827803	827808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831502
15057	NC_015061	CTG	2	6	827815	827820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831502
15058	NC_015061	A	6	6	827841	827846	100 %	0 %	0 %	0 %	322831502
15059	NC_015061	AGC	2	6	827857	827862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831502
15060	NC_015061	TG	3	6	827960	827965	0 %	50 %	50 %	0 %	322831502
15061	NC_015061	GCG	2	6	827977	827982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831502
15062	NC_015061	CAGC	2	8	828081	828088	25 %	0 %	25 %	50 %	322831502
15063	NC_015061	TAA	2	6	828530	828535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831503
15064	NC_015061	CGT	2	6	828561	828566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831503
15065	NC_015061	CAT	2	6	828590	828595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831503
15066	NC_015061	TTC	2	6	828600	828605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831503
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15069	NC_015061	TGA	2	6	828668	828673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831503
15070	NC_015061	TGA	2	6	828694	828699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831503
15071	NC_015061	GTT	2	6	828915	828920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831504
15072	NC_015061	CAGC	2	8	828933	828940	25 %	0 %	25 %	50 %	322831504
15073	NC_015061	GCAC	2	8	828952	828959	25 %	0 %	25 %	50 %	322831504
15074	NC_015061	GAT	2	6	829035	829040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831504
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15076	NC_015061	TGGC	2	8	829126	829133	0 %	25 %	50 %	25 %	322831504
15077	NC_015061	GGC	2	6	829160	829165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831504
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15084	NC_015061	CGA	2	6	829539	829544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831505
15085	NC_015061	CAGGAT	2	12	829633	829644	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322831505
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15088	NC_015061	T	6	6	829725	829730	0 %	100 %	0 %	0 %	322831505
15089	NC_015061	CTGA	2	8	829966	829973	25 %	25 %	25 %	25 %	322831506
15090	NC_015061	GCTGG	2	10	830055	830064	0 %	20 %	60 %	20 %	322831506
15091	NC_015061	CAT	2	6	830068	830073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831506
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15101	NC_015061	GCATC	2	10	830619	830628	20 %	20 %	20 %	40 %	322831506
15102	NC_015061	CCAC	2	8	830699	830706	25 %	0 %	0 %	75 %	322831506
15103	NC_015061	CGT	2	6	830733	830738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831506
15104	NC_015061	TGT	2	6	830744	830749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831506
15105	NC_015061	CA	3	6	830772	830777	50 %	0 %	0 %	50 %	322831506
15106	NC_015061	CAA	2	6	830821	830826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831506
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15108	NC_015061	ATG	2	6	830867	830872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831507
15109	NC_015061	A	6	6	830873	830878	100 %	0 %	0 %	0 %	322831507
15110	NC_015061	TGC	2	6	830886	830891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831507
15111	NC_015061	TGA	2	6	830932	830937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831507
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15115	NC_015061	GAA	2	6	831136	831141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831507
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15119	NC_015061	ATCT	2	8	831343	831350	25 %	50 %	0 %	25 %	322831507
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15357	NC_015061	GC	3	6	844825	844830	0 %	0 %	50 %	50 %	322831520
15358	NC_015061	ACCGAT	2	12	844835	844846	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322831520
15359	NC_015061	AGC	2	6	844863	844868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831520
15360	NC_015061	GTCG	2	8	844889	844896	0 %	25 %	50 %	25 %	322831520
15361	NC_015061	ATC	3	9	844935	844943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831520
15362	NC_015061	ATA	2	6	844956	844961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831520
15363	NC_015061	TCA	2	6	844987	844992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831520
15364	NC_015061	ACA	2	6	845002	845007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831520
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15367	NC_015061	CGC	2	6	845107	845112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831520
15368	NC_015061	CAG	3	9	845120	845128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831520
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15370	NC_015061	ATAC	2	8	845231	845238	50 %	25 %	0 %	25 %	322831520
15371	NC_015061	CGG	2	6	845253	845258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831520
15372	NC_015061	AAC	2	6	845259	845264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831520
15373	NC_015061	GCG	2	6	845305	845310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831520
15374	NC_015061	GCA	2	6	845311	845316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831520
15375	NC_015061	TCA	2	6	845338	845343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831520
15376	NC_015061	CGATGC	2	12	845350	845361	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322831520
15377	NC_015061	GGT	2	6	845369	845374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831520
15378	NC_015061	GCCA	2	8	845377	845384	25 %	0 %	25 %	50 %	322831520
15379	NC_015061	GAC	2	6	845401	845406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831520
15380	NC_015061	T	7	7	845470	845476	0 %	100 %	0 %	0 %	322831520
15381	NC_015061	CCGG	2	8	845478	845485	0 %	0 %	50 %	50 %	322831520
15382	NC_015061	GGGCGA	2	12	845533	845544	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	322831520
15383	NC_015061	CG	3	6	845551	845556	0 %	0 %	50 %	50 %	322831520
15384	NC_015061	CCA	2	6	845560	845565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831520
15385	NC_015061	CGA	2	6	845584	845589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831520
15386	NC_015061	TGGC	2	8	845601	845608	0 %	25 %	50 %	25 %	322831520
15387	NC_015061	GAT	3	9	845624	845632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831520
15388	NC_015061	CAG	2	6	845633	845638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831520
15389	NC_015061	CAG	2	6	845663	845668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831520
15390	NC_015061	ACC	2	6	845694	845699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831520
15391	NC_015061	GGC	2	6	845753	845758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831520
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15404	NC_015061	GTT	2	6	846898	846903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831522
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15411	NC_015061	CTG	2	6	847248	847253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831523
15412	NC_015061	CTG	2	6	847264	847269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831523
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15431	NC_015061	T	6	6	848575	848580	0 %	100 %	0 %	0 %	322831524
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15434	NC_015061	GC	3	6	848640	848645	0 %	0 %	50 %	50 %	322831524
15435	NC_015061	GAT	2	6	848658	848663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831524
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15438	NC_015061	TGCG	2	8	848726	848733	0 %	25 %	50 %	25 %	322831524
15439	NC_015061	GGT	2	6	848742	848747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831524
15440	NC_015061	GACGGT	2	12	848757	848768	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322831524
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15444	NC_015061	TGG	2	6	849128	849133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831524
15445	NC_015061	CAG	2	6	849153	849158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831524
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15460	NC_015061	CTG	2	6	849873	849878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831525
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15472	NC_015061	GGCG	2	8	850358	850365	0 %	0 %	75 %	25 %	322831525
15473	NC_015061	GGC	2	6	850409	850414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831525
15474	NC_015061	G	6	6	850478	850483	0 %	0 %	100 %	0 %	322831525
15475	NC_015061	CCG	2	6	850537	850542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831525
15476	NC_015061	GCG	2	6	850581	850586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831525
15477	NC_015061	AGC	2	6	850619	850624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831525
15478	NC_015061	AACA	2	8	850653	850660	75 %	0 %	0 %	25 %	322831525
15479	NC_015061	GGT	2	6	850712	850717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831525
15480	NC_015061	TGG	2	6	850858	850863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831525
15481	NC_015061	TTCCTG	2	12	850875	850886	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	322831525
15482	NC_015061	AAC	2	6	850980	850985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831525
15483	NC_015061	GTG	2	6	851040	851045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831525
15484	NC_015061	ACG	2	6	851060	851065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831525
15485	NC_015061	GGC	2	6	851093	851098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831525
15486	NC_015061	GCA	2	6	851111	851116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831525
15487	NC_015061	ATT	2	6	851130	851135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831525
15488	NC_015061	GCT	2	6	851171	851176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831525
15489	NC_015061	TGG	2	6	851251	851256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831525
15490	NC_015061	TGT	2	6	851278	851283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831525
15491	NC_015061	TGC	2	6	851293	851298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831525
15492	NC_015061	CA	3	6	851301	851306	50 %	0 %	0 %	50 %	322831525
15493	NC_015061	GAA	2	6	851310	851315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831525
15494	NC_015061	T	6	6	851349	851354	0 %	100 %	0 %	0 %	322831525
15495	NC_015061	GCT	2	6	851417	851422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831525
15496	NC_015061	TTC	2	6	851481	851486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831525
15497	NC_015061	CGT	2	6	851559	851564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831525
15498	NC_015061	ACTG	2	8	851573	851580	25 %	25 %	25 %	25 %	322831525
15499	NC_015061	TAA	2	6	851639	851644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831525
15500	NC_015061	TGA	2	6	851690	851695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831525

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