MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 86290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_015061	GA	3	6	763417	763422	50 %	0 %	50 %	0 %	322831443
14002	NC_015061	GGC	2	6	763433	763438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831443
14003	NC_015061	TTC	2	6	763485	763490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831443
14004	NC_015061	CCA	2	6	763554	763559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831443
14005	NC_015061	CGC	2	6	763600	763605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831443
14006	NC_015061	TTTATG	2	12	763623	763634	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	322831443
14007	NC_015061	GCA	2	6	763727	763732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831443
14008	NC_015061	GAC	2	6	763940	763945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831444
14009	NC_015061	CGC	2	6	764059	764064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831444
14010	NC_015061	ACGG	2	8	764065	764072	25 %	0 %	50 %	25 %	322831444
14011	NC_015061	TCA	2	6	764213	764218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831444
14012	NC_015061	CGTC	2	8	764303	764310	0 %	25 %	25 %	50 %	322831444
14013	NC_015061	ACGC	2	8	764383	764390	25 %	0 %	25 %	50 %	322831444
14014	NC_015061	CGG	2	6	764415	764420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831444
14015	NC_015061	G	6	6	764426	764431	0 %	0 %	100 %	0 %	322831444
14016	NC_015061	CGC	2	6	764482	764487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831444
14017	NC_015061	CCA	2	6	764520	764525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831444
14018	NC_015061	CAGCGT	2	12	764617	764628	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322831444
14019	NC_015061	CCT	2	6	764640	764645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831444
14020	NC_015061	CGT	2	6	764674	764679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831444
14021	NC_015061	TTC	2	6	764686	764691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831444
14022	NC_015061	TTC	2	6	764713	764718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831444
14023	NC_015061	ATCG	2	8	764749	764756	25 %	25 %	25 %	25 %	322831444
14024	NC_015061	CCA	3	9	764831	764839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831445
14025	NC_015061	CAA	2	6	764901	764906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831445
14026	NC_015061	CAT	2	6	764925	764930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831445
14027	NC_015061	TGCAGT	2	12	764932	764943	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322831445
14028	NC_015061	GCG	2	6	764994	764999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831445
14029	NC_015061	ACCG	2	8	765012	765019	25 %	0 %	25 %	50 %	322831445
14030	NC_015061	CCT	2	6	765126	765131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831446
14031	NC_015061	CCG	3	9	765138	765146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831446
14032	NC_015061	GCC	2	6	765203	765208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831446
14033	NC_015061	GCC	2	6	765236	765241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831446
14034	NC_015061	GA	3	6	765254	765259	50 %	0 %	50 %	0 %	322831446
14035	NC_015061	ACT	2	6	765285	765290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831446
14036	NC_015061	GGGC	2	8	765481	765488	0 %	0 %	75 %	25 %	322831446
14037	NC_015061	CGC	2	6	765535	765540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831446
14038	NC_015061	AGC	2	6	765549	765554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831446
14039	NC_015061	CCA	2	6	765581	765586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831446
14040	NC_015061	TGC	2	6	765640	765645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831446
14041	NC_015061	GTTGA	2	10	765734	765743	20 %	40 %	40 %	0 %	322831446
14042	NC_015061	GCT	2	6	765851	765856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831447
14043	NC_015061	GCA	2	6	765982	765987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831447
14044	NC_015061	CTG	2	6	766007	766012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831447
14045	NC_015061	CGT	2	6	766129	766134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831447
14046	NC_015061	AAAG	2	8	766170	766177	75 %	0 %	25 %	0 %	322831447
14047	NC_015061	CCA	2	6	766195	766200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831447
14048	NC_015061	GCCCG	2	10	766205	766214	0 %	0 %	40 %	60 %	322831447
14049	NC_015061	GCAA	2	8	766245	766252	50 %	0 %	25 %	25 %	322831447
14050	NC_015061	GTT	2	6	766273	766278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831447
14051	NC_015061	TGT	2	6	766300	766305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831447
14052	NC_015061	TGG	2	6	766397	766402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831448
14053	NC_015061	CCG	2	6	766436	766441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831448
14054	NC_015061	AAT	2	6	766455	766460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831448
14055	NC_015061	CAG	2	6	766506	766511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831448
14056	NC_015061	CTG	2	6	766517	766522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831448
14057	NC_015061	ATC	2	6	766546	766551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831448
14058	NC_015061	CTC	2	6	766559	766564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831448
14059	NC_015061	TTG	2	6	766570	766575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831448
14060	NC_015061	GTT	2	6	766686	766691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831448
14061	NC_015061	TTG	2	6	766730	766735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831448
14062	NC_015061	AG	3	6	766839	766844	50 %	0 %	50 %	0 %	322831449
14063	NC_015061	TTG	2	6	766927	766932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831449
14064	NC_015061	CTG	3	9	766936	766944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831449
14065	NC_015061	TGA	2	6	766947	766952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831449
14066	NC_015061	GGC	2	6	766975	766980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831449
14067	NC_015061	T	7	7	767053	767059	0 %	100 %	0 %	0 %	322831449
14068	NC_015061	GC	3	6	767063	767068	0 %	0 %	50 %	50 %	322831449
14069	NC_015061	TCTG	2	8	767069	767076	0 %	50 %	25 %	25 %	322831449
14070	NC_015061	CAG	2	6	767089	767094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831449
14071	NC_015061	GCCG	2	8	767140	767147	0 %	0 %	50 %	50 %	322831449
14072	NC_015061	TGC	2	6	767272	767277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831449
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14074	NC_015061	GTC	2	6	767333	767338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831450
14075	NC_015061	GTA	2	6	767384	767389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831450
14076	NC_015061	CTG	2	6	767419	767424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831450
14077	NC_015061	GTT	2	6	767556	767561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831451
14078	NC_015061	TAA	2	6	767599	767604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831451
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14080	NC_015061	CGA	3	9	767649	767657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831451
14081	NC_015061	GTC	2	6	767948	767953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831452
14082	NC_015061	GTCA	2	8	767990	767997	25 %	25 %	25 %	25 %	322831452
14083	NC_015061	CTGG	2	8	768002	768009	0 %	25 %	50 %	25 %	322831452
14084	NC_015061	ATTGC	2	10	768053	768062	20 %	40 %	20 %	20 %	322831452
14085	NC_015061	TGT	2	6	768111	768116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831452
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14087	NC_015061	GT	4	8	768385	768392	0 %	50 %	50 %	0 %	322831453
14088	NC_015061	GA	3	6	768404	768409	50 %	0 %	50 %	0 %	322831453
14089	NC_015061	TCG	2	6	768454	768459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831453
14090	NC_015061	ACC	2	6	768528	768533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831453
14091	NC_015061	CCGA	2	8	768655	768662	25 %	0 %	25 %	50 %	322831453
14092	NC_015061	AGG	2	6	768710	768715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831453
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14102	NC_015061	GGT	2	6	769146	769151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831453
14103	NC_015061	GAT	2	6	769160	769165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831453
14104	NC_015061	TAA	2	6	769187	769192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831453
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14106	NC_015061	GCG	2	6	769374	769379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831453
14107	NC_015061	ATC	2	6	769450	769455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831453
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14109	NC_015061	CTG	2	6	769638	769643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831453
14110	NC_015061	TG	3	6	769642	769647	0 %	50 %	50 %	0 %	322831453
14111	NC_015061	CAA	2	6	769656	769661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831453
14112	NC_015061	CAGC	2	8	769689	769696	25 %	0 %	25 %	50 %	322831453
14113	NC_015061	TTG	2	6	769741	769746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831453
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14116	NC_015061	GT	3	6	769838	769843	0 %	50 %	50 %	0 %	322831453
14117	NC_015061	TCA	2	6	769895	769900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831453
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14119	NC_015061	GCT	2	6	770055	770060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831453
14120	NC_015061	G	6	6	770072	770077	0 %	0 %	100 %	0 %	322831453
14121	NC_015061	CCA	3	9	770082	770090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831453
14122	NC_015061	ACAT	2	8	770171	770178	50 %	25 %	0 %	25 %	322831453
14123	NC_015061	TTCT	2	8	770284	770291	0 %	75 %	0 %	25 %	322831454
14124	NC_015061	GAT	2	6	770340	770345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831454
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14129	NC_015061	TCA	2	6	770565	770570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831455
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14132	NC_015061	TTTC	2	8	770701	770708	0 %	75 %	0 %	25 %	322831455
14133	NC_015061	GCT	3	9	770740	770748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831455
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14144	NC_015061	GCTG	2	8	771327	771334	0 %	25 %	50 %	25 %	322831456
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14152	NC_015061	GCG	2	6	771980	771985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831457
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14236	NC_015061	A	6	6	777161	777166	100 %	0 %	0 %	0 %	322831462
14237	NC_015061	ACCAA	2	10	777170	777179	60 %	0 %	0 %	40 %	322831462
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14241	NC_015061	GCT	2	6	777367	777372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831462
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14476	NC_015061	TGGTGC	2	12	795517	795528	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	322831470
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14478	NC_015061	GCA	2	6	795566	795571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831470
14479	NC_015061	CGG	2	6	795593	795598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831470
14480	NC_015061	TGG	2	6	795657	795662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831470
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