MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 86290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_015061	ACC	2	6	736989	736994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831416
13502	NC_015061	TGA	2	6	737237	737242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831416
13503	NC_015061	ACG	2	6	737245	737250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831416
13504	NC_015061	CAGC	2	8	737300	737307	25 %	0 %	25 %	50 %	322831416
13505	NC_015061	GTG	2	6	737308	737313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831416
13506	NC_015061	TGC	2	6	737327	737332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831416
13507	NC_015061	GACA	2	8	737393	737400	50 %	0 %	25 %	25 %	322831416
13508	NC_015061	GCA	2	6	737452	737457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831416
13509	NC_015061	AGC	2	6	737461	737466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831416
13510	NC_015061	GAT	2	6	737688	737693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831416
13511	NC_015061	TGA	2	6	737735	737740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831416
13512	NC_015061	ATT	2	6	737796	737801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831416
13513	NC_015061	TGAA	2	8	737830	737837	50 %	25 %	25 %	0 %	322831416
13514	NC_015061	ATT	2	6	737898	737903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831416
13515	NC_015061	CAG	2	6	737970	737975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831416
13516	NC_015061	CAC	2	6	738102	738107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831416
13517	NC_015061	AATGTG	2	12	738108	738119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831416
13518	NC_015061	GGCA	2	8	738128	738135	25 %	0 %	50 %	25 %	322831416
13519	NC_015061	CG	3	6	738181	738186	0 %	0 %	50 %	50 %	322831416
13520	NC_015061	CGT	2	6	738200	738205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831416
13521	NC_015061	GAT	2	6	738273	738278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831416
13522	NC_015061	A	7	7	738306	738312	100 %	0 %	0 %	0 %	322831416
13523	NC_015061	TGA	2	6	738377	738382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831416
13524	NC_015061	AT	3	6	738389	738394	50 %	50 %	0 %	0 %	322831416
13525	NC_015061	GAT	2	6	738462	738467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831416
13526	NC_015061	GTTATT	2	12	738493	738504	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	322831416
13527	NC_015061	CCT	2	6	738541	738546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831416
13528	NC_015061	GCC	2	6	738550	738555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831416
13529	NC_015061	GCCA	2	8	738591	738598	25 %	0 %	25 %	50 %	322831416
13530	NC_015061	GCG	2	6	738655	738660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831416
13531	NC_015061	CCAT	2	8	738706	738713	25 %	25 %	0 %	50 %	322831416
13532	NC_015061	CCT	2	6	738719	738724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831416
13533	NC_015061	ATG	2	6	738756	738761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831416
13534	NC_015061	GCG	2	6	738862	738867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831416
13535	NC_015061	CGA	2	6	738871	738876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831416
13536	NC_015061	GCG	2	6	738889	738894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831416
13537	NC_015061	CAG	2	6	738905	738910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831416
13538	NC_015061	CAA	2	6	738920	738925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831416
13539	NC_015061	AAT	2	6	739018	739023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831416
13540	NC_015061	TTC	2	6	739195	739200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831417
13541	NC_015061	TAA	2	6	739232	739237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831417
13542	NC_015061	GAA	2	6	739282	739287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831417
13543	NC_015061	TGG	2	6	739313	739318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831417
13544	NC_015061	CTG	2	6	739323	739328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831417
13545	NC_015061	TTG	2	6	739393	739398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831417
13546	NC_015061	ATG	2	6	739441	739446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831417
13547	NC_015061	CAAAC	2	10	739455	739464	60 %	0 %	0 %	40 %	322831417
13548	NC_015061	CAG	2	6	739494	739499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831417
13549	NC_015061	GCA	2	6	739552	739557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831417
13550	NC_015061	GCC	2	6	739649	739654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831417
13551	NC_015061	CTG	2	6	739797	739802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831417
13552	NC_015061	CCG	2	6	739808	739813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831417
13553	NC_015061	GAT	2	6	739821	739826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831417
13554	NC_015061	ATT	2	6	739972	739977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831417
13555	NC_015061	GCA	2	6	740022	740027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831417
13556	NC_015061	CTG	2	6	740040	740045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831417
13557	NC_015061	AGC	2	6	740087	740092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831417
13558	NC_015061	TGC	2	6	740140	740145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831417
13559	NC_015061	CG	3	6	740270	740275	0 %	0 %	50 %	50 %	322831417
13560	NC_015061	GCG	2	6	740483	740488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831418
13561	NC_015061	TGG	2	6	740504	740509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831418
13562	NC_015061	AGTG	2	8	740671	740678	25 %	25 %	50 %	0 %	322831418
13563	NC_015061	GGT	2	6	740683	740688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831418
13564	NC_015061	GCG	2	6	740717	740722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831418
13565	NC_015061	GACG	2	8	740822	740829	25 %	0 %	50 %	25 %	322831418
13566	NC_015061	CAG	2	6	740846	740851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831418
13567	NC_015061	GCT	2	6	740885	740890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831418
13568	NC_015061	T	6	6	740892	740897	0 %	100 %	0 %	0 %	322831418
13569	NC_015061	TTA	2	6	740922	740927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831418
13570	NC_015061	TGA	2	6	741051	741056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831419
13571	NC_015061	GCA	2	6	741079	741084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831419
13572	NC_015061	CAT	2	6	741120	741125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831419
13573	NC_015061	GGC	2	6	741205	741210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831419
13574	NC_015061	TCC	2	6	741250	741255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831419
13575	NC_015061	GCT	2	6	741286	741291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831419
13576	NC_015061	A	6	6	741358	741363	100 %	0 %	0 %	0 %	322831419
13577	NC_015061	TCGATA	2	12	741371	741382	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	322831419
13578	NC_015061	CTG	2	6	741385	741390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831419
13579	NC_015061	ATC	2	6	741466	741471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831419
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13581	NC_015061	CTG	2	6	741607	741612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831419
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13583	NC_015061	ACC	3	9	741667	741675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831419
13584	NC_015061	CGT	2	6	741721	741726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831419
13585	NC_015061	AAG	2	6	741740	741745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831419
13586	NC_015061	GAA	2	6	741786	741791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831419
13587	NC_015061	CGC	2	6	741798	741803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831419
13588	NC_015061	ATCAAC	2	12	741847	741858	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	322831419
13589	NC_015061	TGC	2	6	741990	741995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831419
13590	NC_015061	A	6	6	742006	742011	100 %	0 %	0 %	0 %	322831419
13591	NC_015061	TGC	2	6	742022	742027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831419
13592	NC_015061	ACT	2	6	742057	742062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831419
13593	NC_015061	GAC	2	6	742075	742080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831419
13594	NC_015061	A	6	6	742238	742243	100 %	0 %	0 %	0 %	322831420
13595	NC_015061	A	6	6	742253	742258	100 %	0 %	0 %	0 %	322831420
13596	NC_015061	TCG	2	6	742259	742264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831420
13597	NC_015061	A	6	6	742270	742275	100 %	0 %	0 %	0 %	322831420
13598	NC_015061	A	6	6	742327	742332	100 %	0 %	0 %	0 %	322831420
13599	NC_015061	CCA	2	6	742435	742440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831420
13600	NC_015061	TCA	2	6	742480	742485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831420
13601	NC_015061	A	6	6	742489	742494	100 %	0 %	0 %	0 %	322831420
13602	NC_015061	GAA	2	6	742516	742521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831420
13603	NC_015061	GGT	2	6	742524	742529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831420
13604	NC_015061	AGA	2	6	742560	742565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831420
13605	NC_015061	GAA	2	6	742573	742578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831420
13606	NC_015061	ACT	2	6	742598	742603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831420
13607	NC_015061	GAT	2	6	742624	742629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831420
13608	NC_015061	GCGCA	2	10	742681	742690	20 %	0 %	40 %	40 %	322831420
13609	NC_015061	GACT	2	8	742818	742825	25 %	25 %	25 %	25 %	322831420
13610	NC_015061	GAAA	2	8	742827	742834	75 %	0 %	25 %	0 %	322831420
13611	NC_015061	CTT	2	6	742869	742874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831420
13612	NC_015061	GAA	2	6	742879	742884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831420
13613	NC_015061	TTC	2	6	743098	743103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831421
13614	NC_015061	ACA	2	6	743117	743122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831421
13615	NC_015061	TGT	2	6	743165	743170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831421
13616	NC_015061	CCA	2	6	743240	743245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831421
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13618	NC_015061	CTT	2	6	743322	743327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831421
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13737	NC_015061	TCA	2	6	750915	750920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831427
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13972	NC_015061	ACG	2	6	761881	761886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831441
13973	NC_015061	GCC	2	6	761962	761967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831441
13974	NC_015061	CGCATC	2	12	762012	762023	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322831441
13975	NC_015061	CGT	2	6	762083	762088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831441
13976	NC_015061	ACA	2	6	762097	762102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831441
13977	NC_015061	TGA	2	6	762112	762117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831441
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13980	NC_015061	G	7	7	762378	762384	0 %	0 %	100 %	0 %	322831442
13981	NC_015061	AAT	2	6	762385	762390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831442
13982	NC_015061	AAT	2	6	762491	762496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831442
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13985	NC_015061	CTCGC	2	10	762569	762578	0 %	20 %	20 %	60 %	322831442
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13988	NC_015061	AACC	2	8	762660	762667	50 %	0 %	0 %	50 %	322831442
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13992	NC_015061	GCC	2	6	763083	763088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831442
13993	NC_015061	AATT	2	8	763103	763110	50 %	50 %	0 %	0 %	322831442
13994	NC_015061	CCG	2	6	763143	763148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831442
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13996	NC_015061	CAG	2	6	763232	763237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831442
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13999	NC_015061	CGT	2	6	763364	763369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831443
14000	NC_015061	GCT	3	9	763375	763383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831443

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