MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 86290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015061	CCG	2	6	710455	710460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831392
13002	NC_015061	GGC	2	6	710480	710485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831392
13003	NC_015061	GCG	3	9	710574	710582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831392
13004	NC_015061	CGC	2	6	710660	710665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831392
13005	NC_015061	AGC	2	6	710709	710714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831392
13006	NC_015061	GCTG	2	8	710744	710751	0 %	25 %	50 %	25 %	322831392
13007	NC_015061	GAACG	2	10	710767	710776	40 %	0 %	40 %	20 %	322831392
13008	NC_015061	CG	3	6	710775	710780	0 %	0 %	50 %	50 %	322831392
13009	NC_015061	CGT	2	6	710878	710883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831392
13010	NC_015061	GGC	2	6	710974	710979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831392
13011	NC_015061	ACTC	2	8	711158	711165	25 %	25 %	0 %	50 %	322831392
13012	NC_015061	GGGGC	2	10	711351	711360	0 %	0 %	80 %	20 %	322831393
13013	NC_015061	TGC	2	6	711432	711437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831393
13014	NC_015061	GATC	2	8	711540	711547	25 %	25 %	25 %	25 %	322831393
13015	NC_015061	GTT	2	6	711568	711573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831393
13016	NC_015061	GCT	2	6	711634	711639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831393
13017	NC_015061	TGA	2	6	711651	711656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831393
13018	NC_015061	CCA	2	6	711660	711665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831393
13019	NC_015061	ACC	2	6	711701	711706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831393
13020	NC_015061	GCC	2	6	711716	711721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831393
13021	NC_015061	GGC	2	6	711770	711775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831393
13022	NC_015061	GTG	2	6	711796	711801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831393
13023	NC_015061	ACA	2	6	711816	711821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831393
13024	NC_015061	T	6	6	711848	711853	0 %	100 %	0 %	0 %	322831393
13025	NC_015061	ATC	2	6	711875	711880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831393
13026	NC_015061	TCC	2	6	711881	711886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831393
13027	NC_015061	TTC	2	6	711917	711922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831393
13028	NC_015061	GGGC	2	8	711958	711965	0 %	0 %	75 %	25 %	322831393
13029	NC_015061	TGG	2	6	711966	711971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831393
13030	NC_015061	TGC	2	6	712011	712016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831393
13031	NC_015061	CAT	2	6	712040	712045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831393
13032	NC_015061	ACC	2	6	712067	712072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831393
13033	NC_015061	CGG	2	6	712078	712083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831393
13034	NC_015061	TGG	2	6	712107	712112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831393
13035	NC_015061	TCT	2	6	712128	712133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831393
13036	NC_015061	GCA	2	6	712159	712164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831393
13037	NC_015061	ATG	2	6	712211	712216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831393
13038	NC_015061	TGG	2	6	712224	712229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831393
13039	NC_015061	A	6	6	712271	712276	100 %	0 %	0 %	0 %	322831393
13040	NC_015061	TGC	2	6	712290	712295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831393
13041	NC_015061	CGG	2	6	712299	712304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831393
13042	NC_015061	CCT	2	6	712311	712316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831393
13043	NC_015061	CGG	2	6	712456	712461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831393
13044	NC_015061	TTA	2	6	712555	712560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831393
13045	NC_015061	TGA	2	6	712612	712617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831393
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13047	NC_015061	CGT	2	6	712639	712644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831393
13048	NC_015061	GCG	2	6	712680	712685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831393
13049	NC_015061	TGC	2	6	712709	712714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831393
13050	NC_015061	TCA	2	6	712738	712743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831393
13051	NC_015061	ATT	2	6	712844	712849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831393
13052	NC_015061	GAG	2	6	712862	712867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831393
13053	NC_015061	TAT	2	6	712965	712970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831394
13054	NC_015061	CAT	2	6	713079	713084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831394
13055	NC_015061	AAG	2	6	713132	713137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831394
13056	NC_015061	TGA	2	6	713147	713152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831394
13057	NC_015061	GATG	2	8	713175	713182	25 %	25 %	50 %	0 %	322831394
13058	NC_015061	GCG	2	6	713218	713223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831394
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13060	NC_015061	ACA	2	6	713332	713337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831394
13061	NC_015061	GCA	2	6	713366	713371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831394
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13063	NC_015061	ACG	2	6	713422	713427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831394
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13067	NC_015061	TTCG	2	8	713751	713758	0 %	50 %	25 %	25 %	322831395
13068	NC_015061	AC	3	6	713801	713806	50 %	0 %	0 %	50 %	322831395
13069	NC_015061	AG	3	6	713864	713869	50 %	0 %	50 %	0 %	322831395
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13077	NC_015061	CTG	2	6	714198	714203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831395
13078	NC_015061	ACTG	2	8	714209	714216	25 %	25 %	25 %	25 %	322831395
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13084	NC_015061	TTTC	2	8	714396	714403	0 %	75 %	0 %	25 %	322831396
13085	NC_015061	ACGG	2	8	714613	714620	25 %	0 %	50 %	25 %	322831396
13086	NC_015061	CGG	2	6	714657	714662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831396
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13089	NC_015061	GTT	3	9	714925	714933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831397
13090	NC_015061	CAG	2	6	714971	714976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831397
13091	NC_015061	GGT	2	6	715165	715170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831397
13092	NC_015061	TGA	2	6	715176	715181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831397
13093	NC_015061	ATC	2	6	715242	715247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831397
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13096	NC_015061	TATT	2	8	715430	715437	25 %	75 %	0 %	0 %	322831397
13097	NC_015061	GCG	2	6	715517	715522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831397
13098	NC_015061	TGG	2	6	715529	715534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831397
13099	NC_015061	CAGC	2	8	715594	715601	25 %	0 %	25 %	50 %	322831397
13100	NC_015061	GAC	2	6	715655	715660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831397
13101	NC_015061	CTG	2	6	715676	715681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831397
13102	NC_015061	GC	3	6	715726	715731	0 %	0 %	50 %	50 %	322831397
13103	NC_015061	CAC	2	6	715744	715749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831397
13104	NC_015061	GAACA	2	10	715766	715775	60 %	0 %	20 %	20 %	322831397
13105	NC_015061	AC	3	6	715776	715781	50 %	0 %	0 %	50 %	322831397
13106	NC_015061	GCC	2	6	715847	715852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831397
13107	NC_015061	GAC	2	6	716245	716250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831398
13108	NC_015061	CTC	2	6	716256	716261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831398
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13110	NC_015061	GTCA	2	8	716425	716432	25 %	25 %	25 %	25 %	322831398
13111	NC_015061	CGCC	2	8	716461	716468	0 %	0 %	25 %	75 %	322831398
13112	NC_015061	TGA	2	6	716488	716493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831398
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13114	NC_015061	CAAA	2	8	716548	716555	75 %	0 %	0 %	25 %	322831398
13115	NC_015061	GCT	3	9	716569	716577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831398
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13117	NC_015061	GAA	2	6	716615	716620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831398
13118	NC_015061	A	6	6	716651	716656	100 %	0 %	0 %	0 %	322831398
13119	NC_015061	CTT	2	6	716706	716711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831398
13120	NC_015061	TTC	2	6	716717	716722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831398
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13359	NC_015061	AGG	2	6	729416	729421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831410
13360	NC_015061	GCT	2	6	729432	729437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831410
13361	NC_015061	CGT	2	6	729463	729468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831410
13362	NC_015061	CAT	2	6	729471	729476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831410
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13476	NC_015061	GCA	2	6	735230	735235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831415
13477	NC_015061	AGC	2	6	735247	735252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831415
13478	NC_015061	GCT	2	6	735303	735308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831415
13479	NC_015061	CGG	2	6	735344	735349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831415
13480	NC_015061	CGG	2	6	735359	735364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831415
13481	NC_015061	CCG	2	6	735411	735416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831415
13482	NC_015061	GCC	2	6	735536	735541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831415
13483	NC_015061	CGCT	2	8	735557	735564	0 %	25 %	25 %	50 %	322831415
13484	NC_015061	CGCC	2	8	735729	735736	0 %	0 %	25 %	75 %	322831415
13485	NC_015061	CAG	2	6	735853	735858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831415
13486	NC_015061	CTG	2	6	735892	735897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831415
13487	NC_015061	CAT	2	6	735898	735903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831415
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13490	NC_015061	GCAATT	2	12	736364	736375	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	322831416
13491	NC_015061	GGC	2	6	736443	736448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831416
13492	NC_015061	GGC	2	6	736575	736580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831416
13493	NC_015061	CCGA	2	8	736611	736618	25 %	0 %	25 %	50 %	322831416
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13495	NC_015061	TGA	2	6	736727	736732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831416
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13500	NC_015061	GACA	2	8	736957	736964	50 %	0 %	25 %	25 %	322831416

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