MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 86290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_015061	CTGG	2	8	656791	656798	0 %	25 %	50 %	25 %	322831348
12002	NC_015061	TGA	2	6	656824	656829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831348
12003	NC_015061	A	7	7	656840	656846	100 %	0 %	0 %	0 %	322831348
12004	NC_015061	CAT	2	6	656875	656880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831348
12005	NC_015061	GCC	2	6	656894	656899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831348
12006	NC_015061	AAG	2	6	656907	656912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831348
12007	NC_015061	GAA	2	6	656933	656938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831348
12008	NC_015061	GC	3	6	656957	656962	0 %	0 %	50 %	50 %	322831348
12009	NC_015061	CAG	2	6	657068	657073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831348
12010	NC_015061	GGA	2	6	657085	657090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831348
12011	NC_015061	TGA	2	6	657111	657116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831348
12012	NC_015061	TCT	2	6	657221	657226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831349
12013	NC_015061	GAT	2	6	657296	657301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831349
12014	NC_015061	AGC	2	6	657320	657325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831349
12015	NC_015061	GTG	2	6	657364	657369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831349
12016	NC_015061	GGA	2	6	657430	657435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831349
12017	NC_015061	TGA	2	6	657468	657473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831349
12018	NC_015061	TCG	3	9	657490	657498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831349
12019	NC_015061	ATT	2	6	657583	657588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831349
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12021	NC_015061	TGC	2	6	657652	657657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831349
12022	NC_015061	GCG	3	9	657702	657710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831349
12023	NC_015061	CGG	2	6	657772	657777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831349
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12025	NC_015061	TGA	2	6	657918	657923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831349
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12029	NC_015061	GGA	2	6	658012	658017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831349
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12032	NC_015061	CGC	2	6	658133	658138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831349
12033	NC_015061	ACA	2	6	658152	658157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831349
12034	NC_015061	GGCG	2	8	658223	658230	0 %	0 %	75 %	25 %	322831349
12035	NC_015061	GCA	2	6	658243	658248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831349
12036	NC_015061	GCGT	2	8	658249	658256	0 %	25 %	50 %	25 %	322831349
12037	NC_015061	TGC	2	6	658257	658262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831349
12038	NC_015061	TGA	2	6	658522	658527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831349
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12046	NC_015061	CGCC	2	8	658918	658925	0 %	0 %	25 %	75 %	322831349
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12053	NC_015061	CAGC	2	8	659222	659229	25 %	0 %	25 %	50 %	322831349
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12055	NC_015061	TGA	2	6	659352	659357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831349
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12057	NC_015061	GCGCA	2	10	659405	659414	20 %	0 %	40 %	40 %	322831349
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12060	NC_015061	GCA	2	6	659611	659616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831349
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12070	NC_015061	CTGG	2	8	660034	660041	0 %	25 %	50 %	25 %	322831349
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12118	NC_015061	CG	4	8	662317	662324	0 %	0 %	50 %	50 %	322831351
12119	NC_015061	TTG	2	6	662325	662330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831351
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12237	NC_015061	GAT	2	6	669230	669235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831359
12238	NC_015061	ATT	2	6	669242	669247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831359
12239	NC_015061	T	8	8	669271	669278	0 %	100 %	0 %	0 %	322831359
12240	NC_015061	TAT	2	6	669280	669285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831359
12241	NC_015061	GCG	2	6	669327	669332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831359
12242	NC_015061	GTC	2	6	669335	669340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831359
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12274	NC_015061	A	6	6	671283	671288	100 %	0 %	0 %	0 %	322831362
12275	NC_015061	CTC	2	6	671303	671308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831362
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12339	NC_015061	CG	3	6	675236	675241	0 %	0 %	50 %	50 %	322831366
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12346	NC_015061	TCT	2	6	675662	675667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831366
12347	NC_015061	CGC	2	6	675715	675720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831366
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12350	NC_015061	GCCA	2	8	675858	675865	25 %	0 %	25 %	50 %	322831366
12351	NC_015061	TGA	2	6	675905	675910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831366
12352	NC_015061	ACCCG	2	10	675925	675934	20 %	0 %	20 %	60 %	322831366
12353	NC_015061	GTC	2	6	675939	675944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831366
12354	NC_015061	TGA	2	6	675979	675984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831366
12355	NC_015061	AACATG	2	12	676029	676040	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	322831366
12356	NC_015061	ATC	2	6	676051	676056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831366
12357	NC_015061	GCT	2	6	676073	676078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831366
12358	NC_015061	TGGC	2	8	676095	676102	0 %	25 %	50 %	25 %	322831366
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12382	NC_015061	ATTT	2	8	677532	677539	25 %	75 %	0 %	0 %	322831367
12383	NC_015061	GTG	2	6	677554	677559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831367
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12457	NC_015061	TG	3	6	682599	682604	0 %	50 %	50 %	0 %	322831371
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12464	NC_015061	GCCA	2	8	683165	683172	25 %	0 %	25 %	50 %	322831372
12465	NC_015061	ATC	2	6	683202	683207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831372
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12473	NC_015061	GC	3	6	683442	683447	0 %	0 %	50 %	50 %	322831372
12474	NC_015061	TGA	2	6	683448	683453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831372
12475	NC_015061	CAGC	2	8	683474	683481	25 %	0 %	25 %	50 %	322831372
12476	NC_015061	CAGC	2	8	683528	683535	25 %	0 %	25 %	50 %	322831372
12477	NC_015061	GAA	2	6	683576	683581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831372
12478	NC_015061	GC	3	6	683605	683610	0 %	0 %	50 %	50 %	322831372
12479	NC_015061	CAG	2	6	683615	683620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831372
12480	NC_015061	GCG	2	6	683646	683651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831372
12481	NC_015061	AGC	2	6	683655	683660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831372
12482	NC_015061	GAACA	2	10	683684	683693	60 %	0 %	20 %	20 %	322831372
12483	NC_015061	ATA	2	6	683730	683735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831372
12484	NC_015061	GTC	2	6	684047	684052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831373
12485	NC_015061	CTG	2	6	684109	684114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831373
12486	NC_015061	TTC	2	6	684131	684136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831373
12487	NC_015061	TGC	2	6	684310	684315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831373
12488	NC_015061	ACC	2	6	684336	684341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831373
12489	NC_015061	GCCA	2	8	684360	684367	25 %	0 %	25 %	50 %	322831373
12490	NC_015061	ACT	2	6	684383	684388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831373
12491	NC_015061	CGG	2	6	684523	684528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831373
12492	NC_015061	ATC	2	6	684534	684539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831373
12493	NC_015061	CGA	2	6	684553	684558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831373
12494	NC_015061	TGCC	2	8	684568	684575	0 %	25 %	25 %	50 %	322831373
12495	NC_015061	ATATCG	2	12	684585	684596	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	322831373
12496	NC_015061	CGC	2	6	684623	684628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831373
12497	NC_015061	TGT	2	6	684634	684639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831373
12498	NC_015061	ATG	2	6	684645	684650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831373
12499	NC_015061	ACG	2	6	684651	684656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831373
12500	NC_015061	GGT	2	6	684803	684808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831373

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