MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 86290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_015061	T	6	6	629133	629138	0 %	100 %	0 %	0 %	322831317
11502	NC_015061	TAA	2	6	629145	629150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831317
11503	NC_015061	A	7	7	629249	629255	100 %	0 %	0 %	0 %	322831317
11504	NC_015061	CAT	2	6	629296	629301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831317
11505	NC_015061	GAT	2	6	629330	629335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831317
11506	NC_015061	AG	3	6	629429	629434	50 %	0 %	50 %	0 %	322831317
11507	NC_015061	AAG	2	6	629463	629468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831317
11508	NC_015061	ATG	2	6	629472	629477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831317
11509	NC_015061	TAA	2	6	629545	629550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831317
11510	NC_015061	TAA	2	6	629620	629625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831317
11511	NC_015061	T	6	6	629648	629653	0 %	100 %	0 %	0 %	322831317
11512	NC_015061	TAAT	2	8	629697	629704	50 %	50 %	0 %	0 %	322831317
11513	NC_015061	TCGTT	2	10	629731	629740	0 %	60 %	20 %	20 %	322831317
11514	NC_015061	A	6	6	629783	629788	100 %	0 %	0 %	0 %	322831317
11515	NC_015061	CATC	2	8	629887	629894	25 %	25 %	0 %	50 %	322831318
11516	NC_015061	AAC	2	6	629898	629903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831318
11517	NC_015061	CTG	2	6	629916	629921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831318
11518	NC_015061	CGG	2	6	629990	629995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831318
11519	NC_015061	TGG	2	6	630051	630056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831318
11520	NC_015061	TGA	2	6	630140	630145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831318
11521	NC_015061	CGTCAG	2	12	630157	630168	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322831318
11522	NC_015061	CTG	2	6	630234	630239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831318
11523	NC_015061	CAA	2	6	630359	630364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831318
11524	NC_015061	CAC	2	6	630368	630373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831318
11525	NC_015061	GGC	2	6	630396	630401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831318
11526	NC_015061	CGG	2	6	630428	630433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831318
11527	NC_015061	TTG	2	6	630454	630459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831318
11528	NC_015061	GCG	2	6	630493	630498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831318
11529	NC_015061	ACA	2	6	630516	630521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831318
11530	NC_015061	TCTG	2	8	630558	630565	0 %	50 %	25 %	25 %	322831319
11531	NC_015061	GCA	2	6	630571	630576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831319
11532	NC_015061	CTGG	2	8	630611	630618	0 %	25 %	50 %	25 %	322831319
11533	NC_015061	TGG	2	6	630623	630628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831319
11534	NC_015061	TATT	2	8	630643	630650	25 %	75 %	0 %	0 %	322831319
11535	NC_015061	CAG	2	6	630728	630733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831320
11536	NC_015061	CTGA	2	8	630809	630816	25 %	25 %	25 %	25 %	322831320
11537	NC_015061	CCGC	2	8	630817	630824	0 %	0 %	25 %	75 %	322831320
11538	NC_015061	GCG	2	6	630830	630835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831320
11539	NC_015061	GGC	2	6	630853	630858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831320
11540	NC_015061	ACG	2	6	630920	630925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831320
11541	NC_015061	GGT	2	6	630940	630945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831320
11542	NC_015061	CCG	2	6	630975	630980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831320
11543	NC_015061	GTG	2	6	631052	631057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831321
11544	NC_015061	CCT	2	6	631078	631083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831321
11545	NC_015061	CAG	2	6	631127	631132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831321
11546	NC_015061	GCC	2	6	631133	631138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831321
11547	NC_015061	ACGCTG	2	12	631148	631159	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322831321
11548	NC_015061	GCT	2	6	631180	631185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831321
11549	NC_015061	GGA	2	6	631186	631191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831321
11550	NC_015061	GCAG	2	8	631240	631247	25 %	0 %	50 %	25 %	322831321
11551	NC_015061	CGC	2	6	631288	631293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831321
11552	NC_015061	GGC	2	6	631354	631359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831321
11553	NC_015061	GCA	2	6	631396	631401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831321
11554	NC_015061	CCGGT	2	10	631425	631434	0 %	20 %	40 %	40 %	322831321
11555	NC_015061	CGGG	2	8	631468	631475	0 %	0 %	75 %	25 %	322831321
11556	NC_015061	GGT	2	6	631489	631494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831321
11557	NC_015061	GCCT	2	8	631504	631511	0 %	25 %	25 %	50 %	322831321
11558	NC_015061	CTG	2	6	631565	631570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831321
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11560	NC_015061	GGT	2	6	631645	631650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831321
11561	NC_015061	GCC	2	6	631715	631720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831321
11562	NC_015061	CGC	2	6	631840	631845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831321
11563	NC_015061	GGTG	2	8	631900	631907	0 %	25 %	75 %	0 %	322831321
11564	NC_015061	CTG	2	6	631926	631931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831322
11565	NC_015061	GCC	3	9	631959	631967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831322
11566	NC_015061	TACCT	2	10	632047	632056	20 %	40 %	0 %	40 %	322831322
11567	NC_015061	GCG	2	6	632111	632116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831322
11568	NC_015061	TTCA	2	8	632136	632143	25 %	50 %	0 %	25 %	322831322
11569	NC_015061	GTG	2	6	632178	632183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831322
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11572	NC_015061	GCG	2	6	632397	632402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831322
11573	NC_015061	GCT	2	6	632417	632422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831322
11574	NC_015061	CAC	2	6	632474	632479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831323
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11577	NC_015061	ACGGCA	2	12	632554	632565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831323
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11580	NC_015061	CGA	2	6	632732	632737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831323
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11582	NC_015061	CGCA	2	8	632805	632812	25 %	0 %	25 %	50 %	322831323
11583	NC_015061	CTG	2	6	632859	632864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831323
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11585	NC_015061	CTG	2	6	632910	632915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831323
11586	NC_015061	ACC	2	6	632938	632943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831323
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11588	NC_015061	GCC	2	6	633015	633020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831323
11589	NC_015061	GCC	2	6	633039	633044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831323
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11591	NC_015061	ACG	2	6	633168	633173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831323
11592	NC_015061	ATT	2	6	633201	633206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831323
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11599	NC_015061	CGCA	2	8	633760	633767	25 %	0 %	25 %	50 %	322831323
11600	NC_015061	GC	4	8	633770	633777	0 %	0 %	50 %	50 %	322831323
11601	NC_015061	GCA	2	6	633792	633797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831323
11602	NC_015061	TGG	2	6	634058	634063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831323
11603	NC_015061	CCGG	2	8	634085	634092	0 %	0 %	50 %	50 %	322831323
11604	NC_015061	TGACGG	2	12	634189	634200	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322831323
11605	NC_015061	TTAA	2	8	634284	634291	50 %	50 %	0 %	0 %	322831323
11606	NC_015061	TGC	2	6	634351	634356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831323
11607	NC_015061	GATG	2	8	634403	634410	25 %	25 %	50 %	0 %	322831323
11608	NC_015061	A	6	6	634508	634513	100 %	0 %	0 %	0 %	322831323
11609	NC_015061	ACGGC	2	10	634534	634543	20 %	0 %	40 %	40 %	322831323
11610	NC_015061	CG	3	6	634647	634652	0 %	0 %	50 %	50 %	322831323
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11614	NC_015061	G	6	6	634802	634807	0 %	0 %	100 %	0 %	322831323
11615	NC_015061	CTTT	2	8	634808	634815	0 %	75 %	0 %	25 %	322831323
11616	NC_015061	CGG	3	9	634991	634999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831323
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11620	NC_015061	GGC	3	9	635136	635144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831323
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11859	NC_015061	GGC	2	6	648531	648536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831340
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11862	NC_015061	CG	3	6	648592	648597	0 %	0 %	50 %	50 %	322831340
11863	NC_015061	CGT	2	6	648603	648608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831340
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11978	NC_015061	CAA	2	6	655350	655355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831347
11979	NC_015061	CTT	2	6	655398	655403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831347
11980	NC_015061	TCG	2	6	655472	655477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831347
11981	NC_015061	TCA	2	6	655493	655498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831347
11982	NC_015061	ATT	2	6	655562	655567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831347
11983	NC_015061	GTG	2	6	656063	656068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831348
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11986	NC_015061	CGCTC	2	10	656191	656200	0 %	20 %	20 %	60 %	322831348
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11988	NC_015061	A	6	6	656333	656338	100 %	0 %	0 %	0 %	322831348
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11991	NC_015061	GC	3	6	656379	656384	0 %	0 %	50 %	50 %	322831348
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11999	NC_015061	CTTA	2	8	656689	656696	25 %	50 %	0 %	25 %	322831348
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