MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 86290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_015061	CAG	2	6	598487	598492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831279
11003	NC_015061	TGC	2	6	598524	598529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831279
11004	NC_015061	TGGC	2	8	598530	598537	0 %	25 %	50 %	25 %	322831279
11005	NC_015061	GAC	2	6	598543	598548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831279
11006	NC_015061	CGG	2	6	598609	598614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831279
11007	NC_015061	ACGCC	2	10	598618	598627	20 %	0 %	20 %	60 %	322831279
11008	NC_015061	GGC	2	6	598679	598684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831279
11009	NC_015061	ATC	2	6	598685	598690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831279
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11011	NC_015061	ATC	2	6	598752	598757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831279
11012	NC_015061	AGCC	2	8	598816	598823	25 %	0 %	25 %	50 %	322831279
11013	NC_015061	AAT	2	6	598850	598855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831279
11014	NC_015061	CAG	2	6	598877	598882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831279
11015	NC_015061	CGA	2	6	598900	598905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831279
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11017	NC_015061	ACG	2	6	598968	598973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831279
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11019	NC_015061	CAG	2	6	599033	599038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831279
11020	NC_015061	GCA	2	6	599098	599103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831279
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11036	NC_015061	CGCC	2	8	599931	599938	0 %	0 %	25 %	75 %	322831280
11037	NC_015061	GC	3	6	599976	599981	0 %	0 %	50 %	50 %	322831280
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11044	NC_015061	TAA	2	6	600442	600447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831281
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11093	NC_015061	TG	3	6	605314	605319	0 %	50 %	50 %	0 %	322831284
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11104	NC_015061	AGGGA	2	10	605702	605711	40 %	0 %	60 %	0 %	322831284
11105	NC_015061	AC	3	6	605766	605771	50 %	0 %	0 %	50 %	322831285
11106	NC_015061	TGAAA	2	10	605917	605926	60 %	20 %	20 %	0 %	322831285
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11112	NC_015061	TGGC	2	8	606032	606039	0 %	25 %	50 %	25 %	322831285
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11118	NC_015061	CAA	2	6	606243	606248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831285
11119	NC_015061	T	6	6	606339	606344	0 %	100 %	0 %	0 %	322831285
11120	NC_015061	ATT	2	6	606409	606414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831286
11121	NC_015061	T	8	8	606541	606548	0 %	100 %	0 %	0 %	322831286
11122	NC_015061	CCA	2	6	606550	606555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831286
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11124	NC_015061	TGTT	2	8	606635	606642	0 %	75 %	25 %	0 %	322831286
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11126	NC_015061	GGC	2	6	607333	607338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831287
11127	NC_015061	CATGGG	2	12	607360	607371	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322831287
11128	NC_015061	GTG	2	6	607396	607401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831287
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11133	NC_015061	A	6	6	607756	607761	100 %	0 %	0 %	0 %	322831288
11134	NC_015061	CTG	2	6	607849	607854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831288
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11139	NC_015061	TGTA	2	8	608680	608687	25 %	50 %	25 %	0 %	322831289
11140	NC_015061	CA	3	6	608827	608832	50 %	0 %	0 %	50 %	322831289
11141	NC_015061	AGC	2	6	608972	608977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831289
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11147	NC_015061	TAAT	2	8	609496	609503	50 %	50 %	0 %	0 %	322831290
11148	NC_015061	ATTA	2	8	609512	609519	50 %	50 %	0 %	0 %	322831290
11149	NC_015061	GAT	2	6	609549	609554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831290
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11152	NC_015061	CTT	2	6	609703	609708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831290
11153	NC_015061	TTTC	2	8	609759	609766	0 %	75 %	0 %	25 %	322831290
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11155	NC_015061	GAT	2	6	609870	609875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831290
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11157	NC_015061	TAA	2	6	609968	609973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831290
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11159	NC_015061	ATC	2	6	610017	610022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831290
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11223	NC_015061	TGA	2	6	614654	614659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831300
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11225	NC_015061	CT	3	6	614700	614705	0 %	50 %	0 %	50 %	322831300
11226	NC_015061	CTG	2	6	614745	614750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831300
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11228	NC_015061	AATA	2	8	614775	614782	75 %	25 %	0 %	0 %	322831300
11229	NC_015061	AATG	2	8	614846	614853	50 %	25 %	25 %	0 %	322831300
11230	NC_015061	GCT	2	6	614990	614995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831300
11231	NC_015061	AGAC	2	8	615122	615129	50 %	0 %	25 %	25 %	322831300
11232	NC_015061	TGG	2	6	615180	615185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831300
11233	NC_015061	GC	3	6	615303	615308	0 %	0 %	50 %	50 %	322831300
11234	NC_015061	CCG	2	6	615419	615424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831300
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11236	NC_015061	ACCCG	2	10	615523	615532	20 %	0 %	20 %	60 %	322831300
11237	NC_015061	TGG	2	6	615535	615540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831300
11238	NC_015061	AAG	2	6	615586	615591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831300
11239	NC_015061	GTCT	2	8	615667	615674	0 %	50 %	25 %	25 %	322831300
11240	NC_015061	CAC	2	6	615702	615707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831300
11241	NC_015061	ATG	2	6	615729	615734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831300
11242	NC_015061	AGA	2	6	615797	615802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831300
11243	NC_015061	GGC	2	6	615858	615863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831300
11244	NC_015061	GGCT	2	8	615866	615873	0 %	25 %	50 %	25 %	322831300
11245	NC_015061	GCT	2	6	615947	615952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831300
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11261	NC_015061	CAGG	2	8	616443	616450	25 %	0 %	50 %	25 %	322831300
11262	NC_015061	GACA	2	8	616499	616506	50 %	0 %	25 %	25 %	322831300
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11480	NC_015061	CAT	2	6	628085	628090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831315
11481	NC_015061	AGC	2	6	628105	628110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831315
11482	NC_015061	TTTAAG	2	12	628119	628130	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	322831315
11483	NC_015061	GAT	2	6	628143	628148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831315
11484	NC_015061	GAAT	2	8	628310	628317	50 %	25 %	25 %	0 %	322831315
11485	NC_015061	CAC	2	6	628367	628372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831316
11486	NC_015061	GGC	2	6	628389	628394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831316
11487	NC_015061	CAG	3	9	628423	628431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831316
11488	NC_015061	AGC	2	6	628439	628444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831316
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11491	NC_015061	AAAG	2	8	628500	628507	75 %	0 %	25 %	0 %	322831316
11492	NC_015061	GAC	2	6	628576	628581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831316
11493	NC_015061	GTG	2	6	628585	628590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831316
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11495	NC_015061	GGA	2	6	628710	628715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831316
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11499	NC_015061	TGA	2	6	629014	629019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831317
11500	NC_015061	AAG	4	12	629117	629128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831317

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