MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 86290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_015061	TGT	2	6	485182	485187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831181
9002	NC_015061	CTGC	2	8	485269	485276	0 %	25 %	25 %	50 %	322831181
9003	NC_015061	CAC	2	6	485306	485311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831181
9004	NC_015061	CTG	2	6	485617	485622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831182
9005	NC_015061	CGTCCG	2	12	485694	485705	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322831182
9006	NC_015061	ACGG	2	8	485741	485748	25 %	0 %	50 %	25 %	322831182
9007	NC_015061	TAT	2	6	485800	485805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831182
9008	NC_015061	CCG	3	9	485839	485847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831182
9009	NC_015061	GCAG	2	8	485925	485932	25 %	0 %	50 %	25 %	322831182
9010	NC_015061	GCG	2	6	486137	486142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831182
9011	NC_015061	TGA	2	6	486189	486194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831182
9012	NC_015061	TCA	2	6	486219	486224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831182
9013	NC_015061	TAC	2	6	486232	486237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831182
9014	NC_015061	CCG	2	6	486264	486269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831182
9015	NC_015061	TGT	2	6	486297	486302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831182
9016	NC_015061	GTG	2	6	486358	486363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831182
9017	NC_015061	CGC	2	6	486365	486370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831182
9018	NC_015061	GAA	2	6	486441	486446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831182
9019	NC_015061	GCT	2	6	486537	486542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831182
9020	NC_015061	CCA	2	6	486620	486625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831182
9021	NC_015061	TC	3	6	486651	486656	0 %	50 %	0 %	50 %	322831182
9022	NC_015061	GCA	2	6	486666	486671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831182
9023	NC_015061	ACC	2	6	486727	486732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831182
9024	NC_015061	GCG	2	6	486776	486781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831182
9025	NC_015061	CT	3	6	486816	486821	0 %	50 %	0 %	50 %	322831182
9026	NC_015061	GCC	2	6	486969	486974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831182
9027	NC_015061	CTT	2	6	486984	486989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831182
9028	NC_015061	GGT	2	6	486994	486999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831182
9029	NC_015061	TACAAA	2	12	487018	487029	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	322831182
9030	NC_015061	TGA	2	6	487044	487049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831182
9031	NC_015061	TGG	2	6	487123	487128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831182
9032	NC_015061	GGGTGT	2	12	487197	487208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831182
9033	NC_015061	TTTA	2	8	487319	487326	25 %	75 %	0 %	0 %	322831183
9034	NC_015061	A	7	7	487326	487332	100 %	0 %	0 %	0 %	322831183
9035	NC_015061	TGG	2	6	487375	487380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831183
9036	NC_015061	CA	3	6	487394	487399	50 %	0 %	0 %	50 %	322831183
9037	NC_015061	TGA	2	6	487414	487419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831183
9038	NC_015061	CCTG	2	8	487564	487571	0 %	25 %	25 %	50 %	322831183
9039	NC_015061	GC	3	6	487579	487584	0 %	0 %	50 %	50 %	322831183
9040	NC_015061	TGG	2	6	487621	487626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831183
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9042	NC_015061	CGG	2	6	487841	487846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831183
9043	NC_015061	GTG	2	6	487893	487898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831183
9044	NC_015061	CCG	2	6	487950	487955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831183
9045	NC_015061	GTT	2	6	487997	488002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831183
9046	NC_015061	GCT	2	6	488012	488017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831183
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9048	NC_015061	CGGG	2	8	488308	488315	0 %	0 %	75 %	25 %	322831183
9049	NC_015061	GTGC	2	8	488358	488365	0 %	25 %	50 %	25 %	322831183
9050	NC_015061	CGC	2	6	488458	488463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831183
9051	NC_015061	CTG	2	6	488613	488618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831183
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9053	NC_015061	CAC	2	6	488765	488770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831183
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9055	NC_015061	AAT	2	6	488928	488933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831183
9056	NC_015061	CGCT	2	8	488950	488957	0 %	25 %	25 %	50 %	322831183
9057	NC_015061	TGC	2	6	489040	489045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831183
9058	NC_015061	GCT	2	6	489074	489079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831183
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9061	NC_015061	TAA	2	6	489431	489436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831183
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9065	NC_015061	GAT	2	6	489585	489590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831183
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9119	NC_015061	GCGCA	2	10	493336	493345	20 %	0 %	40 %	40 %	322831187
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9121	NC_015061	GAA	2	6	493369	493374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831187
9122	NC_015061	GTCA	2	8	493461	493468	25 %	25 %	25 %	25 %	322831187
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9234	NC_015061	CTG	2	6	501251	501256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831196
9235	NC_015061	GA	3	6	501318	501323	50 %	0 %	50 %	0 %	322831196
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9238	NC_015061	AGGGA	2	10	501358	501367	40 %	0 %	60 %	0 %	322831196
9239	NC_015061	A	7	7	501401	501407	100 %	0 %	0 %	0 %	322831196
9240	NC_015061	CTT	3	9	501563	501571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831197
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9242	NC_015061	TGC	2	6	501615	501620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831197
9243	NC_015061	CTT	2	6	501653	501658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831197
9244	NC_015061	TGC	2	6	501700	501705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831197
9245	NC_015061	TCA	2	6	501739	501744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831197
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9248	NC_015061	TGC	2	6	501991	501996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831197
9249	NC_015061	TCA	2	6	502067	502072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831197
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9257	NC_015061	GA	3	6	502344	502349	50 %	0 %	50 %	0 %	322831197
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9351	NC_015061	GA	3	6	507817	507822	50 %	0 %	50 %	0 %	322831203
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9355	NC_015061	CAG	2	6	508019	508024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831203
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9363	NC_015061	ATC	2	6	508240	508245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831204
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9484	NC_015061	TTG	2	6	514960	514965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831210
9485	NC_015061	TTCGGT	2	12	514978	514989	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	322831210
9486	NC_015061	TCA	2	6	515037	515042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831210
9487	NC_015061	TGG	2	6	515084	515089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831210
9488	NC_015061	CGTG	2	8	515175	515182	0 %	25 %	50 %	25 %	322831210
9489	NC_015061	ATG	2	6	515186	515191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831210
9490	NC_015061	GGC	2	6	515351	515356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831211
9491	NC_015061	ATC	2	6	515394	515399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831211
9492	NC_015061	TGC	3	9	515456	515464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831211
9493	NC_015061	CTT	2	6	515476	515481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831211
9494	NC_015061	TAC	2	6	515574	515579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831211
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9497	NC_015061	GGATG	2	10	515882	515891	20 %	20 %	60 %	0 %	322831211
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9499	NC_015061	GCG	2	6	515908	515913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831211
9500	NC_015061	GCA	2	6	515933	515938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831211

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