MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 86290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_015061	AGA	2	6	459734	459739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831155
8502	NC_015061	GTT	2	6	459762	459767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831155
8503	NC_015061	CGT	2	6	459936	459941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831156
8504	NC_015061	A	6	6	460028	460033	100 %	0 %	0 %	0 %	322831156
8505	NC_015061	CCCG	2	8	460084	460091	0 %	0 %	25 %	75 %	322831156
8506	NC_015061	AAT	2	6	460107	460112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831156
8507	NC_015061	GCA	2	6	460123	460128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831156
8508	NC_015061	CAA	2	6	460130	460135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831156
8509	NC_015061	GCA	2	6	460172	460177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831156
8510	NC_015061	TCT	2	6	460400	460405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831157
8511	NC_015061	GTC	2	6	460427	460432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831157
8512	NC_015061	GCACC	2	10	460448	460457	20 %	0 %	20 %	60 %	322831157
8513	NC_015061	GAAA	2	8	460562	460569	75 %	0 %	25 %	0 %	322831157
8514	NC_015061	GCG	2	6	460737	460742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831157
8515	NC_015061	GC	3	6	460749	460754	0 %	0 %	50 %	50 %	322831157
8516	NC_015061	CCG	2	6	460786	460791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831157
8517	NC_015061	TGC	2	6	460794	460799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831157
8518	NC_015061	AGC	2	6	460845	460850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831157
8519	NC_015061	GTC	2	6	460860	460865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831157
8520	NC_015061	TTGG	2	8	460901	460908	0 %	50 %	50 %	0 %	322831157
8521	NC_015061	GTT	2	6	460978	460983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831157
8522	NC_015061	TAT	2	6	461011	461016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831157
8523	NC_015061	TGAT	2	8	461145	461152	25 %	50 %	25 %	0 %	322831157
8524	NC_015061	TGA	2	6	461241	461246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831157
8525	NC_015061	GAG	2	6	461294	461299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831157
8526	NC_015061	CT	3	6	461378	461383	0 %	50 %	0 %	50 %	322831157
8527	NC_015061	GCA	2	6	461395	461400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831157
8528	NC_015061	CCG	2	6	461414	461419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831157
8529	NC_015061	GTCT	2	8	461583	461590	0 %	50 %	25 %	25 %	322831157
8530	NC_015061	GAA	2	6	461601	461606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831157
8531	NC_015061	TAA	2	6	461656	461661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831158
8532	NC_015061	GCA	3	9	461685	461693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831158
8533	NC_015061	ATA	3	9	461694	461702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831158
8534	NC_015061	TGG	2	6	461713	461718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831158
8535	NC_015061	TGG	2	6	461725	461730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831158
8536	NC_015061	ACA	2	6	461739	461744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831158
8537	NC_015061	GAT	2	6	461777	461782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831158
8538	NC_015061	G	6	6	461809	461814	0 %	0 %	100 %	0 %	322831158
8539	NC_015061	CAA	3	9	461836	461844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831158
8540	NC_015061	CAA	2	6	461851	461856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831158
8541	NC_015061	GTG	2	6	461889	461894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831158
8542	NC_015061	TTG	2	6	461901	461906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831158
8543	NC_015061	GGT	3	9	461923	461931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831158
8544	NC_015061	GCA	2	6	461939	461944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831158
8545	NC_015061	AAG	2	6	461964	461969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831158
8546	NC_015061	GCCTG	2	10	462019	462028	0 %	20 %	40 %	40 %	322831158
8547	NC_015061	TGC	2	6	462091	462096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831158
8548	NC_015061	TGA	2	6	462118	462123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831158
8549	NC_015061	GAC	2	6	462203	462208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831158
8550	NC_015061	TAC	2	6	462289	462294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831158
8551	NC_015061	GAA	2	6	462323	462328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831158
8552	NC_015061	CG	3	6	462382	462387	0 %	0 %	50 %	50 %	322831158
8553	NC_015061	CCG	2	6	462389	462394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831158
8554	NC_015061	GAA	2	6	462395	462400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831158
8555	NC_015061	CTTC	2	8	462408	462415	0 %	50 %	0 %	50 %	322831158
8556	NC_015061	CGC	2	6	462427	462432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831158
8557	NC_015061	AAC	2	6	462444	462449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831158
8558	NC_015061	GTGA	2	8	462689	462696	25 %	25 %	50 %	0 %	322831158
8559	NC_015061	TGC	2	6	462735	462740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831158
8560	NC_015061	GCA	2	6	462752	462757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831158
8561	NC_015061	ATG	2	6	462777	462782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831158
8562	NC_015061	TTG	2	6	462791	462796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831158
8563	NC_015061	CAG	2	6	462817	462822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831158
8564	NC_015061	CAG	2	6	462847	462852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831158
8565	NC_015061	GA	3	6	462925	462930	50 %	0 %	50 %	0 %	322831158
8566	NC_015061	TCG	2	6	462959	462964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831159
8567	NC_015061	TGG	2	6	462974	462979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831159
8568	NC_015061	TGTT	2	8	462995	463002	0 %	75 %	25 %	0 %	322831159
8569	NC_015061	TGC	2	6	463028	463033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831159
8570	NC_015061	ATA	2	6	463061	463066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831159
8571	NC_015061	CG	3	6	463134	463139	0 %	0 %	50 %	50 %	322831159
8572	NC_015061	GAA	2	6	463185	463190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831159
8573	NC_015061	TCG	2	6	463199	463204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831159
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8577	NC_015061	GTC	2	6	463331	463336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831159
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8580	NC_015061	GCA	2	6	463465	463470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831159
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8584	NC_015061	GAA	2	6	463582	463587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831159
8585	NC_015061	TC	3	6	463649	463654	0 %	50 %	0 %	50 %	322831159
8586	NC_015061	AGA	2	6	463662	463667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831159
8587	NC_015061	GCT	2	6	463684	463689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831159
8588	NC_015061	GCG	2	6	463768	463773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831159
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8591	NC_015061	A	7	7	463922	463928	100 %	0 %	0 %	0 %	322831159
8592	NC_015061	AAT	2	6	463931	463936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831159
8593	NC_015061	TCA	2	6	464028	464033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831160
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8595	NC_015061	TGG	2	6	464167	464172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831160
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8601	NC_015061	A	6	6	464523	464528	100 %	0 %	0 %	0 %	322831161
8602	NC_015061	TTC	2	6	464532	464537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831161
8603	NC_015061	CAT	2	6	464578	464583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831161
8604	NC_015061	TGA	2	6	464616	464621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831161
8605	NC_015061	GC	3	6	464726	464731	0 %	0 %	50 %	50 %	322831161
8606	NC_015061	CAC	2	6	464761	464766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831161
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8609	NC_015061	ACT	2	6	464901	464906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831161
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8614	NC_015061	GC	3	6	465045	465050	0 %	0 %	50 %	50 %	322831161
8615	NC_015061	CGTA	2	8	465087	465094	25 %	25 %	25 %	25 %	322831161
8616	NC_015061	CTG	2	6	465111	465116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831161
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8618	NC_015061	TGA	2	6	465229	465234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831161
8619	NC_015061	GCAA	2	8	465252	465259	50 %	0 %	25 %	25 %	322831161
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8986	NC_015061	A	6	6	484182	484187	100 %	0 %	0 %	0 %	322831180
8987	NC_015061	ACC	2	6	484227	484232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831180
8988	NC_015061	CAC	2	6	484263	484268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831180
8989	NC_015061	TAA	2	6	484413	484418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831180
8990	NC_015061	ATT	2	6	484672	484677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831181
8991	NC_015061	GCG	2	6	484678	484683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831181
8992	NC_015061	CAGA	2	8	484685	484692	50 %	0 %	25 %	25 %	322831181
8993	NC_015061	GCC	2	6	484700	484705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831181
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8995	NC_015061	CTG	2	6	484832	484837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831181
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9000	NC_015061	AGC	2	6	485152	485157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831181

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