MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 86290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_015061	TCTGC	2	10	433277	433286	0 %	40 %	20 %	40 %	322831132
8002	NC_015061	TCT	2	6	433295	433300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831132
8003	NC_015061	TGA	2	6	433311	433316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831132
8004	NC_015061	CAC	2	6	433318	433323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831132
8005	NC_015061	GCG	2	6	433371	433376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831132
8006	NC_015061	GGC	2	6	433397	433402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831132
8007	NC_015061	ATG	2	6	433412	433417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831132
8008	NC_015061	ATC	3	9	433420	433428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831132
8009	NC_015061	GCT	2	6	433759	433764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831133
8010	NC_015061	TCA	2	6	433783	433788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831133
8011	NC_015061	CAG	2	6	433805	433810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831133
8012	NC_015061	GAC	2	6	433823	433828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831133
8013	NC_015061	CGG	2	6	433897	433902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831133
8014	NC_015061	GGC	2	6	433961	433966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831133
8015	NC_015061	GGTC	2	8	434038	434045	0 %	25 %	50 %	25 %	322831133
8016	NC_015061	GCTCG	2	10	434290	434299	0 %	20 %	40 %	40 %	322831134
8017	NC_015061	TCA	2	6	434349	434354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831134
8018	NC_015061	CG	3	6	434370	434375	0 %	0 %	50 %	50 %	322831134
8019	NC_015061	TCG	3	9	434378	434386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831134
8020	NC_015061	GTA	2	6	434434	434439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831134
8021	NC_015061	CAG	2	6	434490	434495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831134
8022	NC_015061	CAA	2	6	434512	434517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831134
8023	NC_015061	AGC	2	6	434531	434536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831134
8024	NC_015061	GC	3	6	434570	434575	0 %	0 %	50 %	50 %	322831134
8025	NC_015061	ATT	2	6	434581	434586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831134
8026	NC_015061	TGAT	2	8	434600	434607	25 %	50 %	25 %	0 %	322831134
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8030	NC_015061	AAT	2	6	434800	434805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831134
8031	NC_015061	GAC	2	6	434892	434897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831134
8032	NC_015061	CAA	2	6	434968	434973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831134
8033	NC_015061	AAC	2	6	434980	434985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831134
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8037	NC_015061	TCT	2	6	435242	435247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831134
8038	NC_015061	T	7	7	435282	435288	0 %	100 %	0 %	0 %	322831134
8039	NC_015061	CAT	2	6	435317	435322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831135
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8041	NC_015061	CGT	2	6	435450	435455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831135
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8054	NC_015061	GC	3	6	436354	436359	0 %	0 %	50 %	50 %	322831137
8055	NC_015061	AGCG	2	8	436363	436370	25 %	0 %	50 %	25 %	322831137
8056	NC_015061	CTG	2	6	436499	436504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831138
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8120	NC_015061	CGC	2	6	439910	439915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831142
8121	NC_015061	GCA	2	6	440009	440014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831142
8122	NC_015061	CCG	2	6	440065	440070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831142
8123	NC_015061	GCG	2	6	440073	440078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831142
8124	NC_015061	TGA	2	6	440155	440160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831142
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8127	NC_015061	GCC	2	6	440275	440280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831142
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8130	NC_015061	TGA	2	6	440921	440926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831143
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8141	NC_015061	GTT	3	9	441282	441290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831143
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8144	NC_015061	GCA	2	6	441528	441533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831143
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8152	NC_015061	GAT	2	6	442192	442197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831144
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8227	NC_015061	CTGAT	2	10	445920	445929	20 %	40 %	20 %	20 %	322831146
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8231	NC_015061	CAG	2	6	446093	446098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831146
8232	NC_015061	CAGCG	2	10	446135	446144	20 %	0 %	40 %	40 %	322831146
8233	NC_015061	CAG	2	6	446159	446164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831146
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8235	NC_015061	ATG	2	6	446187	446192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831146
8236	NC_015061	T	6	6	446207	446212	0 %	100 %	0 %	0 %	322831146
8237	NC_015061	CG	3	6	446234	446239	0 %	0 %	50 %	50 %	322831146
8238	NC_015061	ACC	2	6	446265	446270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831146
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8240	NC_015061	CCA	2	6	446602	446607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831146
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8354	NC_015061	TCCAT	2	10	452964	452973	20 %	40 %	0 %	40 %	322831150
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8483	NC_015061	AAC	2	6	458850	458855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831155
8484	NC_015061	TAT	2	6	458876	458881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831155
8485	NC_015061	GCT	2	6	458921	458926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831155
8486	NC_015061	CCTG	2	8	458933	458940	0 %	25 %	25 %	50 %	322831155
8487	NC_015061	GGAT	2	8	458980	458987	25 %	25 %	50 %	0 %	322831155
8488	NC_015061	AGA	2	6	459011	459016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831155
8489	NC_015061	GCTG	2	8	459017	459024	0 %	25 %	50 %	25 %	322831155
8490	NC_015061	GCACC	2	10	459027	459036	20 %	0 %	20 %	60 %	322831155
8491	NC_015061	CGG	2	6	459073	459078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831155
8492	NC_015061	TCG	2	6	459086	459091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831155
8493	NC_015061	CTG	2	6	459205	459210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831155
8494	NC_015061	T	8	8	459355	459362	0 %	100 %	0 %	0 %	322831155
8495	NC_015061	CCG	2	6	459449	459454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831155
8496	NC_015061	ATT	2	6	459458	459463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831155
8497	NC_015061	TGT	2	6	459496	459501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831155
8498	NC_015061	TG	3	6	459576	459581	0 %	50 %	50 %	0 %	322831155
8499	NC_015061	GTG	2	6	459643	459648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831155
8500	NC_015061	CGACA	2	10	459655	459664	40 %	0 %	20 %	40 %	322831155

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