MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 86290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_015061	GC	3	6	402073	402078	0 %	0 %	50 %	50 %	322831111
7502	NC_015061	CGGCAT	2	12	402181	402192	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322831111
7503	NC_015061	TTC	2	6	402240	402245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831111
7504	NC_015061	TAC	2	6	402293	402298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831111
7505	NC_015061	GTT	3	9	402308	402316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831111
7506	NC_015061	AAAG	2	8	402364	402371	75 %	0 %	25 %	0 %	322831111
7507	NC_015061	TGA	2	6	402406	402411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831111
7508	NC_015061	GAC	2	6	402487	402492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831111
7509	NC_015061	AAT	2	6	402557	402562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831111
7510	NC_015061	TGG	2	6	402597	402602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831111
7511	NC_015061	GGCA	2	8	402603	402610	25 %	0 %	50 %	25 %	322831111
7512	NC_015061	GAG	2	6	402665	402670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831111
7513	NC_015061	AAAG	2	8	402673	402680	75 %	0 %	25 %	0 %	322831111
7514	NC_015061	CTT	2	6	402742	402747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831112
7515	NC_015061	ATT	2	6	402788	402793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831112
7516	NC_015061	AGA	2	6	402794	402799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831112
7517	NC_015061	TCA	2	6	402819	402824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831112
7518	NC_015061	CTGC	2	8	402906	402913	0 %	25 %	25 %	50 %	322831112
7519	NC_015061	CGA	2	6	402934	402939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831112
7520	NC_015061	CAG	2	6	402950	402955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831112
7521	NC_015061	GCA	2	6	403003	403008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831112
7522	NC_015061	AAT	2	6	403040	403045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831112
7523	NC_015061	TGA	2	6	403077	403082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831112
7524	NC_015061	ATT	2	6	403136	403141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831112
7525	NC_015061	TCA	2	6	403182	403187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831112
7526	NC_015061	CAC	2	6	403208	403213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831112
7527	NC_015061	CCA	2	6	403225	403230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831112
7528	NC_015061	TCA	2	6	409473	409478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831113
7529	NC_015061	GATCCC	2	12	409497	409508	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322831113
7530	NC_015061	CTTT	2	8	409546	409553	0 %	75 %	0 %	25 %	322831113
7531	NC_015061	GAA	2	6	409584	409589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831113
7532	NC_015061	CAA	2	6	409607	409612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831113
7533	NC_015061	ATC	2	6	409696	409701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831113
7534	NC_015061	CTG	2	6	409709	409714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831113
7535	NC_015061	TAAG	2	8	409715	409722	50 %	25 %	25 %	0 %	322831113
7536	NC_015061	CG	3	6	409748	409753	0 %	0 %	50 %	50 %	322831113
7537	NC_015061	AAT	2	6	409785	409790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831113
7538	NC_015061	GCA	2	6	409807	409812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831113
7539	NC_015061	CGA	2	6	409880	409885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831113
7540	NC_015061	AAC	2	6	409896	409901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831113
7541	NC_015061	TCA	2	6	409924	409929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831113
7542	NC_015061	TGA	2	6	409952	409957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831113
7543	NC_015061	GA	3	6	409976	409981	50 %	0 %	50 %	0 %	322831113
7544	NC_015061	CCG	2	6	409982	409987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831113
7545	NC_015061	ACC	2	6	410014	410019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831113
7546	NC_015061	GAA	2	6	410061	410066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831113
7547	NC_015061	ACCG	2	8	410073	410080	25 %	0 %	25 %	50 %	322831113
7548	NC_015061	ATT	2	6	410106	410111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831113
7549	NC_015061	CCG	2	6	410113	410118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831113
7550	NC_015061	CTT	2	6	410249	410254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831113
7551	NC_015061	CAT	2	6	410258	410263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831113
7552	NC_015061	GAA	2	6	410271	410276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831113
7553	NC_015061	CGG	2	6	410300	410305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831113
7554	NC_015061	TCC	2	6	410361	410366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831113
7555	NC_015061	TGA	2	6	410498	410503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831113
7556	NC_015061	GTC	2	6	410515	410520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831113
7557	NC_015061	ACA	2	6	410537	410542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831113
7558	NC_015061	CAA	2	6	410654	410659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831113
7559	NC_015061	CCA	2	6	410660	410665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831113
7560	NC_015061	AGC	2	6	410683	410688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831113
7561	NC_015061	CAT	2	6	410822	410827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831113
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7563	NC_015061	GCC	2	6	410925	410930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831113
7564	NC_015061	TAG	2	6	410938	410943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831113
7565	NC_015061	TGC	2	6	410967	410972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831113
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7567	NC_015061	CAA	2	6	410999	411004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831113
7568	NC_015061	GCA	2	6	411073	411078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831113
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7571	NC_015061	CG	3	6	411194	411199	0 %	0 %	50 %	50 %	322831114
7572	NC_015061	CCCACG	2	12	411243	411254	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	322831114
7573	NC_015061	TGG	2	6	411271	411276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831114
7574	NC_015061	AG	3	6	411286	411291	50 %	0 %	50 %	0 %	322831114
7575	NC_015061	CAG	2	6	411365	411370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831114
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7577	NC_015061	CT	3	6	411427	411432	0 %	50 %	0 %	50 %	322831114
7578	NC_015061	TCAT	2	8	411444	411451	25 %	50 %	0 %	25 %	322831114
7579	NC_015061	ACG	2	6	411509	411514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831115
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7581	NC_015061	TTC	2	6	411534	411539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831115
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7586	NC_015061	TAA	2	6	411937	411942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831115
7587	NC_015061	ACG	2	6	411954	411959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831115
7588	NC_015061	TGA	2	6	412067	412072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831115
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7590	NC_015061	GAA	2	6	412140	412145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831115
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7593	NC_015061	GTA	2	6	412269	412274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831115
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7601	NC_015061	CAT	2	6	412853	412858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831115
7602	NC_015061	GC	3	6	412891	412896	0 %	0 %	50 %	50 %	322831115
7603	NC_015061	TCG	2	6	412903	412908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831115
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7605	NC_015061	CAT	2	6	413117	413122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831115
7606	NC_015061	TCA	2	6	413167	413172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831115
7607	NC_015061	ATA	2	6	413385	413390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831115
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7614	NC_015061	AATA	2	8	414206	414213	75 %	25 %	0 %	0 %	322831116
7615	NC_015061	CATT	2	8	414235	414242	25 %	50 %	0 %	25 %	322831116
7616	NC_015061	TGACC	2	10	414253	414262	20 %	20 %	20 %	40 %	322831116
7617	NC_015061	CGG	2	6	414270	414275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831116
7618	NC_015061	CAG	2	6	414334	414339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831116
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7983	NC_015061	GTT	2	6	432740	432745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831132
7984	NC_015061	CAA	2	6	432748	432753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831132
7985	NC_015061	ACC	2	6	432758	432763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831132
7986	NC_015061	ATC	3	9	432764	432772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831132
7987	NC_015061	GAA	2	6	432785	432790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831132
7988	NC_015061	CAG	2	6	432824	432829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831132
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7991	NC_015061	TGAAA	2	10	432934	432943	60 %	20 %	20 %	0 %	322831132
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7993	NC_015061	TGC	2	6	432985	432990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831132
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7998	NC_015061	GAA	2	6	433151	433156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831132
7999	NC_015061	CAAA	2	8	433170	433177	75 %	0 %	0 %	25 %	322831132
8000	NC_015061	GAA	2	6	433220	433225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831132

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