MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 86290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
74001	NC_015061	TCAATC	2	12	4159856	4159867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834506
74002	NC_015061	CAG	2	6	4159891	4159896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834506
74003	NC_015061	GTGA	2	8	4159979	4159986	25 %	25 %	50 %	0 %	322834506
74004	NC_015061	CG	3	6	4160044	4160049	0 %	0 %	50 %	50 %	322834506
74005	NC_015061	CTT	2	6	4160080	4160085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322834506
74006	NC_015061	TTC	2	6	4160094	4160099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322834506
74007	NC_015061	CCCG	2	8	4160123	4160130	0 %	0 %	25 %	75 %	322834506
74008	NC_015061	TGG	2	6	4160186	4160191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322834506
74009	NC_015061	ATG	2	6	4160231	4160236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834506
74010	NC_015061	GGCCAA	2	12	4160469	4160480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834507
74011	NC_015061	AGC	2	6	4160502	4160507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834507
74012	NC_015061	ATT	2	6	4160529	4160534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322834507
74013	NC_015061	ATG	2	6	4160669	4160674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834507
74014	NC_015061	TGG	2	6	4160768	4160773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322834507
74015	NC_015061	ATC	2	6	4160846	4160851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834507
74016	NC_015061	ACC	2	6	4160953	4160958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322834507
74017	NC_015061	CTG	2	6	4160962	4160967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834507
74018	NC_015061	TGA	2	6	4160972	4160977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834507
74019	NC_015061	CGC	2	6	4160982	4160987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322834507
74020	NC_015061	TAT	2	6	4161000	4161005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322834507
74021	NC_015061	GCC	2	6	4161029	4161034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322834507
74022	NC_015061	GCA	2	6	4161045	4161050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834507
74023	NC_015061	CTG	2	6	4161061	4161066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834507
74024	NC_015061	AGA	2	6	4161087	4161092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322834507
74025	NC_015061	TGA	2	6	4161093	4161098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834507
74026	NC_015061	GAA	2	6	4161103	4161108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322834507
74027	NC_015061	CGC	2	6	4161128	4161133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322834507
74028	NC_015061	AAG	2	6	4161203	4161208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322834507
74029	NC_015061	GCA	2	6	4161239	4161244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834507
74030	NC_015061	AAT	2	6	4161272	4161277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322834508
74031	NC_015061	ACG	2	6	4161446	4161451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834508
74032	NC_015061	GCA	2	6	4161487	4161492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834508
74033	NC_015061	TCC	2	6	4161692	4161697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322834508
74034	NC_015061	CAG	2	6	4161706	4161711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834508
74035	NC_015061	GCC	2	6	4161822	4161827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322834508
74036	NC_015061	CCT	2	6	4161838	4161843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322834508
74037	NC_015061	AGC	2	6	4161970	4161975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834508
74038	NC_015061	GCT	2	6	4161985	4161990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834508
74039	NC_015061	GAT	2	6	4162002	4162007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834508
74040	NC_015061	TCC	2	6	4162014	4162019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322834508
74041	NC_015061	CCA	2	6	4162171	4162176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322834508
74042	NC_015061	CGT	2	6	4162300	4162305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834508
74043	NC_015061	GCC	2	6	4162507	4162512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322834508
74044	NC_015061	CAG	2	6	4162792	4162797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834509
74045	NC_015061	GTC	2	6	4162835	4162840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834509
74046	NC_015061	GCG	2	6	4162850	4162855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322834509
74047	NC_015061	CGG	2	6	4162944	4162949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322834509
74048	NC_015061	CG	4	8	4163046	4163053	0 %	0 %	50 %	50 %	322834509
74049	NC_015061	CGC	2	6	4163071	4163076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322834509
74050	NC_015061	GCAC	2	8	4163207	4163214	25 %	0 %	25 %	50 %	322834509
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74052	NC_015061	GAT	2	6	4163236	4163241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834509
74053	NC_015061	T	7	7	4163241	4163247	0 %	100 %	0 %	0 %	322834509
74054	NC_015061	AGGA	2	8	4163289	4163296	50 %	0 %	50 %	0 %	322834509
74055	NC_015061	CACG	2	8	4163364	4163371	25 %	0 %	25 %	50 %	322834509
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74059	NC_015061	GAT	3	9	4163775	4163783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834510
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74068	NC_015061	GACA	2	8	4164033	4164040	50 %	0 %	25 %	25 %	322834510
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74082	NC_015061	ACC	2	6	4164920	4164925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322834511
74083	NC_015061	CGCA	2	8	4164964	4164971	25 %	0 %	25 %	50 %	322834511
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74090	NC_015061	ACTG	2	8	4165323	4165330	25 %	25 %	25 %	25 %	322834511
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74099	NC_015061	ATC	2	6	4165886	4165891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834511
74100	NC_015061	CCG	2	6	4165901	4165906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322834511
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74103	NC_015061	GTTGAG	2	12	4165987	4165998	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	322834511
74104	NC_015061	TCCAG	2	10	4166004	4166013	20 %	20 %	20 %	40 %	322834511
74105	NC_015061	AC	3	6	4166049	4166054	50 %	0 %	0 %	50 %	322834511
74106	NC_015061	TCAT	2	8	4166057	4166064	25 %	50 %	0 %	25 %	322834511
74107	NC_015061	ATAG	2	8	4166080	4166087	50 %	25 %	25 %	0 %	322834511
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74115	NC_015061	CAG	2	6	4166422	4166427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834512
74116	NC_015061	CCGG	2	8	4166480	4166487	0 %	0 %	50 %	50 %	322834512
74117	NC_015061	TCA	3	9	4166532	4166540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834512
74118	NC_015061	TGA	2	6	4166592	4166597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834512
74119	NC_015061	GAT	2	6	4166671	4166676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834512
74120	NC_015061	CAG	2	6	4166683	4166688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834512
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74122	NC_015061	GC	3	6	4166763	4166768	0 %	0 %	50 %	50 %	322834512
74123	NC_015061	CG	3	6	4166815	4166820	0 %	0 %	50 %	50 %	322834512
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74207	NC_015061	TGC	2	6	4171892	4171897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834518
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74212	NC_015061	CTG	2	6	4172100	4172105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834518
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74215	NC_015061	CTG	2	6	4172316	4172321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834518
74216	NC_015061	ATC	2	6	4172380	4172385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834518
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74219	NC_015061	ACG	2	6	4172572	4172577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834518
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74222	NC_015061	GCG	2	6	4172715	4172720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322834518
74223	NC_015061	CAGC	2	8	4172738	4172745	25 %	0 %	25 %	50 %	322834518
74224	NC_015061	CAGGTT	2	12	4172778	4172789	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322834518
74225	NC_015061	ATA	2	6	4172802	4172807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322834518
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74227	NC_015061	CGC	2	6	4172864	4172869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322834518
74228	NC_015061	CGC	2	6	4172888	4172893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322834518
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74463	NC_015061	GCCGC	2	10	4188713	4188722	0 %	0 %	40 %	60 %	322834532
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