MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 86290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015061	GCT	2	6	348906	348911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831036
6502	NC_015061	CCGATG	2	12	348950	348961	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322831036
6503	NC_015061	CGC	2	6	348983	348988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831036
6504	NC_015061	CGT	2	6	349003	349008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831036
6505	NC_015061	ACG	2	6	349043	349048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831036
6506	NC_015061	CGG	2	6	349070	349075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831036
6507	NC_015061	GC	3	6	349118	349123	0 %	0 %	50 %	50 %	322831036
6508	NC_015061	TTC	2	6	349235	349240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831037
6509	NC_015061	GACCA	2	10	349296	349305	40 %	0 %	20 %	40 %	322831037
6510	NC_015061	CCA	2	6	349411	349416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831037
6511	NC_015061	AAT	2	6	349454	349459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831037
6512	NC_015061	TGT	2	6	349465	349470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831038
6513	NC_015061	AAAC	2	8	349557	349564	75 %	0 %	0 %	25 %	322831038
6514	NC_015061	TCT	2	6	349616	349621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831038
6515	NC_015061	GTC	2	6	349654	349659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831038
6516	NC_015061	CGG	2	6	349721	349726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831038
6517	NC_015061	TAA	2	6	349727	349732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831038
6518	NC_015061	CGT	2	6	349773	349778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831038
6519	NC_015061	GCT	2	6	349809	349814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831038
6520	NC_015061	TGA	2	6	349906	349911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831038
6521	NC_015061	GCG	2	6	349950	349955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831038
6522	NC_015061	ACC	2	6	349961	349966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831038
6523	NC_015061	CGG	2	6	349968	349973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831038
6524	NC_015061	GCC	2	6	350026	350031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831038
6525	NC_015061	TGAA	2	8	350087	350094	50 %	25 %	25 %	0 %	322831038
6526	NC_015061	A	6	6	350093	350098	100 %	0 %	0 %	0 %	322831038
6527	NC_015061	GCA	2	6	350133	350138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831038
6528	NC_015061	GAC	2	6	350176	350181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831038
6529	NC_015061	AGCC	2	8	350186	350193	25 %	0 %	25 %	50 %	322831038
6530	NC_015061	GAA	2	6	350236	350241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831038
6531	NC_015061	GCC	2	6	350376	350381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831038
6532	NC_015061	CGC	2	6	350599	350604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831039
6533	NC_015061	TGT	2	6	350628	350633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831039
6534	NC_015061	TTC	2	6	350660	350665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831039
6535	NC_015061	TGC	2	6	350715	350720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831039
6536	NC_015061	TGG	2	6	350721	350726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831039
6537	NC_015061	CGG	2	6	350737	350742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831039
6538	NC_015061	TCA	2	6	350745	350750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831039
6539	NC_015061	CTG	2	6	350801	350806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831039
6540	NC_015061	TGGC	2	8	350807	350814	0 %	25 %	50 %	25 %	322831039
6541	NC_015061	TGC	2	6	350898	350903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831039
6542	NC_015061	GCC	2	6	350969	350974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831039
6543	NC_015061	ATC	2	6	351035	351040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831039
6544	NC_015061	TGGCT	2	10	351041	351050	0 %	40 %	40 %	20 %	322831039
6545	NC_015061	GCC	2	6	351066	351071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831039
6546	NC_015061	TGC	2	6	351072	351077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831039
6547	NC_015061	GCA	2	6	351078	351083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831039
6548	NC_015061	GCGT	2	8	351085	351092	0 %	25 %	50 %	25 %	322831039
6549	NC_015061	CCG	2	6	351126	351131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831039
6550	NC_015061	TG	3	6	351134	351139	0 %	50 %	50 %	0 %	322831039
6551	NC_015061	TCT	2	6	351214	351219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831040
6552	NC_015061	GTT	2	6	351253	351258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831040
6553	NC_015061	GC	3	6	351295	351300	0 %	0 %	50 %	50 %	322831040
6554	NC_015061	TGT	2	6	351315	351320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831040
6555	NC_015061	TGT	2	6	351352	351357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831040
6556	NC_015061	GC	3	6	351511	351516	0 %	0 %	50 %	50 %	322831040
6557	NC_015061	CGC	2	6	351523	351528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831040
6558	NC_015061	CTG	2	6	351548	351553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831040
6559	NC_015061	CCA	2	6	351574	351579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831040
6560	NC_015061	GCC	2	6	351626	351631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831040
6561	NC_015061	GTG	2	6	351654	351659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831040
6562	NC_015061	CGACA	2	10	351683	351692	40 %	0 %	20 %	40 %	322831040
6563	NC_015061	GGT	2	6	351754	351759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831040
6564	NC_015061	CAG	2	6	351779	351784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831040
6565	NC_015061	CCG	2	6	351834	351839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831040
6566	NC_015061	CTG	2	6	351908	351913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831040
6567	NC_015061	GCG	2	6	351952	351957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831040
6568	NC_015061	TCT	2	6	351960	351965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831040
6569	NC_015061	GC	3	6	351966	351971	0 %	0 %	50 %	50 %	322831040
6570	NC_015061	TGC	2	6	351987	351992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831040
6571	NC_015061	GCG	2	6	352042	352047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831040
6572	NC_015061	GCCA	2	8	352055	352062	25 %	0 %	25 %	50 %	322831040
6573	NC_015061	GTG	2	6	352158	352163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831040
6574	NC_015061	CTG	2	6	352376	352381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831040
6575	NC_015061	CTG	2	6	352397	352402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831040
6576	NC_015061	AGT	2	6	352441	352446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831040
6577	NC_015061	CTG	2	6	352469	352474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831040
6578	NC_015061	GAT	2	6	352496	352501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831040
6579	NC_015061	CCAG	2	8	352570	352577	25 %	0 %	25 %	50 %	322831040
6580	NC_015061	GGT	2	6	352597	352602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831040
6581	NC_015061	AGC	2	6	352617	352622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831040
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6583	NC_015061	GCT	2	6	352699	352704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831040
6584	NC_015061	CGC	2	6	352745	352750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831040
6585	NC_015061	GC	4	8	352749	352756	0 %	0 %	50 %	50 %	322831040
6586	NC_015061	TCA	2	6	352818	352823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831040
6587	NC_015061	TGC	2	6	352836	352841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831040
6588	NC_015061	AGC	2	6	352995	353000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831040
6589	NC_015061	CCA	2	6	353035	353040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831040
6590	NC_015061	CAG	2	6	353084	353089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831040
6591	NC_015061	AGG	2	6	353116	353121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831040
6592	NC_015061	CCA	2	6	353273	353278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831041
6593	NC_015061	TGC	2	6	353286	353291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831041
6594	NC_015061	CAG	2	6	353342	353347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831041
6595	NC_015061	T	7	7	353401	353407	0 %	100 %	0 %	0 %	322831041
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6599	NC_015061	ATGG	2	8	353506	353513	25 %	25 %	50 %	0 %	322831041
6600	NC_015061	ACC	2	6	353591	353596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831041
6601	NC_015061	GCGG	2	8	353621	353628	0 %	0 %	75 %	25 %	322831041
6602	NC_015061	G	6	6	353804	353809	0 %	0 %	100 %	0 %	322831041
6603	NC_015061	CTG	2	6	353848	353853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831042
6604	NC_015061	GGT	2	6	353868	353873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831042
6605	NC_015061	ATC	2	6	354025	354030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831042
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6608	NC_015061	GGC	2	6	354159	354164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831042
6609	NC_015061	GGC	2	6	354250	354255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831042
6610	NC_015061	TGC	2	6	354272	354277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831042
6611	NC_015061	G	6	6	354330	354335	0 %	0 %	100 %	0 %	322831042
6612	NC_015061	GCA	2	6	354344	354349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831042
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6614	NC_015061	GCGT	2	8	354452	354459	0 %	25 %	50 %	25 %	322831042
6615	NC_015061	CCG	3	9	354470	354478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831042
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6617	NC_015061	GCTCG	2	10	354492	354501	0 %	20 %	40 %	40 %	322831042
6618	NC_015061	TGCTGG	2	12	354692	354703	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	322831042
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6739	NC_015061	ACCAC	2	10	361636	361645	40 %	0 %	0 %	60 %	322831053
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6742	NC_015061	CGTT	2	8	361812	361819	0 %	50 %	25 %	25 %	322831053
6743	NC_015061	GTT	2	6	361856	361861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831053
6744	NC_015061	GTT	2	6	361940	361945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831053
6745	NC_015061	GAA	2	6	362009	362014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831053
6746	NC_015061	GAA	2	6	362042	362047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831053
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6985	NC_015061	AAG	2	6	374691	374696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831067
6986	NC_015061	TGC	2	6	374728	374733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831067
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