MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014834	GTG	2	6	167732	167737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931543
4002	NC_014834	GTA	2	6	167761	167766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931543
4003	NC_014834	GTT	2	6	167767	167772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931543
4004	NC_014834	TTG	3	9	167774	167782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931543
4005	NC_014834	GTC	2	6	167809	167814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931543
4006	NC_014834	TTG	2	6	167822	167827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931543
4007	NC_014834	CGC	2	6	167833	167838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931543
4008	NC_014834	GTCG	2	8	167854	167861	0 %	25 %	50 %	25 %	316931543
4009	NC_014834	AGC	2	6	167897	167902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931543
4010	NC_014834	TGGCGG	2	12	167931	167942	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	316931543
4011	NC_014834	CCG	2	6	167951	167956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931543
4012	NC_014834	CGC	2	6	168039	168044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931543
4013	NC_014834	GCC	2	6	168059	168064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931543
4014	NC_014834	CGT	2	6	168123	168128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931543
4015	NC_014834	GTCG	2	8	168151	168158	0 %	25 %	50 %	25 %	316931543
4016	NC_014834	ACCG	2	8	168205	168212	25 %	0 %	25 %	50 %	316931543
4017	NC_014834	GGC	2	6	168214	168219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931543
4018	NC_014834	CCG	3	9	168222	168230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931543
4019	NC_014834	GCGCA	2	10	168244	168253	20 %	0 %	40 %	40 %	316931543
4020	NC_014834	GCTCA	2	10	168788	168797	20 %	20 %	20 %	40 %	316931544
4021	NC_014834	GCG	2	6	168850	168855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931544
4022	NC_014834	TCG	2	6	168940	168945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931544
4023	NC_014834	CAC	2	6	168996	169001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931544
4024	NC_014834	CGC	2	6	169064	169069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931544
4025	NC_014834	GGCA	2	8	169102	169109	25 %	0 %	50 %	25 %	316931544
4026	NC_014834	CGC	2	6	169124	169129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931544
4027	NC_014834	GCC	2	6	169165	169170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931544
4028	NC_014834	GC	3	6	169171	169176	0 %	0 %	50 %	50 %	316931544
4029	NC_014834	GC	3	6	169190	169195	0 %	0 %	50 %	50 %	316931544
4030	NC_014834	CCG	2	6	169211	169216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931544
4031	NC_014834	CCAG	2	8	169238	169245	25 %	0 %	25 %	50 %	316931544
4032	NC_014834	GCC	2	6	169260	169265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931544
4033	NC_014834	CGA	2	6	169310	169315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931544
4034	NC_014834	ACC	2	6	169345	169350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931544
4035	NC_014834	GC	3	6	169363	169368	0 %	0 %	50 %	50 %	316931544
4036	NC_014834	CAC	2	6	169557	169562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931544
4037	NC_014834	GCC	2	6	169575	169580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931544
4038	NC_014834	GGC	2	6	169644	169649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931544
4039	NC_014834	CAG	2	6	169764	169769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931544
4040	NC_014834	CGG	2	6	169959	169964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931545
4041	NC_014834	ATC	2	6	169977	169982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931545
4042	NC_014834	CG	3	6	170005	170010	0 %	0 %	50 %	50 %	316931545
4043	NC_014834	CAC	2	6	170027	170032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931545
4044	NC_014834	CGG	2	6	170074	170079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931545
4045	NC_014834	CA	3	6	170087	170092	50 %	0 %	0 %	50 %	316931545
4046	NC_014834	GC	3	6	170097	170102	0 %	0 %	50 %	50 %	316931545
4047	NC_014834	TCGCCG	2	12	170106	170117	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	316931545
4048	NC_014834	GCCG	2	8	170177	170184	0 %	0 %	50 %	50 %	316931545
4049	NC_014834	CAC	2	6	170186	170191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931545
4050	NC_014834	GCG	2	6	170202	170207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931545
4051	NC_014834	CCG	2	6	170212	170217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931545
4052	NC_014834	CCG	2	6	170248	170253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931545
4053	NC_014834	GC	3	6	170278	170283	0 %	0 %	50 %	50 %	316931545
4054	NC_014834	GAT	2	6	170300	170305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931545
4055	NC_014834	T	7	7	170316	170322	0 %	100 %	0 %	0 %	316931545
4056	NC_014834	ACC	2	6	170328	170333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931545
4057	NC_014834	GCG	2	6	170335	170340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931545
4058	NC_014834	GGC	2	6	170411	170416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931545
4059	NC_014834	CGCGGC	2	12	170423	170434	0 %	0 %	50 %	50 %	316931545
4060	NC_014834	GC	3	6	170433	170438	0 %	0 %	50 %	50 %	316931545
4061	NC_014834	TCCAGC	2	12	170439	170450	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	316931545
4062	NC_014834	GTC	2	6	170454	170459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931545
4063	NC_014834	TTCG	2	8	170489	170496	0 %	50 %	25 %	25 %	316931545
4064	NC_014834	CCGG	2	8	170511	170518	0 %	0 %	50 %	50 %	316931545
4065	NC_014834	GCA	2	6	170527	170532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931545
4066	NC_014834	CGC	2	6	170624	170629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931545
4067	NC_014834	CGG	2	6	170641	170646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931545
4068	NC_014834	CGC	2	6	170648	170653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931545
4069	NC_014834	GGCGA	2	10	170663	170672	20 %	0 %	60 %	20 %	316931545
4070	NC_014834	CAGC	2	8	170747	170754	25 %	0 %	25 %	50 %	316931545
4071	NC_014834	TCGAGC	2	12	170757	170768	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	316931545
4072	NC_014834	CGC	2	6	170779	170784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931545
4073	NC_014834	GC	4	8	170783	170790	0 %	0 %	50 %	50 %	316931545
4074	NC_014834	CGA	2	6	170803	170808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931545
4075	NC_014834	TGC	3	9	171127	171135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931546
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4078	NC_014834	CGC	2	6	171194	171199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931546
4079	NC_014834	CGC	2	6	171223	171228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931546
4080	NC_014834	GCT	2	6	171251	171256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931546
4081	NC_014834	TGC	2	6	171316	171321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931546
4082	NC_014834	CGC	2	6	171335	171340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931546
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4084	NC_014834	CTT	2	6	171389	171394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931546
4085	NC_014834	CG	3	6	171435	171440	0 %	0 %	50 %	50 %	316931546
4086	NC_014834	GC	3	6	171452	171457	0 %	0 %	50 %	50 %	316931546
4087	NC_014834	CGG	2	6	171581	171586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931546
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4090	NC_014834	CGG	2	6	171752	171757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931546
4091	NC_014834	GATCT	2	10	171759	171768	20 %	40 %	20 %	20 %	316931546
4092	NC_014834	GACG	2	8	171807	171814	25 %	0 %	50 %	25 %	316931546
4093	NC_014834	GGC	2	6	171842	171847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931546
4094	NC_014834	CGA	2	6	171848	171853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931546
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4097	NC_014834	GAG	2	6	171936	171941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931546
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4099	NC_014834	GAT	2	6	172022	172027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931546
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4101	NC_014834	CGG	2	6	172058	172063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931546
4102	NC_014834	GCCG	2	8	172067	172074	0 %	0 %	50 %	50 %	316931546
4103	NC_014834	AAGG	2	8	172173	172180	50 %	0 %	50 %	0 %	316931546
4104	NC_014834	GCC	2	6	172191	172196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931546
4105	NC_014834	ACC	2	6	172213	172218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931546
4106	NC_014834	CAC	2	6	172448	172453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931546
4107	NC_014834	TGG	2	6	172480	172485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931546
4108	NC_014834	CG	3	6	172576	172581	0 %	0 %	50 %	50 %	316931546
4109	NC_014834	TCG	2	6	172614	172619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931546
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4111	NC_014834	CGA	2	6	172685	172690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931546
4112	NC_014834	GCT	2	6	172832	172837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931547
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4114	NC_014834	GCG	2	6	172862	172867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931547
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4119	NC_014834	CGG	2	6	172953	172958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931547
4120	NC_014834	GCC	2	6	172997	173002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931547
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4122	NC_014834	CTG	2	6	173044	173049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931547
4123	NC_014834	GCC	2	6	173143	173148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931547
4124	NC_014834	TCG	2	6	173168	173173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931547
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4126	NC_014834	GTCC	2	8	173184	173191	0 %	25 %	25 %	50 %	316931547
4127	NC_014834	GGT	2	6	173215	173220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931547
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4131	NC_014834	GCC	2	6	173284	173289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931547
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4142	NC_014834	CTG	2	6	173793	173798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931548
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4150	NC_014834	GCT	2	6	174113	174118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931548
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4223	NC_014834	TGC	2	6	176662	176667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931551
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4231	NC_014834	CGCC	2	8	177068	177075	0 %	0 %	25 %	75 %	316931551
4232	NC_014834	GGT	2	6	177098	177103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931551
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4234	NC_014834	TGG	2	6	177187	177192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931551
4235	NC_014834	CGG	2	6	177203	177208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931551
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4237	NC_014834	GTG	2	6	177267	177272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931551
4238	NC_014834	CG	4	8	177281	177288	0 %	0 %	50 %	50 %	316931551
4239	NC_014834	CGA	2	6	177299	177304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931551
4240	NC_014834	CGC	2	6	177317	177322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931551
4241	NC_014834	CGC	2	6	177344	177349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931551
4242	NC_014834	GCCGA	2	10	177369	177378	20 %	0 %	40 %	40 %	316931551
4243	NC_014834	GGA	2	6	177386	177391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931551
4244	NC_014834	CGT	2	6	177410	177415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931551
4245	NC_014834	GCT	2	6	177416	177421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931551
4246	NC_014834	TCGGC	2	10	177430	177439	0 %	20 %	40 %	40 %	316931551
4247	NC_014834	GGT	2	6	177443	177448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931551
4248	NC_014834	GCCG	2	8	177505	177512	0 %	0 %	50 %	50 %	316931551
4249	NC_014834	CG	3	6	177563	177568	0 %	0 %	50 %	50 %	316931552
4250	NC_014834	GCT	2	6	177592	177597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931552
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4255	NC_014834	GATC	2	8	177847	177854	25 %	25 %	25 %	25 %	316931552
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4258	NC_014834	GAT	2	6	177961	177966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931552
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4264	NC_014834	GGT	2	6	178392	178397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931553
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4266	NC_014834	GCT	3	9	178429	178437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931553
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4268	NC_014834	CGA	2	6	178477	178482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931553
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4270	NC_014834	CCG	2	6	178631	178636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931553
4271	NC_014834	CG	3	6	178704	178709	0 %	0 %	50 %	50 %	316931553
4272	NC_014834	TGG	2	6	178716	178721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931553
4273	NC_014834	CTA	2	6	178747	178752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931553
4274	NC_014834	CTG	2	6	178754	178759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931553
4275	NC_014834	TCGCC	2	10	178788	178797	0 %	20 %	20 %	60 %	316931553
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4278	NC_014834	ATC	2	6	178913	178918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931553
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4281	NC_014834	C	6	6	179021	179026	0 %	0 %	0 %	100 %	316931553
4282	NC_014834	CGC	2	6	179064	179069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931553
4283	NC_014834	GCCG	2	8	179092	179099	0 %	0 %	50 %	50 %	316931553
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4345	NC_014834	GC	3	6	181736	181741	0 %	0 %	50 %	50 %	316931555
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4350	NC_014834	CGT	2	6	182160	182165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931556
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4352	NC_014834	ACC	2	6	182245	182250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931556
4353	NC_014834	CCG	2	6	182291	182296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931556
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4355	NC_014834	TGC	2	6	182357	182362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931556
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4357	NC_014834	CGGCA	2	10	182521	182530	20 %	0 %	40 %	40 %	316931556
4358	NC_014834	CAT	2	6	182538	182543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931556
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4360	NC_014834	ATC	2	6	182681	182686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931556
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4362	NC_014834	CGA	2	6	182730	182735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931556
4363	NC_014834	GCG	3	9	182834	182842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931556
4364	NC_014834	CGG	2	6	182858	182863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931556
4365	NC_014834	GAT	2	6	182883	182888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931556
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4367	NC_014834	CGGCAA	2	12	182904	182915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931556
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4371	NC_014834	GATC	2	8	183144	183151	25 %	25 %	25 %	25 %	316931556
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4390	NC_014834	CGC	2	6	183993	183998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931557
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4397	NC_014834	CCTCG	2	10	184203	184212	0 %	20 %	20 %	60 %	316931557
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4400	NC_014834	CGA	2	6	184316	184321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931557
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4442	NC_014834	CGGC	2	8	185845	185852	0 %	0 %	50 %	50 %	316931558
4443	NC_014834	GCG	2	6	185865	185870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931558
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4481	NC_014834	GCG	3	9	187430	187438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931559
4482	NC_014834	CGC	2	6	187458	187463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931559
4483	NC_014834	CTGC	2	8	187498	187505	0 %	25 %	25 %	50 %	316931559
4484	NC_014834	GCCGA	2	10	187528	187537	20 %	0 %	40 %	40 %	316931559
4485	NC_014834	TGT	2	6	187547	187552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931559
4486	NC_014834	GAA	2	6	187644	187649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931559
4487	NC_014834	TTC	2	6	187663	187668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931559
4488	NC_014834	CGC	3	9	187728	187736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931559
4489	NC_014834	GGT	2	6	187737	187742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931559
4490	NC_014834	GGC	2	6	187748	187753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931559
4491	NC_014834	CTG	3	9	187813	187821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931559
4492	NC_014834	GCG	2	6	187826	187831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931559
4493	NC_014834	GCTGAT	2	12	187875	187886	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	316931559
4494	NC_014834	CGC	2	6	187893	187898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931559
4495	NC_014834	CTG	2	6	187915	187920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931559
4496	NC_014834	TGC	2	6	187940	187945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931559
4497	NC_014834	TCGCGG	2	12	187949	187960	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316931559
4498	NC_014834	CGG	3	9	188001	188009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931559
4499	NC_014834	GGT	2	6	188046	188051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931559
4500	NC_014834	GCG	2	6	188062	188067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931559

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