MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_014834	GCCG	2	8	811723	811730	0 %	0 %	50 %	50 %	316932152
19002	NC_014834	CG	3	6	811735	811740	0 %	0 %	50 %	50 %	316932152
19003	NC_014834	GCCG	2	8	811786	811793	0 %	0 %	50 %	50 %	316932152
19004	NC_014834	CGAGG	2	10	811806	811815	20 %	0 %	60 %	20 %	316932152
19005	NC_014834	GC	3	6	811822	811827	0 %	0 %	50 %	50 %	316932152
19006	NC_014834	CGC	2	6	811839	811844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932152
19007	NC_014834	TCGGCC	2	12	811874	811885	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	316932152
19008	NC_014834	CGC	2	6	811898	811903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932152
19009	NC_014834	GCC	3	9	811951	811959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932152
19010	NC_014834	CGC	2	6	811980	811985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932152
19011	NC_014834	AGT	2	6	812021	812026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932152
19012	NC_014834	CCGC	2	8	812033	812040	0 %	0 %	25 %	75 %	316932153
19013	NC_014834	GCT	2	6	812088	812093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932153
19014	NC_014834	GC	4	8	812094	812101	0 %	0 %	50 %	50 %	316932153
19015	NC_014834	CGC	2	6	812122	812127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932153
19016	NC_014834	GCG	2	6	812189	812194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932153
19017	NC_014834	GC	3	6	812204	812209	0 %	0 %	50 %	50 %	316932153
19018	NC_014834	TCG	2	6	812219	812224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932153
19019	NC_014834	CTG	2	6	812244	812249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932153
19020	NC_014834	CGA	2	6	812259	812264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932153
19021	NC_014834	GCT	2	6	812286	812291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932153
19022	NC_014834	CGC	2	6	812303	812308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932153
19023	NC_014834	GCT	2	6	812355	812360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932153
19024	NC_014834	CGG	2	6	812378	812383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932153
19025	NC_014834	CCG	2	6	812399	812404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932153
19026	NC_014834	CGT	2	6	812409	812414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932153
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19028	NC_014834	CGA	2	6	812460	812465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932153
19029	NC_014834	CGATC	2	10	812502	812511	20 %	20 %	20 %	40 %	316932153
19030	NC_014834	TGG	2	6	812549	812554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932153
19031	NC_014834	GAT	2	6	812758	812763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932153
19032	NC_014834	CGG	2	6	812792	812797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932153
19033	NC_014834	TGC	2	6	812852	812857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932153
19034	NC_014834	GGT	3	9	812898	812906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932153
19035	NC_014834	TGG	2	6	812972	812977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932153
19036	NC_014834	CGC	2	6	813006	813011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932153
19037	NC_014834	CCG	2	6	813012	813017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932153
19038	NC_014834	CG	3	6	813016	813021	0 %	0 %	50 %	50 %	316932153
19039	NC_014834	CGA	2	6	813198	813203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932154
19040	NC_014834	GTG	2	6	813247	813252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932154
19041	NC_014834	CGG	2	6	813257	813262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932154
19042	NC_014834	CGC	2	6	813276	813281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932154
19043	NC_014834	CGGCG	2	10	813285	813294	0 %	0 %	60 %	40 %	316932154
19044	NC_014834	CG	3	6	813293	813298	0 %	0 %	50 %	50 %	316932154
19045	NC_014834	GAC	2	6	813310	813315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932154
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19049	NC_014834	GGC	2	6	813537	813542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932154
19050	NC_014834	GC	3	6	813541	813546	0 %	0 %	50 %	50 %	316932154
19051	NC_014834	CCG	2	6	813551	813556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932154
19052	NC_014834	CGA	2	6	813561	813566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932154
19053	NC_014834	GGC	2	6	813598	813603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932154
19054	NC_014834	ACA	2	6	813608	813613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316932154
19055	NC_014834	GCGCT	2	10	813622	813631	0 %	20 %	40 %	40 %	316932154
19056	NC_014834	CGC	2	6	813633	813638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932154
19057	NC_014834	GAT	2	6	813642	813647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932154
19058	NC_014834	CGA	2	6	813654	813659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932154
19059	NC_014834	CGC	4	12	813665	813676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932154
19060	NC_014834	GCCG	2	8	813684	813691	0 %	0 %	50 %	50 %	316932154
19061	NC_014834	GGCC	2	8	813701	813708	0 %	0 %	50 %	50 %	316932154
19062	NC_014834	CG	3	6	813733	813738	0 %	0 %	50 %	50 %	316932154
19063	NC_014834	TCT	2	6	813746	813751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932154
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19065	NC_014834	GCG	2	6	813770	813775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932154
19066	NC_014834	GCG	2	6	813790	813795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932154
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19068	NC_014834	CG	3	6	813861	813866	0 %	0 %	50 %	50 %	316932154
19069	NC_014834	GGC	2	6	813894	813899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932154
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19071	NC_014834	CGAC	2	8	813950	813957	25 %	0 %	25 %	50 %	316932154
19072	NC_014834	CG	3	6	814019	814024	0 %	0 %	50 %	50 %	316932154
19073	NC_014834	CG	3	6	814058	814063	0 %	0 %	50 %	50 %	316932154
19074	NC_014834	CATG	2	8	814071	814078	25 %	25 %	25 %	25 %	316932154
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19080	NC_014834	CGGC	2	8	814293	814300	0 %	0 %	50 %	50 %	316932154
19081	NC_014834	CGC	2	6	814325	814330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932154
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19086	NC_014834	GC	3	6	814645	814650	0 %	0 %	50 %	50 %	316932154
19087	NC_014834	CGAT	2	8	814658	814665	25 %	25 %	25 %	25 %	316932154
19088	NC_014834	GCC	3	9	814695	814703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932154
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19091	NC_014834	GCT	2	6	814842	814847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932154
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19093	NC_014834	CCG	2	6	814919	814924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932154
19094	NC_014834	TCG	2	6	814931	814936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932154
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19101	NC_014834	CAT	2	6	815064	815069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932154
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19104	NC_014834	CG	3	6	815256	815261	0 %	0 %	50 %	50 %	316932154
19105	NC_014834	CG	3	6	815305	815310	0 %	0 %	50 %	50 %	316932154
19106	NC_014834	GC	3	6	815314	815319	0 %	0 %	50 %	50 %	316932154
19107	NC_014834	CGC	2	6	815412	815417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932154
19108	NC_014834	TGG	2	6	815486	815491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932154
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19110	NC_014834	CGG	2	6	815580	815585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932154
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19113	NC_014834	GTC	2	6	815663	815668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932154
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19116	NC_014834	CGC	2	6	815754	815759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932154
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19118	NC_014834	CGA	2	6	815856	815861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932154
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19120	NC_014834	GC	3	6	815888	815893	0 %	0 %	50 %	50 %	316932154
19121	NC_014834	GGA	2	6	815904	815909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316932154
19122	NC_014834	GGC	2	6	816048	816053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932154
19123	NC_014834	GGC	2	6	816057	816062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932154
19124	NC_014834	CGA	2	6	816066	816071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932154
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19127	NC_014834	GAT	2	6	816222	816227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932154
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19134	NC_014834	GATC	2	8	816354	816361	25 %	25 %	25 %	25 %	316932154
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19240	NC_014834	GCG	2	6	819818	819823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932157
19241	NC_014834	CGA	2	6	819875	819880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932157
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19471	NC_014834	GCGA	2	8	829092	829099	25 %	0 %	50 %	25 %	316932166
19472	NC_014834	ATC	2	6	829101	829106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932166
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