MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_014834	GGC	2	6	684388	684393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932030
16002	NC_014834	CGG	2	6	684418	684423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932030
16003	NC_014834	GTC	2	6	684545	684550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932030
16004	NC_014834	CGG	2	6	684553	684558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932030
16005	NC_014834	GCC	2	6	684585	684590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932030
16006	NC_014834	CAG	2	6	684623	684628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932030
16007	NC_014834	GCC	2	6	684725	684730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932030
16008	NC_014834	CGG	2	6	684992	684997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932031
16009	NC_014834	GCA	2	6	685016	685021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932031
16010	NC_014834	GGC	2	6	685031	685036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932031
16011	NC_014834	CGA	2	6	685082	685087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932031
16012	NC_014834	CGT	2	6	685109	685114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932031
16013	NC_014834	AAC	2	6	685231	685236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316932031
16014	NC_014834	CGA	2	6	685244	685249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932031
16015	NC_014834	CG	3	6	685256	685261	0 %	0 %	50 %	50 %	316932031
16016	NC_014834	GC	4	8	685273	685280	0 %	0 %	50 %	50 %	316932031
16017	NC_014834	CGT	2	6	685286	685291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932031
16018	NC_014834	GGCCGG	2	12	685310	685321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932031
16019	NC_014834	CAG	2	6	685329	685334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932031
16020	NC_014834	GAT	2	6	685340	685345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932031
16021	NC_014834	GCCG	2	8	685395	685402	0 %	0 %	50 %	50 %	316932031
16022	NC_014834	CAG	2	6	685452	685457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932031
16023	NC_014834	GAC	2	6	685477	685482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932031
16024	NC_014834	AGC	2	6	685492	685497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932031
16025	NC_014834	GCG	2	6	685500	685505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932031
16026	NC_014834	GTC	2	6	685512	685517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932031
16027	NC_014834	CAG	2	6	685530	685535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932031
16028	NC_014834	TGTTC	2	10	685553	685562	0 %	60 %	20 %	20 %	316932031
16029	NC_014834	CGGA	2	8	685818	685825	25 %	0 %	50 %	25 %	316932032
16030	NC_014834	GGT	2	6	685858	685863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932032
16031	NC_014834	TCG	2	6	685910	685915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932032
16032	NC_014834	CAC	2	6	685918	685923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932032
16033	NC_014834	ATCG	2	8	685945	685952	25 %	25 %	25 %	25 %	316932032
16034	NC_014834	GTC	2	6	685975	685980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932032
16035	NC_014834	GAA	2	6	686020	686025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932032
16036	NC_014834	GCC	2	6	686038	686043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932032
16037	NC_014834	CGAC	2	8	686319	686326	25 %	0 %	25 %	50 %	316932032
16038	NC_014834	CGA	2	6	686337	686342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932032
16039	NC_014834	GTT	2	6	686347	686352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316932032
16040	NC_014834	CGC	2	6	686473	686478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932032
16041	NC_014834	GCG	2	6	686525	686530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932032
16042	NC_014834	CG	4	8	686565	686572	0 %	0 %	50 %	50 %	316932032
16043	NC_014834	GCA	2	6	686608	686613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932032
16044	NC_014834	CGA	2	6	686628	686633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932032
16045	NC_014834	GGC	2	6	686686	686691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932032
16046	NC_014834	CAC	2	6	686695	686700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932032
16047	NC_014834	GGAT	2	8	686707	686714	25 %	25 %	50 %	0 %	316932032
16048	NC_014834	GTC	2	6	686737	686742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932032
16049	NC_014834	CGAG	2	8	686748	686755	25 %	0 %	50 %	25 %	316932032
16050	NC_014834	GC	3	6	686763	686768	0 %	0 %	50 %	50 %	316932032
16051	NC_014834	GCC	2	6	686780	686785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932032
16052	NC_014834	GTC	2	6	686806	686811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932032
16053	NC_014834	GCCG	2	8	686830	686837	0 %	0 %	50 %	50 %	316932032
16054	NC_014834	GC	4	8	686942	686949	0 %	0 %	50 %	50 %	316932032
16055	NC_014834	GCG	2	6	686984	686989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932032
16056	NC_014834	GCCG	2	8	687238	687245	0 %	0 %	50 %	50 %	316932033
16057	NC_014834	GCT	2	6	687281	687286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932033
16058	NC_014834	ATC	2	6	687348	687353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932033
16059	NC_014834	TCG	2	6	687403	687408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932033
16060	NC_014834	CGG	2	6	687416	687421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932033
16061	NC_014834	CGG	2	6	687431	687436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932033
16062	NC_014834	GCT	2	6	687476	687481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932033
16063	NC_014834	GCGCTG	2	12	687486	687497	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316932033
16064	NC_014834	CGC	2	6	687505	687510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932033
16065	NC_014834	GCT	2	6	687515	687520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932033
16066	NC_014834	CGC	2	6	687521	687526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932033
16067	NC_014834	ATC	2	6	687564	687569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932033
16068	NC_014834	TGC	2	6	687571	687576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932033
16069	NC_014834	CGAT	2	8	687616	687623	25 %	25 %	25 %	25 %	316932033
16070	NC_014834	GCG	2	6	687648	687653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932033
16071	NC_014834	TCGT	2	8	687669	687676	0 %	50 %	25 %	25 %	316932033
16072	NC_014834	TGC	2	6	687679	687684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932033
16073	NC_014834	GCTGGC	2	12	687701	687712	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316932033
16074	NC_014834	GCG	3	9	687714	687722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932033
16075	NC_014834	CGCT	2	8	687723	687730	0 %	25 %	25 %	50 %	316932033
16076	NC_014834	GCT	2	6	687758	687763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932033
16077	NC_014834	ACG	2	6	687790	687795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932033
16078	NC_014834	CG	3	6	687889	687894	0 %	0 %	50 %	50 %	316932033
16079	NC_014834	CTG	2	6	687924	687929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932033
16080	NC_014834	GGTC	2	8	687953	687960	0 %	25 %	50 %	25 %	316932033
16081	NC_014834	GCC	2	6	687980	687985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932033
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16083	NC_014834	GCA	2	6	688032	688037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932033
16084	NC_014834	GCG	2	6	688062	688067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932033
16085	NC_014834	CGC	3	9	688087	688095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932033
16086	NC_014834	CGG	2	6	688141	688146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932033
16087	NC_014834	GCGAC	2	10	688148	688157	20 %	0 %	40 %	40 %	316932033
16088	NC_014834	TTC	2	6	688197	688202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932033
16089	NC_014834	CG	3	6	688292	688297	0 %	0 %	50 %	50 %	316932033
16090	NC_014834	CCG	2	6	688341	688346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932034
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16092	NC_014834	GCT	2	6	688423	688428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932034
16093	NC_014834	TGCC	2	8	688453	688460	0 %	25 %	25 %	50 %	316932034
16094	NC_014834	CCA	2	6	688527	688532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932034
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16096	NC_014834	GAT	3	9	688588	688596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932034
16097	NC_014834	ACA	2	6	688745	688750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316932034
16098	NC_014834	GGA	2	6	688752	688757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316932034
16099	NC_014834	CAT	2	6	688767	688772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932034
16100	NC_014834	CCG	2	6	689105	689110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932035
16101	NC_014834	TCGT	2	8	689170	689177	0 %	50 %	25 %	25 %	316932035
16102	NC_014834	TGG	2	6	689207	689212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932035
16103	NC_014834	GCC	2	6	689239	689244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932035
16104	NC_014834	GCT	3	9	689298	689306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932035
16105	NC_014834	CAA	2	6	689325	689330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316932035
16106	NC_014834	CATC	2	8	689367	689374	25 %	25 %	0 %	50 %	316932035
16107	NC_014834	GCG	2	6	689381	689386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932035
16108	NC_014834	TGG	2	6	689420	689425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932035
16109	NC_014834	ACC	2	6	689426	689431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932035
16110	NC_014834	CGGC	2	8	689471	689478	0 %	0 %	50 %	50 %	316932035
16111	NC_014834	CGG	2	6	689489	689494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932035
16112	NC_014834	GGC	2	6	689527	689532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932035
16113	NC_014834	CGGAC	2	10	689699	689708	20 %	0 %	40 %	40 %	316932035
16114	NC_014834	GTG	2	6	689842	689847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932035
16115	NC_014834	GCACG	2	10	689874	689883	20 %	0 %	40 %	40 %	316932035
16116	NC_014834	GCCGGC	2	12	689893	689904	0 %	0 %	50 %	50 %	316932035
16117	NC_014834	AGC	2	6	689906	689911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932035
16118	NC_014834	TCG	2	6	689953	689958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932035
16119	NC_014834	TTC	2	6	689977	689982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932035
16120	NC_014834	CAC	2	6	690019	690024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932035
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16124	NC_014834	GCT	2	6	690160	690165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932035
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16230	NC_014834	TGG	2	6	694165	694170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932040
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16357	NC_014834	ACG	2	6	699753	699758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932045
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16475	NC_014834	GGTCG	2	10	705009	705018	0 %	20 %	60 %	20 %	316932050
16476	NC_014834	CGA	2	6	705041	705046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932050
16477	NC_014834	GGCC	2	8	705071	705078	0 %	0 %	50 %	50 %	316932050
16478	NC_014834	GTC	2	6	705108	705113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932050
16479	NC_014834	CG	3	6	705166	705171	0 %	0 %	50 %	50 %	316932050
16480	NC_014834	TTC	2	6	705226	705231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932050
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16483	NC_014834	CAG	2	6	705342	705347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932050
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