MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_014834	CGT	2	6	636746	636751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931982
15002	NC_014834	TGT	2	6	636790	636795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931982
15003	NC_014834	ATC	2	6	636801	636806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931982
15004	NC_014834	CGAG	2	8	636905	636912	25 %	0 %	50 %	25 %	316931982
15005	NC_014834	GTG	2	6	636921	636926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931982
15006	NC_014834	TCG	2	6	637042	637047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931982
15007	NC_014834	TAT	2	6	637122	637127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	316931982
15008	NC_014834	CGAT	2	8	637153	637160	25 %	25 %	25 %	25 %	316931982
15009	NC_014834	GCG	2	6	637207	637212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931982
15010	NC_014834	TGG	2	6	637216	637221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931982
15011	NC_014834	CGG	2	6	637306	637311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931982
15012	NC_014834	ATC	2	6	637359	637364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931982
15013	NC_014834	AAG	2	6	637446	637451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931982
15014	NC_014834	GCA	2	6	637454	637459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931982
15015	NC_014834	GC	3	6	637526	637531	0 %	0 %	50 %	50 %	316931982
15016	NC_014834	GAG	2	6	637533	637538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931982
15017	NC_014834	GTT	2	6	637629	637634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931983
15018	NC_014834	CGA	2	6	637743	637748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931983
15019	NC_014834	GGA	2	6	637787	637792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931983
15020	NC_014834	CTTC	2	8	637796	637803	0 %	50 %	0 %	50 %	316931983
15021	NC_014834	CGAG	2	8	637845	637852	25 %	0 %	50 %	25 %	316931983
15022	NC_014834	CG	3	6	637863	637868	0 %	0 %	50 %	50 %	316931983
15023	NC_014834	GCAAG	2	10	637884	637893	40 %	0 %	40 %	20 %	316931983
15024	NC_014834	GGCGA	2	10	637900	637909	20 %	0 %	60 %	20 %	316931983
15025	NC_014834	CAT	2	6	637935	637940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931983
15026	NC_014834	GGA	2	6	637953	637958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931983
15027	NC_014834	CAG	2	6	638008	638013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931983
15028	NC_014834	CGC	2	6	638043	638048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931983
15029	NC_014834	GGC	2	6	638106	638111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931983
15030	NC_014834	GAA	2	6	638140	638145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931983
15031	NC_014834	ACG	2	6	638498	638503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931983
15032	NC_014834	GCT	2	6	638524	638529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931983
15033	NC_014834	TCG	3	9	638540	638548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931983
15034	NC_014834	CGA	2	6	638559	638564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931983
15035	NC_014834	GTCGA	2	10	638597	638606	20 %	20 %	40 %	20 %	316931983
15036	NC_014834	GCGCG	2	10	638640	638649	0 %	0 %	60 %	40 %	316931983
15037	NC_014834	CTT	3	9	638688	638696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931983
15038	NC_014834	GACG	2	8	638712	638719	25 %	0 %	50 %	25 %	316931983
15039	NC_014834	GAG	2	6	638746	638751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931983
15040	NC_014834	TGT	2	6	638763	638768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931983
15041	NC_014834	CGT	2	6	638777	638782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931983
15042	NC_014834	TGC	2	6	638835	638840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931983
15043	NC_014834	GCG	2	6	638860	638865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931983
15044	NC_014834	GC	3	6	638873	638878	0 %	0 %	50 %	50 %	316931983
15045	NC_014834	ACC	2	6	638915	638920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931983
15046	NC_014834	GCCTT	2	10	638924	638933	0 %	40 %	20 %	40 %	316931983
15047	NC_014834	GGA	2	6	638950	638955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931983
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15050	NC_014834	GTT	2	6	639334	639339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931984
15051	NC_014834	CGGCGC	2	12	639403	639414	0 %	0 %	50 %	50 %	316931984
15052	NC_014834	CAT	2	6	639443	639448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931984
15053	NC_014834	GTCG	2	8	639454	639461	0 %	25 %	50 %	25 %	316931984
15054	NC_014834	TC	3	6	639537	639542	0 %	50 %	0 %	50 %	316931984
15055	NC_014834	CGG	2	6	639565	639570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931984
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15057	NC_014834	CT	3	6	639711	639716	0 %	50 %	0 %	50 %	316931984
15058	NC_014834	TCA	2	6	639747	639752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931984
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15060	NC_014834	GA	3	6	639834	639839	50 %	0 %	50 %	0 %	316931984
15061	NC_014834	GAC	2	6	639869	639874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931984
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15063	NC_014834	CG	3	6	639894	639899	0 %	0 %	50 %	50 %	316931984
15064	NC_014834	AGCGG	2	10	639906	639915	20 %	0 %	60 %	20 %	316931984
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15068	NC_014834	CG	3	6	640171	640176	0 %	0 %	50 %	50 %	316931985
15069	NC_014834	TTG	2	6	640209	640214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931985
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15091	NC_014834	GACGC	2	10	641033	641042	20 %	0 %	40 %	40 %	316931985
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15101	NC_014834	GTC	2	6	641620	641625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931986
15102	NC_014834	TCG	2	6	641661	641666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931986
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15359	NC_014834	AAG	2	6	655162	655167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931998
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15362	NC_014834	ATGCTT	2	12	655300	655311	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	316931998
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15389	NC_014834	CTTC	2	8	657306	657313	0 %	50 %	0 %	50 %	316932000
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15472	NC_014834	CGGGG	2	10	661887	661896	0 %	0 %	80 %	20 %	316932005
15473	NC_014834	GCAAG	2	10	661917	661926	40 %	0 %	40 %	20 %	316932005
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15476	NC_014834	ATC	2	6	662039	662044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932005
15477	NC_014834	TGC	2	6	662118	662123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932005
15478	NC_014834	CCTG	2	8	662202	662209	0 %	25 %	25 %	50 %	316932005
15479	NC_014834	CGA	2	6	662286	662291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932005
15480	NC_014834	CTT	3	9	662317	662325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932005
15481	NC_014834	GCG	2	6	662363	662368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932005
15482	NC_014834	TGCTTG	2	12	662372	662383	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	316932005
15483	NC_014834	GCT	2	6	662388	662393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932005
15484	NC_014834	CCTT	2	8	662414	662421	0 %	50 %	0 %	50 %	316932005
15485	NC_014834	TCGCGC	2	12	662441	662452	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	316932005
15486	NC_014834	CG	3	6	662453	662458	0 %	0 %	50 %	50 %	316932005
15487	NC_014834	GCGA	2	8	662462	662469	25 %	0 %	50 %	25 %	316932005
15488	NC_014834	TGCCGT	2	12	662484	662495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932005
15489	NC_014834	GGC	2	6	662520	662525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932005
15490	NC_014834	AGCC	2	8	662606	662613	25 %	0 %	25 %	50 %	316932005
15491	NC_014834	TCGG	2	8	662664	662671	0 %	25 %	50 %	25 %	316932005
15492	NC_014834	GCG	2	6	662672	662677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932005
15493	NC_014834	CGT	2	6	662724	662729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932005
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15498	NC_014834	CGT	2	6	663295	663300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932006
15499	NC_014834	TCG	2	6	663306	663311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932006
15500	NC_014834	GCC	2	6	663317	663322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932006

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