MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_014834	CTC	2	6	610199	610204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931958
14502	NC_014834	AACG	2	8	610217	610224	50 %	0 %	25 %	25 %	316931958
14503	NC_014834	CGT	2	6	610276	610281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931958
14504	NC_014834	CGA	2	6	610341	610346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931958
14505	NC_014834	GTG	2	6	610358	610363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931958
14506	NC_014834	CCG	2	6	610364	610369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931958
14507	NC_014834	CGGC	2	8	610420	610427	0 %	0 %	50 %	50 %	316931958
14508	NC_014834	ATG	2	6	610475	610480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931958
14509	NC_014834	CGA	2	6	610483	610488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931958
14510	NC_014834	GGC	2	6	610503	610508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931958
14511	NC_014834	TTC	2	6	610514	610519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931958
14512	NC_014834	CTT	2	6	610561	610566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931958
14513	NC_014834	AAC	2	6	610610	610615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931958
14514	NC_014834	ACG	2	6	610659	610664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931958
14515	NC_014834	CT	3	6	610797	610802	0 %	50 %	0 %	50 %	316931958
14516	NC_014834	TGG	2	6	610851	610856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931958
14517	NC_014834	CGC	2	6	610863	610868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931958
14518	NC_014834	GAA	2	6	610879	610884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931958
14519	NC_014834	CTA	2	6	610891	610896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931958
14520	NC_014834	GCC	3	9	610927	610935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931958
14521	NC_014834	GCCG	2	8	610949	610956	0 %	0 %	50 %	50 %	316931958
14522	NC_014834	ATC	2	6	610957	610962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931958
14523	NC_014834	ACGG	2	8	610967	610974	25 %	0 %	50 %	25 %	316931958
14524	NC_014834	CGG	2	6	611004	611009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931958
14525	NC_014834	GAC	2	6	611107	611112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931958
14526	NC_014834	AGA	2	6	611128	611133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931958
14527	NC_014834	GCC	2	6	611138	611143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931958
14528	NC_014834	TGACGA	2	12	611149	611160	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	316931958
14529	NC_014834	CAG	2	6	611192	611197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931958
14530	NC_014834	GCG	2	6	611202	611207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931958
14531	NC_014834	CTG	2	6	611297	611302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931959
14532	NC_014834	TCGG	2	8	611341	611348	0 %	25 %	50 %	25 %	316931959
14533	NC_014834	GTT	2	6	611366	611371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931959
14534	NC_014834	GCG	2	6	611408	611413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931959
14535	NC_014834	CGC	3	9	611523	611531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931959
14536	NC_014834	ACG	2	6	611538	611543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931959
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14538	NC_014834	GTC	2	6	611658	611663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931959
14539	NC_014834	GAA	2	6	611675	611680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931959
14540	NC_014834	GA	3	6	611685	611690	50 %	0 %	50 %	0 %	316931959
14541	NC_014834	CG	3	6	611851	611856	0 %	0 %	50 %	50 %	316931960
14542	NC_014834	TGC	2	6	611870	611875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931960
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14544	NC_014834	TTG	2	6	612027	612032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931960
14545	NC_014834	CGCGT	2	10	612046	612055	0 %	20 %	40 %	40 %	316931960
14546	NC_014834	CG	3	6	612134	612139	0 %	0 %	50 %	50 %	316931960
14547	NC_014834	TGGCG	2	10	612155	612164	0 %	20 %	60 %	20 %	316931960
14548	NC_014834	GCG	3	9	612162	612170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931960
14549	NC_014834	GGC	2	6	612313	612318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931960
14550	NC_014834	GCG	3	9	612336	612344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931960
14551	NC_014834	CAG	2	6	612403	612408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931960
14552	NC_014834	CGT	2	6	612584	612589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931960
14553	NC_014834	GCG	2	6	612595	612600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931960
14554	NC_014834	GTT	2	6	612608	612613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931960
14555	NC_014834	CGGAG	2	10	612650	612659	20 %	0 %	60 %	20 %	316931960
14556	NC_014834	GTG	2	6	612669	612674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931960
14557	NC_014834	CCG	2	6	612810	612815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931960
14558	NC_014834	TTGG	2	8	612859	612866	0 %	50 %	50 %	0 %	316931960
14559	NC_014834	CGAT	2	8	612916	612923	25 %	25 %	25 %	25 %	316931960
14560	NC_014834	GTCC	2	8	612932	612939	0 %	25 %	25 %	50 %	316931960
14561	NC_014834	GTCG	2	8	613085	613092	0 %	25 %	50 %	25 %	316931960
14562	NC_014834	GAC	2	6	613128	613133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931960
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14564	NC_014834	TGGG	2	8	613314	613321	0 %	25 %	75 %	0 %	316931961
14565	NC_014834	GAC	2	6	613322	613327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931961
14566	NC_014834	CCATT	2	10	613337	613346	20 %	40 %	0 %	40 %	316931961
14567	NC_014834	CG	3	6	613363	613368	0 %	0 %	50 %	50 %	316931961
14568	NC_014834	GC	4	8	613369	613376	0 %	0 %	50 %	50 %	316931961
14569	NC_014834	ATC	2	6	613431	613436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931961
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14571	NC_014834	CAC	2	6	613554	613559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931961
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14579	NC_014834	TGGCG	2	10	613937	613946	0 %	20 %	60 %	20 %	316931961
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14584	NC_014834	CAG	2	6	614278	614283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931961
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14590	NC_014834	TCA	3	9	614459	614467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931962
14591	NC_014834	TCG	2	6	614468	614473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931962
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14601	NC_014834	CACT	2	8	614659	614666	25 %	25 %	0 %	50 %	316931963
14602	NC_014834	GCG	2	6	614683	614688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931963
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14613	NC_014834	GCCG	2	8	615042	615049	0 %	0 %	50 %	50 %	316931964
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