MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_014834	CAC	2	6	588306	588311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931937
14002	NC_014834	GCG	2	6	588338	588343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931937
14003	NC_014834	GCA	2	6	588344	588349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931937
14004	NC_014834	ACG	2	6	588380	588385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931937
14005	NC_014834	CGTCGA	2	12	588419	588430	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	316931937
14006	NC_014834	CGG	2	6	588533	588538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931937
14007	NC_014834	CGA	2	6	588539	588544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931937
14008	NC_014834	TGT	2	6	588560	588565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931937
14009	NC_014834	TTGA	2	8	588702	588709	25 %	50 %	25 %	0 %	316931937
14010	NC_014834	CTGCGC	2	12	588744	588755	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	316931937
14011	NC_014834	GCG	2	6	588766	588771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931937
14012	NC_014834	GCCC	2	8	588798	588805	0 %	0 %	25 %	75 %	316931937
14013	NC_014834	GCT	2	6	588842	588847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931937
14014	NC_014834	CCA	2	6	588905	588910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931937
14015	NC_014834	GGCCTG	2	12	588945	588956	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316931937
14016	NC_014834	GATC	2	8	588983	588990	25 %	25 %	25 %	25 %	316931937
14017	NC_014834	TCG	2	6	589000	589005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931937
14018	NC_014834	CCTT	2	8	589024	589031	0 %	50 %	0 %	50 %	316931937
14019	NC_014834	CGA	2	6	589043	589048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931937
14020	NC_014834	CGT	2	6	589100	589105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931937
14021	NC_014834	GGT	2	6	589107	589112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931937
14022	NC_014834	GCC	2	6	589122	589127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931937
14023	NC_014834	GCC	2	6	589146	589151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931937
14024	NC_014834	CAG	2	6	589161	589166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931937
14025	NC_014834	GCA	2	6	589169	589174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931937
14026	NC_014834	AGC	2	6	589183	589188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931937
14027	NC_014834	CG	3	6	589223	589228	0 %	0 %	50 %	50 %	316931937
14028	NC_014834	TGA	2	6	589375	589380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931938
14029	NC_014834	CCA	2	6	589393	589398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931938
14030	NC_014834	CGT	2	6	589408	589413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931938
14031	NC_014834	GAGC	2	8	589417	589424	25 %	0 %	50 %	25 %	316931938
14032	NC_014834	GCGGTG	2	12	589434	589445	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	316931938
14033	NC_014834	GC	3	6	589452	589457	0 %	0 %	50 %	50 %	316931938
14034	NC_014834	AGC	2	6	589476	589481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931938
14035	NC_014834	GCCGC	2	10	589483	589492	0 %	0 %	40 %	60 %	316931938
14036	NC_014834	GCG	2	6	589517	589522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931938
14037	NC_014834	GTC	2	6	589529	589534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931938
14038	NC_014834	GCG	2	6	589538	589543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931938
14039	NC_014834	AGCC	2	8	589548	589555	25 %	0 %	25 %	50 %	316931938
14040	NC_014834	CAT	2	6	589607	589612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931938
14041	NC_014834	GC	3	6	589644	589649	0 %	0 %	50 %	50 %	316931938
14042	NC_014834	TGCCG	2	10	589687	589696	0 %	20 %	40 %	40 %	316931938
14043	NC_014834	CGC	2	6	589697	589702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931938
14044	NC_014834	CACGAC	2	12	590025	590036	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	316931939
14045	NC_014834	GCCG	2	8	590079	590086	0 %	0 %	50 %	50 %	316931939
14046	NC_014834	TGC	2	6	590119	590124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931939
14047	NC_014834	GAG	2	6	590172	590177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931939
14048	NC_014834	CGGC	2	8	590196	590203	0 %	0 %	50 %	50 %	316931939
14049	NC_014834	TGC	2	6	590340	590345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931939
14050	NC_014834	TCGG	2	8	590349	590356	0 %	25 %	50 %	25 %	316931939
14051	NC_014834	GGC	2	6	590396	590401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931939
14052	NC_014834	GGT	2	6	590432	590437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931939
14053	NC_014834	TGC	2	6	590680	590685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931940
14054	NC_014834	CTGT	2	8	590690	590697	0 %	50 %	25 %	25 %	316931940
14055	NC_014834	TGC	2	6	590731	590736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931940
14056	NC_014834	CCG	2	6	590745	590750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931940
14057	NC_014834	GGC	2	6	590759	590764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931940
14058	NC_014834	CGGC	2	8	590773	590780	0 %	0 %	50 %	50 %	316931940
14059	NC_014834	GC	3	6	590779	590784	0 %	0 %	50 %	50 %	316931940
14060	NC_014834	ATC	2	6	590799	590804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931940
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14062	NC_014834	GGGCTG	2	12	591024	591035	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	316931940
14063	NC_014834	CGG	2	6	591119	591124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931940
14064	NC_014834	GCC	2	6	591138	591143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931940
14065	NC_014834	ACC	2	6	591144	591149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931940
14066	NC_014834	GCC	2	6	591234	591239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931940
14067	NC_014834	GCC	2	6	591243	591248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931940
14068	NC_014834	GGT	2	6	591320	591325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931940
14069	NC_014834	CTG	2	6	591339	591344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931940
14070	NC_014834	GGC	2	6	591419	591424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931940
14071	NC_014834	CGG	2	6	591472	591477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931940
14072	NC_014834	CCGG	2	8	591509	591516	0 %	0 %	50 %	50 %	316931940
14073	NC_014834	GAC	2	6	591607	591612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931941
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14076	NC_014834	CGG	2	6	591672	591677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931941
14077	NC_014834	TCG	2	6	591689	591694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931941
14078	NC_014834	CGC	2	6	591750	591755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931941
14079	NC_014834	GAG	2	6	591802	591807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931941
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14083	NC_014834	TCG	2	6	592004	592009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931941
14084	NC_014834	AAC	2	6	592024	592029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931941
14085	NC_014834	GCTC	2	8	592058	592065	0 %	25 %	25 %	50 %	316931941
14086	NC_014834	CTG	2	6	592075	592080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931941
14087	NC_014834	CGC	2	6	592101	592106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931941
14088	NC_014834	CTG	2	6	592165	592170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931941
14089	NC_014834	CGG	2	6	592172	592177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931941
14090	NC_014834	CG	3	6	592178	592183	0 %	0 %	50 %	50 %	316931941
14091	NC_014834	GAT	2	6	592212	592217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931941
14092	NC_014834	CGG	2	6	592235	592240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931941
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14095	NC_014834	CTG	2	6	592366	592371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931941
14096	NC_014834	CAG	2	6	592372	592377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931941
14097	NC_014834	CTG	2	6	592459	592464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931941
14098	NC_014834	CAC	2	6	592524	592529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931941
14099	NC_014834	GC	3	6	592552	592557	0 %	0 %	50 %	50 %	316931941
14100	NC_014834	CGA	2	6	592578	592583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931941
14101	NC_014834	AGCA	2	8	592669	592676	50 %	0 %	25 %	25 %	316931941
14102	NC_014834	GCCG	2	8	592716	592723	0 %	0 %	50 %	50 %	316931941
14103	NC_014834	TCG	2	6	592733	592738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931941
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14106	NC_014834	GCC	2	6	592846	592851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931941
14107	NC_014834	CGG	3	9	592862	592870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931941
14108	NC_014834	TGG	2	6	593233	593238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931942
14109	NC_014834	GCG	2	6	593301	593306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931942
14110	NC_014834	TGG	2	6	593310	593315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931942
14111	NC_014834	G	7	7	593424	593430	0 %	0 %	100 %	0 %	316931943
14112	NC_014834	CGGTT	2	10	593596	593605	0 %	40 %	40 %	20 %	316931943
14113	NC_014834	GGC	2	6	593623	593628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931943
14114	NC_014834	GGCT	2	8	593698	593705	0 %	25 %	50 %	25 %	316931943
14115	NC_014834	GCC	2	6	593713	593718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931943
14116	NC_014834	AGCG	2	8	593725	593732	25 %	0 %	50 %	25 %	316931943
14117	NC_014834	TCG	2	6	593747	593752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931943
14118	NC_014834	CTG	2	6	593827	593832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931943
14119	NC_014834	CCG	2	6	593850	593855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931943
14120	NC_014834	TCGATC	2	12	593876	593887	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	316931943
14121	NC_014834	GCT	2	6	593934	593939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931943
14122	NC_014834	CGA	2	6	594006	594011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931943
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14124	NC_014834	TCA	2	6	594116	594121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931943
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14150	NC_014834	CTCG	2	8	594870	594877	0 %	25 %	25 %	50 %	316931943
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14235	NC_014834	CGG	3	9	598726	598734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931949
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14238	NC_014834	CGT	2	6	598815	598820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931949
14239	NC_014834	GTCGT	2	10	599075	599084	0 %	40 %	40 %	20 %	316931950
14240	NC_014834	CCG	2	6	599085	599090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931950
14241	NC_014834	CCCG	2	8	599100	599107	0 %	0 %	25 %	75 %	316931950
14242	NC_014834	GACCGC	2	12	599119	599130	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	316931950
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14349	NC_014834	CGGCG	2	10	603865	603874	0 %	0 %	60 %	40 %	316931954
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14352	NC_014834	CCGA	2	8	603971	603978	25 %	0 %	25 %	50 %	316931954
14353	NC_014834	GCT	2	6	604009	604014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931954
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14357	NC_014834	ACGCC	2	10	604179	604188	20 %	0 %	20 %	60 %	316931954
14358	NC_014834	GCT	2	6	604189	604194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931954
14359	NC_014834	TCG	2	6	604212	604217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931954
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14478	NC_014834	CCCG	2	8	609424	609431	0 %	0 %	25 %	75 %	316931958
14479	NC_014834	TCT	3	9	609432	609440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931958
14480	NC_014834	GGT	3	9	609441	609449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931958
14481	NC_014834	ACG	2	6	609456	609461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931958
14482	NC_014834	GCG	2	6	609500	609505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931958
14483	NC_014834	GGCG	2	8	609552	609559	0 %	0 %	75 %	25 %	316931958
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14485	NC_014834	GC	3	6	609593	609598	0 %	0 %	50 %	50 %	316931958
14486	NC_014834	GCG	2	6	609623	609628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931958
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