MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_014834	CAT	2	6	531166	531171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931883
12502	NC_014834	CCGA	2	8	531206	531213	25 %	0 %	25 %	50 %	316931883
12503	NC_014834	GC	3	6	531278	531283	0 %	0 %	50 %	50 %	316931883
12504	NC_014834	GCG	2	6	531302	531307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931883
12505	NC_014834	GC	3	6	531316	531321	0 %	0 %	50 %	50 %	316931883
12506	NC_014834	CG	3	6	531441	531446	0 %	0 %	50 %	50 %	316931883
12507	NC_014834	GC	3	6	531447	531452	0 %	0 %	50 %	50 %	316931883
12508	NC_014834	GTG	2	6	531503	531508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931883
12509	NC_014834	ACC	2	6	531512	531517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931883
12510	NC_014834	CG	3	6	531531	531536	0 %	0 %	50 %	50 %	316931883
12511	NC_014834	GGC	2	6	531565	531570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931883
12512	NC_014834	GCT	2	6	531571	531576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931883
12513	NC_014834	ATC	2	6	531614	531619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931883
12514	NC_014834	TTCG	2	8	531631	531638	0 %	50 %	25 %	25 %	316931883
12515	NC_014834	GCCTG	2	10	531645	531654	0 %	20 %	40 %	40 %	316931883
12516	NC_014834	TGA	2	6	531666	531671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931883
12517	NC_014834	CGA	2	6	531724	531729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931884
12518	NC_014834	CG	3	6	531743	531748	0 %	0 %	50 %	50 %	316931884
12519	NC_014834	GTCTAT	2	12	531801	531812	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	316931884
12520	NC_014834	GCT	2	6	531848	531853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931884
12521	NC_014834	CGC	3	9	531892	531900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931884
12522	NC_014834	GGCGA	2	10	531912	531921	20 %	0 %	60 %	20 %	316931884
12523	NC_014834	CGG	2	6	531964	531969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931884
12524	NC_014834	GCT	2	6	531977	531982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931884
12525	NC_014834	TGC	2	6	531994	531999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931884
12526	NC_014834	TCG	2	6	532015	532020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931884
12527	NC_014834	AGC	2	6	532036	532041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931884
12528	NC_014834	TCT	2	6	532042	532047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931884
12529	NC_014834	TGG	3	9	532071	532079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931884
12530	NC_014834	TGT	2	6	532084	532089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931884
12531	NC_014834	A	6	6	532128	532133	100 %	0 %	0 %	0 %	316931884
12532	NC_014834	CAT	2	6	532314	532319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931884
12533	NC_014834	GTG	2	6	532338	532343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931884
12534	NC_014834	TCG	2	6	532407	532412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931884
12535	NC_014834	CGA	2	6	532439	532444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931884
12536	NC_014834	CGA	2	6	532638	532643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931885
12537	NC_014834	ACG	2	6	532685	532690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931885
12538	NC_014834	GGC	2	6	532717	532722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931885
12539	NC_014834	GACCAC	2	12	532756	532767	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	316931885
12540	NC_014834	CTG	2	6	532768	532773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931885
12541	NC_014834	GCG	2	6	532826	532831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931885
12542	NC_014834	AAG	2	6	532858	532863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931885
12543	NC_014834	AGG	2	6	532889	532894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931885
12544	NC_014834	GCC	2	6	532903	532908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931885
12545	NC_014834	CGGCG	2	10	532917	532926	0 %	0 %	60 %	40 %	316931885
12546	NC_014834	CG	3	6	532928	532933	0 %	0 %	50 %	50 %	316931885
12547	NC_014834	GGGGC	2	10	532976	532985	0 %	0 %	80 %	20 %	316931885
12548	NC_014834	GC	3	6	533001	533006	0 %	0 %	50 %	50 %	316931885
12549	NC_014834	GCT	2	6	533103	533108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931885
12550	NC_014834	CGACCA	2	12	533121	533132	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	316931885
12551	NC_014834	CGC	3	9	533148	533156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931885
12552	NC_014834	GCC	2	6	533210	533215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931886
12553	NC_014834	GCT	2	6	533224	533229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931886
12554	NC_014834	GGC	2	6	533275	533280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931886
12555	NC_014834	GCC	2	6	533291	533296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931886
12556	NC_014834	ATC	2	6	533325	533330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931886
12557	NC_014834	CGG	2	6	533371	533376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931886
12558	NC_014834	GC	3	6	533381	533386	0 %	0 %	50 %	50 %	316931886
12559	NC_014834	GCT	2	6	533413	533418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931886
12560	NC_014834	CGG	2	6	533460	533465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931886
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12567	NC_014834	TCG	2	6	533640	533645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931886
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12570	NC_014834	CGCT	2	8	533760	533767	0 %	25 %	25 %	50 %	316931886
12571	NC_014834	GAG	2	6	533837	533842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931887
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12573	NC_014834	TGCG	2	8	533855	533862	0 %	25 %	50 %	25 %	316931887
12574	NC_014834	CCG	2	6	533950	533955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931887
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12579	NC_014834	GCTC	2	8	534331	534338	0 %	25 %	25 %	50 %	316931888
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12585	NC_014834	GTG	2	6	534480	534485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931888
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12589	NC_014834	CGA	2	6	534754	534759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931889
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12591	NC_014834	CCGGCG	2	12	534816	534827	0 %	0 %	50 %	50 %	316931889
12592	NC_014834	CGC	2	6	534832	534837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931889
12593	NC_014834	CGG	2	6	534850	534855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931889
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12600	NC_014834	GGCGAG	2	12	535007	535018	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	316931889
12601	NC_014834	TCG	2	6	535029	535034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931889
12602	NC_014834	GC	3	6	535124	535129	0 %	0 %	50 %	50 %	316931889
12603	NC_014834	GCCGC	2	10	535167	535176	0 %	0 %	40 %	60 %	316931889
12604	NC_014834	CCG	2	6	535214	535219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931889
12605	NC_014834	TGG	2	6	535248	535253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931889
12606	NC_014834	GGC	2	6	535270	535275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931889
12607	NC_014834	CGGC	2	8	535285	535292	0 %	0 %	50 %	50 %	316931889
12608	NC_014834	TCA	2	6	535302	535307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931889
12609	NC_014834	GCT	2	6	535315	535320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931889
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12611	NC_014834	CGC	2	6	535351	535356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931889
12612	NC_014834	CG	3	6	535389	535394	0 %	0 %	50 %	50 %	316931889
12613	NC_014834	GC	4	8	535425	535432	0 %	0 %	50 %	50 %	316931889
12614	NC_014834	GCCG	2	8	535504	535511	0 %	0 %	50 %	50 %	316931889
12615	NC_014834	GCC	2	6	535520	535525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931889
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12978	NC_014834	CG	3	6	547823	547828	0 %	0 %	50 %	50 %	316931901
12979	NC_014834	TGG	2	6	547839	547844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931901
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12982	NC_014834	CAG	2	6	547876	547881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931901
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