MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
123001	NC_014834	AGC	2	6	5262782	5262787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936188
123002	NC_014834	CCA	2	6	5262851	5262856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936188
123003	NC_014834	TAC	2	6	5262901	5262906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936188
123004	NC_014834	CCA	2	6	5262908	5262913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936188
123005	NC_014834	CGG	2	6	5262915	5262920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936188
123006	NC_014834	GCG	2	6	5262941	5262946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936188
123007	NC_014834	ACCA	2	8	5262976	5262983	50 %	0 %	0 %	50 %	316936188
123008	NC_014834	GATC	2	8	5263035	5263042	25 %	25 %	25 %	25 %	316936188
123009	NC_014834	CGA	2	6	5263074	5263079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936188
123010	NC_014834	CGC	2	6	5263086	5263091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936188
123011	NC_014834	GCT	2	6	5263196	5263201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936188
123012	NC_014834	GGA	2	6	5263323	5263328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316936188
123013	NC_014834	ATG	2	6	5263373	5263378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936188
123014	NC_014834	ACG	2	6	5263388	5263393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936188
123015	NC_014834	TGC	2	6	5263445	5263450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936188
123016	NC_014834	GCG	2	6	5263469	5263474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936188
123017	NC_014834	GC	3	6	5263502	5263507	0 %	0 %	50 %	50 %	316936188
123018	NC_014834	CCA	2	6	5263523	5263528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936188
123019	NC_014834	GTG	2	6	5263546	5263551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936188
123020	NC_014834	CGG	2	6	5263578	5263583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936188
123021	NC_014834	GTG	2	6	5263711	5263716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936188
123022	NC_014834	GACCGC	2	12	5263719	5263730	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	316936188
123023	NC_014834	GAA	2	6	5263749	5263754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316936188
123024	NC_014834	TCG	2	6	5263780	5263785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936188
123025	NC_014834	CGG	2	6	5263787	5263792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936188
123026	NC_014834	CGA	2	6	5263998	5264003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936188
123027	NC_014834	GGC	2	6	5264005	5264010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936188
123028	NC_014834	GCCG	2	8	5264040	5264047	0 %	0 %	50 %	50 %	316936188
123029	NC_014834	GAA	2	6	5264094	5264099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316936188
123030	NC_014834	CGA	2	6	5264121	5264126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936188
123031	NC_014834	CG	3	6	5264148	5264153	0 %	0 %	50 %	50 %	316936188
123032	NC_014834	AAG	2	6	5264194	5264199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316936188
123033	NC_014834	GTCG	2	8	5264211	5264218	0 %	25 %	50 %	25 %	316936188
123034	NC_014834	GTG	2	6	5264227	5264232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936188
123035	NC_014834	CGA	2	6	5264304	5264309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936188
123036	NC_014834	GCA	3	9	5264337	5264345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936188
123037	NC_014834	CTCG	2	8	5264376	5264383	0 %	25 %	25 %	50 %	316936188
123038	NC_014834	CG	4	8	5264391	5264398	0 %	0 %	50 %	50 %	316936188
123039	NC_014834	GGC	2	6	5264412	5264417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936188
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123042	NC_014834	GGC	2	6	5264440	5264445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936188
123043	NC_014834	GC	3	6	5264450	5264455	0 %	0 %	50 %	50 %	316936188
123044	NC_014834	TGA	2	6	5264456	5264461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936188
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123046	NC_014834	CGG	2	6	5264480	5264485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936188
123047	NC_014834	GGC	2	6	5264511	5264516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936188
123048	NC_014834	GGC	2	6	5264518	5264523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936188
123049	NC_014834	GCCGA	2	10	5264530	5264539	20 %	0 %	40 %	40 %	316936188
123050	NC_014834	CGA	2	6	5264547	5264552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936188
123051	NC_014834	GCT	2	6	5264585	5264590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936188
123052	NC_014834	TCG	3	9	5264627	5264635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936188
123053	NC_014834	TGC	2	6	5264791	5264796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936189
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123055	NC_014834	GC	3	6	5264808	5264813	0 %	0 %	50 %	50 %	316936189
123056	NC_014834	AGC	2	6	5264884	5264889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936189
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123058	NC_014834	CAG	2	6	5264982	5264987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936189
123059	NC_014834	CAC	3	9	5265008	5265016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936189
123060	NC_014834	CGA	2	6	5265041	5265046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936189
123061	NC_014834	CGA	2	6	5265052	5265057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936189
123062	NC_014834	TCA	2	6	5265106	5265111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936189
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123064	NC_014834	GC	3	6	5265218	5265223	0 %	0 %	50 %	50 %	316936189
123065	NC_014834	CGA	2	6	5265335	5265340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936189
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123086	NC_014834	CGG	2	6	5266163	5266168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936189
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123101	NC_014834	GGC	3	9	5266604	5266612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936189
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123114	NC_014834	GTG	2	6	5267013	5267018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936189
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123221	NC_014834	G	6	6	5271818	5271823	0 %	0 %	100 %	0 %	316936192
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123223	NC_014834	GCG	2	6	5271898	5271903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936192
123224	NC_014834	CGA	2	6	5271936	5271941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936192
123225	NC_014834	CGG	2	6	5271957	5271962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936192
123226	NC_014834	GAA	2	6	5272017	5272022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316936192
123227	NC_014834	TTC	2	6	5272039	5272044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936192
123228	NC_014834	AAG	2	6	5272051	5272056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316936192
123229	NC_014834	GC	3	6	5272070	5272075	0 %	0 %	50 %	50 %	316936192
123230	NC_014834	GTCG	2	8	5272080	5272087	0 %	25 %	50 %	25 %	316936192
123231	NC_014834	TCG	2	6	5272133	5272138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936192
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123233	NC_014834	GGC	2	6	5272156	5272161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936192
123234	NC_014834	GTGCTG	2	12	5272210	5272221	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	316936192
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123238	NC_014834	CGG	2	6	5272546	5272551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936193
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123253	NC_014834	GCC	2	6	5273199	5273204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936193
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123263	NC_014834	CAG	2	6	5273692	5273697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936194
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123302	NC_014834	GC	3	6	5275436	5275441	0 %	0 %	50 %	50 %	316936195
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123315	NC_014834	GGC	2	6	5276014	5276019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936195
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123320	NC_014834	CGG	2	6	5276098	5276103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936195
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123323	NC_014834	CCG	2	6	5276193	5276198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936195
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123325	NC_014834	GC	3	6	5276244	5276249	0 %	0 %	50 %	50 %	316936195
123326	NC_014834	GTG	2	6	5276342	5276347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936195
123327	NC_014834	GC	3	6	5276348	5276353	0 %	0 %	50 %	50 %	316936195
123328	NC_014834	TCA	2	6	5276382	5276387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936195
123329	NC_014834	CGC	2	6	5276394	5276399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936195
123330	NC_014834	CG	3	6	5276417	5276422	0 %	0 %	50 %	50 %	316936195
123331	NC_014834	CGA	2	6	5276446	5276451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936195
123332	NC_014834	CTA	2	6	5276527	5276532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936195
123333	NC_014834	ACGC	2	8	5276553	5276560	25 %	0 %	25 %	50 %	316936195
123334	NC_014834	GC	3	6	5276563	5276568	0 %	0 %	50 %	50 %	316936195
123335	NC_014834	CGC	2	6	5277035	5277040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936196
123336	NC_014834	CGA	2	6	5277086	5277091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936196
123337	NC_014834	TCG	2	6	5277103	5277108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936196
123338	NC_014834	CGG	2	6	5277116	5277121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936196
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123340	NC_014834	TGC	2	6	5277154	5277159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936196
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