MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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122002	NC_014834	GCT	2	6	5221657	5221662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936150
122003	NC_014834	CCGG	2	8	5221679	5221686	0 %	0 %	50 %	50 %	316936150
122004	NC_014834	CCGGGA	2	12	5221749	5221760	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	316936150
122005	NC_014834	GTT	2	6	5221768	5221773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316936150
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122007	NC_014834	CGG	2	6	5221822	5221827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936150
122008	NC_014834	GCT	2	6	5221948	5221953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936150
122009	NC_014834	CGGCG	2	10	5221958	5221967	0 %	0 %	60 %	40 %	316936150
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122011	NC_014834	GGT	2	6	5222050	5222055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936150
122012	NC_014834	GCC	2	6	5222066	5222071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936150
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122019	NC_014834	GCT	2	6	5222257	5222262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936150
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122108	NC_014834	GTA	2	6	5226227	5226232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936153
122109	NC_014834	GC	3	6	5226282	5226287	0 %	0 %	50 %	50 %	316936153
122110	NC_014834	TTG	2	6	5226297	5226302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316936153
122111	NC_014834	CGAA	2	8	5226310	5226317	50 %	0 %	25 %	25 %	316936153
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122114	NC_014834	GTC	2	6	5226425	5226430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936153
122115	NC_014834	CAG	2	6	5226440	5226445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936153
122116	NC_014834	GTC	2	6	5226461	5226466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936153
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122227	NC_014834	TGA	2	6	5232317	5232322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936158
122228	NC_014834	CGC	2	6	5232352	5232357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936158
122229	NC_014834	CGA	2	6	5232372	5232377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936158
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122232	NC_014834	GGC	2	6	5232435	5232440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936158
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122234	NC_014834	TGGA	2	8	5232493	5232500	25 %	25 %	50 %	0 %	316936158
122235	NC_014834	ATCG	2	8	5232548	5232555	25 %	25 %	25 %	25 %	316936158
122236	NC_014834	CGA	2	6	5232570	5232575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936158
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122239	NC_014834	GAC	2	6	5232639	5232644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936158
122240	NC_014834	ATC	2	6	5232667	5232672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936158
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122326	NC_014834	ACGGC	2	10	5236059	5236068	20 %	0 %	40 %	40 %	316936161
122327	NC_014834	AAG	2	6	5236088	5236093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316936161
122328	NC_014834	TCA	2	6	5236200	5236205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936161
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122331	NC_014834	CAT	2	6	5236243	5236248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936161
122332	NC_014834	GCA	2	6	5236257	5236262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936161
122333	NC_014834	CGC	2	6	5236273	5236278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936161
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122335	NC_014834	GGC	2	6	5236438	5236443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936161
122336	NC_014834	GACCG	2	10	5236444	5236453	20 %	0 %	40 %	40 %	316936161
122337	NC_014834	GCCG	2	8	5236540	5236547	0 %	0 %	50 %	50 %	316936161
122338	NC_014834	CGC	2	6	5236551	5236556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936161
122339	NC_014834	GAA	3	9	5236615	5236623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316936161
122340	NC_014834	GCT	2	6	5236624	5236629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936161
122341	NC_014834	AGC	2	6	5236665	5236670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936161
122342	NC_014834	GTG	2	6	5236709	5236714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936161
122343	NC_014834	GCG	2	6	5236744	5236749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936161
122344	NC_014834	AGC	2	6	5236777	5236782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936162
122345	NC_014834	GCAG	2	8	5236864	5236871	25 %	0 %	50 %	25 %	316936162
122346	NC_014834	CG	4	8	5236997	5237004	0 %	0 %	50 %	50 %	316936162
122347	NC_014834	CCTC	2	8	5237058	5237065	0 %	25 %	0 %	75 %	316936162
122348	NC_014834	CGCC	2	8	5237069	5237076	0 %	0 %	25 %	75 %	316936162
122349	NC_014834	CG	3	6	5237109	5237114	0 %	0 %	50 %	50 %	316936162
122350	NC_014834	CGG	2	6	5237119	5237124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936162
122351	NC_014834	TCG	2	6	5237137	5237142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936162
122352	NC_014834	GTC	2	6	5237150	5237155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936162
122353	NC_014834	CAT	2	6	5237159	5237164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936162
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122355	NC_014834	GGTCT	2	10	5237196	5237205	0 %	40 %	40 %	20 %	316936162
122356	NC_014834	CTG	2	6	5237244	5237249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936162
122357	NC_014834	GCCG	2	8	5237279	5237286	0 %	0 %	50 %	50 %	316936162
122358	NC_014834	GCT	2	6	5237378	5237383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936162
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122363	NC_014834	GC	3	6	5237519	5237524	0 %	0 %	50 %	50 %	316936162
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122365	NC_014834	GC	3	6	5237569	5237574	0 %	0 %	50 %	50 %	316936162
122366	NC_014834	TGG	2	6	5237581	5237586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936162
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122368	NC_014834	GCA	2	6	5237618	5237623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936162
122369	NC_014834	CCTG	2	8	5237812	5237819	0 %	25 %	25 %	50 %	316936163
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122379	NC_014834	GATCAA	2	12	5238272	5238283	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	316936163
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122381	NC_014834	ACGTC	2	10	5238523	5238532	20 %	20 %	20 %	40 %	316936163
122382	NC_014834	CG	3	6	5238568	5238573	0 %	0 %	50 %	50 %	316936163
122383	NC_014834	CGG	2	6	5238575	5238580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936163
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122415	NC_014834	GCT	2	6	5239814	5239819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936164
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122420	NC_014834	CGA	2	6	5239979	5239984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936164
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122423	NC_014834	CGCC	2	8	5240054	5240061	0 %	0 %	25 %	75 %	316936164
122424	NC_014834	GTAA	2	8	5240101	5240108	50 %	25 %	25 %	0 %	316936164
122425	NC_014834	TCGC	2	8	5240154	5240161	0 %	25 %	25 %	50 %	316936165
122426	NC_014834	GC	3	6	5240271	5240276	0 %	0 %	50 %	50 %	316936165
122427	NC_014834	CCG	2	6	5240289	5240294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936165
122428	NC_014834	TGC	3	9	5240301	5240309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936165
122429	NC_014834	GAT	2	6	5240326	5240331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936165
122430	NC_014834	CGT	2	6	5240365	5240370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936165
122431	NC_014834	CGG	2	6	5240385	5240390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936165
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122433	NC_014834	CTT	2	6	5240404	5240409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936165
122434	NC_014834	CTG	2	6	5240417	5240422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936165
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122437	NC_014834	ATC	2	6	5240459	5240464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936165
122438	NC_014834	GCTCG	2	10	5240557	5240566	0 %	20 %	40 %	40 %	316936165
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122440	NC_014834	CGC	2	6	5240584	5240589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936165
122441	NC_014834	GC	3	6	5240592	5240597	0 %	0 %	50 %	50 %	316936165
122442	NC_014834	GTG	2	6	5240615	5240620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936165
122443	NC_014834	GAC	2	6	5240630	5240635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936165
122444	NC_014834	CGT	2	6	5240638	5240643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936165
122445	NC_014834	GGT	2	6	5240644	5240649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936165
122446	NC_014834	CGC	2	6	5240653	5240658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936165
122447	NC_014834	GGC	2	6	5240671	5240676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936165
122448	NC_014834	CGC	2	6	5240680	5240685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936165
122449	NC_014834	GC	3	6	5240716	5240721	0 %	0 %	50 %	50 %	316936165
122450	NC_014834	GCG	2	6	5240733	5240738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936165
122451	NC_014834	TGA	2	6	5240804	5240809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936165
122452	NC_014834	GCG	2	6	5240815	5240820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936166
122453	NC_014834	TCG	2	6	5240840	5240845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936166
122454	NC_014834	GC	3	6	5240883	5240888	0 %	0 %	50 %	50 %	316936166
122455	NC_014834	GAT	2	6	5240929	5240934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936166
122456	NC_014834	CGG	2	6	5240937	5240942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936166
122457	NC_014834	GCC	2	6	5240963	5240968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936166
122458	NC_014834	TCG	2	6	5240986	5240991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936166
122459	NC_014834	TCA	2	6	5241020	5241025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936166
122460	NC_014834	CCG	2	6	5241029	5241034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936166
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