MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
121501	NC_014834	GCC	2	6	5200893	5200898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936134
121502	NC_014834	GCC	2	6	5200909	5200914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936134
121503	NC_014834	GCT	2	6	5200964	5200969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936134
121504	NC_014834	CGC	3	9	5201016	5201024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936134
121505	NC_014834	CGA	2	6	5201180	5201185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936134
121506	NC_014834	GCA	2	6	5201263	5201268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936134
121507	NC_014834	GC	3	6	5201281	5201286	0 %	0 %	50 %	50 %	316936134
121508	NC_014834	TCG	2	6	5201341	5201346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936134
121509	NC_014834	GCC	2	6	5201367	5201372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936134
121510	NC_014834	TGG	2	6	5201498	5201503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936134
121511	NC_014834	CGTCCT	2	12	5201567	5201578	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	316936134
121512	NC_014834	GC	3	6	5201598	5201603	0 %	0 %	50 %	50 %	316936134
121513	NC_014834	AGCC	2	8	5201715	5201722	25 %	0 %	25 %	50 %	316936134
121514	NC_014834	CAC	2	6	5201748	5201753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936134
121515	NC_014834	CGG	2	6	5202548	5202553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936135
121516	NC_014834	CTC	2	6	5202571	5202576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316936135
121517	NC_014834	CTG	2	6	5202583	5202588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936135
121518	NC_014834	GCT	2	6	5202644	5202649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936135
121519	NC_014834	GTG	2	6	5202652	5202657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936135
121520	NC_014834	ACG	2	6	5202688	5202693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936135
121521	NC_014834	CAC	2	6	5202723	5202728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936135
121522	NC_014834	CGA	2	6	5202750	5202755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936135
121523	NC_014834	GGC	2	6	5202771	5202776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936135
121524	NC_014834	TGG	2	6	5202858	5202863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936135
121525	NC_014834	CGA	2	6	5202870	5202875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936135
121526	NC_014834	CGC	2	6	5202954	5202959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936135
121527	NC_014834	GCC	2	6	5202982	5202987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936135
121528	NC_014834	GC	4	8	5203138	5203145	0 %	0 %	50 %	50 %	316936136
121529	NC_014834	CG	3	6	5203148	5203153	0 %	0 %	50 %	50 %	316936136
121530	NC_014834	AGA	2	6	5203157	5203162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316936136
121531	NC_014834	CCG	2	6	5203163	5203168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936136
121532	NC_014834	TCA	2	6	5203171	5203176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936136
121533	NC_014834	CGGCCG	2	12	5203178	5203189	0 %	0 %	50 %	50 %	316936136
121534	NC_014834	CGA	2	6	5203196	5203201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936136
121535	NC_014834	CGCACG	2	12	5203246	5203257	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	316936136
121536	NC_014834	CGC	2	6	5203283	5203288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936136
121537	NC_014834	CAG	2	6	5203326	5203331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936136
121538	NC_014834	TCG	2	6	5203333	5203338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936136
121539	NC_014834	ATCTG	2	10	5203354	5203363	20 %	40 %	20 %	20 %	316936136
121540	NC_014834	TCG	2	6	5203444	5203449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936136
121541	NC_014834	GGT	2	6	5203463	5203468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936136
121542	NC_014834	CGC	2	6	5203499	5203504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936136
121543	NC_014834	GGT	3	9	5203511	5203519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936136
121544	NC_014834	GAG	2	6	5203527	5203532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316936136
121545	NC_014834	GGC	2	6	5203556	5203561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936136
121546	NC_014834	GCG	2	6	5203575	5203580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936136
121547	NC_014834	CGAC	2	8	5203642	5203649	25 %	0 %	25 %	50 %	316936136
121548	NC_014834	GCC	2	6	5203665	5203670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936136
121549	NC_014834	CGT	2	6	5203673	5203678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936136
121550	NC_014834	TCGA	2	8	5203680	5203687	25 %	25 %	25 %	25 %	316936136
121551	NC_014834	CAA	2	6	5203694	5203699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316936136
121552	NC_014834	CG	4	8	5203726	5203733	0 %	0 %	50 %	50 %	316936136
121553	NC_014834	GAA	2	6	5203758	5203763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316936136
121554	NC_014834	ACC	2	6	5203779	5203784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936136
121555	NC_014834	ACA	2	6	5203828	5203833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316936136
121556	NC_014834	GTG	2	6	5203857	5203862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936136
121557	NC_014834	CGG	3	9	5203874	5203882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936136
121558	NC_014834	TATC	2	8	5203901	5203908	25 %	50 %	0 %	25 %	316936136
121559	NC_014834	TGG	2	6	5203918	5203923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936136
121560	NC_014834	GAA	2	6	5203937	5203942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316936136
121561	NC_014834	GCC	2	6	5203948	5203953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936136
121562	NC_014834	ACA	2	6	5204047	5204052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316936136
121563	NC_014834	TCG	3	9	5204112	5204120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936136
121564	NC_014834	GCT	2	6	5204144	5204149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936136
121565	NC_014834	ACA	2	6	5204161	5204166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316936136
121566	NC_014834	GGC	2	6	5204239	5204244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936136
121567	NC_014834	CTG	2	6	5204259	5204264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936136
121568	NC_014834	CGCGG	2	10	5204282	5204291	0 %	0 %	60 %	40 %	316936136
121569	NC_014834	GCG	2	6	5204318	5204323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936136
121570	NC_014834	TCA	2	6	5204332	5204337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936136
121571	NC_014834	CGC	2	6	5204405	5204410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936136
121572	NC_014834	CAAGGC	2	12	5204447	5204458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936136
121573	NC_014834	GCTC	2	8	5204539	5204546	0 %	25 %	25 %	50 %	316936136
121574	NC_014834	GAC	2	6	5204648	5204653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936136
121575	NC_014834	CGG	3	9	5204764	5204772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936136
121576	NC_014834	GCCAAG	2	12	5204814	5204825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936136
121577	NC_014834	CGC	2	6	5204936	5204941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936136
121578	NC_014834	GGCT	2	8	5205026	5205033	0 %	25 %	50 %	25 %	316936136
121579	NC_014834	TCGT	2	8	5205078	5205085	0 %	50 %	25 %	25 %	316936136
121580	NC_014834	TCG	2	6	5205091	5205096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936136
121581	NC_014834	CGA	2	6	5205101	5205106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936136
121582	NC_014834	GGC	2	6	5205112	5205117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936136
121583	NC_014834	GAT	2	6	5205128	5205133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936136
121584	NC_014834	GGC	2	6	5205153	5205158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936136
121585	NC_014834	ACG	2	6	5205202	5205207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936136
121586	NC_014834	CGT	2	6	5205229	5205234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936136
121587	NC_014834	CG	3	6	5205253	5205258	0 %	0 %	50 %	50 %	316936136
121588	NC_014834	CGA	2	6	5205260	5205265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936136
121589	NC_014834	CGT	2	6	5205271	5205276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936136
121590	NC_014834	CAC	2	6	5205290	5205295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936136
121591	NC_014834	GCG	2	6	5205334	5205339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936136
121592	NC_014834	CGG	2	6	5205364	5205369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936136
121593	NC_014834	CAA	2	6	5205398	5205403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316936136
121594	NC_014834	TGCAAC	2	12	5205448	5205459	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	316936136
121595	NC_014834	GGC	2	6	5205461	5205466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936136
121596	NC_014834	CCA	2	6	5205648	5205653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936137
121597	NC_014834	CCT	2	6	5205666	5205671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316936137
121598	NC_014834	CGA	2	6	5205676	5205681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936137
121599	NC_014834	CGG	2	6	5205727	5205732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936137
121600	NC_014834	GCT	2	6	5205739	5205744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936137
121601	NC_014834	TGA	2	6	5205750	5205755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936137
121602	NC_014834	AGC	2	6	5205756	5205761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936137
121603	NC_014834	TCG	2	6	5205783	5205788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936137
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121605	NC_014834	GGC	2	6	5205850	5205855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936137
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121609	NC_014834	CGG	2	6	5205967	5205972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936137
121610	NC_014834	CCA	2	6	5205981	5205986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936137
121611	NC_014834	CGG	3	9	5205993	5206001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936137
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121613	NC_014834	TTC	2	6	5206073	5206078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936137
121614	NC_014834	CGA	2	6	5206102	5206107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936137
121615	NC_014834	GAT	2	6	5206114	5206119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936137
121616	NC_014834	TCG	2	6	5206206	5206211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936137
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121625	NC_014834	TGC	2	6	5206745	5206750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936138
121626	NC_014834	GC	3	6	5206785	5206790	0 %	0 %	50 %	50 %	316936138
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121722	NC_014834	CG	3	6	5210749	5210754	0 %	0 %	50 %	50 %	316936141
121723	NC_014834	CGG	2	6	5210770	5210775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936141
121724	NC_014834	TGA	2	6	5210785	5210790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936141
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121726	NC_014834	CAT	2	6	5210837	5210842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936141
121727	NC_014834	GTC	2	6	5210940	5210945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936141
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121827	NC_014834	GTCG	2	8	5214995	5215002	0 %	25 %	50 %	25 %	316936145
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121835	NC_014834	CG	3	6	5215405	5215410	0 %	0 %	50 %	50 %	316936146
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121841	NC_014834	ATA	2	6	5215745	5215750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	316936146
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