MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
121001	NC_014834	GACG	2	8	5178506	5178513	25 %	0 %	50 %	25 %	316936116
121002	NC_014834	GC	3	6	5178528	5178533	0 %	0 %	50 %	50 %	316936116
121003	NC_014834	CG	3	6	5178595	5178600	0 %	0 %	50 %	50 %	316936116
121004	NC_014834	TCA	2	6	5178669	5178674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936116
121005	NC_014834	GCC	2	6	5178751	5178756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936116
121006	NC_014834	GCC	2	6	5178769	5178774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936116
121007	NC_014834	GCC	3	9	5178797	5178805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936116
121008	NC_014834	GCC	2	6	5178841	5178846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936116
121009	NC_014834	GCGT	2	8	5178881	5178888	0 %	25 %	50 %	25 %	316936116
121010	NC_014834	GCC	2	6	5178916	5178921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936116
121011	NC_014834	GC	3	6	5179029	5179034	0 %	0 %	50 %	50 %	316936116
121012	NC_014834	CCG	2	6	5179044	5179049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936116
121013	NC_014834	GCA	2	6	5179091	5179096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936116
121014	NC_014834	CCG	3	9	5179098	5179106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936116
121015	NC_014834	GCC	2	6	5179133	5179138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936116
121016	NC_014834	CCA	2	6	5179148	5179153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936116
121017	NC_014834	GC	3	6	5179165	5179170	0 %	0 %	50 %	50 %	316936116
121018	NC_014834	GCGCG	2	10	5179215	5179224	0 %	0 %	60 %	40 %	316936116
121019	NC_014834	TCT	2	6	5179227	5179232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936116
121020	NC_014834	CCT	2	6	5179236	5179241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316936116
121021	NC_014834	GAGCG	2	10	5179249	5179258	20 %	0 %	60 %	20 %	316936116
121022	NC_014834	AGCCGA	2	12	5179293	5179304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936116
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121024	NC_014834	GACG	2	8	5179328	5179335	25 %	0 %	50 %	25 %	316936116
121025	NC_014834	AGCCC	2	10	5179405	5179414	20 %	0 %	20 %	60 %	316936116
121026	NC_014834	GC	3	6	5179426	5179431	0 %	0 %	50 %	50 %	316936116
121027	NC_014834	TCGA	2	8	5179469	5179476	25 %	25 %	25 %	25 %	316936116
121028	NC_014834	GGCC	2	8	5179524	5179531	0 %	0 %	50 %	50 %	316936116
121029	NC_014834	GC	3	6	5179621	5179626	0 %	0 %	50 %	50 %	316936116
121030	NC_014834	TCA	2	6	5179629	5179634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936116
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121033	NC_014834	GCA	2	6	5179806	5179811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936116
121034	NC_014834	CAG	2	6	5179819	5179824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936116
121035	NC_014834	GGCC	2	8	5179836	5179843	0 %	0 %	50 %	50 %	316936116
121036	NC_014834	GCGGTC	2	12	5179855	5179866	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316936116
121037	NC_014834	CGCTT	2	10	5180104	5180113	0 %	40 %	20 %	40 %	316936117
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121040	NC_014834	ATC	2	6	5180223	5180228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936117
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121043	NC_014834	CAC	2	6	5180276	5180281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936117
121044	NC_014834	GC	3	6	5180309	5180314	0 %	0 %	50 %	50 %	316936117
121045	NC_014834	CG	3	6	5180459	5180464	0 %	0 %	50 %	50 %	316936117
121046	NC_014834	ACG	2	6	5180508	5180513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936117
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121052	NC_014834	TCC	2	6	5180796	5180801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316936117
121053	NC_014834	TTG	2	6	5180808	5180813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316936117
121054	NC_014834	CGG	2	6	5180880	5180885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936117
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121082	NC_014834	CGAC	2	8	5181935	5181942	25 %	0 %	25 %	50 %	316936118
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121115	NC_014834	CGA	2	6	5184724	5184729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936120
121116	NC_014834	CGA	2	6	5184733	5184738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936120
121117	NC_014834	CGC	2	6	5184772	5184777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936120
121118	NC_014834	ACG	2	6	5184809	5184814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936120
121119	NC_014834	GTC	2	6	5184850	5184855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936120
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121121	NC_014834	GCTGGA	2	12	5184895	5184906	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	316936120
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121219	NC_014834	CGT	2	6	5188344	5188349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936124
121220	NC_014834	TAC	2	6	5188373	5188378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936124
121221	NC_014834	GTG	2	6	5188387	5188392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936124
121222	NC_014834	GAC	2	6	5188407	5188412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936124
121223	NC_014834	GGA	2	6	5188419	5188424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316936124
121224	NC_014834	CGC	2	6	5188452	5188457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936124
121225	NC_014834	CGA	2	6	5188545	5188550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936124
121226	NC_014834	CAG	2	6	5188560	5188565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936124
121227	NC_014834	GAGC	2	8	5188584	5188591	25 %	0 %	50 %	25 %	316936124
121228	NC_014834	TGT	3	9	5188612	5188620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316936124
121229	NC_014834	TCGG	2	8	5188666	5188673	0 %	25 %	50 %	25 %	316936124
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121450	NC_014834	GC	4	8	5198840	5198847	0 %	0 %	50 %	50 %	316936133
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121453	NC_014834	CCGT	2	8	5198888	5198895	0 %	25 %	25 %	50 %	316936133
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