MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014834	TCA	2	6	467549	467554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931825
11002	NC_014834	C	6	6	467555	467560	0 %	0 %	0 %	100 %	316931825
11003	NC_014834	GCCA	2	8	467572	467579	25 %	0 %	25 %	50 %	316931825
11004	NC_014834	CTG	2	6	467622	467627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931825
11005	NC_014834	GTC	2	6	467631	467636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931825
11006	NC_014834	GGCC	2	8	467660	467667	0 %	0 %	50 %	50 %	316931825
11007	NC_014834	GCC	2	6	467689	467694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931825
11008	NC_014834	GCA	2	6	467702	467707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931825
11009	NC_014834	GGC	2	6	467957	467962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931826
11010	NC_014834	GCG	2	6	467964	467969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931826
11011	NC_014834	AGC	2	6	467991	467996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931826
11012	NC_014834	CGA	2	6	468043	468048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931826
11013	NC_014834	GCC	2	6	468051	468056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931826
11014	NC_014834	GCA	2	6	468100	468105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931826
11015	NC_014834	CAG	3	9	468116	468124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931826
11016	NC_014834	GCC	2	6	468125	468130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931826
11017	NC_014834	GCG	2	6	468131	468136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931826
11018	NC_014834	GCG	2	6	468153	468158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931826
11019	NC_014834	CAG	2	6	468197	468202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931826
11020	NC_014834	AGC	2	6	468243	468248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931826
11021	NC_014834	CGA	2	6	468268	468273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931826
11022	NC_014834	GCC	2	6	468288	468293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931826
11023	NC_014834	GGC	2	6	468314	468319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931826
11024	NC_014834	TCA	2	6	468346	468351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931826
11025	NC_014834	CGAG	2	8	468361	468368	25 %	0 %	50 %	25 %	316931826
11026	NC_014834	CGG	2	6	468382	468387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931826
11027	NC_014834	CAG	2	6	468407	468412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931826
11028	NC_014834	AGC	2	6	468420	468425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931826
11029	NC_014834	GC	3	6	468424	468429	0 %	0 %	50 %	50 %	316931826
11030	NC_014834	CAC	3	9	468500	468508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931826
11031	NC_014834	GAA	2	6	468515	468520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931826
11032	NC_014834	GC	3	6	468535	468540	0 %	0 %	50 %	50 %	316931826
11033	NC_014834	CGC	3	9	468538	468546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931826
11034	NC_014834	ATG	2	6	468579	468584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931826
11035	NC_014834	GCT	2	6	468618	468623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931827
11036	NC_014834	GTGG	2	8	468649	468656	0 %	25 %	75 %	0 %	316931827
11037	NC_014834	CGA	2	6	468660	468665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931827
11038	NC_014834	GCC	3	9	468670	468678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931827
11039	NC_014834	CAG	2	6	468751	468756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931827
11040	NC_014834	GCC	2	6	468765	468770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931827
11041	NC_014834	ACC	2	6	468773	468778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931827
11042	NC_014834	GGCG	2	8	468783	468790	0 %	0 %	75 %	25 %	316931827
11043	NC_014834	CGC	3	9	468800	468808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931827
11044	NC_014834	CGC	2	6	468826	468831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931827
11045	NC_014834	GGC	2	6	468871	468876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931827
11046	NC_014834	CGC	2	6	468894	468899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931827
11047	NC_014834	CCG	2	6	469010	469015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931827
11048	NC_014834	CAG	2	6	469045	469050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931827
11049	NC_014834	CAA	2	6	469066	469071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931827
11050	NC_014834	CGC	3	9	469116	469124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931827
11051	NC_014834	GCAT	2	8	469197	469204	25 %	25 %	25 %	25 %	316931827
11052	NC_014834	CTCG	2	8	469421	469428	0 %	25 %	25 %	50 %	316931828
11053	NC_014834	GCA	2	6	469462	469467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931828
11054	NC_014834	CCG	2	6	469495	469500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931828
11055	NC_014834	AGA	2	6	469501	469506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931828
11056	NC_014834	TGC	2	6	469549	469554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931828
11057	NC_014834	CTG	2	6	469563	469568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931828
11058	NC_014834	GAC	2	6	469578	469583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931828
11059	NC_014834	AAG	2	6	469593	469598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931828
11060	NC_014834	CAT	2	6	469604	469609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931828
11061	NC_014834	GAA	2	6	469631	469636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931828
11062	NC_014834	GC	3	6	469668	469673	0 %	0 %	50 %	50 %	316931828
11063	NC_014834	CGG	2	6	469702	469707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931828
11064	NC_014834	GGC	2	6	469718	469723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931828
11065	NC_014834	CTT	2	6	469820	469825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931828
11066	NC_014834	AAC	2	6	469830	469835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931828
11067	NC_014834	AAG	2	6	469845	469850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931828
11068	NC_014834	GAG	2	6	469860	469865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931828
11069	NC_014834	GGT	2	6	469931	469936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931828
11070	NC_014834	GCC	2	6	469937	469942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931828
11071	NC_014834	CCA	2	6	469958	469963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931828
11072	NC_014834	AAG	2	6	470001	470006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931828
11073	NC_014834	CAC	2	6	470084	470089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931828
11074	NC_014834	CGG	2	6	470126	470131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931828
11075	NC_014834	AAGG	2	8	470217	470224	50 %	0 %	50 %	0 %	316931828
11076	NC_014834	TGC	2	6	470263	470268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931828
11077	NC_014834	TCG	2	6	470293	470298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931828
11078	NC_014834	TTC	2	6	470301	470306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931828
11079	NC_014834	ATC	2	6	470320	470325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931828
11080	NC_014834	TC	3	6	470324	470329	0 %	50 %	0 %	50 %	316931828
11081	NC_014834	CTT	2	6	470387	470392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931828
11082	NC_014834	GC	3	6	470445	470450	0 %	0 %	50 %	50 %	316931828
11083	NC_014834	TGACGC	2	12	470527	470538	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	316931828
11084	NC_014834	GTG	2	6	470553	470558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931828
11085	NC_014834	CGG	2	6	470605	470610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931828
11086	NC_014834	CAC	2	6	470624	470629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931828
11087	NC_014834	AAG	2	6	470649	470654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931828
11088	NC_014834	CTG	2	6	470781	470786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931828
11089	NC_014834	GC	3	6	470787	470792	0 %	0 %	50 %	50 %	316931828
11090	NC_014834	CGC	3	9	470795	470803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931828
11091	NC_014834	GTC	2	6	470859	470864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931828
11092	NC_014834	TCG	2	6	470923	470928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931828
11093	NC_014834	CAC	2	6	470939	470944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931828
11094	NC_014834	GGA	2	6	470972	470977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931828
11095	NC_014834	TCG	2	6	471007	471012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931828
11096	NC_014834	CGC	3	9	471088	471096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931828
11097	NC_014834	TGG	3	9	471097	471105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931828
11098	NC_014834	CGATC	2	10	471146	471155	20 %	20 %	20 %	40 %	316931828
11099	NC_014834	ACC	2	6	471204	471209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931828
11100	NC_014834	AAG	2	6	471231	471236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931828
11101	NC_014834	GC	3	6	471261	471266	0 %	0 %	50 %	50 %	316931828
11102	NC_014834	CCG	2	6	471366	471371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931828
11103	NC_014834	AGC	2	6	471391	471396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931828
11104	NC_014834	CAC	2	6	471455	471460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931828
11105	NC_014834	GCCG	2	8	471473	471480	0 %	0 %	50 %	50 %	316931828
11106	NC_014834	CGCC	2	8	471499	471506	0 %	0 %	25 %	75 %	316931828
11107	NC_014834	CGC	2	6	471564	471569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931828
11108	NC_014834	TGA	2	6	471583	471588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931828
11109	NC_014834	GGC	2	6	471660	471665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931828
11110	NC_014834	ACG	2	6	471706	471711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931828
11111	NC_014834	TGG	2	6	471745	471750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931828
11112	NC_014834	TCG	2	6	471780	471785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931828
11113	NC_014834	CG	3	6	471784	471789	0 %	0 %	50 %	50 %	316931828
11114	NC_014834	GCT	2	6	471812	471817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931828
11115	NC_014834	CCGTG	2	10	471824	471833	0 %	20 %	40 %	40 %	316931828
11116	NC_014834	TGC	2	6	471886	471891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931828
11117	NC_014834	CCT	2	6	471913	471918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931828
11118	NC_014834	CTCG	2	8	471923	471930	0 %	25 %	25 %	50 %	316931828
11119	NC_014834	GCAAGC	2	12	472024	472035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931828
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11359	NC_014834	GTG	2	6	483167	483172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931839
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11457	NC_014834	GCCGA	2	10	487453	487462	20 %	0 %	40 %	40 %	316931841
11458	NC_014834	CTGC	2	8	487578	487585	0 %	25 %	25 %	50 %	316931841
11459	NC_014834	AGGGGC	2	12	487601	487612	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	316931841
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11461	NC_014834	GGT	2	6	487674	487679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931841
11462	NC_014834	ACC	2	6	487687	487692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931841
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11473	NC_014834	CTG	2	6	487987	487992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931841
11474	NC_014834	TGGTG	2	10	488066	488075	0 %	40 %	60 %	0 %	316931841
11475	NC_014834	GGC	2	6	488098	488103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931841
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11477	NC_014834	GCCGC	2	10	488180	488189	0 %	0 %	40 %	60 %	316931841
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