MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
109001	NC_014834	TCG	2	6	4660992	4660997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935630
109002	NC_014834	CGC	2	6	4661020	4661025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935630
109003	NC_014834	CGA	2	6	4661026	4661031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935630
109004	NC_014834	TCG	2	6	4661139	4661144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935630
109005	NC_014834	CG	3	6	4661219	4661224	0 %	0 %	50 %	50 %	316935630
109006	NC_014834	GCT	2	6	4661230	4661235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935630
109007	NC_014834	GCA	2	6	4661248	4661253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935630
109008	NC_014834	TCGA	2	8	4661360	4661367	25 %	25 %	25 %	25 %	316935630
109009	NC_014834	CG	4	8	4661389	4661396	0 %	0 %	50 %	50 %	316935630
109010	NC_014834	CCG	2	6	4661397	4661402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935630
109011	NC_014834	GAC	2	6	4661471	4661476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935630
109012	NC_014834	TGG	2	6	4661550	4661555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316935630
109013	NC_014834	CGA	2	6	4661569	4661574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935630
109014	NC_014834	TGG	3	9	4661577	4661585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316935630
109015	NC_014834	CAG	2	6	4661684	4661689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935630
109016	NC_014834	GTG	2	6	4661765	4661770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316935630
109017	NC_014834	CGG	2	6	4661776	4661781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935630
109018	NC_014834	CAC	2	6	4661804	4661809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935630
109019	NC_014834	GTG	2	6	4661828	4661833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316935630
109020	NC_014834	GAC	2	6	4661990	4661995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935630
109021	NC_014834	GAC	2	6	4662011	4662016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935630
109022	NC_014834	CGC	2	6	4662110	4662115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935631
109023	NC_014834	CCTACG	2	12	4662137	4662148	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	316935631
109024	NC_014834	ACG	2	6	4662188	4662193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935631
109025	NC_014834	CG	3	6	4662192	4662197	0 %	0 %	50 %	50 %	316935631
109026	NC_014834	CGGC	2	8	4662276	4662283	0 %	0 %	50 %	50 %	316935631
109027	NC_014834	CGTGC	2	10	4662435	4662444	0 %	20 %	40 %	40 %	316935631
109028	NC_014834	CGA	2	6	4662528	4662533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935631
109029	NC_014834	CGGCG	2	10	4662561	4662570	0 %	0 %	60 %	40 %	316935631
109030	NC_014834	GC	3	6	4662616	4662621	0 %	0 %	50 %	50 %	316935631
109031	NC_014834	GGT	3	9	4662669	4662677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316935631
109032	NC_014834	CCG	2	6	4662695	4662700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935631
109033	NC_014834	TGC	2	6	4662812	4662817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935631
109034	NC_014834	TGC	2	6	4662836	4662841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935631
109035	NC_014834	CGACGG	2	12	4662870	4662881	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	316935631
109036	NC_014834	GCG	2	6	4662890	4662895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935631
109037	NC_014834	CGA	2	6	4662900	4662905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935631
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109039	NC_014834	GC	3	6	4662949	4662954	0 %	0 %	50 %	50 %	316935631
109040	NC_014834	CG	3	6	4662978	4662983	0 %	0 %	50 %	50 %	316935631
109041	NC_014834	TGC	2	6	4663031	4663036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935631
109042	NC_014834	CTT	3	9	4663140	4663148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935631
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109045	NC_014834	GCGATC	2	12	4663192	4663203	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	316935631
109046	NC_014834	CG	3	6	4663219	4663224	0 %	0 %	50 %	50 %	316935631
109047	NC_014834	GTC	2	6	4663272	4663277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935631
109048	NC_014834	CGA	2	6	4663280	4663285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935631
109049	NC_014834	CGC	2	6	4663289	4663294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935631
109050	NC_014834	CGA	2	6	4663302	4663307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935631
109051	NC_014834	CGA	2	6	4663326	4663331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935631
109052	NC_014834	TCG	2	6	4663373	4663378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935631
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109054	NC_014834	TGG	4	12	4663481	4663492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316935631
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109056	NC_014834	TGC	2	6	4663550	4663555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935631
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109058	NC_014834	GCT	2	6	4663778	4663783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935632
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109060	NC_014834	CGG	2	6	4663841	4663846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935632
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109065	NC_014834	CGA	2	6	4664052	4664057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935632
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109068	NC_014834	TCG	2	6	4664271	4664276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935633
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109079	NC_014834	GCCGG	2	10	4664943	4664952	0 %	0 %	60 %	40 %	316935634
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109082	NC_014834	GCT	2	6	4665141	4665146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935635
109083	NC_014834	CTT	2	6	4665186	4665191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935635
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109085	NC_014834	GACC	2	8	4665299	4665306	25 %	0 %	25 %	50 %	316935635
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109087	NC_014834	GGC	2	6	4665336	4665341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935635
109088	NC_014834	CTT	2	6	4665372	4665377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935635
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109094	NC_014834	TGC	2	6	4665587	4665592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935635
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109096	NC_014834	GCCG	2	8	4665624	4665631	0 %	0 %	50 %	50 %	316935635
109097	NC_014834	CCG	2	6	4665667	4665672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935635
109098	NC_014834	CCG	2	6	4665694	4665699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935635
109099	NC_014834	GCG	3	9	4665719	4665727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935635
109100	NC_014834	CAC	2	6	4665732	4665737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935635
109101	NC_014834	CGG	2	6	4665746	4665751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935635
109102	NC_014834	ACG	2	6	4665790	4665795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935635
109103	NC_014834	GCG	2	6	4665796	4665801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935635
109104	NC_014834	AG	3	6	4665803	4665808	50 %	0 %	50 %	0 %	316935635
109105	NC_014834	CCA	2	6	4666415	4666420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935636
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109108	NC_014834	GTC	2	6	4666522	4666527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935636
109109	NC_014834	CGA	2	6	4666547	4666552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935636
109110	NC_014834	TCG	2	6	4666610	4666615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935636
109111	NC_014834	ATC	2	6	4666621	4666626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316935636
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109113	NC_014834	GCT	2	6	4666662	4666667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935636
109114	NC_014834	CGA	2	6	4666670	4666675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935636
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109219	NC_014834	CGT	2	6	4671521	4671526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935639
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