MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
108001	NC_014834	GCT	2	6	4619153	4619158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935595
108002	NC_014834	CGT	2	6	4619216	4619221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935595
108003	NC_014834	CTG	3	9	4619250	4619258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935595
108004	NC_014834	TTA	2	6	4619300	4619305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	316935595
108005	NC_014834	GCGG	2	8	4619307	4619314	0 %	0 %	75 %	25 %	316935595
108006	NC_014834	CGG	2	6	4619318	4619323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935595
108007	NC_014834	ACC	2	6	4619353	4619358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935595
108008	NC_014834	CG	3	6	4619461	4619466	0 %	0 %	50 %	50 %	316935595
108009	NC_014834	CGC	4	12	4619489	4619500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935595
108010	NC_014834	GCG	3	9	4619572	4619580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935595
108011	NC_014834	TTC	2	6	4619610	4619615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935595
108012	NC_014834	CGA	2	6	4619663	4619668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935595
108013	NC_014834	AGA	2	6	4619671	4619676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316935595
108014	NC_014834	GGCTGG	2	12	4619679	4619690	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	316935595
108015	NC_014834	TGC	2	6	4619725	4619730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935595
108016	NC_014834	ACC	2	6	4619733	4619738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935595
108017	NC_014834	TGC	2	6	4620000	4620005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935596
108018	NC_014834	TTC	2	6	4620095	4620100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935596
108019	NC_014834	ATCAG	2	10	4620105	4620114	40 %	20 %	20 %	20 %	316935596
108020	NC_014834	TCG	2	6	4620144	4620149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935596
108021	NC_014834	GCT	2	6	4620154	4620159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935596
108022	NC_014834	GCC	2	6	4620176	4620181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935596
108023	NC_014834	CTG	2	6	4620233	4620238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935596
108024	NC_014834	ATC	2	6	4620281	4620286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316935596
108025	NC_014834	TCT	2	6	4620348	4620353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935596
108026	NC_014834	TCG	2	6	4620408	4620413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935596
108027	NC_014834	CCT	2	6	4620415	4620420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316935596
108028	NC_014834	GGC	2	6	4620460	4620465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935596
108029	NC_014834	CGC	2	6	4620550	4620555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935596
108030	NC_014834	GCTGC	2	10	4620605	4620614	0 %	20 %	40 %	40 %	316935596
108031	NC_014834	TCG	4	12	4620630	4620641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935596
108032	NC_014834	CGG	2	6	4620646	4620651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935596
108033	NC_014834	CTG	2	6	4620698	4620703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935596
108034	NC_014834	GCTC	2	8	4620729	4620736	0 %	25 %	25 %	50 %	316935596
108035	NC_014834	CTG	3	9	4620836	4620844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935596
108036	NC_014834	CTGATC	2	12	4620848	4620859	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	316935596
108037	NC_014834	GACC	2	8	4620897	4620904	25 %	0 %	25 %	50 %	316935596
108038	NC_014834	GCGCC	2	10	4620914	4620923	0 %	0 %	40 %	60 %	316935597
108039	NC_014834	TGC	2	6	4620989	4620994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935597
108040	NC_014834	CGG	2	6	4621017	4621022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935597
108041	NC_014834	GAC	2	6	4621029	4621034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935597
108042	NC_014834	ATC	2	6	4621057	4621062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316935597
108043	NC_014834	ACA	2	6	4621076	4621081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316935597
108044	NC_014834	CGG	2	6	4621137	4621142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935597
108045	NC_014834	CAT	2	6	4621158	4621163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316935597
108046	NC_014834	CAA	2	6	4621179	4621184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316935597
108047	NC_014834	CCGCTG	2	12	4621195	4621206	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	316935597
108048	NC_014834	CGG	2	6	4621218	4621223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935597
108049	NC_014834	GTT	2	6	4621233	4621238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316935597
108050	NC_014834	TGA	2	6	4621262	4621267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935597
108051	NC_014834	GAT	2	6	4621293	4621298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935597
108052	NC_014834	CTT	2	6	4621350	4621355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935597
108053	NC_014834	CAGATC	2	12	4621426	4621437	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	316935597
108054	NC_014834	TAT	2	6	4621438	4621443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	316935597
108055	NC_014834	TGG	2	6	4621445	4621450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316935597
108056	NC_014834	ATC	2	6	4621471	4621476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316935597
108057	NC_014834	TCG	2	6	4621553	4621558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935597
108058	NC_014834	GTG	2	6	4621573	4621578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316935597
108059	NC_014834	CTT	2	6	4621605	4621610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935597
108060	NC_014834	CGC	2	6	4621632	4621637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935597
108061	NC_014834	CGG	2	6	4621713	4621718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935597
108062	NC_014834	CTT	2	6	4621725	4621730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935597
108063	NC_014834	TTC	2	6	4621822	4621827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935597
108064	NC_014834	ATC	2	6	4621828	4621833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316935597
108065	NC_014834	CGG	2	6	4621851	4621856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935597
108066	NC_014834	TGA	2	6	4621871	4621876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935597
108067	NC_014834	GCT	2	6	4621887	4621892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935597
108068	NC_014834	GC	3	6	4621893	4621898	0 %	0 %	50 %	50 %	316935597
108069	NC_014834	TGC	2	6	4621916	4621921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935597
108070	NC_014834	CTGATG	2	12	4621969	4621980	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	316935597
108071	NC_014834	ACC	2	6	4621987	4621992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935597
108072	NC_014834	GCC	2	6	4622056	4622061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935597
108073	NC_014834	GCC	2	6	4622077	4622082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935597
108074	NC_014834	CGG	2	6	4622084	4622089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935597
108075	NC_014834	GTC	3	9	4622095	4622103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935597
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108079	NC_014834	CGC	2	6	4622424	4622429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935598
108080	NC_014834	CTGCG	2	10	4622490	4622499	0 %	20 %	40 %	40 %	316935598
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108082	NC_014834	CACCT	2	10	4622598	4622607	20 %	20 %	0 %	60 %	316935598
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108084	NC_014834	CGG	2	6	4622623	4622628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935598
108085	NC_014834	AGC	2	6	4622647	4622652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935598
108086	NC_014834	CGA	2	6	4622705	4622710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935598
108087	NC_014834	GC	3	6	4622744	4622749	0 %	0 %	50 %	50 %	316935598
108088	NC_014834	CCG	2	6	4622762	4622767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935598
108089	NC_014834	TCG	2	6	4622794	4622799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935598
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108095	NC_014834	GCCG	2	8	4623322	4623329	0 %	0 %	50 %	50 %	316935599
108096	NC_014834	CGG	2	6	4623340	4623345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935599
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108099	NC_014834	CCGA	2	8	4623413	4623420	25 %	0 %	25 %	50 %	316935599
108100	NC_014834	GCA	2	6	4623442	4623447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935599
108101	NC_014834	CGCC	2	8	4623472	4623479	0 %	0 %	25 %	75 %	316935599
108102	NC_014834	GCG	2	6	4623480	4623485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935599
108103	NC_014834	CTG	2	6	4623494	4623499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935599
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108107	NC_014834	TTA	2	6	4623795	4623800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	316935600
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108112	NC_014834	CG	3	6	4623975	4623980	0 %	0 %	50 %	50 %	316935600
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