MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
106501	NC_014834	CGG	2	6	4559401	4559406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935542
106502	NC_014834	GCCGG	2	10	4559407	4559416	0 %	0 %	60 %	40 %	316935542
106503	NC_014834	CCT	2	6	4559458	4559463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316935542
106504	NC_014834	CGG	2	6	4559473	4559478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935542
106505	NC_014834	TGC	2	6	4559488	4559493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935542
106506	NC_014834	GC	3	6	4559523	4559528	0 %	0 %	50 %	50 %	316935542
106507	NC_014834	TCG	2	6	4559535	4559540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935542
106508	NC_014834	CAG	2	6	4559615	4559620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935542
106509	NC_014834	GC	3	6	4559663	4559668	0 %	0 %	50 %	50 %	316935542
106510	NC_014834	GCA	2	6	4559731	4559736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935542
106511	NC_014834	CAC	2	6	4559849	4559854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935542
106512	NC_014834	CGG	2	6	4559873	4559878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935542
106513	NC_014834	TCG	2	6	4559919	4559924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935542
106514	NC_014834	CGC	2	6	4559942	4559947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935542
106515	NC_014834	CGG	2	6	4560004	4560009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935542
106516	NC_014834	CGA	2	6	4560013	4560018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935542
106517	NC_014834	GTG	2	6	4560104	4560109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316935542
106518	NC_014834	TGGG	2	8	4560114	4560121	0 %	25 %	75 %	0 %	316935542
106519	NC_014834	CGC	2	6	4560122	4560127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935542
106520	NC_014834	CAG	2	6	4560152	4560157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935542
106521	NC_014834	CG	3	6	4560203	4560208	0 %	0 %	50 %	50 %	316935542
106522	NC_014834	CGA	2	6	4560232	4560237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935542
106523	NC_014834	AGCA	2	8	4560266	4560273	50 %	0 %	25 %	25 %	316935542
106524	NC_014834	TGGT	2	8	4560282	4560289	0 %	50 %	50 %	0 %	316935542
106525	NC_014834	TGA	2	6	4560509	4560514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935543
106526	NC_014834	GCG	2	6	4560517	4560522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935543
106527	NC_014834	CGA	2	6	4560531	4560536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935543
106528	NC_014834	GCA	2	6	4560642	4560647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935543
106529	NC_014834	CCG	2	6	4560657	4560662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935543
106530	NC_014834	GC	3	6	4560674	4560679	0 %	0 %	50 %	50 %	316935543
106531	NC_014834	AGC	2	6	4560683	4560688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935543
106532	NC_014834	GATC	2	8	4560777	4560784	25 %	25 %	25 %	25 %	316935543
106533	NC_014834	CGT	2	6	4560807	4560812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935543
106534	NC_014834	CGC	2	6	4560830	4560835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935543
106535	NC_014834	CCGG	2	8	4560909	4560916	0 %	0 %	50 %	50 %	316935543
106536	NC_014834	GAA	2	6	4560937	4560942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316935543
106537	NC_014834	GGT	2	6	4560952	4560957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316935543
106538	NC_014834	CTT	2	6	4561006	4561011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935543
106539	NC_014834	GGTC	2	8	4561038	4561045	0 %	25 %	50 %	25 %	316935543
106540	NC_014834	ATC	2	6	4561048	4561053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316935543
106541	NC_014834	CGA	4	12	4561090	4561101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935543
106542	NC_014834	GCG	2	6	4561223	4561228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935543
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106546	NC_014834	CAG	2	6	4561414	4561419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935543
106547	NC_014834	CG	3	6	4561422	4561427	0 %	0 %	50 %	50 %	316935543
106548	NC_014834	GCCG	2	8	4561447	4561454	0 %	0 %	50 %	50 %	316935543
106549	NC_014834	CGG	2	6	4561715	4561720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935544
106550	NC_014834	GCT	2	6	4561722	4561727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935544
106551	NC_014834	CGC	2	6	4561755	4561760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935544
106552	NC_014834	CGC	2	6	4561764	4561769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935544
106553	NC_014834	CGC	2	6	4561779	4561784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935544
106554	NC_014834	TGGC	2	8	4561795	4561802	0 %	25 %	50 %	25 %	316935544
106555	NC_014834	GCTGGC	3	18	4561797	4561814	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316935544
106556	NC_014834	TCG	2	6	4561835	4561840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935544
106557	NC_014834	CGTTG	2	10	4561844	4561853	0 %	40 %	40 %	20 %	316935544
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106567	NC_014834	CCTT	2	8	4562082	4562089	0 %	50 %	0 %	50 %	316935544
106568	NC_014834	CTG	2	6	4562188	4562193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935544
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106579	NC_014834	GC	3	6	4562809	4562814	0 %	0 %	50 %	50 %	316935545
106580	NC_014834	TCG	2	6	4562815	4562820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935545
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106604	NC_014834	CG	3	6	4563541	4563546	0 %	0 %	50 %	50 %	316935545
106605	NC_014834	GT	3	6	4563559	4563564	0 %	50 %	50 %	0 %	316935545
106606	NC_014834	CGG	2	6	4563617	4563622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935545
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106612	NC_014834	CTG	2	6	4563836	4563841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935546
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106725	NC_014834	CGC	2	6	4567821	4567826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935548
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