MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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106002	NC_014834	CTG	2	6	4540938	4540943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935525
106003	NC_014834	TCG	2	6	4541151	4541156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935526
106004	NC_014834	CTGCG	2	10	4541168	4541177	0 %	20 %	40 %	40 %	316935526
106005	NC_014834	GC	3	6	4541213	4541218	0 %	0 %	50 %	50 %	316935526
106006	NC_014834	GC	3	6	4541238	4541243	0 %	0 %	50 %	50 %	316935526
106007	NC_014834	CGC	2	6	4541245	4541250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935526
106008	NC_014834	CGCGC	2	10	4541291	4541300	0 %	0 %	40 %	60 %	316935526
106009	NC_014834	GCC	2	6	4541314	4541319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935526
106010	NC_014834	GCC	2	6	4541324	4541329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935526
106011	NC_014834	TCG	2	6	4541352	4541357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935526
106012	NC_014834	CGGC	2	8	4541377	4541384	0 %	0 %	50 %	50 %	316935526
106013	NC_014834	GC	3	6	4541406	4541411	0 %	0 %	50 %	50 %	316935526
106014	NC_014834	CGC	3	9	4541409	4541417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935526
106015	NC_014834	CGA	2	6	4541424	4541429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935526
106016	NC_014834	GCT	2	6	4541500	4541505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935526
106017	NC_014834	CGG	2	6	4541518	4541523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935526
106018	NC_014834	GAT	2	6	4541531	4541536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935526
106019	NC_014834	GCGCC	3	15	4541554	4541568	0 %	0 %	40 %	60 %	316935526
106020	NC_014834	TCG	2	6	4541583	4541588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935526
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106023	NC_014834	CCGG	2	8	4541678	4541685	0 %	0 %	50 %	50 %	316935526
106024	NC_014834	CGA	2	6	4541689	4541694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935526
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106026	NC_014834	CGA	2	6	4541734	4541739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935526
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106028	NC_014834	CGG	2	6	4541815	4541820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935526
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106031	NC_014834	TGC	2	6	4541922	4541927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935526
106032	NC_014834	TCG	2	6	4541946	4541951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935526
106033	NC_014834	GCT	3	9	4541965	4541973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935526
106034	NC_014834	GC	3	6	4541975	4541980	0 %	0 %	50 %	50 %	316935526
106035	NC_014834	CGA	2	6	4541986	4541991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935526
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106038	NC_014834	GCG	2	6	4542050	4542055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935527
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106040	NC_014834	TCG	2	6	4542073	4542078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935527
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106042	NC_014834	CACCG	2	10	4542097	4542106	20 %	0 %	20 %	60 %	316935527
106043	NC_014834	CGC	2	6	4542118	4542123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935527
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106047	NC_014834	GTA	2	6	4542214	4542219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935527
106048	NC_014834	CG	4	8	4542228	4542235	0 %	0 %	50 %	50 %	316935527
106049	NC_014834	CAG	2	6	4542262	4542267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935527
106050	NC_014834	AGC	2	6	4542329	4542334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935527
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106055	NC_014834	TCG	2	6	4542486	4542491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935527
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106057	NC_014834	GTA	2	6	4542535	4542540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935527
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106083	NC_014834	TGGGG	2	10	4543198	4543207	0 %	20 %	80 %	0 %	316935527
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106091	NC_014834	GC	4	8	4543573	4543580	0 %	0 %	50 %	50 %	316935528
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106098	NC_014834	CGAT	2	8	4543763	4543770	25 %	25 %	25 %	25 %	316935528
106099	NC_014834	TGC	2	6	4543802	4543807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935528
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106104	NC_014834	GCA	2	6	4543923	4543928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935528
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106107	NC_014834	TCTCA	2	10	4543991	4544000	20 %	40 %	0 %	40 %	316935528
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106109	NC_014834	TC	3	6	4544032	4544037	0 %	50 %	0 %	50 %	316935528
106110	NC_014834	CCG	2	6	4544038	4544043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935528
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106229	NC_014834	CCA	2	6	4548131	4548136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935532
106230	NC_014834	TGA	2	6	4548140	4548145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935532
106231	NC_014834	ACG	2	6	4548157	4548162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935532
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106240	NC_014834	ATG	2	6	4548608	4548613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935533
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106251	NC_014834	GCG	2	6	4548957	4548962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935533
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106334	NC_014834	CCG	2	6	4552611	4552616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935537
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106339	NC_014834	CGG	2	6	4552774	4552779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935537
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106450	NC_014834	GCC	2	6	4557521	4557526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935540
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