MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_014834	GGC	2	6	340304	340309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931698
8002	NC_014834	ACCGC	2	10	340330	340339	20 %	0 %	20 %	60 %	316931698
8003	NC_014834	ATT	2	6	340526	340531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	316931699
8004	NC_014834	CGT	2	6	340554	340559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931699
8005	NC_014834	GATC	2	8	340602	340609	25 %	25 %	25 %	25 %	316931699
8006	NC_014834	ACG	2	6	340652	340657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931699
8007	NC_014834	TCG	2	6	340661	340666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931699
8008	NC_014834	ACC	2	6	340687	340692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931699
8009	NC_014834	GCT	2	6	340701	340706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931699
8010	NC_014834	GTG	2	6	340783	340788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931699
8011	NC_014834	GCG	2	6	340799	340804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931699
8012	NC_014834	CG	3	6	340817	340822	0 %	0 %	50 %	50 %	316931699
8013	NC_014834	GGC	2	6	340839	340844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931699
8014	NC_014834	TGG	2	6	340903	340908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931699
8015	NC_014834	TGG	2	6	340919	340924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931699
8016	NC_014834	ACC	2	6	340981	340986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931699
8017	NC_014834	TCG	2	6	340994	340999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931699
8018	NC_014834	GCC	2	6	341033	341038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931699
8019	NC_014834	GGT	2	6	341156	341161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931700
8020	NC_014834	CAG	2	6	341190	341195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931700
8021	NC_014834	CG	3	6	341232	341237	0 %	0 %	50 %	50 %	316931700
8022	NC_014834	TGA	2	6	341284	341289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931700
8023	NC_014834	GC	3	6	341493	341498	0 %	0 %	50 %	50 %	316931701
8024	NC_014834	GGT	2	6	341546	341551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931701
8025	NC_014834	GC	3	6	341580	341585	0 %	0 %	50 %	50 %	316931701
8026	NC_014834	CGGCG	2	10	341629	341638	0 %	0 %	60 %	40 %	316931701
8027	NC_014834	AAGG	2	8	341673	341680	50 %	0 %	50 %	0 %	316931701
8028	NC_014834	TGC	2	6	341812	341817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931701
8029	NC_014834	CGG	2	6	341818	341823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931701
8030	NC_014834	CGC	2	6	341828	341833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931701
8031	NC_014834	GCC	2	6	341865	341870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931701
8032	NC_014834	ATC	2	6	341910	341915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931701
8033	NC_014834	CGGC	2	8	341917	341924	0 %	0 %	50 %	50 %	316931701
8034	NC_014834	CGGC	2	8	341969	341976	0 %	0 %	50 %	50 %	316931701
8035	NC_014834	CGC	3	9	342065	342073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931701
8036	NC_014834	CAT	2	6	342081	342086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931701
8037	NC_014834	TTG	2	6	342087	342092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931701
8038	NC_014834	GGC	2	6	342128	342133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931701
8039	NC_014834	GCC	2	6	342152	342157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931701
8040	NC_014834	GCCG	2	8	342164	342171	0 %	0 %	50 %	50 %	316931701
8041	NC_014834	GAT	2	6	342188	342193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931701
8042	NC_014834	CGG	2	6	342237	342242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931701
8043	NC_014834	CG	3	6	342249	342254	0 %	0 %	50 %	50 %	316931701
8044	NC_014834	CAT	2	6	342258	342263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931701
8045	NC_014834	GGC	2	6	342275	342280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931701
8046	NC_014834	CGG	3	9	342287	342295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931701
8047	NC_014834	CGA	2	6	342350	342355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931701
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8049	NC_014834	TGG	2	6	342469	342474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931701
8050	NC_014834	GATC	2	8	342596	342603	25 %	25 %	25 %	25 %	316931701
8051	NC_014834	CGG	2	6	342619	342624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931701
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8053	NC_014834	GCC	3	9	342647	342655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931701
8054	NC_014834	CCG	2	6	342667	342672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931701
8055	NC_014834	CGC	2	6	342677	342682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931701
8056	NC_014834	TGC	2	6	342689	342694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931701
8057	NC_014834	GC	3	6	342696	342701	0 %	0 %	50 %	50 %	316931701
8058	NC_014834	GC	3	6	342710	342715	0 %	0 %	50 %	50 %	316931701
8059	NC_014834	GCCG	2	8	342764	342771	0 %	0 %	50 %	50 %	316931701
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8062	NC_014834	CTG	2	6	342816	342821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931701
8063	NC_014834	GCC	2	6	342828	342833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931701
8064	NC_014834	GC	3	6	342852	342857	0 %	0 %	50 %	50 %	316931701
8065	NC_014834	TGC	2	6	342871	342876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931701
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8069	NC_014834	GC	3	6	343167	343172	0 %	0 %	50 %	50 %	316931702
8070	NC_014834	CGGGC	2	10	343195	343204	0 %	0 %	60 %	40 %	316931702
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8112	NC_014834	GCA	2	6	344577	344582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931702
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8121	NC_014834	GAA	2	6	345233	345238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931703
8122	NC_014834	TCA	2	6	345241	345246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931703
8123	NC_014834	GCT	2	6	345248	345253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931703
8124	NC_014834	CCG	2	6	345265	345270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931703
8125	NC_014834	GCC	2	6	345273	345278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931703
8126	NC_014834	CGG	2	6	345307	345312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931703
8127	NC_014834	GCTG	2	8	345317	345324	0 %	25 %	50 %	25 %	316931703
8128	NC_014834	TCGCCG	2	12	345345	345356	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	316931703
8129	NC_014834	GC	3	6	345419	345424	0 %	0 %	50 %	50 %	316931703
8130	NC_014834	CGA	2	6	345481	345486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931703
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8132	NC_014834	ATC	2	6	345529	345534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931703
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8134	NC_014834	CGC	2	6	345551	345556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931703
8135	NC_014834	AGC	2	6	345577	345582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931703
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8140	NC_014834	GCC	2	6	345728	345733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931703
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8153	NC_014834	TGT	2	6	346379	346384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931704
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8157	NC_014834	TCG	2	6	346549	346554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931704
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8230	NC_014834	GATC	2	8	349197	349204	25 %	25 %	25 %	25 %	316931707
8231	NC_014834	TCAGTT	2	12	349238	349249	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	316931708
8232	NC_014834	CAA	2	6	349303	349308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931708
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8235	NC_014834	AGT	2	6	349439	349444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931708
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8237	NC_014834	GC	4	8	349646	349653	0 %	0 %	50 %	50 %	316931709
8238	NC_014834	CGG	2	6	349674	349679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931709
8239	NC_014834	TCG	2	6	349802	349807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931709
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8358	NC_014834	TCCA	2	8	355046	355053	25 %	25 %	0 %	50 %	316931715
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8483	NC_014834	CGT	2	6	361842	361847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931723
8484	NC_014834	CCG	2	6	361941	361946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931723
8485	NC_014834	GAAG	2	8	361995	362002	50 %	0 %	50 %	0 %	316931723
8486	NC_014834	GCT	2	6	362019	362024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931723
8487	NC_014834	CGC	2	6	362093	362098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931723
8488	NC_014834	CGA	2	6	362130	362135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931723
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8491	NC_014834	TCG	2	6	362210	362215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931723
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8499	NC_014834	TGG	2	6	362441	362446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931723
8500	NC_014834	GTC	2	6	362461	362466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931723

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